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1.
为了阐明大蜜蜂的群体遗传特征,评价云南地区大蜜蜂的遗传多样性,本研究利用14对微卫星引物对采自云南省的35群野生大蜜蜂进行了群体遗传变异检测和遗传多样性分析。在大蜜蜂群体中共检测到51个等位基因,平均等位基因数为3.642 9,平均有效等位基因数2.809 2,平均期望杂合度为0.573 0,平均多态信息含量为0.524 3。根据Nei’s遗传距离用UPGMA方法对35群大蜜蜂进行亲缘关系分析,结果聚为A,B,C,D共4个支系。结果表明云南大蜜蜂群体遗传多样性相对贫乏,分化程度较低。 相似文献
2.
新疆、甘肃是我国古代丝绸之路的必经之地,同时也是黍稷的主要种植区。研究该地区黍稷种质资源的遗传多样性和群体遗传结构,对于开展黍稷起源进化研究,明确黍稷传播路径具有重要的意义。本研究利用103对SSR标记对来自新疆、甘肃的216份黍稷资源进行了遗传多样性分析,共检测到299个等位基因,平均每个位点产生2.9个等位基因,平均Shannon’s指数为0.7360,平均观测杂合度为0.6298,平均期望杂合度为0.5497,多态性信息含量指数为0.0688～0.7786,均值0.4714,具有中度多态性。216份黍稷资源的近交系数为0.5870,遗传分化系数为0.0383,遗传分化程度很小。甘肃资源的等位基因数、Shannon-Weaver多样性指数、Nei’s期望杂合度和PIC值分别为2.8252、0.7347、0.4501和0.4674,其遗传参数值均大于新疆资源,表明甘肃种质资源的遗传多样性较新疆更丰富。基于遗传距离的聚类分析将216份黍稷资源分为5个类群,类群I～IV共包含7份黍稷资源,与别的资源遗传关系较远; 96%的资源集中于类群V,在遗传距离为0.38处,类群V又分为4个亚群,亚群A和亚群D主要包含甘肃资源,亚群B和亚群C主要包含新疆资源,表明新疆与甘肃资源有明显分离和相互渗透现象。聚类分析与群体遗传结构分析结果相似,均与生态地理分布相关。 相似文献
3.
为研究云南白莺山茶树种质资源的遗传多样性，以白莺山68 份茶树种质为试验材料，进行生物学性状的调查，并采用EST-SSR分子标记毛细管电泳的方法对云南白莺山12 个类型茶树遗传多样性、亲缘关系及群体遗传结构等内容进行研究。结果表明：（1）该群体生物学形态变异非常丰富，涵盖了乔木、小乔木和灌木；大叶种、中叶种和小叶种；叶形有椭圆形、长椭圆形和披针形；芽叶茸毛量呈现从无、少、中、多到特多的连续变化。（2）利用34 对EST-SSR引物进行分子标记分析，表明云南白莺山群体期望杂合度平均值为0.6981，观测杂合度值为0.5982；PIC 信息指数为0.6686，Shannon’s 信息指数为1.6068，有效等位基因数和观测等位基因数分别为4.1761 和9.7353。（3）基于Evanno 统计模型的群体遗传结构分析可将白莺山茶树群体资源分为5 个亚群，5 个亚群间的基因流值为1.8995，群体间遗传分化系数(Fst)0.1163，表明各亚群是一个中度分化的群体，各亚群间存在着基因交流。 相似文献
4.
利用11对SSR分子标记对长柄扁桃10个野生群体遗传多样性和遗传结构进行分析,11对SSR引物共检测到157个等位基因(Na),各位点平均等位基因数(Na)和多态性信息含量(PIC)分别为14.27和0.50;物种水平上的Shannon's信息指数(I)和期望杂合度(He)分别为1.48和0.49。群体水平上的等位基因(Na)、有效等位基因(Ne)、Shannon's信息指数(I)、期望杂合度(He)和观察杂合度(Ho)分别为4.39、2.29、0.92、0.37和0.47;其中内蒙古喇嘛洞群体遗传多样性最丰富,而内蒙古湿壕乡群体遗传多样性最低。分子方差分析(AMOVA)显示长柄扁桃大部分遗传变异来自群体内93%,群体间的遗传变异只占7%。长柄扁桃群体遗传距离为0.03~0.35,平均为0.11;遗传相似度为0.72~0.96,平均为0.89;遗传相似度的聚类分析将供试10个群体划分为4组。研究结果表明,中国长柄扁桃资源具有丰富的遗传多样性,群体遗传分化程度适中,为长柄扁桃资源的合理保护与利用提供了科学依据。 相似文献
5.
《分子植物育种》2021,19(7):2410-2418
六堡茶是中国名茶之一,但针对其原产地野生茶树资源遗传评价与保护研究一直未予足够重视。本研究以六堡茶原产地广西六堡镇及其周边区域的10株野生古茶树和35株子代群体为研究对象,基于19个EST-SSR标记进行基因分型及遗传多样性分析,结果显示:平均每个位点上检测出4.16个等位基因(Na),其中84.21%的SSR位点显示出较高的多态性水平(PIC0.5);古茶树和子代群体的平均等位基因数分别为3.42和3.68,平均有效等位基因数(Ne)为2.60和2.54,平均观察杂合度(Ho)分别为0.52与0.36,平均期望杂合度(He)为分别为0.60与0.55,Nei分别为0.56和0.53,总体上子代遗传多样性略低于亲本群体。六堡茶古茶树按照Nei's遗传距离可分为4组。针对古茶树的Mantel检验表明,遗传距离与地理距离不存在显著相关性(r~2=0.022, p=0.328),表明其不存在明显的空间结构,可能受到较强的人为干扰;古茶树扦插存活率与母树基因杂合度相关性不显著(r~2=0.39, p=0.052),但有随着遗传多样性的增加而提高的趋势。 相似文献
6.
贵州旱稻种质资源的SSR遗传多样性分析 总被引：4，自引：0，他引：4
本研究利用24对水稻微卫星（SSR）标记对源自贵州部分县乡种植以及早期基因库收集的112份地方旱稻材料的遗传多样性进行分析,结果共检出187个等位基因,每个位点的等位基因变幅为4～13个,平均Nei＇s基因多样性指数为0.6431,平均香农指数为1.3669。籼粳亚种均具有较高的遗传多样性,前者稍高于后者,但差异不明显。黔西南州拥有最多的种质,存在丰富的遗传变异,是贵州旱稻种质资源遗传多样性分布中心。分子方差分析表明,旱稻种质总变异的88%是由各地区内的群体间差异造成,地区间和各个群体内的遗传变异较小,均为6%。不同地区旱稻种质的遗传分化程度不一,变幅为2%～18%。聚类分析将供试旱稻材料较为明显地分为籼粳两个类群,而地理分组不明显。 相似文献
7.
高粱微卫星分析中遗传完整性样本量的确定 总被引：3，自引：0，他引：3
采用微卫星分析高粱不同样本量对遗传多样性指数的影响,从而确定最佳样本量,为遗传完整性研究奠定基础。试验设置了10个样本量梯度,对群体的等位基因数目、有效等位基因数目、香农指数、观察杂合度、预期杂合度、多态位点百分数和稀有等位基因频率的变化趋势进行了分析。结果表明,10～40个样本量范围内,等位基因数目、有效等位基因数目、香农指数、多态位点百分数随着样本量的增大而增大;在40个样本量时,等位基因数目、有效等位基因数目和香农指数达到较高值,分别代表了100个群体98.5%的等位基因数、99.1%的有效等位基因数和98.5%的香农指数,之后样本量继续增加,各指标变化不显著。稀有等位基因频率在40个样本量以上,随着样本量的增加数值变化很小。以稀有等位基因频率、等位基因数、有效等位基因数和香农指数为多样性指标,在高粱遗传完整性研究中样本量大小的确定上达到一致性。因此,建议在用SSR技术对高粱进行遗传完整性分析时,样本量要选择40个单株以上。 相似文献
8.
以来自15个不同产地的150份苦参为材料,采用cpSSR分子标记技术探究不同产地苦参种质资源的遗传多样性。结果表明,18对cpSSR引物共扩增出311个条带,检测出97.47个等位基因,平均每对cpSSR引物扩增出17.28个条带。平均检测到的等位基因数（Na）为5.415,有效等位基因数（Ne）为4.395,Shannon?s信息指数（I）为1.535,多样性指数（h）为0.748,无偏多样性指数（uh）为0.832,多态信息含量（PIC）为0.886,PIC>0.5说明18对cpSSR引物具有较高的多态性。不同产地的苦参遗传多样性丰富,其中山西武乡土河坪种质（THP）的I为1.600,Ne为4.786,其他遗传多样性指数均较大,是遗传多样性较丰富的苦参产地。居群分子方差分析（AMOVA）表明,苦参种质内个体间差异大,苦参种质内遗传变异率大于种质间的。聚类分析、主坐标分析（PCoA）和STRUCTURE软件进行的遗传结构分析结果均将不同产地的苦参分为2个类群,并且分类结果有明显的地理相关性。第1类群中的9个苦参种质主要来自山西、河北、陕西和内蒙古等地,第2类群主要来自山东、河南... 相似文献
9.
福建黄兔的遗传多态性及分类 总被引：2，自引：0，他引：2
用8个微卫星标记对福建黄兔的等位基因频率、多态信息含量、杂合度和有效等位基因数等指标进行统计分析,并在此基础上对其进行聚类分析和分类研究。结果表明：（1）8个微卫星标记在所检测的福建黄兔群体中都表现出较丰富的多态性,在6个群体微卫星标记的平均多态信息含量（PIC）为0.6622(0.5723~0.7222),各群体的PIC差异不显著;全部群体平均杂合度为0.6857(0.5904~0.7267)。这显示黄兔群体的多态信息含量、杂合度等指标有较好的一致性,说明福建黄兔品种内在微卫星位点上均具有丰富的遗传多样性。（2）根据奈氏标准遗传距离,并进行UPGMA聚类分析,结果显示6个群体间的遗传变异不大。福建黄兔地方品种在微卫星位点上具有丰富的遗传多样性;从遗传距离及聚类分析结果表明这些群体黄兔属于同一个地方品种。 相似文献
10.
马氏珠母贝选系F4遗传结构和亲缘关系建分析 总被引：3，自引：2，他引：1
为了有效避免因近交引起性状退化,本实验利用微卫星标记分析了选系F4的遗传结构,并估计了其有效亲本的数量。2010年9月,从快速生长系F3选择亲本进行子代繁殖,雌雄亲本数量分别为42和38个,人工解剖授精,按照常规技术进行幼体培育和海区养殖。2011年6月,从选系F4随机选取90个个体,利用45对微卫星引物进行遗传结构分析和有效亲本数量的推断。结果表明：45个微卫星位点共检测到186个等位基因,每个位点的等位基因数在2~9之间,平均每个位点有4.13个等位基因。平均观察杂合度为0.543;平均期望杂合度为0.542;平均Shannon多样性指数为1.012;平均PIC值为0.491。根据基因频率的似然率算法成功的推断出该群体含有30个全同胞家系,用于繁殖选系F4有效亲本数量为60个,有75%的亲本参与了繁殖。世代之间近交系数增量△F=0.83%,F4代群体的近交系数F=3.27%。本研究结果表明：（1）该选系F4具有较高的遗传变异;（2）利用微卫星标记能有效推算选系的有效亲本数量,同时为构建继代群体提供技术支持。 相似文献
11.
不同世代湿地松净光合速率及日进程对氮磷营养的响应 总被引：2，自引：0，他引：2
使用LI-6400便携式光合测定系统,对不同世代湿地松净光合速率值及其日进程对氮磷营养的响应规律进行了研究,结果表明二代种子园苗木的净光合速率与一代种子园、母树林苗木的净光合速率值有极显著差异,通过遗传改良,二代种子园、一代种子园所培育苗木苗期的净光合速率值分别比其低一世代提高了51.29%和9.82%;氮、磷营养施用量过高反而降低了叶片中核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶的活性,因而降低了湿地松的净光合速率值,适量氮、磷营养能明显提高湿地松的净光合速率值,其净光合速率值分别比对照提高70.31%和68.89%;二代种子园、一代种子园、母树林湿地松盆栽苗苗期净光合速率对不同水平N素营养的日响应进程为‘双峰’型,二代种子园湿地松盆栽苗苗期净光合速率对不同水平P素营养的日响应进程有二种模式,一代种子园、母树林湿地松盆栽苗苗期净光合速率对不同水平P素营养的日响应进程为‘双峰’型。 相似文献
12.
麻疯树优树子代苗期主要生长性状变异研究 总被引：1，自引：0，他引：1
为推进麻疯树良种选育水平的不断提高,挖掘麻疯树的遗传改良优良特性,提供种子园、采穗圃等建设优良材料,采用完全随机区组设计,在贵州巧马采育林场和罗甸国营林场开展了主要野生或半野生麻疯树优树子代苗期试验.贵州册亨、贞丰鲁容及鲁贡、望谟乐元及乐康、罗甸和广西隆林、田林8个种源的苗高和地径生长差异不显著,同一种源不同家系差异不显著.巧马试验点80个优树子代的苗高差异显著,地径差异极显著,罗甸试验点24个优树子代的苗高和地径差异都达到极显著水平;苗高变异程度均大于地径,两地的变异系数CV为42.79%和18.59%,而地径为CV17.75%、8.88%.罗甸国营林场试验点的苗高和地径家系遗传力都较高,巧马采育林场试验点的地径家系遗传力高于苗高,两地的苗高家系遗传力为0.29、0.68,地径为0.41、0.68.优树子代的苗高和地径生长差异主要由遗传和环境引起,地径变异程度具有较高遗传控制.麻疯树的良种选育应直接从优树选择开始,通过苗期种源试验对麻疯树的苗高和地径生长量进行选择无效. 相似文献
13.
为了探讨60Co-γ辐射剂量对杉木种子萌发及幼苗生长的影响,本研究以杉木第3 代种子园收集的种子为供试材料,研究了不同剂量的γ射线辐照处理对杉木种子发芽率、发芽时间、出苗率以及诱变苗早期生长的影响。结果表明：20 Gy辐照明显促进发芽,随着剂量的增加发芽率逐渐降低,80 Gy是致死剂量;辐照剂量20~60 Gy之间时,随着剂量的增加发芽时间会逐渐延长,出苗率会逐渐降低;γ射线辐照处理获得的诱变苗株高、地径和分枝数同样受剂量效应的影响,随着辐照剂量的增加,表现在植株矮化,地径变细,分枝数先升高后降低,尤其是40 Gy的辐照剂量能够显著促进分枝。根据辐照剂量与发芽率、出苗率可以初步确定,γ射线辐射杉木种子的半致死剂量在40~60 Gy之间。 相似文献
14.
Levels of genetic variation using 6 enzyme systems for a total of 11 interpretable loci were examined in chickpea (Cicer arietinum) originating from 9locations in Bangladesh. The measurement of genetic variation at enzyme loci was carried out on the seed
embryo, on the early leaves of seedlings and on the mature leaves at the vegetative stage. A total of 592individuals, including
240 seeds, 200 seedlings and152 mature leaves were investigated. Using electrophoretic data, chickpea was found to express
higher percentages of polymorphic loci at the seed stage (36–64%) than at seedling (22–56%) or the vegetative stage (11–44%).
The proportion of mean number of alleles and the average mean observed heterozygosity also were higher at the seed stage when
compared to the seedling and vegetative stages. Unique alleles were absent, and only differences infrequencies could be noticed.
Positive values of the fixation index were noted for pgm-1 and 6pg-1 for all stages and in both mnr loci for the seed embryo's.
A trend towards lower genetic distances of all possible pairs of populations could be observed when comparing those of seed
embryo's with seedlings or mature leaves. This trend was even more pronounced when pooling the data of 9 populations into
their 3regions. Slight differences in genetic distances caused a separative clustering of population 3 at seed embryo, of
population 2 at seedling and of population5 at vegetative stages. It is suggested that careful examination of enzyme polymorphisms
at different developmental stages is a prerequisite before drawing conclusions on the genetic distance between germplasm collections
from different origins since small differences in the data entry for clustering results in ties that may affect tree topologies.
This revised version was published online in July 2006 with corrections to the Cover Date. 相似文献
15.
旨在发掘粳稻育成品种中与种子耐贮性相关联的优异等位变异和携带优异等位变异的载体材料。利用太湖流域和黑龙江省粳稻育成品种构成的群体为实验材料,调查了100 个品种种子耐贮性指数,利用259 对SSR标记对基因组进行扫描,采用Structure 软件进行群体分析,根据GLM(general linear model)方法对标记与耐贮藏性状进行关联分析;并以携带无效等位基因(null allele)材料的表型均值作为对照,鉴别出携带优异等位变异的载体材料。（1）太湖流域粳稻育成品种的耐贮藏能力、遗传多样性高于黑龙江省;（2）与种子耐贮性关联的标记总计有71 个,与苗高关联的SSR标记有17 个,贡献率最大的是RM6811(50.54%),增加表型效应值最大的等位变异是RM5753-215,载体材料为‘台粳16 号选紫’;与根长关联的SSR 标记有26 个,贡献率最大的是RM5753(49.3%),增加表型效应值最大的等位变异是RM5753-207,载体材料为‘垦稻12 号’;与干重关联的SSR 标记有28 个,贡献率最大的是RM5340(50.49%)和M24481 (50.51%),增加表型效应值最大的等位变异是RM180-101,载体材料为‘连粳4号’。 相似文献
16.
西南桦自由授粉子代适应性与斑块大小、遗传多样性间的相关性 总被引：1，自引：0，他引：1
以位于广西靖西土石山生态交错区的9个西南桦斑块为研究对象,通过种子收集、种子萌发与幼苗培育试验,揭示西南桦子代适应性与斑块大小、遗传多样性间的关系.结果表明,种子重量与种子萌发率、胚根长、芽苗长呈极显著正相关(p＜0.01),而仅与移苗后2个月时的苗高及移苗后5个月时的地径呈显著正相关(p＜0.05),说明种子萌发阶段母本效应很明显,而在幼苗生长阶段母本效应逐渐减弱;种子千粒重、萌发特征、幼苗生长表现指标与斑块大小、遗传多样性指标大多呈不显著相关(p＞0.05)或呈显著负相关,而且各石山斑块跟土山大斑块间的地理距离与相应斑块的子代适应性指标大多呈负相关,说明斑块间存在强烈的花粉流,这种相关性规律是斑块大小以及斑块间地理距离等因素共同作用的结果. 相似文献
17.
贵州省花生地方品种的遗传多样性 总被引：3，自引：0，他引：3
为进一步了解贵州花生地方品种的遗传多样性,合理、高效利用花生资源,用50对SSR引物评价了贵州不同地理来源的68份花生地方品种,结果多态性较好的41对引物共扩增出79个等位基因,平均每个引物1.93个;多态性信息量(PIC)变幅为0.045(PM43)~0.951(PM169);Shannon信息指数变幅为0.2518(PM79)~0.6926(PM188),平均0.5268;Nei遗传多样性指数变幅为0.1699(PM79)~0.4995(PM188),平均0.3556。采用类平均法对欧氏距离聚类分析表明,在遗传距离为0.94时将68个花生地方品种分成2个大类,同一地理来源、同一粒型的地方品种的亲缘关系并不是最近的,表明地方品种间亲缘关系与地理来源关系不大。说明贵州花生地方品种具有丰富遗传多样性。 相似文献
18.
Summary InDactylis glomerata L. subsp.lusitanica, triploid and tetraploid plants were obtained by bilateral sexual polyploidization in crosses between diploid parents known to produce 2n gametes. The polyploid and diploid progeny were compared for allozyme diversity (allele number and heterozygosity), phenological (pollen fertility, inflorescence emergence date), cellular (stomatic cell size) and morphological characters (vegetative biomass, seed weight, total seed number per plant, panicle number and seed number per panicle length) in four contrasting growing conditions. Stomatal cell size and the total number of alleles were significantly lower in diploids than in polyploids which sometimes recovered more than two distinct alleles at a locus via 2n gametes possessing heterozygous loci. Pollen fertility was similar in diploids and tetraploids, but significantly lower in the triploids. Seed weight was significantly higher in polyploids, although the average number of seeds per panicle length and the total number of seeds was higher in the diploid sibs. No phenological differences occurred among ploidy levels whereas such differences were observed inDactylis in all the natural areas of sympatry between diploids and their related polyploids. Our results provide evidence for an instantaneous effect of polyploidization on certain traits and suggest that natural selection would act subsequently on several other traits to allow the establishment of new polyploids. 相似文献
19.
小豆遗传差异、群体结构和连锁不平衡水平的SSR分析 总被引：1，自引：0，他引：1
利用57对小豆SSR标记和31对绿豆SSR标记,用5份日本材料作对照,对249份中国小豆种质进行遗传差异、群体结构和连锁不平衡(LD)分析。结果表明,共检测到630个等位变异,SSR位点等位变异数在2~17之间,遗传多样性指数范围为0.024~0.898,平均为0.574。15个不同地理来源群体间表现出显著的遗传多样性差异,其中中国云南最高,河北、天津最低。聚类分析将254份材料划分为3个类群,在一定程度上和地理生态环境相关。LD分析显示和其他作物相比,小豆LD衰减距离较短,最大衰减距离为5.8 cM (R2>0.1),基因组LD平均衰减距离小于1 cM (R2>0.1,P<0.001)。 相似文献