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规模化畜禽养殖场粪便中多重耐药菌分离鉴定及其耐药特征 总被引：2，自引：1，他引：1
为了解禽畜粪便中多重耐药菌的污染特征,本研究对鸡粪、牛粪、猪粪和有机肥这4种不同样品中多重耐药菌进行了计数分析,并对不同来源的多重耐药菌株进行了分离和纯化,进一步开展了基于16S rDNA序列比对的分子生物学鉴定以确定其种属地位,以及基于药敏试验的耐药性特征分析。结果表明:不同养殖动物粪便中四环素、恩诺沙星、磺胺甲恶唑和泰乐菌素4种抗生素多重耐药菌的绝对数量和相对数量排序均为鸡粪>猪粪>牛粪,粪源有机肥中可培养的多重耐药菌的绝对数量和相对数量在堆肥后均有所下降。通过对耐药菌株鉴定和分类学分析,发现禽畜粪便中多耐药菌的菌门集中分布在Proteobacteria、Firmicutes和Actinobacteria,多重耐药菌的优势菌属为Escherichia、Corynebacterium、Kurthia;而有机肥样品中多重耐药菌的优势菌属为Staphylococcus、Glutamicibacter。菌株的药敏试验表明,3类动物粪污中的多重耐药菌都对红霉素、四环素有着较高的耐药率,均高于80%,而对阿米卡星这种抗生素表现出较好的敏感性,其耐药率低于30%。通过对Ⅰ、Ⅱ类整合子基因盒的扩增,发现PCR产物的大小从0.8 kb到1.8 kb不等,基因盒ad A2、dfr A17、dfr A1及sat2在养殖场粪污中检出率均较高。 相似文献
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为分析当前西藏地区牦牛源沙门菌耐药性与分子特征，本研究对源自西藏地区内的30株沙门菌牦牛粪便分离株，采用药敏纸片法测定相关菌株对β-内酰胺类，喹诺酮类和氨基糖苷类三大类共22种抗生素的耐药情况；采用PCR扩增的方式检测bla-TEM、bla-CTX和bla-CMY等18种耐药基因，并采用卡方检验（Chi-square test）和费希尔精确检验（Fisher）分析耐药表型和耐药基因携带情况的相关性，将相关耐药基因进行扩增测序，并应用序列综合分析软件（CLC Sequence Viewer 7.5和MAGA7.0）分析β-内酰胺类耐药基因（bla-TEM）和氨基糖苷类耐药基因（armA）编码翻译相关的氨基酸关键位置点位差异与耐药性的关系。结果表明：1）分离的30株沙门菌对于β-内酰胺类存在比较严重耐药现象，30株沙门菌对苯唑西林（OX）耐药占比最多，为60%，对青霉素（PG）、哌拉西林（PRL）、阿莫西林（AMX）、氨苄西林（AM）、羧苄西林（CB）、头孢氨苄（CN）、头孢呋辛（CXM）、头孢曲松（CRO）、头孢拉定（RAD）、头孢他啶（CAZ）、头孢哌酮（CFP）和头孢唑林（CZO）耐药率分别为56.67%、43.33%、40.00%、53.33%、53.33%、46.67%、56.67%、53.33%、50.00%、46.67%、56.67%和30.00%；对喹诺酮药物均为敏感；对氨基糖苷类药物中的链霉素（SM），耐药率为60.00%，卡那霉素（KAN）、妥布霉素（CAS）、阿米卡星（AKM）耐药率分别为13.33%、33.33%和30.00%。2）30株沙门菌的优势耐药谱型为PG/OX/PRL/AMX/AM/CB/SM。3）β-内酰胺类相关的耐药基因bla-TEM携带率较高（53.30%，16/30），且bla-TEM与β-内酰胺类药物对青霉素（PG）、苯唑西林（OX）、哌拉西林（PRL）、阿莫西林（AMX）、氨苄西林（AM）、羧苄西林（CB）、头孢氨苄（CN）、头孢呋辛（CXM）、头孢拉定（RAD）、头孢他啶（CAZ）和头孢哌酮（CFP）的耐药性相关性，呈现出显著相关（P＜0.05），氨基糖苷类相关耐药基因armA携带率为60%（18/30），且与妥布霉素（CAS）、链霉素（SM）、阿米卡星（AKM）的耐药性相关性，呈现出显著相关（P＜0.05）。4）部分bla-TEM和armA编码翻译的氨基酸存在可能与沙门菌耐药能力有关的差异位点。综上，西藏地区沙门菌对β-内酰胺类药物和氨基糖苷类耐药情况形势十分严峻，西藏地区沙门菌对β-内酰胺类药物和氨基糖苷类药物耐药率高的原因是因为其携带耐药基因bla-TEM和armA，且与氨基酸位点突变有关。本研究为加强对西藏地区牦牛源沙门菌耐药性监测提供理论依据。 相似文献
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为探究微塑料降解菌群的降解性能及其对农作物种子发芽的影响,利用五点采样法于2020年9月采集北京市农林科学院长期覆膜样地土壤,通过富集培养法筛选获得一组微塑料降解菌群,命名为ZH-5,通过高通量测序技术和Biolog-Eco微平板法分析了ZH-5的组成多样性及生长特性,通过失重法、扫描电子显微镜及傅里叶变换红外光谱评估了ZH-5对微塑料的降解潜力,通过种子萌发试验探究了ZH-5对作物种子的毒性效应。结果表明：从土壤样品中筛选出的降解菌群主要由9门组成,包括94属,优势门中变形菌门（Proteobacteria）占比60.34%、放线菌门（Actinobacteriota）占比16.86%;主要菌属中新生螺旋菌（Noviherbaspirillum sp.）占29.81%、嗜氨菌（Ammoniphilus sp.）占16.28%、假单胞菌（Pseudomonas sp.）占11.76%。培养60 d后,ZH-5对聚乙烯的降解率达2.86%,对作物种子具有显著促生作用,与P0处理（未接菌液）相比,P1处理（接种稀释100倍菌液）对黄瓜、萝卜、甜瓜和香瓜根长的促生率分别为31.38%、108.13%、57.59%和223.03%。研究表明,ZH-5具有降解聚乙烯微塑料的潜力,在减轻微塑料对环境污染等方面具有一定的研究 相似文献
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目的 分析2016年至2018年湖南省脑科医院铜绿假单胞菌的临床分布情况、耐药情况以及耐药菌株Ⅰ类整合子基因。方法 选取湖南省脑科医院2016年1月1日至2018年12月31日临床送检各类标本中分离出795株铜绿假单胞菌作为分析对象,就铜绿假单胞菌的临床分布情况以及耐药情况统计分析,2018年ICU分离的13株多重耐药菌株采用PCR扩增检测Ⅰ类整合子。结果 铜绿假单胞菌分布科室主要为神经外科（24.53%）,其次为呼吸内科（22.26%）和重症医学科（13.21%）;铜绿假单胞菌对临床常用的20种抗生素耐药率和敏感率0-100%不等,多重耐药呈上升趋势;13株多重耐药菌株6株Ⅰ类整合子阳性。结论 及时统计细菌分布情况、药物的耐药率、敏感率,并对其进行分析,可以为临床合理用药提供依据,有效预防和控制感染。 相似文献
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【目的】了解福建省猪源mcr-1基因阳性细菌的流行性、耐药特性及分布特征。【方法】从福建省7个地市的21个猪场采集313份粪便样本，应用PCR方法筛选、分离和鉴定mcr-1基因阳性细菌；采用K-B琼脂扩散试验进行药敏检测，分析mcr-1基因阳性细菌的耐药性，并使用PCR方法分析其耐药表型；进一步采用多位点序列分型（MLST）方法鉴定mcr-1基因阳性大肠杆菌的类型，使用脉冲场凝胶电泳（PFGE）分析方法对mcr-1阳性大肠杆菌进行聚类分析，探明其分布特征和亲缘关系。【结果】从313份猪粪便中共分离获得43株mcr-1基因阳性细菌，其中大肠杆菌39株。耐药性结果显示，分离菌株对磺胺甲基异恶唑、氟苯尼考、链霉素、强力霉素、恩诺沙星、新霉素、阿莫西林、头孢噻肟、林可-壮观、亚胺培南、呋喃妥因、利奈唑胺和替加环素的耐药率分别为90.1%，83.7%，74.4%，67.4%，67.4%，58.1%，53.5%，39.5%，34.9%，11.6%，4.6%，0和0。磺胺类耐药基因中的sul1、sul2和sul3基因检出率较高，分别达到81.4%，90.7%和74.4%；喹诺酮类耐药基因中仅有qnrS和aac(6′)-Ib-cr被检出，其检出率分别为51.2%和30.2%；氯霉素类耐药基因中Cat2和cmlA基因的检出率较高，分别达到86.0%和74.4%；氟苯尼考耐药基因（floR）的检出率为83.7%；金属β-内酰胺酶耐药基因（NDM-1）的检出率为23.2%；多药耐药基因（cfr）的检出率为7.0%；而替加环素耐药基因（tet(X)）未被检出。39株mcr-1基因阳性大肠杆菌除了4株不能分型外，其他35株共分为19个ST型，具有高度多样性，其中ST10为优势型，共有9株菌株。PFGE图谱显示，39株mcr-1基因阳性大肠杆菌共获得30种PFGE谱型，具有多态性特征，分为6组克隆群。【结论】福建猪源mcr-1基因阳性细菌主要为大肠杆菌，少部分为肠杆菌科其他菌株，且分离菌株具有明显的多重耐药性；mcr-1基因阳性大肠杆菌在地域分布上具有多态性和高度多样性特点。 相似文献
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《江西农业学报》2017,(8)
从福州地区9个猪场不同来源的饮用水中分离获得42株肠球菌。采用微量肉汤稀释法对这些分离菌进行药物敏感性实验,测定了它们对6种抗生素的最小抑菌浓度(MIC)。结果表明:这些分离菌对土霉素、红霉素、氯霉素、环丙沙星、氨苄西林和万古霉素的耐药率分别为80.95%、66.67%、35.71%、19.05%、16.67%、14.29%;水池进水口及蓄水池分离菌对土霉素和红霉素的耐药率略低于饮水器饮用水分离菌的,但对氯霉素、环丙沙星、氨苄西林的耐药率均显著低于饮水器分离菌的;保育舍饮水器分离菌对所有抗生素都有更高的耐药率;所分离的肠球菌共有11种耐药谱,发现有11株分离菌对4~5种抗生素耐药,其中5株来自保育舍饮水器;水池进水口及蓄水池分离菌的多重耐药率均低于饮水器分离菌的,以保育舍饮水器分离菌的多重耐药率最高。 相似文献
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《江西农业学报》2022,(8)
从福州地区9个猪场不同来源的饮用水中分离获得42株肠球菌。采用微量肉汤稀释法对这些分离菌进行药物敏感性实验,测定了它们对6种抗生素的最小抑菌浓度(MIC)。结果表明:这些分离菌对土霉素、红霉素、氯霉素、环丙沙星、氨苄西林和万古霉素的耐药率分别为80.95%、66.67%、35.71%、19.05%、16.67%、14.29%;水池进水口及蓄水池分离菌对土霉素和红霉素的耐药率略低于饮水器饮用水分离菌的,但对氯霉素、环丙沙星、氨苄西林的耐药率均显著低于饮水器分离菌的;保育舍饮水器分离菌对所有抗生素都有更高的耐药率;所分离的肠球菌共有11种耐药谱,发现有11株分离菌对45种抗生素耐药,其中5株来自保育舍饮水器;水池进水口及蓄水池分离菌的多重耐药率均低于饮水器分离菌的,以保育舍饮水器分离菌的多重耐药率最高。 相似文献
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【目的】分析犏牛、黄牛和娟姗牛瘤胃微生物多样性的差异,并对菌群功能进行预测。【方法】选取甘南藏族自治州合作市同一牧场放养的生理状态正常、年龄相近（1.5岁左右）的犏牛、黄牛和娟姗牛各6头,抽取瘤胃液于冻存管,放入液氮保存。基于16S rRNA测序技术,对供试牛瘤胃液样本基因组DNA进行V3~V4区扩增及测序,对所得序列处理后进行OTU聚类分析和物种分类,并利用Tax4Fun对菌落的16S rRNA基因序列进行KEGG功能注释。【结果】Alpha多样性分析显示,犏牛瘤胃微生物多样性和丰富度显著高于黄牛和娟姗牛（P＜0.05）。门分类水平上,犏牛瘤胃液中厚壁菌门、脱硫杆菌门、疣微菌门、髌骨细菌门和纤维菌门显著高于黄牛（P＜0.05）,脱硫杆菌门和疣微菌门显著高于娟姗牛（P＜0.05）。属分类水平上的差异主要表现在厚壁菌门与拟杆菌门所属的各菌群中,犏牛瘤胃液中普雷沃菌属、瘤胃球菌属和解琥珀酸菌属丰度显著低于黄牛（P＜0.05）;理研菌科_RC9菌群丰度显著高于黄牛（P＜0.05）;犏牛和娟姗牛瘤胃中克里斯氏菌科_R-7菌群、瘤胃菌科_NK4A214菌群、g_norank_f_UCG-011和未分类毛螺菌科显著高于黄牛（P＜0.05）。瘤胃菌群功能预测发现,犏牛富集在碳水化合物代谢、核苷酸代谢和翻译二级通路上的功能丰度显著高于黄牛（P＜0.05）,但与娟姗牛差异不显著（P＞0.05）;黄牛二级通路中辅助因子和维生素的代谢功能丰度显著高于犏牛和娟姗牛（P＜0.05）。【结论】犏牛和黄牛间瘤胃菌群组成差异较大,娟姗牛菌群组成介于犏牛和黄牛之间;犏牛瘤胃菌群发酵最具优势,可能为其适应高原地区严酷的生存环境发挥了重要作用。 相似文献
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为研究不同体况对妊娠初期母牛阴道菌群的影响，采集相同放牧条件下不同体况妊娠初期西门塔尔母牛18 头(每组6头，偏瘦组(TC)，标准组(MC)和肥胖组(FC))阴道分泌物，利用16S rRNA测序技术对其阴道菌群多样性进行分析。结果显示:18 份样品平均每份样品测得70 567条序列，经过质控平均得到68 309条序列，质控有效率达96.84%；通过聚类共获得2 677 个操作分类单元(Operational taxonomic units，OTU)，37.58%的OTU注释到门水平，24.36%的OTU注释到属水平；标准组阴道菌群Alpha多样性指数的Shannon指数、Chao1指数和ACE指数均显著低于肥胖组和偏瘦组(P<0.05)；各组阴道菌群的Good’s coverage指数均在99.4%以上，表明样本测序质量较高；在门水平上，偏瘦组、标准组和肥胖组妊娠初期母牛阴道中前10大优势菌门为厚壁菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、变形菌门(Proteobacteria)、无壁菌门(Tenericutes)、放线菌门(Actinobacteria)、梭杆菌门(Fusobacteria)、疣微菌门(Verrucomicrobia)、未知菌门(Unidentified_Bacteria)、螺旋体菌门(Spirochaetes)和Melainabacteria；在属水平上，偏瘦组、标准组和肥胖组前10大优势菌属分别为拟杆菌属(Bacteroides)、阿利斯佩斯菌属(Alistipes)、气球菌属(Aerococcus)、费氏菌属(Faecalibacterium)、链杆菌属(Streptobacillus)、链球菌属(Streptococcus)、棒杆菌属(Corynebacterium)、嗜组织菌属(Histophilus)、脲原体菌属(Ureaplasma)和支原体属(Mycoplasma)，其中标准组嗜组织菌属显著高于其他2组(P<0.05)。 相似文献
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为了解源自合肥地区表观健康鸡的沙门氏菌耐药性及其与血清型、基因型的相关性,在前期已鉴定血清型和ERIC基因型的基础上,采用K-B纸片法对21株沙门氏菌分离株进行21种抗生素药物敏感试验,利用PCR技术对耐药菌株进行32种耐药基因检测。结果显示,总耐药率为100%（21/21）,耐2种以上抗生素的菌株占76.19%（16/21）,多重耐药谱为青霉素-氨苄西林-阿莫西林-链霉素-复方新诺明,其中耐受β-内酰胺类抗生素的类别最多,耐药率最高达100%（21/21）。21株沙门氏菌均检出耐药基因,涉及blaPSE、sul1、strA、blaTEM、sul2、tetA、tetB、aph3-Ⅱa和catⅠ 9种,其中blaPSE基因的检出率最高,为85.7%（8/21）。可见源自合肥地区表观健康鸡的沙门氏菌对β-内酰胺类抗生素耐药性最强,与其携带blaPSE基因有关;耐药表型测定结果与耐药基因检测结果基本一致;耐药性与具有相同来源的同一血清型、基因型相关。 相似文献
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眼睛晶体作为鱼类的硬组织之一,具有结构稳定、耐腐蚀、易获取的特性,其含有大量的蛋白质,蕴含着丰富的化学信息,并在鱼类的年龄鉴定中得到了一定程度的应用。近年来,随着生物地球化学技术的不断创新与进步,鱼类眼睛晶体的微量元素、稳定同位素信息也越来越受到国内外学者的重视。本文将依据国内外学者的研究成果,从眼睛晶体的直径与重量、微结构、微量元素和稳定同位素等方面,对鱼类的年龄鉴定、栖息环境重建、摄食生态的追踪等方面的应用进行综述,并通过分析鱼类眼睛晶体的组成成分与生长模式,比较眼睛晶体与其他组织做稳定同位素分析的优势,着重归纳总结了眼睛晶体碳氮稳定同位素在鱼类生活史信息,尤其在摄食生态、栖息环境重建等方面的研究方法、应用现状及发展前景,为以后开展相关的研究提供参考。 相似文献
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为探究磷酸盐在不同水分条件下对土壤铅(Pb)、镉(Cd)的钝化效果及其在酸雨淋溶下修复时可能造成的重金属淋失风险,选择安徽铜陵某矿区周边Cd、Pb污染水稻土为研究对象,对比磷酸氢二铵(DAP)和磷酸三钙(TCP)在不同用量及不同土壤含水率下对Cd、Pb的修复效果,并探讨模拟酸雨条件下含磷钝化剂施用后对Cd、Pb修复稳定性的影响。结果表明:施用两种磷肥均能降低土壤中有效态Cd、Pb含量,DAP使土壤有效态Cd含量降低了41.87%～65.62%,有效态Pb含量降低了38.83%～76.98%;TCP处理下有效态Cd、Pb含量分别降低了39.55%～56.17%、37.52%～66.46%。75%最大田间持水量下有效态Cd含量分别下降了21.22%(TCP)、23.45%(DAP),有效态Pb含量分别下降了14.22%(TCP)、9.28%(DAP)。磷肥对Cd、Pb的固定作用随着酸雨淋溶量增加而减弱,两种磷肥处理下,土壤5～55 cm深度范围内Pb的平均含量分别为47.23 mg·kg-1(DAP)和53.21 mg·kg-1(TCP),不同酸... 相似文献
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为了探究水稻开花期喷施氯化氨基乙酸对水稻中Cd转运特性的影响，以湘早籼24号（X24）水稻为研究对象开展盆栽试验，对水稻籽粒及各器官中的Cd含量、水稻必需元素（K、Mg、Ca、Fe、Mn、Zn）及水稻体内氨基酸含量的变化进行分析。结果表明：水稻开花期叶面喷施0.8 mmol·L-1氯化氨基乙酸显著降低了稻米和穗轴中的Cd含量，稻米中的Cd含量从0.28 mg·kg-1下降至0.17 mg·kg-1，降幅为39.29%。通过对水稻体内各器官间Cd转移系数的分析发现，开花期水稻叶面喷施氯化氨基乙酸可以显著降低Cd离子从穗轴向籽粒、穗节向穗颈、倒二节间向倒一节间的转移系数，即倒二节间向上的转移效率降低导致了稻米中Cd含量显著下降。同时，叶面喷施氯化氨基乙酸降低了水稻籽粒和穗轴中Ca的含量，促进了K、Mg和Zn从倒一节向穗轴的转移。氨基酸分析结果显示，叶面喷施0.8 mmol·L-1氯化氨基乙酸后，稻米中天冬氨酸和谷氨酸的含量分别增加了28.54%和22.96%，甘氨酸含量减少了51.92%。由此可见，水稻开花期叶面喷施氯化氨基乙酸有利于稻米中天冬氨酸和谷氨酸的合成，能促进K、Mg和Zn的转运，并通过抑制Cd由营养器官向籽粒的转运过程显著降低稻米中的Cd含量，该方法在我国南方Cd污染农田水稻生产过程中具有良好的应用前景。 相似文献
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为探究新烟碱类农药在农田土壤中的吸附、淋溶行为,于2022年4—8月,采用振荡平衡法和土柱淋溶法,以呋虫胺等5种新烟碱类农药为代表,在广东省河源市灯塔盆地国家现代农业示范区中选取3种不同类型土壤(红壤土、水稻土、潮土)开展试验。结果表明:5种新烟碱类农药在3种土壤中的Kd值(土壤吸附系数)范围为红壤土0.33～0.86 mL·g-1、水稻土1.47～3.21 mL·g-1、潮土0.63～1.47 mL·g-1;Koc值(土壤吸附常数)范围为红壤土36.67～95.56 mL·g-1、水稻土81.64～178.37 mL·g-1、潮土52.56～122.51 mL·g-1);ΔG值(土壤吸附自由能)范围为红壤土-8.76～-11.10 kJ·mol-1、水稻土-10.71～-12.61 kJ·mol-1、潮土-9.64～-11.70 kJ·mol-1... 相似文献