尼罗罗非鱼IPS-1基因SNP位点的筛选及其与链球菌抗性的关联分析     

高风英  卢迈新  曹建萌  刘志刚  朱华平  可小丽  杨先乐 《农业生物技术学报》2018,(1)

抗病相关SNP标记的筛选是抗病选育的基础与前提。为获得与尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)链球菌(Streptococcus agalactiae)抗性性状相关的单核苷酸多态性(single nucleotide polymophisms,SNPs)标记,本研究通过克隆测序或PCR产物直接测序法,从20个亲本家系的39尾尼罗罗非鱼的β干扰素启动子刺激物1(interferon-b promoter stimulator 1,IPS-1)基因的测序序列中筛选得到36个SNPs位点。通过snapshot分型法对子代中的链球菌敏感群体(susceptible group,SG)(82尾)和抗性群体(resistance group,RG)(84尾)进行分型,并利用Popgen32软件统计分析IPS-1基因各SNPs位点在两个群体的多态性和遗传参数,结果显示,多态信息含量(polymorphism information content,PIC)介于0.02~0.37,所检测SNPs位点呈现出低度或中度多态。通过SNP位点与链球菌抗性/敏感性状之间的关联分析,发现位点S8(T-3059C)与链球菌敏感性状显著相关(P0.05)。利用Haploview 4.2软件分析IPS-1基因中的36个SNPs位点所形成的单倍块和连锁不平衡情况,结果显示,36个位点可构成6个单倍块和22个单倍型;其中单倍块2中的单倍型H2-3(GTTG)和单倍块3中的H3-4(TTDGTTGAGCGCCA)、H3-2(CCDGTTGAGCGCCA)3个单倍型与尼罗罗非鱼链球菌敏感性状显著相关(P0.05),单倍块3中的单倍型H3-5(TCDGTTGAGCGCCA)则与尼罗罗非鱼链球菌抗性性状显著相关(P0.05)。上述结果表明,筛选到的尼罗罗非鱼IPS-1基因的1个SNPs位点和4个单倍型可作为抗链球菌病尼罗罗非鱼选育的候选分子标记。该研究可为抗链球菌病尼罗罗非鱼新品系的选育提供了资料基础。  相似文献   

杂交尖塘鳢人工繁殖及饲料驯化技术要点     

樊佳佳  马冬梅  朱华平  林明辉  池金泉 《科学养鱼》2022,(4):9-10

<正>尖塘鳢肉嫩味美、无肌间刺、蛋白质水平高,在高档水产品市场很受欢迎,市场售价在100～300元/千克。目前在广东、海南等地已规模化养殖,年产量达10多万吨。杂交尖塘鳢(云斑尖塘鳢♀×线纹尖塘鳢♂)生长上具有显著的超亲杂交优势,且容易进行饲料驯化,2009年后杂交尖塘鳢苗种陆续扩大其市场占有率,苗种的需求逐年递增。  相似文献   

复方中草药对尼罗罗非鱼非特异性免疫功能的影响   总被引：3，自引：0，他引：3  

张意敏  刘志刚  卢迈新  朱华平  可小丽  高风英  黄樟翰 《淡水渔业》2015,(1):67-72

研究了在饲料中添加一种以鱼腥草为主要成分(占40%)的复方中草药制剂对尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)非特异性免疫指标的影响。将鱼腥草、黄芩、板蓝根、连翘、金银花等10种中草药按一定比例充分粉碎后混匀制成以鱼腥草为主要成分的复方中草药制剂,按质量分数0%(对照组)、1%(A组)、3%(B组)和6%(C组)分别添加到基础饲料中饲喂尼罗罗非鱼,饲养12周。分别在第4、8和12周采集各组尼罗罗非鱼血液,测定相关非特异性免疫指标。结果显示:从第8周开始,B组尼罗罗非鱼血清丙二醛(MDA)含量显著降低,C组尼罗罗非鱼血清溶菌酶(LSZ)活力、超氧化物歧化酶(SOD)活力、一氧化氮(NO)含量显著提高,MDA含量显著降低。在第12周,B组和C组尼罗罗非鱼白细胞吞噬百分比、吞噬指数和血细胞呼吸爆发活力、血清SOD活力、LSZ活力、NO含量都显著提高,MDA含量则显著降低。结果表明:在饲料中添加3%和6%质量分数的以鱼腥草为主要成分的复方中草药制剂均能增强尼罗罗非鱼的非特异性免疫力,其中以添加比例为6%的效果最好。  相似文献   

鱼类遗传改良研究综述   总被引：6，自引：2，他引：6  

朱华平  卢迈新  黄樟翰  高风英  杨丽萍 《中国水产科学》2010,17(1)

本文对全世界范围内鱼类遗传改良研究的概况及其有关问题进行了全面的介绍和评述,从选择育种、杂交育种、性别控制、多倍体诱导、细胞核移植和细胞融合、低温保存技术、DNA分子标记育种、转基因技术等方面系统介绍了鱼类遗传改良的方法、在水产养殖中的应用和已取得的成就,并对鱼类遗传改良今后的发展趋势进行了展望,旨在为今后进一步开展鱼类遗传改良研究提供参考。  相似文献   

云斑尖塘鳢与线纹尖塘鳢杂交种肌肉营养成分分析     

苏换换  马冬梅  朱华平  林明辉  樊佳佳  池金泉  梁康威 《水产科学》2022,(2):258-265

为科学评价云斑尖塘鳢、线纹尖塘鳢及其杂交种肌肉的营养价值,采用国内外通用的营养测定方法对3种尖塘鳢的常规营养组分、氨基酸组分、脂肪酸组分以及矿物质元素进行测定与比较分析.试验结果显示,3种尖塘鳢水分、粗蛋白、粗脂肪和粗灰分含量分别为75.80％～79.23％、18.33％～19.23％、0.62％～1.63％和1.20...  相似文献   

罗非鱼无乳链球菌C5a肽酶的克隆及原核表达质粒构建   总被引：1，自引：0，他引：1  

李庆勇  可小丽  卢迈新  朱华平  高风英 《华中农业大学学报》2013,32(4):92-99

为进一步了解无乳链球菌表面蛋白C5a肽酶scpB基因免疫表位及毒力作用基团的相关信息,通过提取罗非鱼无乳链球菌基因组DNA,利用特异性引物PCR扩增出scpB基因的全长开放阅读框(ORF)。结果表明,该基因包括3 405 bp的ORF,可编码1 134个氨基酸,与已报道的人源无乳链球菌ScpB的氨基酸同源性达99.74%。利用生物信息学软件DNAstar、Clustal X 2.0和MEGA 5.05及在线分析工具ExPASy ProtParam、NCBI Proten blast及Conserved Domain等对推导的氨基酸序列进行分析,结果显示罗非鱼无乳链球菌scpB基因编码的氨基酸序列含有3个催化三联体(catalytic triad)位点、7个假定活性位点(putative active site)、2个特异位点(specific hits),以及4个超家族结构（2个肽酶超家族结构Peptidases-S8-S53 superfamily、1个类纤连蛋白超家族结构 DUF1034 superfamily和1个鞭毛钩蛋白超家族结构FlgD-lg superfamily）;并且该氨基酸序列有多个抗原表位,推测ScpB蛋白应具有较强的免疫原性,可作为候选的蛋白疫苗成分。将该片段插入原核表达载体pET32a(+),转入大肠杆菌BL21(DE3),挑取阳性克隆,经PCR、酶切及测序鉴定表明成功构建原核表达载体pET32a(+)/scpB。  相似文献   

翘嘴红鲌鱼苗对几种药物的敏感性试验鲐     

朱华平  谢刚  黄樟翰  卢迈新  黄伟星  肖学铮 《水产养殖》2003,(2)

通过试验确定了8种药物对翘嘴红鲌鱼苗的最低致死浓度范围、半致死浓度和安全浓度。鱼苗对这8种药物的敏感性大小依次为:孔雀石绿>兴棉宝>硫酸铜>漂白粉>敌白虫>亚甲基蓝>甲醛>食盐。并对各种药物使用的有关问题进行了讨论。  相似文献   

广东省淡水养殖的现状、问题以及发展对策   总被引：1，自引：0，他引：1  

朱华平  黄樟翰  卢迈新  高风英 《水产科技》2008,35(2)

广东省淡水养殖业近5年来一直保持着稳步增长，2006年广东省淡水养殖总产量达到323万吨，比2002年增长34．36％，年均递增6．87％。同时“一条鱼”工程的实施取得了很好的成效，渔业产业结构进一步优化，初步形成了以名优品种养殖为主的生产格局，罗非鱼、鳗鱼、鲈鱼、鳜鱼、淡水虾等产量连续多年居全国前列，广东已成为我国淡水养殖的重要基地。本文对广东省淡水养殖的现状、存在的问题进行总结，以期为今后我省淡水养殖业的发展提供借鉴。  相似文献   

3个尖塘鳢引进群体繁育后代的遗传多样性分析          下载免费PDF全文

林明辉  朱华平  苏换换  樊佳佳  池金泉  马冬梅 《南方农业学报》2021,52(1):213-220

【目的】分析3个尖塘鳢引进群体繁育后代的遗传多样性和遗传结构,为尖塘鳢亲本管理和资源可持续利用提供基础资料,同时为尖塘鳢的遗传改良及新品种培育打下基础。【方法】采用微卫星分子标记分析2000年引进的线纹尖塘鳢群体繁育后代（AZ1）、2005年引进的线纹尖塘鳢群体繁育后代（AZ2）及1986年引进的云斑尖塘鳢群体繁育后代（TG）的遗传多样性,运用PopGene32、CERVUS 3.0、Arlequin 3.1计算3个尖塘鳢群体的等位基因数（Na）、期望杂合度（He）、多态信息含量（PIC）及遗传分化系数（F_st）等遗传参数,基于Nei氏遗传距离利用MEGA 7.0中的非加权组平均法（UPGMA）构建系统发育进化树,并以Structure 2.3分析群体间的遗传结构。【结果】12个微卫星分子标记在3个尖塘鳢群体中扩增得到32个等位基因。AZ1群体、AZ2群体和TG群体的平均Na分别为1.33、1.92和2.33,平均He分别为0.034、0.180和0.214,平均PIC分别为0.031、0.155和0.191。3个尖塘鳢群体间的F_st为0.077～0.384、遗传相似度为0.926～0.950、遗传距离为0.052～0.077。3个尖塘鳢群体有22.54%的变异来自于群体间,77.46%的遗传变异来自群体内。基于Nei氏遗传距离构建的UPGM系统发育进化树显示,AZ1群体和AZ2群体先聚类为一支,然后与TG群体聚类在一起。【结论】3个尖塘鳢引进群体繁殖后代遗传多样性水平较低,尤其是AZ1群体近交程度较高,因此相关引种单位或繁殖场需尽快采取相应的选育手段提高现有杂交鳢群体遗传多样性,避免近交衰退带来的风险,也可通过引进新的种质资源提高杂交鳢遗传多样性。此外,3个杂交鳢群体尚未出现种质混杂和杂交情况,仍可作为杂交鳢遗传育种奠基种群。  相似文献   

一株能抑制罗非鱼源无乳链球菌的反硝化芽孢杆菌的筛选鉴定     

刘观斌  王淼  卢迈新  可小丽  刘志刚  朱华平  高风英  曹建萌 《中国水产科学》2016,23(1):207-217

从尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)肠道内容物中分离筛选出具有反硝化能力并拮抗无乳链球菌(Streptococcus agalactiae)的芽孢杆菌好氧菌株,并对其中拮抗性最强的1株芽孢杆菌进行形态学、生理生化特性、16S rRNA基因序列鉴定,进一步研究其最适生长条件、水解淀粉和蛋白的能力,并进行菌株药物敏感试验及安全性检测。经鉴定,筛选出的菌株(命名为NY 5)为蜡样芽孢杆菌(Bacillus cereus)。在反硝化性能检测培养基中接种1%的NY5菌液后,对50 mg/L的亚硝酸盐氮12 h去除效率达到100%;对本实验室保存的21株不同来源的无乳链球菌均有拮抗作用,平均抑菌圈直径为(26.67±3.00)mm。NY 5在温度为25~40℃、盐度为0~40、pH为5~9的环境中生长较好。同时NY 5还具有水解酪蛋白和淀粉的功能。NY 5菌株对多数抗生素敏感,对少数检测抗生素(青霉素G、麦迪霉素、头孢唑啉等)耐药。在水体中NY5菌液浓度为2.0×10~7 CFU/mL,以及在注射200μL2.0×10~6 CFU/mL浓度NY 5菌液的条件下,体重为(6.0±1.1)g的罗非鱼均未出现死亡及其他异常现象。综合上述结果,证明筛选出的NY 5菌株为蜡样芽孢杆菌。  相似文献