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利用菊芋(Helianthus tuberosus L.)转录组测序获得的63 089条Unigene(45.71 Mb)进行SSR查找分析,共检测出6 635个SSR位点,包含于5 452条Unigene中,出现频率为10.52%,SSR位点发生频率为8.64%,其中SSR位点的主要类型为二核苷酸重复,占总SSR的45.24%,其次为三核苷酸重复。SSR位点中共包含180种重复基序,其中出现频率较高的基序主要有AG/CT、ACC/GGT、ATC/ATG、AAG/CTT。设计36对多态性SSR引物组合进行扩增和多态性评价,其中,20对引物存在多态性差异,占55.56%。利用20对引物对18个菊芋资源样品进行多样性分析,分析表明,有效等位基因(Ne)在SSR位点上变化幅度较小;Shannon指数平均值为0.622;期望杂合度(He)和观察杂合度(Ho)平均值分别为0.434和0.447。系统进化树显示,菊芋资源可从块茎表皮颜色上分为白皮和红皮2大类。此外,从地域来源上进行聚类,能将18份菊芋种质资源聚为5类。以上分析表明,菊芋转录组测序产生的Unigene信息可作为开发SSR标记的有效来源,利用获得的SSR标记可为菊芋及其近缘种的遗传图谱构建、遗传多样性分析、基因组比较研究等提供丰富可靠的标记选择。 相似文献
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[目的]明晰引进小白菜种质资源在青海地区种植的适应性,筛选性状优异的种质资源,为小白菜优良品种选育及种植提供科学依据.[方法]以收集引进的20份京研系列小白菜品种为材料,对其株幅、净菜率、株型、束腰性等农艺性状及维生素C(Vc)、粗纤维、亚硝酸盐和硝态氮含量等营养指标进行调查统计,结合遗传多样性、营养成分、隶属函数、相关性、主成分和聚类分析等方法进行系统评价.[结果]20份小白菜品种的不同性状间具有丰富的遗传多样性.质量性状的遗传多样性指数(H')变化范围在0.00~1.16,其中叶色最高,为1.16.数量性状的H'在0.88~1.59,变异系数在0.03~0.41,排序为单株重>短缩茎纵径>叶柄宽>叶宽>株高>叶柄长>腰粗>短缩茎横径>叶长>株幅>干物质率>净菜率.Vc含量介于72.89~396.82 mg/100 gFW,粗纤维含量介于3.81%~23.00%,亚硝酸盐含量介于0.32~3.13μg/g,硝态氮含量介于16.67~604.72 mg/kgFW.12个数量性状的隶属函数均值(R)介于0.22~0.81.相关分析结果表明,株高与株幅、腰粗、叶长、叶宽和单株重均存在极显著正相关(P<0.01,下同);株幅与腰粗、叶长和叶宽均呈极显著正相关;腰粗与叶长、叶宽和单株重均呈极显著正相关;叶宽与短缩茎横径呈显著正相关(P<0.05),相关系数为0.476;叶柄宽与短缩茎纵径呈负相关,与干物质率呈极显著负相关;短缩茎横径与单株重间存在极显著正相关.提取到的8个主成分特征值均在1.00以上,8个主成分的累计贡献率达87.45%.根据聚类分析结果,可将20个供试材料划分为五大类,第Ⅰ类中有5份资源,第Ⅱ类有3份资源,第Ⅲ和第Ⅴ类都只有1份资源,第Ⅳ类共有10份资源,其中,以第Ⅱ类的夏绿2号、春油5号和京绿7号3个品种的商品性最好.[结论]参试小白菜资源表型性状的遗传多样性指数和变异程度较高,具有丰富的变异程度和多样性;不同小白菜资源营养成分含量具有明显的差异性.综合隶属函数和营养成分分析筛选出春油5号和春油1号2个小白菜品种,其露地种植田间综合表现较优,适宜在青海当地推广种植. 相似文献
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芜菁是十字花科芸薹属蔬菜作物,具有耐低温、耐贫瘠等优良特征,能够在海拔4 000 m的高原地区种植。为了明晰芜菁种质资源地上部表型的特征特性,本研究以126份芜菁种质资源为材料,分析了其地上部性状的多样性。结果显示芜菁叶片呈现出比较丰富的多样性,其中叶片长度分布范围为20.8~63.17 cm,叶宽分布在6.7~23.5 cm之间,叶片形状、裂片数量、叶片绒毛和叶柄形状均表现出丰富的表型性状。多样性分析显示叶柄宽的变异系数最大,达91.26%,多样性指数最高的性状是叶片绒毛;相关性分析表明叶长与株高的相关性最高;主成分分析结果显示8个主成分因子的贡献率达73.255%;聚类分析结果将126份芜菁种质分为3大类,其中第一类包括1份资源,第二类包括21份资源,第三类包括104份资源;采用隶属函数对126份芜菁种质进行了资源分析,最终筛选出15份具有明显优势的种质,其中7份材料适于作为食用芜菁种植,8份种质材料适于作为冬储牧草的饲用材料,为后续研究、加工利用提供可选优质材料。本研究结果将为芜菁种质资源的利用和鉴定提供有效信息。 相似文献
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菊芋ISSR-PCR反应体系的建立与优化 总被引:1,自引:0,他引:1
利用正交试验设计的方法,从Mg2+浓度、dNTPs浓度、引物浓度和Taq酶浓度4因素对菊芋ISSR-PCR反应体系进行优化分析,并在此基础上对模板DNA浓度及退火温度进行梯度检测。结果表明:菊芋20μl最佳反应体系包括10×PCR buffer,200μmol/L dNTP,0.5μmol/L引物,1.5 mmol/L Mg2+,1.0 U Taq DNA聚合酶和50 ng模板DNA。这一优化系统的建立,将为菊芋种质资源鉴定及遗传多样性的研究奠定基础。 相似文献
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干旱胁迫下菊芋可溶性碳水化合物的积累及分配规律 总被引:1,自引:0,他引:1
以青芋1号、青芋2号2个菊芋品种为试验材料,采用不同的聚乙二醇PEG-6000胁迫浓度(0、10%、20%、30%)及不同控水胁迫强度(轻度、中度、重度)2种人工模拟干旱胁迫的方式对其不同部位可溶性碳水化合物在处理不同时间后的含量变化进行研究。结果表明,在PEG胁迫下,青芋1号、青芋2号叶片中可溶性碳水化合物含量均随着胁迫时间增加而增加;青芋1号茎中随着胁迫时间增加变化趋势不同,青芋2号在PEG浓度为30%、胁迫24 h时效果最明显;青芋1号、青芋2号根中可溶性碳水化合物含量随着胁迫时间增加均增加;在不同控水强度胁迫下,青芋1号叶片中呈现先上升后下降的趋势,青芋2号叶中呈上升趋势;青芋1号、青芋2号茎中均随着控水时间的增加而增加;青芋1号根中随着控水时间的增加呈现下降的趋势,青芋2号根中变化不同,但差异不大。 相似文献
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为了筛选在腾格里沙漠最适宜的菊芋品种和最佳施肥量及浇水量,对青芋系列的4个品种进行了沙漠种植,开展了N、P、K肥料单因素试验及浇水量试验,并进行不同处理下菊芋块茎产量及个数进行统计分析。结果表明:(1)4个品种以青芋3号产量最高,青芋4号产量最低;(2)滴灌模式下,随着浇水量的增加,产量呈现逐渐增加的趋势,单株产量最高的为T4处理;渗透浇水模式下,4个处理下,随着浇水量的增加,产量呈现减低的趋势;(3)以N4下的单株块茎重量最高达900g;以P6处理下的单株块茎重最大为650g;以K5的单株块茎重最大为738.33g。本研究为后续利用菊芋治理沙漠创造价值奠定了理论基础。 相似文献
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菊芋的功能营养价值开发及应用前景 总被引:1,自引:0,他引:1
菊芋是一种非粮能源作物,被称为"21世纪人畜共用作物",在医疗保健、生态环境改善以及功能食品开发等方面有着重要作用。为全面了解菊芋的应用价值和应用前景,主要从菊芋所含的菊糖、氨基酸、绿原酸、黄酮等成分介绍了菊芋的营养价值和医疗保健功能,从防风固沙、植物修复、生物防治等方面综述了菊芋的生态应用价值,从食品、饲料、能源、园林观赏等角度总结了菊芋的开发利用前景,以期为菊芋的生产应用提供参考。 相似文献
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实时荧光定量PCR具有灵敏度、特异性和重复性好等优点,是植物中常用于基因表达和转录分析的重要手段。在分子生物学的研究中,选择表达相对稳定的内参基因是分析实时荧光定量实验数据的前提。本研究以菊芋(Helianthus tuberosus)开花时期的幼根、嫩茎、叶片、块茎和花瓣为材料,运用荧光定量PCR方法分析了18S rRNA、EF1α、Actin、β-actin、GAPDH、25S rRNA和UBQ5 7个内参基因的表达量,通过Ge Norm、Norm Finder和Best Kkeeper软件的综合分析,发现25S r RNA的稳定性最好,可用于菊芋基因表达的内参基因。而GAPDH在不同样品中稳定性最差,不适合作为内参基因。本研究为菊芋实时荧光定量PCR中内参基因的选择提供了参考。 相似文献
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29份菊芋种质资源氨基酸含量和营养价值评价 总被引:1,自引:0,他引:1
[目的]研究29份菊芋块茎氨基酸含量及组成。[方法]将菊芋块茎冻干后,利用氨基酸自动分析仪法进行氨基酸测定。[结论]菊芋块茎中含有13种氨基酸,种类较齐全。菊芋块茎中人体必需氨基酸含量最高的F6质量分数为610.0mg/100g,F6中必需氨基酸含量占氨基酸总量的15.0%;儿童必需氨基酸含量最高的F7为2 885.2mg/100g。必需氨基酸占总氨基酸含量最高的是青芋4号,为8.31%,精氨酸含量最高的是F7,为2 851.1mg/100g,鲜味类氨基酸含量最高的是F18,为322.7mg/100g,甜味类氨基酸含量最高的是F5,为859.7mg/100g,芳香族氨基酸含量最高的是青芋4号,为127.2mg/100g。在遗传距离698处,可将29份菊芋资源分成2大类。 相似文献
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猕猴桃具有丰富的营养、药用价值还含有丰富的维生素,深受人们喜爱。近年来,随着猕猴桃产业的不断发展壮大,也面临着众多问题,如由于其果实属呼吸跃变型果实,易软化霉烂,不耐贮藏,怎样延长果实的贮藏期限,目前已成为猕猴桃产业发展壮大亟待解决的关键问题。本综述围绕猕猴桃果实采后生理及贮藏条件的研究从猕猴桃采后环境和采后处理等方面对猕猴桃贮藏的温度、光照等贮藏环境,草酸、褪黑素、槲皮素等化学处理,O_3、H_2等气体处理以及对保鲜剂如1-甲基环丙烯(1-MCP)、乳酸链球菌素(Nisin)等应用的最新研究,进展进行评述。本研究为猕猴桃鲜果的贮藏提供了科学依据,同时为猕猴桃产业的深入研究及进一步开发利用提供有益思路。 相似文献