基于松属不同树种EST序列的马尾松SSR引物开发     

王晓锋  季孔庶  何卫龙 《湖南林业科技》2013,(1):14-17,64

利用松属5个树种的EST序列,分别树种查找SSR位点,采用Primer3．0软件进行引物设计。设计的5个树种的EST-SSR引物中：所占比例最高的均为三核苷酸重复,其次是六核苷酸重复,两者之和都达到了64％以上;四核苷酸重复所占比例均为最低。从设计的引物中分别不同树种各选取20对进行引物合成和通用性检测以及马尾松群体检测,结果表明：松属5个树种的EST序列开发的马尾松SSR引物,其在马尾松中的扩增成功率为60％-80％;最高的是辐射松,最低的是海岸松,平均为72％。通用性最好的为辐射松,属内的通用性为94％;属间和科间通用性也分别达到75％和44％。不同树种序列来源的EST-SSR引物,其扩增成功率在10％-30％;最高的是北美短叶松,其次是辐射松,最低的是扭叶松和火炬松;平均为17％。  相似文献   

马尾松转录组测序和分析   总被引：7，自引：0，他引：7  

王晓锋  何卫龙  蔡卫佳  阮倩倩  潘婷  季孔庶 《分子植物育种》2013,(3):385-392

本研究首次构建了马尾松均一化cDNA文库,采用Illumina高通量测序技术对转录组进行了测序,利用生物信息学方法开展基因表达谱的研究、功能基因的预测。EST序列拼接获得83680个contig,其中33772个contig被注释为相应的331669对生物学功能,10647个contig被注释具有酶功能。根据KEGGpathway数据库,对马尾松转录组的contig进行Pathway生物学通路的注释和预测,共识别出10647个contig具有对应的1029种酶功能,并关联到135条生物学通路。SSR查找发现,从83680个contig中找到889个SSR位点,占contig总数的比例为1.06%。其中,三核苷酸重复所占比例最高,达到48.37%,其次是六核苷酸重复,为19.12%,比例最低的是四核苷酸重复,仅为4.72%,二核苷酸重复和五核苷酸重复基本相同,分别为14.62%和13.16%。SSR不同重复基元类型中,出现频率最高的为AT/AT,其次是AGC/CTG和AAG/CTT。  相似文献   

杂交鹅掌楸苗期超氧化物歧化酶和过氧化物酶的活力变异   总被引：1，自引：1，他引：0  

杨秀艳  季孔庶  王章荣  赖焕林 《浙江林学院学报》2005,22(4):385-389

在不同生长季节,对19个杂交鹅掌楸Liriodendron chinense×Liriodendron tulipifera家系和2个对照家系苗木的超氧化物歧化酶(SOD)和过氧化物酶(POD)的活力进行了测定,并对它们在家系间的变异以及与生长的关系进行了分析.结果表明,2种酶的活力表现出生长前期低于生长后期的趋势,并且在家系间的差异达到了显著或极显著水平.相关分析结果表明,生长性状与SOD活力呈显著正相关,而与POD活力负相关不显著.鹅掌楸Liriodendron chinense与北美鹅掌楸Liriodendron tulipifera的SOD活性均较低,有84.2%的家系SOD活性较两亲本种高,其余表现为两亲本种的中间类型;有63.2%杂种家系的POD活性表现为两亲本的中间类型.SOD可以作为评价和预测杂交鹅掌楸家系生长性状的生理生化指标之一.图2表3参10  相似文献   

马尾松实生种子园花量分析   总被引：5，自引：0，他引：5  

方彦  张薇  陈月旻  季孔庶 《林业科技开发》2007,21(6):43-46

观测了福建省上杭县白沙林场马尾松实生种子园的21个家系花量,分析了家系内与家系间雌雄球花量、各家系雌雄球花量在不同冠层和方位的分布.结果表明:家系间与家系内球花量差异显著.马尾松球花花量在不同冠层的分布呈现显著差异.雌球花主要集中在上、中层,下层极少;雄球花则主要集中在中、下层.同时球花花量的分布在方位上差异不显著.可见,构建马尾松实生种子园过程中,在注重建园材料的生长、材性等重要经济性状的同时,还要注意雌雄球花量选择.此外,选择建园立地环境和加强人工管理也是提高马尾松开花量和保证雌雄球花比例,保证种子园稳产、高产的重要措施.  相似文献   

利用ISSR标记鉴别珍珠黄杨无性系   总被引：1，自引：0，他引：1  

吕乐燕  季孔庶 《林业科技开发》2009,23(5):87-89

利用ISSR-PCR方法对珍珠黄杨5个无性系进行了基因组多态性分析,从100个ISSR引物中筛选出19个多态性引物用于扩增,共扩增出256条谱带,其中多态性条带211条,占总带数的82.4%,平均每条引物扩增的DNA带数目为13.5条,依据扩增结果进行Nei相似性系数和遗传距离分析,利用UPGMA法构建聚类树状图.结果表明:ISSR分析产生了一些无性系特有的指纹图谱,认为ISSR技术在珍珠黄杨无性系鉴定和阐明遗传关系中有一定的应用潜力.  相似文献   

马尾松种源针叶内痕量元素数量变异与生长相关性*          下载免费PDF全文

季孔庶 《浙江农林大学学报》1997,14(3):231-236

采用电感耦合等离子直读光谱仪(ICPQ)测定休眠期马尾松10个种源针叶内10种痕量矿质元素的水平, 并测量树高和胸径的平均生长量。ICPQ检测到其中7种痕量元素, 而其余的3种均低于其测定范围。痕量矿质营养存在种源水平上的变异, 各元素在种源间的离散程度随含量降低而趋小, 且不少元素与原产地经、纬度呈负相关。对马尾松树高和胸径生长量与痕量矿质营养水平进行逐步回归分析, 初步认为锂元素可作为马尾松生长量的早期预测因子。  相似文献