牡丹根际微生物的研究进展     

杨瑞先  王祖华  赵梓轩  李嘉珏 《河南农业科学》2017,46(6)

牡丹连作障碍严重危害牡丹的生长发育,其形成原因复杂,最新研究显示,牡丹连作障碍与根际微生物菌群结构的变化具有一定的相关性。根据近年来国内外关于牡丹与根际微生物互作的研究成果,对牡丹根际微生物的多样性、牡丹与根际微生物的相互作用、牡丹连作障碍与根际微生物的关系等方面的研究进展进行综述,提出了今后牡丹根际微生物方面需要深入研究的几个问题,以期从根际微生物种群动态变化的角度认识牡丹连作障碍的原因并为其防治提供思路。  相似文献   

基于网络药理学和分子对接探讨苦参碱在奶牛生产中的抗炎作用机制     

赵梓轩  杨嘉睿  蒋林树  童津津 《动物营养学报》2022,(12):7872-7885

本研究旨在应用网络药理学和分子对接技术探讨苦参碱在奶牛生产中的抗炎作用机制。登录中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）数据库查找苦参碱的主要靶点,再登录PubChem以及PharmMapper数据库对苦参碱靶点进行补充,同时检索GeneCards和DisGeNET数据库获得炎症相关靶点,获取苦参碱与炎症交集靶点即为苦参碱治疗奶牛炎症的候选靶点;通过STRING数据库输入苦参碱抗炎交集靶点并构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络,通过Cytoscape 3.9.1软件中的CytoNCA模块筛选该网络核心靶点,利用David数据库对苦参碱抗炎靶点进行基因本体（GO）功能和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。通过Autodock Tools软件对核心靶点以及活性成分进行分子对接。结果表明,苦参碱发挥抗炎作用的相关靶点有71个;PPI网络分析结果发现白蛋白（ALB）、肿瘤坏死因子（TNF）、MYC原癌基因碱性螺旋-环-螺旋转录因子（MYC）、半胱氨酸-天冬氨酸蛋白酶3(CASP3)、周期蛋白D1(CCND1)、CD44和白细胞介素-6(IL-6)是苦参碱抗炎作用的核心靶点...  相似文献   

基于网络药理学预测青蒿缓解奶牛氧化应激的作用机制     

潘婵媛  赵梓轩  段铭洁  蒋林树  童津津 《畜牧兽医学报》2023,(3):1071-1084

运用网络药理学分析青蒿的药理成分及其作用网络，探讨其缓解奶牛氧化应激的作用机制。通过TCMSP数据库确定青蒿的化合物组成并筛选活性成分靶点，使用Uniprot找到对应靶点基因；OMIM、Gene Cards和CTD数据库查找与氧化应激(热应激)有关的病理靶点。用Venny 2.1对活性成分靶点与氧化应激疾病的靶点取交集后导入STRING数据库，建立蛋白质互作(PPI)网络并应用Cytoscape 3.9.1软件进行可视化处理及获取核心靶点。DAVID数据库对活性成分和氧化应激疾病的共同靶点基因进行GO功能注释和KEGG通路富集，应用Cytoscape软件构建成分-靶点-通路的网络图。结果表明，青蒿的化合物组成共筛选到19个活性成分及217个对应的靶点基因，氧化应激对应靶点基因共11 442个。成分与氧化应激交集靶点基因共有136个，Cytoscape筛选得到5种关键活性成分和33个关键靶点。PPI网络分析共得到11个核心靶点基因，GO功能注释细胞组分、生物学过程、分子功能各320、37、105个条目，KEGG通路富集分析得到170条通路。综上，青蒿可通过多成分、多靶点、多通路抗奶牛氧化...  相似文献