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相似文献
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1.
根据甘蓝型油菜多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白(PGIP)基因PGIP3的全长序列设计引物,从普通白菜核隐性不育两用系‘Bajh97-01A/B'可育株中成功克隆了多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白基因BcPGIP,对其DNA和cDNA全长序列进行分析,结果表明,该基因包含2个外显子和1个内含子,最大开放阅读框为996bp,编码331个氨基酸,共有10个LRR(Leucine-rich repeat,高氨酸富集)重复序列。将BcPGIP与其他植物的49个PGIPs蛋白进行同源序列比对后,发现PGIP蛋白特征序列非常保守。由重建的进化树可知,该基因与十字花科芸薹属的甘蓝型油菜的同源性最高。通过实时荧光定量PCR分析发现,BcPGIP基因可能与花粉的发育相关。  相似文献   

2.
马哈利樱桃PGIP基因克隆及全序列测定   总被引:12,自引:0,他引:12  
以马哈利樱桃(Prunus mahalebL.)基因组DNA为模板,用PGIP(多聚半乳糖醛酸酶抵制蛋白)基因保守序列为引物进行PCR扩增,得到长度约为1.2kb的目的片段,将其克隆到pUCm-T载体上,进行序列测定,结果表明,目的片段全长1192bp,由2个外显子和1个内含子构成,外显子总长996bp,编码330个氨基酸,与杏的PGIP基因mRNA序列、编码的氨基酸序殓同源性分别达到94.1%、  相似文献   

3.
以珊西烟草(Nicotina tabacum cv. Xanthi-nc)的基因组DNA为模板,通过合成一对特异性引物,利用多聚酶链式反应(PCR)扩增获得PR-1a蛋白基因。将其克隆到E.coli质粒上进行序列分析。结果表明:该基因由504个碱基组成,编码168个氨基酸。与已发表序列相比较,核苷酸序列及推导出的氨基酸序列的同源性分别为99.9%和100%。  相似文献   

4.
具有多选择标记的植物基因表达载体有利于转基因植物研究中的转基因植株的筛选。本研究对植物基因表达载体pCAMBIA1301进行了改造,产生了1个具有可溶性的红移绿色荧光蛋白基因(smRS-GFP)、抗除草剂Basta、葡萄糖苷酸酶(GUS)及潮霉素(Hpt)的多选择标记的新的植物基因表达载体。运用这一表达载体的多选择标记可以有效降低检测和筛选转化植株时的假阳性率。此外,如此的基因表达载体也能满足实验室的不同筛选方法的需求。  相似文献   

5.
以草莓(Fragaria×ananassa)叶片为试材,采用PCR技术,克隆到1条多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白基因,命名为FaPGIP.基因组DNA片段包含一个长为168 bp的内含子;cDNA编码区全长999 bp,编码332个氨基酸残基.预测该蛋白质分子量为37.1 kD,等电点为7.67,N端24个氨基酸残基构成的疏水区域为信号肽,具有5个潜在的N-糖基化位点.序列同源比对结果表明,所克隆的FaPGIP基因与GenBank中登录的蔷薇科及其它物种PGIP基因具有较高的同源性.采用SyPred3D软件预测了该基因所编码的蛋白质的三维结构,表明FaPGIP蛋白质的三维模型类似马蹄的结构,含12段α-螺旋和21段β-折叠,中心LRR结构域由10个串联的LRRs基序组成.半定量RT-PCR分析显示,FaPGIP在草莓根、茎、叶、花和果五种组织中均有表达,其表达量为果>叶>花>根>茎,相对表达量分别为0.246 0、0.166 4、1.371 2、0.872 1和3.415 4.  相似文献   

6.
已知蜘蛛牵丝Ⅰ型蛋白N端序列不完整,有大量多聚丙氨酸基序组成的重复区。根据已报道的金纺者(Nephila clavipes)相应基因序列,合成若干寡核苷酸链,通过PCR获得编码涵盖三组多聚丙氨酸基序的基因片断。并以此为单体,经过酶切和连接获得重复区分别为2、4、8拷贝的聚合体。序列及RNA二级结构比对显示:所获8聚体与已报道基因编码的氨基酸同源性高达84%,但8聚体基因mRNA具有较低能级。将上述3种聚合体基因分别克隆大肠杆菌(Escherichia coh)表达载体pET-30a(+),经IPTG诱导、利福平阻断菌体基因表达及在培养基中添加^35S-Met,通过放射自显影可见由T7启动子引发的特异目的基因表达带。  相似文献   

7.
玉米大斑病菌G蛋白β亚基编码基因的克隆与表达   总被引:1,自引:0,他引:1  
玉米大斑病菌(Setosphearia turcica)属半知菌亚门丝状真菌,是严重威胁玉米生产的重要植物病原真菌。本研究克隆了玉米大斑病菌G蛋白β亚基编码基因Stgb-1。Stgb-1基因全长1296bp,由5个外显子和4个内含子组成;开放阅读框(ORF)为1056bp,编码351个氨基酸,蛋白质计算分子量为39.081kDa。STGB1蛋白推导氨基酸序列与Cochliobolus heterostrophus(100%)、Cryphonectria parasitica(80%)、Aspergillus fumigatus(81%)等丝状真菌的G蛋白β亚基编码基因均具有较高的同源性。同时,利用RACE技术和Genomic Walking技术获得了Stgb-1基因3’-末端cDNA和DNA的3’端侧翼序列,BlastN结果表明其cDNA 3’-UTR为136bp,poly(A)由9个A构成。此外,构建了pET28a-Stgb-1原核表达载体,SDS-PAGE检测和Western blot鉴定结果表明,目的蛋白在E.coli BL21菌株中已成功实现了诱导表达,为进一步研究蛋白结构与功能的关系奠定了基础。  相似文献   

8.
牦牛MT-I和MT-Ⅲ基因cDNA3’末端全长的克隆与序列分析   总被引:1,自引:0,他引:1  
分别利用基因特异引物YMr-ISP、Ymr-ⅢSP和M13引物M4,通过RT-PCR和3'-RACE方法从牦牛(Bos grunniens)肝脏和大脑组织RNA中分别扩增并克隆出了牦牛Metallothionein-I(MT-I)和Metallothionein-Ⅲ(MT-Ⅲ)cDNA3’末端全长序列(分别为331和378bp,GenBank登录MT-I No.AY758557,MT-Ⅲ No.DQ492300),其中分别包含MT-I,基因编码区全长(183bp)、MT-Ⅲ基因编码区全长(207bp),同时在MT-I和MT-Ⅲ基因cDNA的3’末端具有加尾信号从TAAA和多聚腺苷酸尾巴Poly(A)。分析表明,牦牛MT-I基因编码的MT-I蛋白由61个氨基酸组成,其中20个半胱氨酸(cys)具有保守的三肽结构:C-X-C、C-C-X-C-C、C-X-X-C等,在分子进化上十分保守;MT-Ⅲ编码的蛋白质由68个氨基酸组成,其中19个Cys除了具有与MT-I以上相同的保守短肽结构外,牦牛MT-Ⅲ蛋白质的氨基酸序列还具有T、CPCP、GEGAEA等MT-Ⅲ蛋白质特异的保守短肽结构,在分子进化上亦很保守。这些结构决定了MT-Ⅲ既具有与MT-I相同的重金属解毒等生理功能,又具有区别于MT-I的抑制神经元生长的特异功能。  相似文献   

9.
摘 要:分别利用基因特异引物YMT-ⅠSP、YMT-ⅢSP和M13 引物,通过RT-PCR和3′-RACE 方法从牦牛肝脏和大脑组织RNA中分别扩增并克隆出了牦牛MT-I / Ⅲ cDNA 3′ 端全长序列(分别为331bp和378bp),其中分别包含MT-I基因编码区全长(183bp)、MT-Ⅲ基因编码区全长(207bp),同时在MT-I / Ⅲ基因cDNA的3′ 末端具有加尾信号AATAAA和多聚腺苷酸尾巴Poly(A)。将牦牛MT-I / Ⅲ cDNA序列在CBI上进行同源性搜索发现,牦牛MT-I/Ⅲ核酸序列特别是其编码区序列在不同哺乳动物中相当保守。牦牛MT-I基因编码的MT-I蛋白由61个氨基酸组成,其中20个半胱氨酸(Cys),具有保守的三肽结构如:C-X-C,C-C-X-C-C,C-X-X-C等,在分子进化上十分保守;MT-Ⅲ编码的蛋白质由68个氨基酸组成,其中19个Cys,除了具有与MT-Ⅰ相同的以上保守的短肽结构外,牦牛MT-Ⅲ蛋白质的氨基酸序列还具有T、CPCP、GEGAEA等MT-Ⅲ蛋白质特异的保守短肽结构结构,在分子进化上亦很保守。  相似文献   

10.
根据白菜花粉特异的多聚半乳糖醛酸酶基因BcMF9的全长序列设计引物,通过PCR直接扩增的方法从结球甘蓝(Brassica. oleracea var. capitata)和芥蓝(B. oleracea var. alboglabra)中克隆得到BcMF9的同源基因BoMF9(BoMF9c和BoMF9l)。生物信息学分析和系统树构建发现BoMF9c和BoMF9l具有花粉特异表达的多聚半乳糖醛酸酶基因的序列特征。不同组织的表达特征分析发现它们分别在结球甘蓝和芥蓝的花蕾中特异表达。推测BoMF9c和BoMF9l可能在花粉萌发和花粉管伸长中起作用。  相似文献   

11.
水稻卷窄叶突变相关基因OsCSLD4的RNAi研究及表达分析   总被引:1,自引:1,他引:0  
在图位克隆获得目的基因OsCSLD4的基础上,利用Invitrogen公司的Gateway系统将500bp的OsCSLD4基因cDNA编码序列以反向互补的方式插入pANDA35HK,构建了水稻卷窄叶突变相关基因OsCSLD4的干涉载体pANDAH05。利用农杆菌转化法将干涉载体pANDAH05及对照空载体pANDA35HK分别转化突变体原始亲本日本晴幼胚。转基因阳性植株表型观察结果显示:干涉载体pANDAH05转化日本晴幼胚后,T0代植株出现了类似于突变体1ah137的表型,叶片明显变窄,卷曲程度增加,株高降低;对照空载体pANDA35HK转化日本晴幼胚后,T0代植株仍保持野生型表型;Real-timePCR检测结果显示:日本晴转干涉载体pANDAH05后,目的基因表达量明显降低,干涉强度不同目的基因表达量降低程度不同,研究结果表明目的基因OsCSLD4在水稻叶片形态发育过程中起着非常重要的作用。  相似文献   

12.
以草莓品种星都2号和全明星的无菌苗叶盘和叶柄基部为外植体,采用携带美洲拟鲽编码pre、pro和mature 3种抗冻蛋白(AFP)基因的双元载体系统的根癌农杆菌进行转化,获得7个Km抗性株系。PCR扩增及PCR-Southern杂交检测6个株系呈阳性,结果表明,编码pre、pro和mature的AFP基因分别整合到了星都2号和全明星染色体DNA中,其中获得pre、pro和mature转星都2号株系各1个,转化率分别为1.56%、1.49%、1.67%;mature基因转全明星株系3个,转化率为4.05%.  相似文献   

13.
根据GenBank中报道的猪抑制素基因序列设计两对引物,克隆含有抑制素抗原决定簇基因片段α(1~32)的p1INH和p2INH,在这两个片段中都设有限制性内切酶XbaⅠ的酶切位点,通过XbaⅠ把p1INH与p2INH串联起来。串联抑制素基因片段与pcDNA3.1载体通过EcoRⅠ、HindⅢ酶切位点连接后经过转化DH5α感受态细菌构建重组载体。以重组载体作为模板,以含有EcoRⅠ、HindⅢ酶切位点的引物PCR,产物经验证为含串联的抑制素基因。串联的抑制素基因产生的融合蛋白具有抑制素的免疫原性,也不会与体内其他蛋白发生免疫交叉反应。串联后的基因片段在单位体积内的抗原位点数增多,免疫效果也会加强。可以反馈性地抑制FSH的分泌,提高母畜的排卵数,提高产仔数。  相似文献   

14.
谷子脂转移蛋白cDNA的克隆及特性研究   总被引:3,自引:0,他引:3  
摘要:首次报道了从谷子(Stetaria italica )未成熟种子cDNA文库中克隆到1个与其它物种脂转移蛋白(LTP)具有较高同源性的脂转移蛋白基因Siltp。将核苷酸序列和推断的氨基酸序列在GenBank中进行比较,发现Siltp与大麦脂转移蛋白LTP7a2b和LTPcw-19,玉米脂转移蛋白,欧洲油菜的脂转移蛋白基因的核苷酸序列的同源性分别为72%,70%,60%,54%;氨基酸序列的同源性分别为79%,73%,65%,57%。序列分析表明,编码区含363个碱基 ,编码121个氨基酸,其中包括26个氨基酸的信号肽序列,分子量为9.3 kD。基因组Southern杂交结果表明,Siltp在基因组中以单拷贝存在。Northern杂交研究Siltp的时空表达特异性,发现Siltp仅在茎、叶、穗中表达。利用软件PAUP对17种植物的LTP进行进化分析,从进化系统树可以看出LTP有4个分支,其中,小麦发生分化较早,其它几种单子叶植物如玉米、谷子、大麦和水稻分化较晚,说明发生了早期的基因复制事件。在整个系统图中,双子叶比较分散,说明LTP基因的进化是个复杂的过程;禾本科作物的脂转移蛋白基因是由一个原始基因分化而产生的不同分支,Siltp与大麦LTP亲缘关系最近。  相似文献   

15.
农杆菌介导的蓝色基因转化中国水仙   总被引:1,自引:0,他引:1  
从矮牵牛(Petunia hybrida)花瓣中分离得到编码蓝色基因F3'5'H(类黄酮3',5'羟基化酶)的Hf2基因(1527 bp),从牵牛(Ipomoea nil)花瓣中分离得到dfr基因(二氢黄酮醇4-还原酶,1212 bp),将正向Hf2片段和反向dfr片段连接到pBRLys双元载体质粒上,得到具有Ubi(ubiquitin)组成型启动子的植物表达载体pU-bi-Hf2-dfr.利用冻融法将双价重组质粒pUbi-Hf2一afr导入农杆菌(Agrobacterium tumefaciens)菌株EHA105中,菌落PCR鉴定农杆菌转化子.以中国水仙(Narcissus tazetta var.chinensis)愈伤组织为材料,进行遗传转化.CTAB法提取130株中国水仙遗传转化再生苗的基因组DNA,进行PCR和PCR-Southem blot检测,获得3株阳性转基因植株.  相似文献   

16.
本文以解淀粉芽孢杆菌YN-1菌株为研究对象,利用PCR方法从基因组DNA中扩增出编码TasA抑菌基因的全长DNA,并构建pGEX-4T2/TasA原核表达载体,获得TasA-GST融合表达的抑菌蛋白。测序结果表明,解淀粉芽孢杆菌YN-1TasA基因核苷酸序列全长为786bp(GenBank登录号:EU131674),编码261个氨基酸残基;同源性分析表明,它与解淀粉芽孢杆菌B.amyloliquefaciens FZB42(YP_001421886)序列的同源性最高,达98%,预测蛋白分子量为31kD。SDS-PAGE分析表明,TasA基因能在大肠杆菌BL21中表达,Western印迹分析pGEX-4T2/TasA原核表达载体,检测到约57kD的TasA-GST融合外源蛋白,与预测的融合蛋白分子量大小相符。表达产物细胞裂解液上清经Ni柱层析,表明浓度为500mmol/L咪唑洗脱缓冲液时获得较高浓度和纯度的纯化蛋白。进一步抑菌活性分析表明表达产物对黄瓜灰霉病病原菌检测平板上显示出较好的抑菌活性。本研究结果将为今后深入研究TasA抑菌蛋白基因以及抗病转基因工程提供了参考。  相似文献   

17.
蜡样芽孢杆菌905(Bacillus cereus 905)是从小麦体内分离获得的一株植物有益内生细菌。为从氧自由基毒性角度分析该细菌在植物体内的定殖机制,本研究利用PCR方法得到了B. cereus 905的CuZn-SOD基因全长(sodC)。该基因由537 bp组成,编码179个氨基酸残基。构建表达载体pET-22b-sodC,转化Escherichia coli BL21(DE3),IPTG诱导表达结果表明:该基因表达出的蛋白表现出SOD功能,化学抑制法验证其为CuZn-SOD。  相似文献   

18.
根据前期的研究结果设计PCR引物,从青花菜(Brassica oleracea var.italica)叶片基因组DNA和cDNA中克隆到了查尔酮合成酶基因,定名为BoCHS2.BoCHS2的基因组DNA全长为1267bp,具一个长度为85bp的内含子,基因编码区全长为1182bp,编码393个氨基酸.基因序列已提交至...  相似文献   

19.
The pupal stage of the silkworm Bombyx mori Linnaeus lasts for approximately two weeks. However, prolongation of pupal duration would reduce the labor required to process and dry fresh cocoons. This study investigated the effects of BmKIT(3)(R) gene (from the Chinese scorpion Buthus martensii Karsch) transfer on the pupal development of B. mori using a Gal4/UAS binary transgenic system. Gal4 driven by a pupa-specific promoter BmWCP4 (from a B. mori wing-cuticle protein gene) or PDP (from a B. mori cocoonase gene), and BmKIT(3)(R) driven by a UAS cis-acting element were used to construct novel piggyBac-derived plasmids containing a neomycin-resistance gene (neo) controlled by the Bombyx mori nucleopolyhedrovirus (BmNPV) ie-1 (immediate-early gene) promoter and a green fluorescent protein gene (gfp) under the control of the B. mori actin 3 (A3) promoter. The vector was transferred into silkworm eggs by sperm-mediated gene transfer. Transgenic silkworms were produced after screening for neo and gfp genes, and gene transfer was verified by polymerase chain reaction and dot-blot hybridization. The larval development of the hybrid progeny of Gal4- and UAS-transgenic silkworms was similar to that of normal silkworms, but some pupae failed to metamorphose into moths, and the development of surviving pupae was arrested as a result of BmKIT(3)(R) expression. Moreover, Gal4 driven by the BmWCP4 promoter delayed pupal development more effectively than that driven by the PDP promoter in the Gal4/UAS binary transgenic system. Pupal durations of hybrid transgenic silkworm progeny with BmWCP4 and PDP promoters were approximately 5, 2, and 4 days longer, respectively, compared to corresponding normal silkworms, BmWCP4/Gal4, and UAS/BmKIT(3)(R) transgenic silkworms, respectively. These results suggest new avenues of research for prolonging the pupal duration of silkworms.  相似文献   

20.
摘要:斜纹夜蛾多粒包埋型核型多角体病毒(Spodoptera litura multicapsid nucleopolyhedrovirus,SpltMNPV)bjdp (baculovirus J domain protein) 基因是杆状病毒基因组中唯一编码J 结构域蛋白的基因。利用PCR方法扩增得到此全长基因,将其克隆到5'端有6×His编码序列的原核表达载体pQE30上并转化E. coli M15[pREP4], 在IPTG诱导下表达了一个分子量为36 kD的融合蛋白。以纯化过的6×His-BJDP融合蛋白为抗原,免疫新西兰大白兔,得到该蛋白的抗血清。免疫印迹分析表明,该抗血清能与感染斜纹夜蛾多粒包埋型核型多角体病毒的细胞蛋白样品发生特异性反应。  相似文献   

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