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以辣椒多酚氧化酶家族(PPOs)为研究对象,利用CUSP、CHIPS及CodonW 1.4.4等软件对辣椒PPO基因9个密码子进行分析,研究了辣椒PPOs密码子偏好性特征,以期为辣椒PPO基因家族密码使用模式和分子进化及功能提供参考依据。结果表明：辣椒PPO家族基因偏好性较弱,偏好以A或U(T)结尾的密码子,其中存在28个高频密码子(RSCU>1),4个偏好性较强密码子(RSCU>1.6)和1个偏好性最强密码子(RSCU>2)。聚类结果显示,基于CDS序列聚类效果更好;CaPPO1单独聚为一类,其余8个基因较为接近。相关性分析表明PPO家族基因密码子的偏好性主要影响因素是密码子第3位碱基GC含量(GC3s)。此外,GC、C3s也存在一定的影响。ENC图、中性绘图结果表明自然选择对PPO家族基因密码子偏好性的影响更大。 相似文献
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几种植物花分生组织决定基因APETALA1密码子使用模式比较 总被引：1，自引：0，他引：1
为了揭示花分生组织决定基因AP1(APETALA1)的分子机制以及物种间的进化关系,从GenBank数据库挑选8个不同植物AP1基因编码序列,利用R软件分别计算GC含量、有效密码子数(Effective number of codons,ENC)、同义密码子相对使用度(Relative synonymous codon usage,RSCU)、相对密码子使用偏好性(Relative codon usage bias,RCBS)等参数,分析比较不同植物AP1基因密码子使用模式中密码子偏好性和碱基组成动力学。结果表明,不同植物AP1基因密码子使用受到GC偏好性(GCbias)影响,特别是GC3s;大多数最优密码子偏好使用以A/U结尾,其中不同植物AP1基因中ACA、AUA和CAG均表现为较高的RSCU值,为最优势密码子;芍药(Paeonia lactiflora)和牡丹(Paeonia suffruticosa)AP1基因的密码子使用特点相似,碧桃(Prunus persica)和苹果(Malus×domestica)相似;较低的最优密码子频率Fop值和较高的ENC值暗示了不同植物AP1基因在密码子使用中具有一个较弱的偏好性。 相似文献
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菠萝密码子使用偏好性分析 总被引：1，自引：0，他引：1
《果树学报》2017,(8)
【目的】分析菠萝[Ananas comosus(L.)Merr.]基因组中编码CDS的密码子使用偏好性,为了解菠萝的密码子偏好性规律和进行分子改造提供理论基础,促进植物密码子的生物学研究。【方法】以菠萝基因组测序获得的30 663条编码CDS为数据来源,应用编写的perl脚本、CUSP和SPSS软件对序列进行密码子偏好性、双联密码子以及多元统计分析。【结果】菠萝基因组数据中的编码CDS的GC平均含量为52.09%,密码子中第3位核苷酸的GC平均含量(GC3S)为55.41%,有效密码子数(ENC)取值为58.41,绝大部分的ENC值都大于35。另外,确定了34种高频密码子(RSCU值大于1),其中仅有8个以AT碱基结尾,25个以CG碱基结尾;同时确定了31种高优越表达密码子。结合以上结果,最后筛选出13种最优密码子。通过与17种植物的GC3S和密码子使用频率进行比较,发现双子叶植物与单子叶植物的GC3S和密码子使用频率存在较大差异,而菠萝较其他单子叶植物与双子叶植物更接近。【结论】从不同基因、基因内不同位置以及不同植物3个层面对菠萝密码子的偏好性进行分析,筛选出13种菠萝最优密码子。该研究有助于更好地了解菠萝密码子偏好性规律,促进植物密码子生物学研究及基因组数据在非模式植物中的潜在应用。 相似文献
4.
采用CodonW1.4.2软件和CUSP程序,以普通羊肚菌(Morchella conica)全基因组蛋白质编码序列(coding sequence,CDS)为对象,解析了该菌的有效密码子数(effective number of codon,ENC)、密码子3个位点的 GC含量、相对同义密码子使用度(relative synonymous codon usage,RSCU)和高表达优越密码子。结果表明：普通羊肚菌全基因组密码子第2位密码子的 GC含量明显低于第1位和第3位,第3位密码子与第1位含量差异不大,分别为57.8%和56.8%,RSCU 值大于等于1的密码子总共35个,其中以 G 或 C 结尾的25个,占71.4%,确定了25个高表达优越密码子。 相似文献
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以额济纳荒漠典型红砂(Reaumuria soongorica)群落为研究对象,通过对额济纳旗荒漠盐化环境下红砂自然种群叶片的保护酶活性和丙二醛含量及其影响因子的分析,了解额济纳荒漠条件对红砂生长发育的影响,以期为野生红砂群落的保护和进一步研究提供参考依据.结果表明:在红砂的一个生长季内,随着时间的推移,红砂叶片中超氧化物歧化酶(SOD)活性呈现出逐渐降低的趋势,最高活性为6.65 U·g-1;丙二醛(MDA)含量呈递增趋势,含量变化为0.012～0.046 μmol·g-1FW;过氧化氢酶(CAT)活性表现出先升高后降低的趋势,最低活性为0.002 4 U·g-1·min-1.2年内,红砂叶片中SOD、CAT活性,与平均温度呈极显著正相关(P＜0.01),与空气相对湿度呈极显著负相关(P＜0.01);MDA含量则正好相反,与平均温度呈极显著负相关(P＜0.01),与空气相对湿度呈极显著正相关(PP＜0.01);各土层土壤含水率(SWC)相关性的试验结果表明,SOD活性与SWC(20～100 cm)呈极显著负相关(P＜0.01),与SWC(0～20 cm)呈显著负相关(P＜0.05);CAT活性与SWC(20～100 cm)呈极显著正相关(P＜0.01);MDA含量与SWC(0～20 cm)呈极显著正相关(P＜0.01),与SWC(40～60 cm)呈极显著负相关(P＜0.01);20～60 cm 土层的土壤含水率对红砂叶片中CAT、SOD活性以及MDA含量影响最大. 相似文献
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《中国南方果树》2015,(2)
在宜昌市夷陵区选77个有代表性的温州蜜柑果园定株取样,测定花中10种矿质元素含量和成熟果实品质,分析花中各矿质元素含量与果实品质各指标间的关系,探讨花营养诊断预测果实品质的可行性。结果表明,花中N、P、Mg含量为弱变异(变异系数≤10%),K、Fe、Cu、B含量为中变异(10%变异系数≤20%),Ca、Mn、Zn含量为强变异(变异系数20%)。花中P、Ca、B含量分别与果实可滴定酸和可溶性固形物含量呈极显著或显著负相关,分别与果实固酸比和可食率呈极显著或显著正相关,P含量还与果实维生素C含量呈显著负相关;Mn与果实可滴定酸和可溶性固形物含量呈极显著正相关,与可食率呈显著负相关;N含量与果实可溶性固形物含量呈显著正相关;K含量与果实可溶性固形物含量呈显著负相关;Fe含量与果实可滴定酸含量呈显著负相关。花营养诊断可预测果实品质,根据花营养诊断实施适当的中期管理可提高果实品质。 相似文献
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为了明确南果梨叶片、果实营养状况与果实品质的相关性,为南果梨园科学合理施肥提供理论依据。选取辽宁省主产区28个南果梨园的叶片、果实为试材,测定分析了不同梨园叶片、果实主要矿质营养及果实品质状况。结果表明,梨园叶片N元素含量的平均值处于适量范围内,P元素含量平均值处于较高水平,K元素含量平均值为8.73 g/kg,低于适量范围的最小值,所有梨园Ca、Mg元素均处于适量范围。相关性分析表明：叶片Ca元素含量、果实K元素含量均与果实横径呈显著正相关;叶片P、K元素含量和果实Ca元素含量与果实可溶性糖含量均呈极显著负相关,果实P元素含量与果实可溶性糖含量呈极显著正相关;果实K、Mg元素含量与可滴定酸含量呈极显著或显著正相关;叶片N元素、果实P元素含量与果实维生素C含量均呈显著负相关,叶片P、K元素含量与维生素C含量均呈显著正相关;叶片P元素、果实N元素含量与果实硬度呈显著或极显著负相关;叶片N、K含量与果实N、K含量均呈显著正相关;叶片Ca含量与果实N含量呈显著正相关;叶片Mg含量与果实Ca含量呈极显著负相关,与果实P含量呈显著正相关。综上,所调查南果梨园叶片营养整体呈现高P缺K,N、Ca、M... 相似文献
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采收成熟度对‘玉露香’梨果实品质和耐贮性的影响 总被引：1，自引：0，他引：1
《果树学报》2016,(5)
【目的】研究不同采收成熟度对梨优新品种‘玉露香’采后品质和贮藏效果的影响,以明确其采后生理特性、适宜采收成熟度参数,为生产上优新品种的大面积推广提供技术支撑。【方法】以山西太谷‘玉露香’为材料,分3个采收成熟度进行采收后,测定常温(20℃)和冷藏(0℃)条件下果实可溶性固形物含量、可滴定酸含量、维生素C含量、果皮颜色、叶绿素荧光参数、相对电导率、单果质量、硬度、种子颜色指数等生理指标,并调查了不同贮藏期果实黑心指数、磕碰伤百分率和腐烂率。【结果】常温条件下,随着货架时间的延长,果实硬度、可溶性固形物含量、可滴定酸和维生素C含量逐渐下降,反映果皮颜色的h值不断下降,L值不断升高,叶绿素荧光参数中Fv、Fv/Fm不断下降,而F0、F0/Fm不断升高;随着采收成熟度的增加,可溶性固形物含量、可滴定酸含量、单果质量和种子颜色指数不断增加,果实硬度不断下降,而维生素C含量以采收期Ⅱ最高。h值逐渐下降,L值逐渐升高。冷藏条件下,采收期Ⅲ的h值显著低于采收期Ⅰ和采收期Ⅱ(P0.05),L值则显著高于采收期Ⅰ和采收期Ⅱ(P0.05)。冷藏至240 d和240+10 d货架时,采收期Ⅲ的F0、Fm和Fv显著低于采收期Ⅰ和采收期Ⅱ(P0.05),采收期Ⅰ的相对电导率显著低于采收期Ⅱ和采收期Ⅲ,而采收期Ⅲ果实的黑心指数、磕碰伤百分率和腐烂率显著高于采收期Ⅰ和采收期Ⅱ(P0.05)。L与Fm、Fv、Fv/Fm呈极显著负相关(P0.01),与F0/Fm呈极显著正相关(P0.01);h与Fm、Fv呈极显著正相关(P0.01),与Fv/Fm呈显著正相关(P0.05),与F0/Fm呈显著负相关(P0.05);表征果皮颜色的h值和表征果皮油腻化程度的L值间呈极显著负相关(P0.01)。【结论】对于梨优新品种‘玉露香’的建议:采收后立即销售或短期冷藏(贮藏期不超过120 d)的果实可在9月上中旬采收,用于长期冷藏的果实(尤其是贮藏期达240 d左右),建议9月上旬采收。 相似文献
10.
在自然生长条件下测定了野生苋菜的光合速率和蒸腾速率及环境因子的日变化规律,并分析了光合速率、蒸腾速率与环境因子的相关性。结果表明:光合速率和蒸腾速率的日变化呈"单峰"曲线,光合速率的峰值出现在12:00左右,蒸腾速率的峰值比光合速率的峰值晚2 h,出现在14:00左右。苋菜的Pn与PAR、Ta、Gs呈极显著的正相关(P<0.01),与Ca呈显著的正相关(P<0.05),与RH呈负相关。苋菜的Tr与Ta呈极显著的正相关(P<0.01),与RH呈极显著的负相关(P<0.01),与PAR、Gs、Ca呈显著的正相关(P<0.05)。 相似文献
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侧耳属3种食用菌解剖学性状比较 总被引：3，自引：0，他引：3
以PDA培养基和棉籽壳为培养料,培养了姬菇、榆黄蘑和鲍鱼菇,并对其解剖结构进行了比较,结果表明,姬菇、榆黄蘑和鲍鱼菇菌丝均具有锁状联合,子实体菌柄都侧生,每个担子顶部产生4个担孢子,孢子内含油滴,孢子印皆为白色。姬菇和鲍鱼菇菌盖颜色为灰黑色,榆黄蘑为黄色,姬菇和榆黄蘑菌丝生长快,姬菇菌丝浓密,榆黄蘑和鲍鱼菇菌丝稀疏,鲍鱼菇菌丝能产生黑色分生孢子。姬菇和榆黄蘑子实体小而多,出菇早、产量高,鲍鱼菇子实体较大内部组织紧密,担子、担孢子梗粗壮,孢子饱满油滴大。 相似文献
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本文通过种子层积处理前进行的不同预处理方法和层积天数的试验，对影响美国东部黑核桃种子层积催芽因素进行了探讨。催芽前进行冷水浸种5d(天)，沙藏层积催芽150d(天)，发芽率最高，发芽最快，播种后60d(天)调查，出苗率达75％。 相似文献
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鸡腿蘑菌丝体的同工酶研究 总被引：7，自引：1，他引：7
用8种不同培养基配方，培养鸡腿蘑菌丝体，其同工酶分析结果表明，鸡腿蘑菌丝体酯酶(EST)同工酶谱差异明显，过氧化物酶(POD)同工酶谱差异明显。 相似文献
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采用火焰原子分光光度法,测定了保定市市售的3种类型共16种蔬菜中的Ca、Cu、Zn、Fe、Mn 5种矿质元素,为指导人们日常饮食提供科学依据.结果表明:不同类型蔬菜中矿质元素含量不同,叶菜类蔬菜中的(Ca、Cu、Zn、Fe、Mn含量高于果菜类蔬菜、根茎类蔬菜;而不同品种的蔬菜其矿质元素的含量也存在很大差异,油菜中的Ca和Mn含量最高,分别为7.6 g/100g和8.98 mg/100g;Zn含量最高的为香麦16.72 mg/100g,其次为菠菜12.63 mg/100g,洋白菜的Zn含量最低仅为0.73 mg/100g;菠菜中Fe含量最高138.43 mg/100g,其次为香麦111.11 mg/100g.综合分析结果,香麦、菠菜、油菜的Ca、Cu、Zn、Fe、Mn含量要高于其它种类的蔬菜. 相似文献