草菇S-腺苷-L-高半胱氨酸水解酶基因的克隆和序列分析   总被引：1，自引：0，他引：1  

孙晓红  陈明杰  汪虹  冯爱萍  潘迎捷 《食用菌学报》2010,17(1)

根据草菇(Volvariella volvacea)S-腺苷-L-高半胱氨酸水解酶基因(SAHH)全长cDNA序列设计引物,以草菇基因组DNA为模板,PCR扩增获得草菇SAHH基因的全长序列,序列分析结果表明,草菇SAHH长度为1868bp,编码430个氨基酸残基,基因由12个外显子和11个内含子组成,将草菇SAHH基因推断的氨基酸序列与其它物种的SAHH基因氨基酸序列进行比较发现,SAHH基因保守性较高。  相似文献   

草菇全基因组框架图   总被引：5，自引：1，他引：4  

鲍大鹏  赵国屏  谭琦  王升跃  陈明杰  郑华军  张劲松  朱永强  汪虹  康慧  陈祥  林楠  冯爱萍 《食用菌学报》2010,17(1)

采用Roche 454 GS FLX测序技术和Solexa测序技术相结合,进行了草菇(Volvariella volvacea)全基因组的测序,最终获得了长度为35.67Mb的草菇全基因组序列。通过生物信息学预测,获得了11097个蛋白编码基因,其中5516个基因有明确的功能注释信息。这是在国际上首次报道的草菇基因组框架图。  相似文献   

草菇S-腺苷-L-高半胱氨酸水解酶基因上游序列的克隆和分析     

孙晓红  陈明杰  汪虹  冯爱萍  潘迎捷 《食用菌学报》2010,17(3)

根据草菇(Volvariella volvacea)S-腺苷-L-高半胱氨酸水解酶基因(sahh)全长序列设计两个嵌套引物,与Takara LA PCR in vitro cloning试剂盒的接头引物结合进行巢式PCR扩增,得到sahh上游调控序列,通过序列分析发现,该序列含有1个TATA盒和4个CAAT盒.应用MatInspector程序分析sahh上游调控序列,发现该区域存在1个耐盐因子,1个热激因子,2个DRE元件和2个ABA应答元件.  相似文献