平胸龟2个地理种群遗传差异的比较   总被引：1，自引：0，他引：1  

郑光明  马丽莎  朱新平  刘毅辉  陈永乐  罗建仁 《华中农业大学学报》2008,27(4)

利用25个随机引物对平胸龟2个种群共49个个体分别进行PCR扩增,结果显示:平均每个个体扩增出209条DNA带,平均每个引物可产生8条带,扩增谱带分子质量大小在100～2000 bp之间,多态性比例为72.13%.其中12条引物扩增出16个特异于不同种群的DNA片段,可作为鉴别广东或福建种群的分子标记.用RAPD1.04和Genepop3.2软件分析所得谱带,得出广东、福建2个地理种群的平胸龟具有较高的遗传多样性,且广东种群的遗传多样性高于福建种群.2个种群间的平均遗传距离为0.278 6±0.025 9,遗传分化指数Gst为0.285 7.NJTREE聚类分析显示广东和福建2个地区的平胸龟各自聚成2个类群,有较明显的种群分化.  相似文献   

中国芸芥栽培品种亲缘关系的RAPD分析   总被引：4，自引：0，他引：4  

钟军  李栒  官春云  戴林健  熊兴华  刘春林  周小云 《中国农业科学》2004,37(10):1434-1438

 用100个随机引物对18个芸芥品种的基因组DNA进行扩增,结果有10个随机引物得到了稳定一致的RAPD谱带,扩增出的谱带数在2～17条之间,共扩增出91条谱带;采用UPGMA法对扩增出的谱带进行遗传聚类分析,在遗传距离(D)=0.1333处,将供试芸芥品种分为2类8组,揭示了供试芸芥品种的亲缘关系。  相似文献   

基于RAPD和SRAP分子标记的柑桔大实蝇种群多态性及其亲缘关系研究          下载免费PDF全文

刘浩强  张云飞  李鸿筠  冉春  胡军华  姚廷山  王进军  赵志模 《西南大学学报(自然科学版)》2014,36(11):049-056

目的:利用RAPD(Random AmplifiedpolymorphicDNA)和SRAP(Sequence-RelatedAmplifiedPolymorphism) 分子标记技术,研究来自重庆、湖北、四川和陕西4省市10个地理种群柑桔大实蝇的亲缘关系.方法:利用 10条RAPD引物和5对SRAP引物对10个不同地理种群柑桔大实蝇的基因组DNA 进行扩增,统计多态性谱带, 然后运用DPS统计分析软件进行遗传多态性及聚类分析.结果:10条RAPD 引物扩增产生152条清晰稳定的谱 带,其中多态性谱带132条,多态性谱带的比例为86.84%;不同地理种群间的遗传距离在0.2500~0.6250之间, 10个地理种群的柑桔大实蝇被划分为4个大类群.5对SRAP引物扩增共获得66条重复性好的清晰谱带,其中多 态性谱带60条,多态性谱带比例为90.91%,不同地理种群间的遗传距离在0.2000~0.7895之间,10个地理种 群的柑桔大实蝇被分为5个大的类群.将RAPD和SRAP两种标记的数据整合,聚类结果显示,10个地理种群的 柑桔大实蝇被划分为6个大类群.结论:柑桔大实蝇不同地理种群间具有丰富的遗传多样性,两种方法结合分析更 能准确地反映不同地理种群间的亲缘关系.  相似文献   

黄瓜细菌性白枯病遗传多样性RAPD分析     

刘震  刘长远  赵奎华  梁春浩  关天舒  王辉  李柏宏 《沈阳农业大学学报》2010,41(6)

通过40条随机引物10碱基寡核苷酸链随机引物进行筛选,得到8条随机引物能够扩增出谱带清晰,带型稳定且具有多态性DNA片段,对分离的黄瓜细菌性白枯病8个菌株进行RAPD分析。结果表明:供试菌株共产生65条谱带,其中45条为多态性带,占谱带总数的69.23%;利用UPGMA法对DNA扩增图谱进行聚类分析,以遗传距离0.695为阈值,将8个供试菌株分为2种遗传类型。可见,黄瓜细菌性白枯病具有遗传多样性,遗传多样性与地理区域表现出明显的相关性。  相似文献   

丝瓜种质资源亲缘关系的ISSR分析   总被引：2，自引：0，他引：2  

苏小俊  徐海  陈龙正  宋波  袁希汉  陈劲枫 《南京农业大学学报》2010,33(3)

利用ISSR标记,对来源于不同地区的丝瓜种质资源的亲缘关系进行了分析.从80个ISSR引物中筛选出多态性强、重复性好的9个引物,对43份丝瓜种质基因组DNA进行扩增,共扩增出60条谱带,平均每个引物扩增出6.67条带,其中多态性带47个,多态性位点百分率为78.3%.丝瓜种质间遗传相似系数变化范围在0.37～0.98之间,暗示了丝瓜栽培种内的遗传基础相对狭窄.利用UPGMA聚类分析,43份丝瓜种质被划分为6个类群,类群的划分与形态学性状较吻合,而且与地理来源也有较高的相关性.  相似文献   

兰花基因组DNA多态性RAPD分析   总被引：8，自引：0，他引：8  

谢伟  乐超银  郭政宏  何正权  梁薇  梁宏伟  姚伟 《湖北农业科学》2006,45(1):24-26

利用随机扩增多态DNA技术(RAPD)对兰属的3个品种春兰、春剑、蕙兰进行了分析与研究,建立了它们之间的DNA指纹图谱,找到了参试样品的特征谱带,并探讨它们之间的亲缘关系.结果从20条BA系列引物中筛选出能稳定扩增的10个引物,且对3个品种的植株进行扩增,共扩增出257条,其中243条具有多态性,分析结果表明春剑与春兰的相似系数较之与蕙兰的相似系数要高.  相似文献   

濒危植物天目铁木遗传多样性的RAPD分析   总被引：3，自引：0，他引：3  

王祖良  丁丽霞  赵明水  程晓渊  沈乾 《浙江林学院学报》2008,25(3):304-308

濒危植物天目铁木Ostrya rehderiana现仅在天目山残存5株野生植株,是国家一级保护植物。为研究该物种繁殖与复壮的有效途径,利用随机扩增多态性DNA（RAPD）标记,对这5株天目铁木的遗传多样性和遗传分化进行基因组DNA多态性分析,统计18个扩增较为稳定的引物在5个DNA样品中扩增的电泳带总数与多态带的数目。结果显示：共扩增出176个DNA片段,片段大小为200~2 800 bp,其中多态性谱带为88条,占50%,表现出了丰富的RAPD多态性。根据遗传距离,利用UPGMA构建了个体亲缘关系树状图。结果表明,4号和5号植株间亲缘关系最近,遗传距离为0.133 5,1号和3号植株间亲缘关系最远,遗传距离为0.461 0,1号植株与其他4株的亲缘关系均较远,遗传距离为0.366 5~0.461 0,聚类时被聚在其他4株之外。这一结果与5株间物理距离分布的位置差异相符。  相似文献   

不同核桃品种的SSR分析   总被引：4，自引：0，他引：4  

杨本芸  杨敏生  梁海永  刘军辉 《河北农业大学学报》2008,31(4)

应用SSR技术对21个核桃品种和1个枫杨品种的基因组DNA进行遗传多样性的研究。用筛选出的10对引物对供试材料进行SSR分析,共扩增出67条清晰的谱带,不同引物扩增出的DNA条带数量在4～24条之间,分子量大小在85～300 bp之间,依据特征谱带,可直接鉴别出供试品种,其中引物WGA32的鉴别效率最高。对扩增出的67条带进行聚类分析,结果表明,普通核桃和枫杨亲缘关系较远,不同地域起源的品种界限不明显。  相似文献   

7种芸香科植物的RAPD分析     

桂茜  蒋昊  阮颖 《安徽农业科学》2016,(30):101-103

[目的]构建芸香科植物7个种12个材料的聚类分析树状图,为芸香科植物系统学的研究提供分子水平上的证据。[方法]以芸香科植物7个种12个材料为研究对象,利用RAPD技术对其亲缘关系进行分析。[结果]在建立适合芸香科植物PCR-RAPD反应体系的基础上,从21条随机引物(10 mer)中筛选出10个,对所有供试材料进行扩增,共获得10张DNA指纹图谱,85条DNA谱带,其中84条为多态带,多态性谱带比例为98.82%。[结论]建立了基于RAPD的芸香科植物亲缘关系树状图,该结果与经典的芸香科植物的起源、分类基本一致。  相似文献   

德州驴RAPD遗传多态性分析   总被引：1，自引：0，他引：1       下载免费PDF全文

刘娟  焦传珍 《广东农业科学》2010,37(11):213-214

采用RAPD技术探讨了德州驴的遗传多态性。从20条随机引物中筛选出8条引物对德州驴56个个体的基因组DNA进行随机扩增。结果表明,8条随机引物共扩增产生了784条谱带,其中多态性条带为165条,多态比率在11.1%～37.5%之间;与其他驴的遗传多样性研究结果相比,德州驴的遗传多样性处于中等水平。  相似文献   

藏獒随机扩增多态DNA分析     

兰小平  黄晶  杨俊年  唐韦华  谢元平  康景红  鄢珣 《河南农业科学》2010,(4)

采用随机扩增多态DNA技术,对不同品种的20只藏獒个体之间的亲缘关系进行了分析。从80条随机引物中筛选出了27条引物,共扩增出369条条带,其中339条表现出多态性,多态性位点百分率为91.87%。根据20只藏獒个体之间的遗传距离,用UPGMA法构建了聚类分析图。结果表明,河曲藏獒和青海藏獒同类群个体之间亲缘关系较近,在聚类图上形成了河曲藏獒类群和青海藏獒类群各自独立的分支,这一结果有力地支持了按地域对藏獒进行类群划分的说法。  相似文献   

禾谷镰孢复合种毒素化学型及遗传多样性分析   总被引：5，自引：3，他引：2  

马红霞  孙华  郭宁  张海剑  石洁  常佳迎 《中国农业科学》2018,51(1):82-95

【目的】明确不同省（自治区）引起玉米穗腐病的禾谷镰孢复合种（Fusarium graminearum species complex,FGSC）的毒素化学型和它们之间的遗传差异以及亲缘关系。【方法】选用根据基因Tri13和Tri3序列设计的特异性引物分析来自11个省（自治区）的92株禾谷镰孢复合种菌株的毒素化学型;从100条哥伦比亚大学（UBC）开发的通用引物中筛选出13 条扩增条带丰富、重复性好、信号强、背景清晰的引物,利用筛选出的引物对供试菌株进行ISSR-PCR扩增,使用Popgen32软件计算多态性位点百分率、Shannon’s多样性指数、群体间的遗传距离和遗传相似性;依据Nei’s 遗传距离,利用NTsys2.10e软件进行UPGMA聚类分析,并构建供试菌株的聚类图。【结果】供试的92株禾谷镰孢复合种菌株的产毒素化学型有4种：DON、15-ADON、DON+15-ADON和NIV+15-ADON。其中产生DON和15-ADON的菌株分别为1株和20株;同时产生15-ADON和NIV的有1株;同时产生15-ADON和DON的有55株。筛选出的13条引物对所有供试菌株进行PCR扩增,共获得102条带,其中多态性条带101条,多态性比率为99.02%,平均每条引物产生条带为7.85条。在群体平均水平上,基因多样性指数（H）为0.3129,Shannon’s的信息指数（I）为0.4774,表明禾谷镰孢复合种存在较高的遗传多样性水平;不同地理种群间,各群体的遗传多样性水平具有一定差异,河北、山西、黑龙江和吉林种群遗传多样性最高,安徽和河南种群最低。地理种群间的基因分化系数（Gst）为0.2722,说明不同地理种群间存在一定的遗传变异,但大部分遗传变异（72.78%）发生在种群内。遗传分化系数估算的基因流值Nm=1.3372（＞1）,表明不同地理种群间存在一定的基因流动;遗传关系结果表明河北、山西、黑龙江、吉林、辽宁、内蒙古和甘肃菌株群体间亲缘关系较近,山东、江苏、河南和安徽菌株间亲缘关系较近,安徽和内蒙古菌株间的亲缘关系最远。聚类分析显示所有菌株相似系数为0.43-0.95。在相似系数为0.43时,所有菌株分成2大类群,Group 1包括4株北方春播区菌株（吉林、山西和河北张家口）,不产生NIV和DON;Group 2由余下的88株菌株构成,产生的毒素类型主要为DON和15-ADON,其来源于北方春播区（山西、黑龙江、吉林、辽宁、甘肃和河北张家口、唐山）和黄淮海夏播区（河北石家庄、河南、山东、江苏和安徽）,在相似系数为0.664时,各类群分成不同的亚群,亚群的结果与菌株来源有一定的相关性。聚类分析结果和毒素化学型分析显示,同一地理种群的菌株多数聚在一起,个别菌株分散到不同的分支上。【结论】北方春播区和黄淮海夏播区的禾谷镰孢复合种主要的毒素化学型为DON和15-ADON。引起玉米穗腐病的禾谷镰孢复合种菌株群体内存在丰富的遗传变异,不同地理种群间存在一定的基因交流,遗传多样性与地理来源有关。  相似文献   

黄淮海地区夏玉米弯孢叶斑病菌遗传多样性分析   总被引：1，自引：1，他引：0  

常佳迎  刘树森  马红霞  石洁  郭宁  张海剑 《中国农业科学》2019,52(5):822-836

桂林大旗瓣凤仙花遗传多样性的ISSR分析     

李祥军  唐文秀  黄仕训 《广东农业科学》2013,40(13):142-144

采用ISSR分子标记技术对桂林3个居群的30份大旗瓣凤仙花样品进行遗传多样性分析,结果表明,6个被筛选到的ISSR引物共扩增出52条谱带,其中47条为多态带,多态率达90.38％,表明桂林大旗瓣凤仙花资源的遗传多样性非常丰富.居群间遗传分化系数为0.04838,基因流为2.8626,表明居群间存在较低的遗传分化,这可能主要是由其繁育特性造成的.聚类分析结果表明,采自同一产地的不同大旗瓣凤仙花样品未能严格聚合在一起,此结果可能是由于采样地地理距离较近或者花粉的传播方式所致.  相似文献   

滇西北部分悬钩子属植物亲缘关系的ISSR分析   总被引：2，自引：0，他引：2  

和志娇  和加卫  程在全  杨正松  李燕  杨燕林  杨洪涛 《西北农业学报》2011,20(11):164-169

利用ISSR分子标记研究滇西北39种悬钩子属植物的亲缘关系,从100个引物中筛选出12个能扩增出清晰带型并具多态性的引物,共扩增出166条DNA片段,片段大小为259～2 300 bp,平均每条引物扩增出13.83 条DNA片段,多态性比率为95.78%.利用NTSYS-pc软件计算39种悬钩子属植物种间的Nei's距离,并用UPGMA 法构建系统树.结果表明,39份供试材料明显聚为5大类:即空心莓组、木莓组、刺毛莓组、矮生莓组和葡匐莓组,与形态学的分类结果基本一致.39个悬钩子属植物种间的遗传距离为0.452 8～0.941 1,说明滇西北悬钩子植物在DNA分子水平上具有丰富的遗传多样性.另外,UPGMA聚类结果表明,形态学分类上的同组不同种间具有较近的亲缘关系,不同组的种间具有复杂的遗传差异.  相似文献   

海南不同地理群体羊鲍18SrDNA的克隆与序列分析   总被引：1，自引：0，他引：1  

杨文杰  黄勃  王仁恩  张钰 《安徽农业科学》2012,40(20):10370-10373

[目的]对海南不同地理群体羊鲍18S rDNA进行克隆,并对其进行序列分析。[方法]采用分子生物学的方法,对海南不同海区的2个羊鲍地理群体18S rRNA基因全长进行克隆和序列分析,并将得到的羊鲍18S rRNA基因序列与同海域耳鲍的进行比较。[结果]同一地理群体内羊鲍核糖体18S rRNA基因序列完全一致;不同地理群体间羊鲍核糖体18S rRNA基因在碱基组成上的相似率为99.5%,仅在某些位点处发生了碱基替换,即腺嘌呤(T)被鸟嘌呤(G)替换;同时,将这两个不同群体中羊鲍的18S rRNA基因与同一海域耳鲍18S rRNA基因序列进行比较分析发现,它们之间也只是发生了碱基替换。[结论]为海南鲍鱼特别是羊鲍的遗传多样性、遗传结构、种质鉴定及其种质资源的保护和利用等方面的研究提供可靠依据。  相似文献   

应用ISSR-PCR对西伯利亚红松19个种源的遗传多样性分析   总被引：18，自引：0，他引：18  

杨传平  魏利  姜静  刘桂丰  赵光仪 《东北林业大学学报》2005,33(1):1-3

应用简单重复序列区间扩增多态性(inter-simple sequence repeats，ISSR)技术，以引种俄罗斯的西伯利亚红松(Pinus sibirica Du Tour)不同地理分布区的19个种源为材抖，筛选出12个引物，获得总位点数148条，其中多态位点数136条，多态位点比率为91．89％。遗传多样性研究结果表明：种源的平均多态位点比率为26．48％，具有高的遗传多样性(Shannon指数(Ⅰ)平均值为0．1563)；种源间存在一定程度的基因流动(Nm为0．2461)和遗传分化(Nei指数平均值为0．1068，Gst平均值为0．3298)；种群内的基因多样性占总群体的67．02％，种群间占32．98％。综合UPGMA聚类分析、地理变异规律及生态类型，种源划分结果为：西萨彦-阿尔泰山地生态区种源；东西伯利亚南部高原生态区种源；西西伯利亚平原生态区种源。  相似文献   

海南三亚和黄淮海地区玉米小斑病菌致病性及遗传多样性分析     

常佳迎  刘树森  石洁  郭宁  张海剑  马红霞  杨春凤 《中国农业科学》2020,53(6):1154-1165

【目的】明确海南三亚玉米南繁基地和黄淮海玉米主产区的玉米小斑病菌（Bipolaria maydis）菌株的致病性差异,以及遗传多样性和亲缘关系的远近,为海南三亚南繁基地育种过程中玉米品种的抗病性筛选提供理论依据,并对玉米品种在黄淮海地区的推广种植提供参考。【方法】对采集自海南三亚和黄淮海地区的玉米小斑病病叶进行病原菌分离,经过形态学和分子生物学方法对分离到的菌株进行鉴定,共获得61株玉米小斑病菌菌株。采用人工喷雾接种法对61株小斑病菌菌株的致病力进行鉴定;并选取16条扩增条带清晰、重复性好、多态性高的引物进行ISSR-PCR扩增,利用Popgen32生物软件计算群体间的遗传距离和遗传相似性,并利用NTsys2.10e软件进行聚类分析,构建海南三亚与黄淮海地区小斑病菌的聚类图。【结果】致病性测定结果表明,海南三亚地区未分离到弱致病力菌株,强致病力菌株个数占三亚地区总菌株的57.1%;黄淮海地区分离到的弱致病力菌株占黄淮海地区总菌株的47.5%,强致病力菌株占黄淮海地区总菌株的17.5%。遗传多样性分析结果表明,在群体平均水平上,Nei’s基因多样性指数（H）为0.2820,Shannon’s信息指数（I）为0.4197,表明玉米小斑病菌具有一定的遗传变异;不同地理种群间的遗传相似系数为0.9028—0.9618,遗传距离为0.0390—0.1023,表明整体遗传相似系数较高,遗传距离较近;但不同地理种群间仍存在不同程度的遗传分化,其中,河南与河北的菌株群体遗传相似系数最高（GS=0.9618）,亲缘关系最近;河南和三亚地区的菌株群体遗传相似系数最低（GS=0.9028）,亲缘关系相对较远。聚类分析结果表明,三亚地区菌株和黄淮海地区菌株在相似系数为0.722时,明显被分为两大类群。【结论】黄淮海玉米主产区与海南三亚玉米南繁基地的玉米小斑病菌在致病力上存在一定差异,三亚地区强致病力菌株的分离频率高于黄淮海地区。黄淮海地区与三亚地区的菌株群体具有丰富的遗传多样性,且遗传多样性与地理来源有一定关系,地域相邻的菌株遗传关系较近;但三亚地区与黄淮海地区的菌株遗传相似系数相对较高,亲缘关系较近,且两种群间存在一定基因交流。因此,三亚地区作为玉米的南繁基地,其自然发病条件下筛选出对小斑病具有抗性的玉米品种或抗性亲本材料,对黄淮海地区小斑病抗性的逐年提高具有一定的影响,有利于减轻黄淮海地区病害的发生。  相似文献   

甘肃不同地理种群桃蚜的遗传相似性   总被引：5，自引：2，他引：3  

刘永刚  漆永红  李惠霞  郭满库  吕和平  张俊莲  贺春贵 《中国农业科学》2010,43(15):3134-3142

【目的】探讨甘肃不同地理种群桃蚜Myzus persicae的遗传相似性和遗传差异,遗传距离与地理距离、海拔之间的关系,以期得到桃蚜种群遗传分化和迁飞的分子证据。【方法】利用7对SSR引物对13个桃蚜地理种群进行遗传相似性和聚类分析。【结果】7对SSR引物共检测到43个多态性位点,多态性条带百分率PPB为95.56%。13个桃蚜地理种群观测等位基因数Na为1.3333,有效等位基因数Ne为1.2293,Nei′s基因多样性指数为0.1311,Shannon信息指数I为0.1898,多态位点百分率P为33.33%。临洮、临夏、岷县、兰州种群的遗传多样性较高,天水、酒泉、漳县种群相对较低。种群聚类分析结果显示,桃蚜分为河西和河东两大类群,AMOVA分析结果表明,类群间遗传变异占总变异的1.76%,种群间变异占17.21%,种群内占81.03%。Mentel检测表明,遗传分化与地理距离、海拔无显著相关性。【结论】甘肃省桃蚜种群具有非常丰富的遗传多样性,遗传变异主要来自种群内部,种群间的基因交流较少,容易发生遗传漂变;陕北、陇东、陇南是陇中桃蚜虫源地,应加强对上述地区桃蚜的监测和治理。  相似文献   

Analysis on Genetic Relationship of Oxya chinensis and Oxya japonica from Xuzhou and Pingshan, China     

ZHANG Jian-zhen ZHANG Min GUO Ya-ping MA En-bo 《中国农业科学(英文版)》2006,5(2):116-122

Genetic relationship among Oxya chinensis populations and Oxya japonica populations collected from Xuzhou City, Jiangsu Province and Pingshan County, Hebei Province, China were analyzed by random amplified polymorphic DNA （RAPD） markers. A total of 125 DNA bands ranging from 200 to 2 200 bp were amplified by 10 random primers in DNA samples from 43 grasshopper individuals. One hundred and twenty-three （99%） of these bands were polymorphic. Shannon＇s index showed that the genetic, diversity within O. chinensis （0.3432） was higher than that of O. japonica （0.2781）. Nei＇s genetic distance between O. chinensis population and O. japonica population from the same area was less than that between populations from two different areas. The dendrogram based on Nei＇s genetic distance of RAPD markers was constructed using the unweighted pair group method with the arithmetic average （UPGMA） and Neighbor-Joining （NJ） methods. Cluster analysis indicated that all the individuals were grouped into two main clusters. O. chinensis populations from Xuzhou and Pingshan formed one cluster, and O. japonica populations from the two regions belonged to another cluster. The results demonstrated that RAPD can detect within species, and among closely related species. polymorphisms to distinguish minor difference among individuals  相似文献