正交直观分析法和新复极差法优化苦瓜SRAP反应体系研究   总被引：1，自引：0，他引：1  

刘萌芽  黄如葵  黄玉辉  黄熊娟  陈小凤  冯诚诚 《北方园艺》2014,(5)

以苦瓜为试材,采用正交直观分析法和新复极差法相结合的方法,对影响苦瓜SRAP反应体系的5种因素(dNTP浓度、模板DNA、引物浓度、Mg2+浓度及Taq DNA聚合酶)4个水平进行优化筛选,以期优化苦瓜SRAP的PCR反应体系。结果表明:苦瓜SRAP分析的优化反应体系为20μL PCR反应体系中含有1×PCR buffer,250μmol/L dNTP,50ng模板DNA,1.2μmol/L引物,1.5mmol/L Mg2+,1.5UTaq DNA聚合酶。  相似文献   

均匀设计法优化彩色马蹄莲品种的RAPD-PCR反应体系     

陆波  郑玉红  彭峰  束晓春  陈晓萱 《北方园艺》2012,(11):123-126

以7个彩色马蹄莲品种为研究对象,以品种Prafait DNA为模板,采用均匀设计法对影响彩色马蹄莲RAPD-PCR反应的4因素(模板DNA浓度、引物浓度、Mg2+浓度、dNTPs浓度)在3个水平上进行U12(34)优化试验。结果表明:最佳的彩色马蹄莲RAPD-PCR的反应体系为:20μL体系中含有25ng的模板DNA,0.125mmol/L dNTPs,1.5mmol/L Mg2+,1×buffer反应缓冲液,0.55mmol/L引物,1.0U的Taq DNA聚合酶。  相似文献   

杜鹃属ISSR-PCR反应体系优化     

《现代园艺》2021,(13)

为了优化杜鹃属ISSR-PCR反应体系,以“毛叶杜鹃”叶片为试验材料,应用正交试验与单因素试验相结合,对PCR反应体系的因素Mg2+、Taq DNA聚合酶、引物及DNA模板进行优化组合,确定杜鹃属植物ISSR-PCR的20μL最优反应体系为:Mg2+1.5mmol/L、Taq DNA聚合酶1U、模板DNA 20ng、引物0.9μmol/L、d NTPs 0.2mmol/L。  相似文献   

东部白松SRAP反应体系的建立和优化   总被引：1，自引：1，他引：0  

王骞春  冯建  陆爱君  于世河  曲艺  董建 《北方园艺》2010,(21)

以东部白松针叶DNA为模板,采取正交实验设计L16(45)对SRAP-PCR反应体系的5个因素(Taq酶,Mg2+,dNTPs,模板DNA,引物)在4个水平上进行优化试验。结果表明:确定东部白松SRAP-PCR最佳反应体系(20μL):Taq酶0.5 U,Mg2+1.5 mmol/L,dNTPs 0.15mmol/L,模板DNA 50 ng,引物0.1μmol/L。  相似文献   

杨桃SCoT标记PCR反应体系建立与验证     

欧景莉  覃剑峰  余炳宁  黄小江  陆祖双  朱鹏锦  陈豪军 《中国南方果树》2015,44(3)

用单因素设计法对影响杨桃SCoT-PCR反应体系的主要因素Mg2+、dNTPs、引物、Taq DNA聚合酶及DNA模板浓度进行优化。结果表明,20μL反应体系中,含Mg2+2.5 mmol/L,dNTPs 0.3mmol/L,模板DNA 30mg/L,引物1.00μmol/L和Taq DNA聚合酶0.4U为最佳反应体系。用不同引物及杨桃DNA对该体系进行验证,扩增条带清晰,结果稳定可靠,证明该反应体系适用于杨桃SCoT-PCR扩增。  相似文献   

鸭梨ISSR-PCR反应体系的初步建立     

刘春琴  崔建州  支婷  杜克久 《林业与生态科学》2011,(1):65-68

以沧州泊头市鸭梨为试验材料,对鸭梨ISSR-PCR反应体系中的模板DNA用量、dNTPs浓度、引物浓度以及Taq酶浓度进行了探索,初步建立适合鸭梨ISSR-PCR反应体系为:在20μL反应体系中,含1×TaqPCRBuffer[1.5 mmol/L Mg2+]、0.15 mmol/L dNTPs、0.40 μmol/L...  相似文献   

光核桃ISSR扩增体系的优化     

孟凡娟  邢春  徐福玲  王中奎  李荣钦 《北方园艺》2015,(20)

为确保光核桃ISSR反应条件的稳定性,以改良的CTAB法提取光核桃基因组DNA,对模板DNA浓度、MgCl2浓度、dNTPs浓度、Taq酶用量、引物浓度等因素进行了优化,确立了光核桃ISSR反应体系。结果表明:最佳反应体系为模板浓度40ng/μL、引物浓度0.4μmol/L、Mg2+的浓度2.5mmol/L、酶浓度0.5U、dNTPs浓度0.5mmol/L,为光核桃这一优质的种质资源的遗传多样性研究奠定了理论基础。  相似文献   

古樟ISSR扩增条件的优化     

黄萌  陈尚钘  杨光耀  王宗德  季春峰 《北方园艺》2013,(7)

采用改良CTAB法提取古樟叶片基因组DNA.利用单因素试验设计,对反应体系中退火温度、模板DNA含量、Mg2+浓度、dNTP浓度、引物浓度、Taq DNA聚合酶用量、去离子甲酰胺等7种因素不同梯度对扩增结果的影响进行了比较分析.结果表明:古樟ISSR-PCR最佳反应体系为,在20 μL PCR反应体积中,含50 ng DNA模板,2.5 mmol/L MgCl2,0.20 mmol/LdNTPS,1 U Taq DNA聚合酶,0.5μmol/L引物浓度,2％去离子甲酰胺.该反应体系的建立为今后利用ISSR分子技术对古樟的遗传多样性分析提供了技术支撑.  相似文献   

西藏光核桃SRAP-PCR反应体系的优化和引物筛选   总被引：1，自引：0，他引：1  

谭江平  曾秀丽  廖明安  邱利娜  王玉霞  次仁卓嘎 《北方园艺》2011,(2):139-143

以西藏12份光核桃种质为试材,采用正交设计,从dNTPs、Mg²⁺、引物、模板DNA和Taq DNA聚合酶5种因素5个水平来优化SRAP-PCR反应体系,并对引物进行了筛选。结果表明:光核桃25μL的SRAP反应体系的最佳组分包括2.5μL 10×buffer,0.35 mmol/L dNTPs,1.5 mmol/L Mg²⁺,0.4μmol/L引物,20 ng模板DNA和2.5 U Taq DNA聚合酶。各因素对扩增反应结果均有不同影响,其中以dNTPs浓度影响最大,模板DNA的影响最小。应用该体系从40个引物组合中共筛选出扩增条带清晰、多态性丰富的SRAP引物组合23个。这一体系的建立及多态性引物组合的筛选为利用SRAP标记技术进行光核桃遗传多样性研究提供了依据。  相似文献   

金线莲ISSR-PCR反应体系建立     

唐军荣  谭辛夷  孙正海  辛培尧 《北方园艺》2014,(18)

利用正交设计L16(45)对金线莲ISSR-PCR反应体系的5因素(模板DNA、Taq酶、引物、Mg2+和dNTP)在4个水平上进行优化试验,采用直观分析法获得影响因素最佳反应水平。结果表明:最终建立的金线莲ISSR-PCR的最佳反应体系为,在25μL的反应体系中,DNA模板为40ng、Taq酶为1.60U、引物浓度为0.80mmol/L、dNTP浓度为0.96mmol/L、Mg2+浓度为2.40mmol/L。该反应体系的建立为金线莲种质资源分类、遗传多样性分析提供了更客观可靠的方法。  相似文献