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1.
《分子植物育种》2016,(9)
为了揭示水稻再生力和再生后期耐寒的遗传基础,本研究以"热粳35/协B"226个F2单株为材料,构建了1张含156个SSR标记的分子图谱。分别在水稻成熟、再生和再生后期调查单株穗数、再生穗数和再生后期穗数,利用Excel 2003和MAPMAKER 3.0软件进行性状相关分析和QTL检测。结果表明,3个性状在F2群体呈现连续正态分布,表现为数量性状遗传特征。再生穗数分别与单株穗数和再生后期耐寒穗数呈极显著正相关(0.37和0.36)。3个性状共检测到10个QTLs,分布在第1、2、6、7、8、11和12号染色体上。其中,数6个单株穗QTLs,LOD值介于2.61~79,贡献率介于0.67%~22.72%。2个再生穗数QTLs,LOD值分别为3.08和3.90,贡献率分别为16.01%和23.35%。2个再生后期穗数QTLs,LOD值分别为2.75和5.12,贡献率分别为12.18%和25.12%。3个性状各检测到1对上位性QTL,相同染色体上相同标记区间没有重复检测到同时控制3个性状QTLs。说明3个性状受独立的遗传因子控制,在分子层面上单株穗数、再生穗数以及再生后期耐寒穗数各性状间没相关性。 相似文献
2.
《分子植物育种》2017,(7)
利用TY319/8B的籼粳杂交F3群体的121个单株,对剑叶长、剑叶宽及剑叶长宽比3个性状进行QTL检测,同时利用116对共显性标记对作图群体进行偏分离分析。共定位到6个控制剑叶形态QTL,其中2个剑叶长QTL,3个剑叶宽QTL,1个剑叶长宽比QTL,分别位于第4、第6、第7、第8、第10染色体,LOD值介于2.51~3.44,解释表型变异贡献率介于5.53%~11.44%,所有QTL均为已经报道过的。偏分离结果显示:有39对标记表现为偏分离,占总标记数量的33.62%,同时检测到4个偏分离热点区域,即第1染色体上RM283~RM3738,第3如染色体上InDel8~InDel12,第6染色体上RM510~RM3183,第12染色体上RM1880~RM235。 相似文献
3.
4.
以南方籼型杂交稻恢复系泸恢99和北方粳型超级稻沈农265杂交衍生的重组自交系群体(recombinant inbred lines, RILs)为试验材料, 对株型性状(株高、穗长、分蘖和叶片性状)进行不同环境下的数量性状基因位点(quantitative trait locus, QTL)分析。共检测到39个相关QTL, 分布在水稻第1、第2、第3、第6、第7、第8和第9染色体上, LOD值介于2.50~16.90之间, 有11个QTL能在两年中被检测到。株型相关的QTL在染色体上成簇分布, 主要分布于第1、第6和第9染色体上, 这可能与株型性状间显著或极显著相关有关。其中, 在第9染色体上RM3700B–RM7424区间存在1个QTL簇, 含4个QTL, 即qPH9、qPL9、qFLL9和qSLL9, 这4个QTL在两年中均被检测到。此外, 进一步鉴定出5个能稳定表达的QTL, 其中, qPH8、qFLW6和qSLW6效应较大。这些信息综合反映了株型相关性状遗传的复杂性, 有助于我们更全面地了解和掌握株型性状的遗传基础。 相似文献
5.
为发掘水稻穗部性状有利等位变异,构建了以籼稻保持系II-32B为遗传背景的A7444染色体片段置换系群体;利用QTL Ici Mapping 4.1软件对该群体7个穗部性状进行了QTL定位。结果 2年共检测到26个QTL。2年均检测到的13个QTL中,控制一次枝梗数的4个QTL位于第1、第6、第8和第9染色体,平均贡献率分别为15.16%、13.10%、29.74%和11.21%,平均加性效应分别为-1.40、1.01、1.11和0.77。控制二次枝梗数的2个QTL位于第6和第8染色体,平均贡献率分别为10.97%和21.39%,平均加性效应分别为5.45和6.36。控制每穗总粒数的3个QTL位于第2、第6和第8染色体,平均贡献率分别为8.65%、12.52%和31.22%,平均加性效应分别为-18.61、22.23和31.87。控制每穗实粒数的1个QTL位于第8染色体,平均贡献率为28.06%,平均加性效应30.85。控制千粒重的2个QTL位于第2染色体,平均贡献率分别为44.65%和17.51%,平均加性效应分别为2.88和-2.51。控制粒宽的1个QTL位于第10染色体,平均贡献率为21.96%,平均加性效应为0.11。第2、第6和第8染色体分别存在同时控制二次枝梗数、每穗总粒数和每穗实粒数QTL的区段。qSBN6和qSBN8所在区间与Hd1和DTH8的相同,但分别存在16处和1处碱基差异,推测为Hd1和DTH8的不同等位基因。qSBN2为新检测到的控制二次枝梗数位点。研究结果为实施分子标记聚合育种提供了有用信息。 相似文献
6.
应用SSR标记定位水稻再生力和再生产量及其构成的QTL 总被引：4，自引：0，他引：4
用两个籼稻品种明恢86和佳辐占为亲本建立的F2群体及相应的SSR分子标记连锁图,对水稻再生力和再生产量及其构成的基因进行了定位。结果定位了影响水稻再生力(再生穗数)的1个QTL,影响再生产量的1个QTL和影响产量构成的2个QTL,各QTL的加性效应均来自亲本明恢86,起增效作用。影响水稻再生穗数、结实率和单株产量的QTL位于同一染色体的相同区段上,且加性效应方向相同,这很好地解释了再生穗数与单株产量、结实率呈极显著正相关的关系。 相似文献
7.
利用DH群体动态检测水稻抗褐飞虱数量性状基因位点 总被引：9，自引：0，他引：9
利用籼粳交珍汕97／武育粳2号F1花培获得的190个双单倍体群体(doubled—haploid population,DH系)及其构建的179个SSR分子标记遗传图谱,通过对DH系群体苗期重复接虫试验和2个不同时期对褐飞虱危害程度进行动态调查,并应用Mapmaker／exp Version3．0和Windows QTL Cartographer V2．0对水稻抗褐飞虱数量性状基因位点(quantative trait locus,QTL)进行动态检测和遗传效应分析。结果表明,在苗期对褐飞虱抗性的检测中,共检测到6个抗性QTL,分别位于第2、3、4、8和10染色体上,各QTL的LOD值分别为2．22-4．64,贡献率为5．04％～13．73％,第3染色体和第4染色体上各有1个OTL的加性效应为正值,表明来自于亲本武育粳2号的这2个位点的等位基因可以提高水稻对褐飞虱的抗性,其余4个QTL的加性效应均为负值,表明来自于亲本珍汕97的这些位点的等位基因可以提高水稻对褐飞虱的抗性。 相似文献
8.
水稻剑叶角度与主穗产量的遗传剖析 总被引：2，自引：0，他引：2
理想水稻株型的选育与高产育种密切相关,而剑叶角度则是构成水稻理想株型的重要指标之一,同时也是影响水稻产量的重要因素。合理开发利用水稻中控制剑叶角度及产量相关的数量性状基因座位（QTL）,并结合分子育种技术,可更好地为高产制繁种目标服务。通过应用由244个株系组成的珍汕97B/密阳46重组自交系（RIL）群体,构建含256个分子标记的连锁图谱,采用QTL区间作图法对剑叶角度及主穗产量等5个性状进行定位分析,共检测到17个QTL,分布于染色体1、2、3、5、6、9、10、11。这些QTL对相应性状的贡献率介于3.46%~25.64%之间。在第1染色体上检测到控制5个性状的QTL,其中控制剑叶角度的两个QTL;在第2、3、9、10、11染色体上分别检测到各一个QTL;第5染色体上检测到控制剑叶、每穗总粒数和每穗实粒数的3个QTL;1个每穗实粒数和2个每穗实粒重的QTL分布于第6染色体上。多个区间表现出对两个性状的显著作用,其中第1染色体2个,第6染色体1个。相关性分析表明,较小的剑叶角度可通过提高结实率进而显著增加产量。 相似文献
9.
应用籼稻品种明恢86和佳辐占为亲本建立的F2群体及相应的SSR分子标记连锁图,用区间定位法的Additive和Free两种模型分别对水稻部分重要农艺性状和产量构成性状的QTL进行了定位分析.结果Additive模型共检测到3个QTL,均位于第1号染色体的RM1-RM283区间,分别控制水稻生育期、株高和每穗粒数,基因成簇分布.Free模型共检测到5个QTL,其中控制水稻生育期、株高和每穗粒数的3个QTL的位置和效应大小与Additive模型基本相同;另外还检测到2个影响结实率和千粒重的QTL分别位于第7号染色体的RM180-RM214和第2号染色体的RM279-RM154区间,其贡献率均较小.同时,分析比较了研究结果与前人不同的原因. 相似文献
10.
以东乡普通野生稻和日本晴为亲本构建的染色体片段置换系为研究材料,2019年分别在北京、山东临沂和江西南昌对分蘖数、穗粒数和粒形等11个产量相关性状进行多环境鉴定,结合染色体片段置换系基因型数据定位水稻产量相关性状QTL。3个环境共检测到68个QTL,包括株高4个、穗长5个、分蘖数2个、一次枝梗数7个、一次枝梗粒数8个、二次枝梗数8个、二次枝梗粒数10个、每穗粒数6个、千粒重7个、粒长8个和粒宽3个;LOD值介于2.50~12.66之间,贡献率变幅为4.67%~27.79%,15个QTL的贡献率大于15%;24个QTL与已报道位点/基因位置重叠,44个QTL为新发现位点;6个QTL在2个环境能被检测到,1个QTL qTGW2能在3个环境检测到,且是还未报道的新位点。最后,利用BSA法验证了qPH7、qPBPP8-2和qGW10三个QTL的可靠性。本研究将为后续产量相关性状基因克隆以及进一步解析其遗传基础和分子调控机制奠定基础。 相似文献
11.
Kiyosumi Hori Tomomori Kataoka Kiyoyuki Miura Masayuki Yamaguchi Norikuni Saka Takahiro Nakahara Yoshihiro Sunohara Kaworu Ebana Masahiro Yano 《Breeding Science》2012,62(3):223-234
To identify quantitative trait loci (QTLs) associated with the primary target traits for selection in practical rice breeding programs, backcross inbred lines (BILs) derived from crosses between temperate japonica rice cultivars Nipponbare and Koshihikari were evaluated for 50 agronomic traits at six experimental fields located throughout Japan. Thirty-three of the 50 traits were significantly correlated with heading date. Using a linkage map including 647 single-nucleotide polymorphisms (SNPs), a total of 122 QTLs for 38 traits were mapped on all rice chromosomes except chromosomes 5 and 9. Fifty-eight of the 122 QTLs were detected near the heading date QTLs Hd16 and Hd17 and the remaining 64 QTLs were found in other chromosome regions. QTL analysis of 51 BILs having homozygous for the Koshihikari chromosome segments around Hd16 and Hd17 allowed us to detect 40 QTLs associated with 27 traits; 23 of these QTLs had not been detected in the original analysis. Among the 97 QTLs for the 30 traits measured in multiple environments, the genotype-by-environment interaction was significant for 44 QTLs and not significant for 53 QTLs. These results led us to propose a new selection strategy to improve agronomic performance in temperate japonica rice cultivars. 相似文献
12.
杂交中稻再生力与头季稻农艺性状的相关性研究 总被引：6，自引：1，他引：6
为探明杂交中稻再生力与头季稻农艺性状的关系，给强再生力品种（组合）的选择提供依据，选用229个杂交组合，经3次试验，再生力与头季稻性状的相关及通径分析表明，⑴能体现碳水化合物遗留量的成熟期单茎茎鞘干重，对再生力的直接效应最大或接近最大，两者呈极显著正相关，且其回归方程具较好的预测功能，故可将茎鞘干重作为衡量杂交中稻组合再生力的重要指标。⑵对群体生态环境影响较大的穴有效穗数，与再生力的简单负相关均不显著，偏相关却均极显著，直接效应亦较大，显示其是影响再生力的重要性状。⑶与再生力呈负相关的株高、剑叶长度、穗着粒数、穗实粒重、成熟期以及呈正相关的分蘖力，3次试验的效应均不一致，说明它们对再生力的影响不够稳定。 相似文献
13.
利用已测序水稻品种分析其农艺性状基因座 总被引：1，自引：1，他引：1
水稻重要农艺性状的基因定位研究在育种上具有重要意义。2004年在海南陵水县种植两个完全测序水稻品种日本晴与9311的F2群体及双亲，分别考察了其单株分蘖数、穗数、有效分蘖数、穗长、主穗长、抽穗期、株高和剑叶8个农艺性状3次重复的平均值。用已构建的连锁遗传图谱（Nipponbare/9311-F2遗传图谱）及Excel 2000和Mapmaker/QTL 1.1b软件对这8个性状间的相互关系和基因位点进行了分析。结果在LOD>2.0和P＜0.005的条件下共检测到41个QTLs，它们分布在水稻所有染色体上，单个QTL对性状表型贡献率11.0%～46.4%，其中大于20%的有22个。对选用已测序材料为亲本构建图谱来探讨水稻农艺性状的分子基础及其育种意义进行了讨论。 相似文献
14.
15.
Xinhua Zhao Yang Qin Baoyan Jia Suk-Man Kim Hyun-Suk Lee Moo-Young Eun Kyung-Min Kim Jae-Keun Sohn 《Journal of Crop Science and Biotechnology》2010,13(4):235-241
Two genetic linkage maps based on doubled haploid (DH) and recombinant inbred lines (RILs) populations, derived from the same
indica-japonica cross ‘Samgang × Nagdong’, were constructed to analyze the quantitative trait loci (QTLs) affecting agronomic traits in rice.
The segregations of agronomic traits in RILs population showed larger variations than those in DH population. A total of 10
and 12 QTLs were identified on six chromosomes using DH population and seven chromosomes using RILs population, respectively.
Three stable QTLs including pl9.1, ph1.1, and gwp11.1 were detected through different years. The percentages of phenotypic variation explained by individual QTLs ranged from 8
to 18% in the DH population and 9 to 33% in the RILs population. Twenty-three epistatic QTLs were identified in the DH population,
while 21 epistatic QTLs were detected in the RILs population. Epistatic interactions played an important role in controlling
the agronomic traits genetically. Four significant main-effect QTLs were involved in the digenic interactions. Significant
interactions between QTLs and environments (QE) were identified in two populations. The QTLs affecting grain weight per panicle
(GWP) were more sensitive to the environmental changes. The comparison and QTLs analysis between two populations across different
years should help rice breeders to comprehend the genetic mechanisms of quantitative traits and improve breeding programs
in marker-assisted selection (MAS). 相似文献
16.
越冬栽培稻是一类能越过自然冷冬季节并在第2年春季萌芽、正常开花结实、收获稻谷的水稻品种。本文通过对越冬栽培稻产量性状QTL分析,明确产量相关性状的遗传规律,旨在进一步解析越冬栽培稻产量性状的遗传机制,为育种创新利用提供理论依据。以3份越冬栽培稻构建的3个半同胞F2群体为材料。各考察15个产量相关性状,利用Excel 2003、GraphPad Prism 5.0和QTL IciMapping 4.10软件分析数据、绘制遗传图谱、定位QTL和联合分析。结果表明,产量性状表型值在3群体中呈连续正态分布,表现为数量性状遗传。共检测到37个QTL和26对上位性QTL,贡献率分别介于2.32%～36.31%和1.04%～2.05%;检测到9个同时影响2个及以上产量性状(一因多效)QTL标记区间;以联合分析检测到13个产量性状相关QTL,其中4个QTL区间与单群体检测QTL区间重叠;越冬栽培稻产量相关性状QTL以加–显性效应遗传为主、上位性遗传效应为辅。本研究将为越冬栽培稻产量相关基因挖掘及育种创新利用奠定基础。 相似文献
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QTL analysis of cooked rice grain elongation, volume expansion, and water absorption using a recombinant inbred population 总被引：7，自引：0，他引：7
The traits of elongation, volume expansion, and water absorption are very important in determining the quality of cooked rice grains. In this study, quantitative trait loci (QTL) analysis of these traits was performed using a recombinant inbred population derived from a cross between two indica cultivars, ‘Zhenshan 97’ and ‘Minghui 63 ,’ which are the parents of the most widely grown hybrid rice in China. Using a linkage map based on 221 molecular marker loci covering a total of 1796 cM, a total of 33 QTLs were identified for the nine traits tested. QTLs were detected on chromosomes 1– 3 , 5– 9 , and 11 , respectively. The QTLs identified included three for cooked rice grain length elongation (chromosomes 2 , 6 , and 11), six for width expansion (chromosomes 1‐ 3 , 6 , 9 , and 11) and two for water absorption (chromosomes 2 and 6). Interestingly, a single QTL located near the wx gene on chromosome 6 seemed to influence all the traits tested for the cooked rice quality. 相似文献
18.
水稻再生能力和头季稻产量性状的QTL定位及其遗传效应分析 总被引：30，自引：2，他引：30
对籼稻窄叶青８号和粳稻京系１７杂交Ｆ１的花药进行离体培养，获得了１个含１３３个ＤＨ系的作图群体，通过构 建分子连锁图谱，对水稻再生能力，头季稻产量及其构成因子的ＱＴＬ进行区间作图。 相似文献
19.
水稻产量事关粮食安全,对水稻高产基因的进一步挖掘意义重大。本研究采用花药培养技术,构建了包含101个株系的中嘉早17×D50的加倍单倍体群体(DH群体)。考察海南陵水、浙江杭州高产田块和杭州山区低产田块3种种植环境下DH群体各株系、亲本中嘉早17和D50的有效穗数、每穗粒数、结实率以及千粒重等产量相关性状,同时构建DH群体的遗传连锁图谱。QTL定位分析表明,3种种植环境下共检测到74个具有显著加性效应的QTL,其贡献率变幅为3.7%~43.2%,分布于水稻12条染色体。其中,qPH1-1和qFLL12在3种种植环境下均被检测到,其贡献率分别为8.9%、24.2%、43.2%和16.6%、17.9%、18.9%。此外,qPH3、qFLL10-2、qFLW11-1、qPL11、qGNP11、qSSR3以及qTGW5-17个QTL在其中2种种植环境下被同时检测到,其贡献率变幅为7.4%~42.2%。QTL×环境互作分析表明,仅qPH1-1、qFLW2、qEPP1和qTGW5-14个QTL存在显著的加性×环境互作效应。进一步对qTGW5-1定位区间所包含的GW5测序分析表明,高产株系和低产株系的GW5等位基因分别来自亲本中嘉早17和D50,这与检测到的qTGW5-1的加性效应来自亲本中嘉早17相符。本研究为今后水稻产量相关基因的进一步挖掘以及借助分子聚合育种培育超高产品种提供了理论依据和技术支撑。 相似文献
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摘 要：[目的]研究稻作抗旱的根系特征及其遗传机理,发掘旱稻有利基因,从水旱稻杂交中选育高产耐旱的稻作品种提供理论基础和研究材料。[方法]以旱稻豪格劳为供体亲本,水稻沈农265为受体亲本,利用187个SSR标记构建了一套具有180个家系的旱稻渗入系群体,并采用单标记分析法,对拔节期根系6个性状：最长根长、粗根数、总根数、平均最粗根粗、根干重、总干重进行QTL定位。[结果]抽穗期共检测到QTL38个,其中影响上述六个性状的QTL数目分别是6、6、4、6、4和12,它们的总贡献率分别为29%、27%、21%、33%、23%和61%。除此,在粗根数和总根数中分别检测到3个和1个来自豪格劳的等位基因的加性效应为负,其余均为正。除平均根粗外,其它5个性状的加性效应都较大。[结论]89.5%的渗入位点对以沈农265为遗传背景的渗入系的6个性状根系有促进作用;定位到的影响不同根系性状的QTL多数成簇、集中分布;RM3853附近定位到影响四个性状的QTL,推测是一个在抽穗期与根系性状和抗旱密切相关的基因簇。 相似文献