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1.
为构建四倍体杂交冰草分子遗传连锁图谱,对深入开展冰草产量、抗性等重要性状的QTL定位及分子标记辅助育种提供依据,以四倍体杂种F2分离群体的347个单株及亲本蒙古冰草和航道冰草为材料,采用SSR分子标记技术和Joinmap 4.0软件进行了遗传作图研究。试验从256对SSR引物中筛选出条带清晰稳定、多态性丰富的适宜引物30对,PCR扩增得到224个SSR标记位点,平均每对引物扩增出7.47个位点,其中多态性标记位点185个,占82.6%。偏分离分析显示,在185个SSR多态性标记位点中有24个标记产生偏分离,占13.0%,符合植物遗传作图时通常偏分离标记比率<30%的要求,可用于遗传作图。构建了1张四倍体杂交冰草的分子遗传连锁框架图谱,该图谱包含14个连锁群、185个标记,其长度范围在123.0~202.6 cM之间,连锁群LG4最长、LG12最短,各连锁群的平均长度167.32 cM,覆盖基因组总长度2342.5 cM,标记间的平均距离12.66 cM。 相似文献
2.
本研究以‘凤梨朵’ב大乌圆’的F1群体（FD）200 株杂交后代作为作图群体，结合父母本，利用RAD-seq技术开发大量SNP标记。采用Joinmap4.1软件构建遗传图谱，使用Mergemap进行整合获得整合图谱。并采用MapQTL软件对单果重进行QTL定位，确定QTL位点的数量、位置。结果表明：使用MergeMap软件对父母本连锁群进行整合，整合图谱共形成15个连锁群，总的遗传距离为2 873.39 cM，平均遗传距离为0.36 cM，包含8 014个SNP位点。在该图谱上监测到65 个与单果重性状相关的QTL位点，分布于lg1，lg3，lg4，lg5，lg8，lg10，lg14 连锁群上。本研究所构建的遗传图谱是目前龙眼上所建立的标记数量最多，密度最高的遗传图谱，为未来龙眼数量性状精细定位、图位克隆以及功能基因挖掘等研究提供了有力的依据。 相似文献
3.
为了给后期马铃薯块茎高淀粉、高干物质及产量等重要数量性状基因座(QTL)定位和分子标记辅助育种奠定基础,以四倍体马铃薯YSP-4×MIN-021杂种F1的182个分离单株为作图群体,利用相关序列扩增多态性(SRAP)分子标记进行了遗传图谱构建研究。试验从357对SRAP引物中筛选出适宜引物36对。用这些引物对马铃薯杂种F1的182个分离单株及其亲本的基因组DNA进行PCR扩增得到598个SRAP标记。卡方检验显示偏分离标记数为127个,其中母本连锁群59个,父本连锁群68个,偏分离比率均小于30%,符合遗传作图的要求。用软件JoinMap4.0建立了2张四倍体马铃薯双亲的SRAP遗传图谱。母本YSP-4的连锁群总长度为1572.2cM,标记数目为274个,平均间距为5.74cM,12个连锁群的长度范围为14.03~214.44cM;父本MIN-021的连锁群总长度为1932.23cM,标记数目为324个,平均间距为5.96cM,各连锁群的长度范围为93.65~242.06cM。 相似文献
4.
多花黑麦草遗传连锁图的构建 总被引：6，自引：0，他引：6
利用多花黑麦草(Loliummu ltiflorum)细胞质雄性不育(CMS)F1群体(124个个体),以来自父本和母本的分离位点采用SSR、AFLP、EST-CAPS(表达序列标签酶切扩增多态性)和RGA-CAPS(抗病基因类似物酶切扩增多态性)等标记方法进行多态性的选择并对父、母本分别构建遗传连锁图。母本连锁图包含362个标记位点,分别包含SSR标记240个、AFLP标记84个、EST-CAPS标记24个和RGA-CAPS标记14个,由7个连锁群组成,覆盖全长776.4cM,各连锁群长度在85.8至135cM之间,相邻标记之间的平均距离为2.14cM;父本7个连锁群,包含376个标记,其中SSR标记252个、AFLP标记82个、EST-CAPS标记29个和RGA-CAPS标记13个,连锁图全长710.0cM,相邻标记之间的平均距离为1.89cM;标记密度高、标记分布均匀、连锁图长度中等。 相似文献
5.
基于SRAP标记,以遗传关系和表型差异大的菊苣亲本PI 651947和PI 652007杂交获得的84个F1单株为作图群体,进行连锁图谱的构建。采用Map Manager QTX b20软件进行连锁分析,分别构建了PI 651947和PI 652007的分子连锁框架图,共获得77个SRAP标记,其中父本遗传图谱涉及4个连锁群,包含19个标记,图谱总长为450.9 cM,标记间平均图距为23.7 cM。母本遗传图谱涉及13个连锁群,包含58个标记,图谱总长为1404.8 cM,标记间平均图距为24.2 cM。研究结果可为菊苣重要农艺性状QTL定位奠定基础,为菊苣分子育种研究提供了基础信息。 相似文献
6.
为解析调控小黑麦(Triticosecale Wittmack)草产量的遗传机制,本研究以‘甘农7号’小黑麦与‘石大1号’小黑麦构建的F6代重组自交系(RIL)群体为材料,利用小黑麦RIL群体分子图谱,结合株高、分蘖数、穗下节间长和单株鲜重的表型值,进行QTL分析。共检测到5个株高QTL,分布在连锁群LG1,LG3,LG4,LG6上,遗传贡献率为6.56%～12.86%;4个分蘖数QTL,分布在连锁群LG2,LG5,LG6,LG7上,遗传贡献率为7.11%～12.44%;3个穗下节间长QTL,分布在连锁群LG1,LG2,LG5上,遗传贡献率为7.69%～9.63%;4个单株鲜重QTL,分布在连锁群LG2,LG5,LG6,LG7上,遗传贡献率为9.65%～13.63%。其中,株高和分蘖数的主效位点为qPH6-1和qNT5-1,表型变异解释为12.86%和12.44%;单株鲜重的主效位点为qBS2-1和qBS6-1,表型变异解释率为12.17%和13.63%,二者累加对单株鲜重具有增加效应。本研究为饲用小黑麦生物产量的精细定位和分子辅助育种提供了重要理论支撑。 相似文献
7.
《中国草地学报》2017,(4)
以散穗高粱×红壳苏丹草杂种F2代305个分离单株群体为材料,在前期已构建出的高丹草高密度AFLP分子标记遗传图谱上,采用MQM模型法对茎粗、叶片数、叶长、叶宽、穗长、穗宽、分蘖数共7个农艺性状进行了QTL定位分析。结果表明:7个性状三年一点测定的平均值均呈正态分布,适合于QTL定位分析;在LOD2.5条件下,7个性状共定位了63个QTL,分布在10个连锁群上,其遗传贡献率变幅在8.8%~44.4%之间。在63个QTL中,控制茎粗的QTL有13个,控制叶长的有11个,控制分蘖数的有10个,控制穗宽的有16个,4个性状的QTL在10个连锁群上均有分布;控制叶宽的QTL有2个,分布在LG4连锁群上;控制穗长的有2个,分别位于LG2和LG3连锁群上;控制叶片数的QTL有9个,其分别位于LG1、LG2、LG3、LG4、LG6、LG8、LG10连锁群上。 相似文献
8.
刘晶赵方媛李冬梅李雪田新会杜文华 《草地学报》2019,(1):219-226
本研究以饲用型小黑麦杂交F_2代为作图群体,利用ISSR分子标记构建了遗传连锁图谱,并对小黑麦草产量相关性状(株高,分蘖数,单株生物量)进行了QTLs定位,可为小黑麦草产量相关主效QTL挖掘、功能基因定位以及分子标记辅助育种奠定基础。结果表明:521个F_2代单株草产量相关性状的田间表型数据呈连续变异,分布频率大致接近正态分布,可用于QTLs定位。该遗传图谱包含7个连锁群,图谱总长度为542.9cM,标记间平均距离为5.90cM,共有92个位点。对草产量相关性状基因进行QTL定位分析,共检测到17个QTLs,分布在6个连锁群上,控制株高的QTLs有5个,贡献率为6.7%～13.2%;控制分蘖数的QTLs有7个,贡献率为5.4%～15.4%;控制单株生物量的QTLs有5个,贡献率为7.4%～12.4%。其中QPH7-2,QNT2-2和QBS2分别对小黑麦株高、分蘖数和单株生物量的贡献率最大,为主效QTLs,可对其进行进一步克隆、转化及利用。 相似文献
9.
分别以早熟低产和晚熟高产苜蓿单株为父母本,通过人工杂交构建了四倍体紫花苜蓿(Medicago Sativa)F1遗传作图群体,采用单因子变量分析法,以降落式PCR和常规PCR结合的反应程序,建立了适宜于紫花苜蓿的分子标记扩增体系;应用130对SSR引物进行筛选,获得60对引物在父母本间存在多态性而被用于绘制遗传连锁图。采用PAGE电泳分析,对作图群体进行基因型分析。通过TetraploidMap软件对60个SSR标记进行连锁作图分析,有44个标记可以定位在8个连锁群上,占总标记数的33.8%,覆盖遗传距离979 cM,两标记间平均图距为22.25 cM,初步构建了四倍体紫花苜蓿遗传图谱的框架图,还需要进一步添加标记数量增大其饱和度,为重要性状的QTL定位奠定基础。 相似文献
10.
本研究以饲用型小黑麦杂交F2代为作图群体,利用ISSR分子标记构建了遗传连锁图谱,并对小黑麦草产量相关性状（株高,分蘖数,单株生物量）进行了QTLs定位,可为小黑麦草产量相关主效QTL挖掘、功能基因定位以及分子标记辅助育种奠定基础。结果表明：521个F2代单株草产量相关性状的田间表型数据呈连续变异,分布频率大致接近正态分布,可用于QTLs定位。该遗传图谱包含7个连锁群,图谱总长度为542.9 cM,标记间平均距离为5.90 cM,共有92个位点。对草产量相关性状基因进行QTL定位分析,共检测到17个QTLs,分布在6个连锁群上,控制株高的QTLs有5个,贡献率为6.7%~13.2%;控制分蘖数的QTLs有7个,贡献率为5.4%~15.4%;控制单株生物量的QTLs有5个,贡献率为7.4%~12.4%。其中QPH7-2,QNT2-2和QBS2分别对小黑麦株高、分蘖数和单株生物量的贡献率最大,为主效QTLs,可对其进行进一步克隆、转化及利用。 相似文献
11.
通过构建紫花苜蓿杂交F1代遗传分离群体,研究紫花苜蓿早熟性状的遗传特性,确定始花期性状的最适遗传模型,同时定位始花期相关的QTL位点。以低产早熟紫花苜蓿(父本)和高产晚熟紫花苜蓿(母本)为亲本构建杂交群体,以亲本和二者杂交产生的152个F1代单株为研究对象。于2015和2016年调查始花期性状,运用主多基因遗传模型分析始花期性状的最适遗传模型。通过GBS测序技术对154个单株进行基因分型,利用测序产生的SNP标记构建连锁图谱,同时结合表型数据进行QTL定位。结果表明:2MG-A为始花期性状的最适遗传模型,2015年的主基因遗传率为99%,2016年的主基因遗传率为98.5%。父本连锁图覆盖图距为1386cM,平均标记密度3.2cM;母本连锁图覆盖图距为798.73cM,平均标记密度8.07cM。对两年的数据进行QTL定位分析得到2个主效QTL位点,表型贡献率分别为12.1334%和11.0157%。表明始花期主要受两对主效基因控制,同时具有加性作用。始花期性状主要由2个QTL位点控制。 相似文献
12.
水稻饲料营养含量的QTL定位分析 总被引：1，自引：1，他引：0
应用85个SSR标记,对普通野生稻与粳稻台中65为亲本建立的F2群体进行基因检测,构建了覆盖水稻基因组12条染色体的SSR分子标记连锁图,采用Mapmaker/QTL1.0统计软件对决定水稻饲用营养价值的粗蛋白、粗纤维、粗脂肪、粗灰分、硅酸和可溶性糖含量的基因座位进行了定位分析。结果定位了影响粗蛋白含量的3个QTLs,影响粗脂肪含量的1个QTL,影响可溶性糖含量的3个QTLs,影响硅酸含量的2个QTLs,这9个QTLs分别位于第1,2,4,7,8,9,10和11染色体上。其中主效QTL4个,分别是影响粗脂肪含量的qCEE-1(贡献率56.8%),影响可溶性糖含量的qCWSC-4(贡献率23.1%)和qCWSC-7(贡献率25.0%),影响硅酸含量的qCS-9(贡献率15.9%),其余5个为微效QTL。没有检测到影响粗纤维含量和粗灰分含量的QTL。 相似文献
13.
Zhang H Zhang YD Wang SZ Liu XF Zhang Q Tang ZQ Li H 《Zeitschrift für Tierzüchtung und Züchtungsbiologie》2010,127(6):462-468
In broiler chickens, bone problems are an important welfare issue that has been linked to genetic selection for rapid growth. The objectives of this study were to identify and fine map quantitative trait loci (QTL) associated with bone traits. The Northeast Agricultural University resource population (NEAURP) being an F(2) population was used in this study, and a total of 17 bone traits were measured. In primary genome scan, the linkage map was constructed with 23 microsatellite markers across the entire chicken chromosome 1. Seventeen QTLs for bone traits were identified and 12 of these were found between LEI0079 and ROS0025 (50.8 cM apart). To fine map the QTLs located between LEI0079 and ROS0025, more markers and more individuals were used and a new partial linkage map was constructed. The confidence intervals for QTLs were sharply narrowed down from 24.5～52.6 to 2.7～17.0 Mb. This study identified chromosome regions harbouring significant QTLs affecting bone traits and showed that the use of more markers and individuals could decrease the confidence interval of QTL effectively. The results provide a useful reference for further candidate gene research and MAS for bone traits. 相似文献
14.
Fine mapping a quantitative trait locus affecting ovulation rate in swine on chromosome 8 总被引：9，自引：0，他引：9
Ovulation rate is an integral component of litter size in swine, but is difficult to directly select for in commercial swine production. Because a QTL has been detected for ovulation rate at the terminal end of chromosome 8p, genetic markers for this QTL would enable direct selection for ovulation rate in both males and females. Eleven genes from human chromosome 4p16-p15, as well as one physiological candidate gene, were genetically mapped in the pig. Large insert swine genomic libraries were screened, clones were isolated and then screened for microsatellite repeats, and informative microsatellite markers were developed for seven genes (GNRHR, IDUA, MAN2B2, MSX1, PDE6B, PPP2R2C, and RGS12). Three genes (LRPAP1, GPRK2L, and FLJ20425) were mapped using genotyping assays developed from single nucleotide polymorphisms. Two genes were assigned since they were present in clones that contained mapped markers (HGFAC and HMX1). The resulting linkage map of pig chromosome 8 contains markers associated with 14 genes in the first 27 cM. One inversion spanning at least 3 Mb in the human genome was detected; all other differences could be explained by resolution of mapping techniques used. Fourteen of the most informative microsatellite markers in the first 27 cM of the map were genotyped across the entire MARC swine resource population, increasing the number of markers typed from 2 to 14 and more than doubling the number ofgenotyped animals with ovulation rate data (295 to 600). Results from the revised data set for the QTL analysis, assuming breed specific QTL alleles, indicated that the most likely position of the QTL resided at 4.85 cM on the new linkage map (F1,592 = 20.5150, genome-wide probability less than 0.015). The updated estimate of the effect of an allele substitution was -1.65 ova for the Meishan allele. The F-ratio peak was closest to markers for MAN2B2 (4.80 cM) and was flanked on the other side by markers for PPP2R2C. Two positional candidate genes included in this study are MAN2B2 and RGS12. These results validate the presence of a QTL affecting ovulation rate on chromosome 8 and facilitate selection of positional candidate genes to be evaluated. 相似文献
15.
为初步鉴定与紫花苜蓿(Medicago sativa)粗灰分、钾、钙、镁、磷含量调控相关的数量性状基因座(Quantitative trait loci，QTL)和分子标记，本研究用低产早熟苜蓿和高产晚熟苜蓿杂交，构建了由392个个体组成的F1群体，对这些性状进行3年表型数据测定，且基于前期已构建的高密度遗传连锁图谱开展QTL定位。结果表明：共检测到63个与粗灰分和4种矿质元素含量相关的QTL，分布于22个染色体上，单个QTL的贡献率为2.50%~29.85%；其中重复定位的QTL共8个(qCa-3C-1和qCa-3C-2，qCa-6B-1和qCa-6B-2，qCa-6D-1和qCa-6D-2，qAsh-8B-1和qAsh-8B-2)，共定位的QTL有6个(qP-2C和qK-2C，qP-3A和qMg-3A，qP-6D-3和qMg-6D-2)；经进一步验证，与这些QTL紧密连锁的标记可用于分子标记辅助选择育种。本研究为选育矿质营养更丰富的苜蓿新品种奠定了基础。 相似文献