应用参考家系信息构建猪12号染色体部分微位星位点遗传图 …     

赵书红  张建生 《华中农业大学学报》1998,17(5):469-473

为了提高猪１２号染色体遗传图的精度,选择德系大约克与二花脸猪通过回交方法建立了参考家系,采取了两胎共１５４头个体的血样,全血裂解法提取ＤＮＡ后,对每头猪的ＤＮＡ样品进行ＰＣＲ扩增后应用银染法检测了每头个体在猪１２号染色体上３个微卫星位点（ＳＷ１５５３,ＳＷ８７４,ＳＷ１３５０）的基因型,应用ＣＲＩＭＡＰ程序进行了统计分析,得到的３位点间的最佳排离为：ＳＷ１５５３－ＳＷ１３５０－ＳＷ８７５。其中在两  相似文献   

利用眼肌深度预测猪活体眼肌面积     

倪德斌  赵书红  夏欣  胡军勇  刘望宏  马云龙 《华中农业大学学报》2018,37(4):126-130

采用胴体性状测定方法对286头猪胴体进行测定,采用B超测定方法对357头猪活体进行测定,通过分析286头猪胴体测定数据(宰前活体质量、背膘厚、眼肌深、眼肌宽、瘦肉率等)和357头猪活体测定数据(结测质量、背膘厚、眼肌深、眼肌面积),建立胴体与活体2个预测模型并加以验证。结果发现:胴体眼肌深与眼肌面积的相关系数(0.945)高于活体(0.720),胴体模型的决定系数(R2)值(0.894)高于活体模型的R2值(0.519);胴体模型预测值与实测值的散点分布相对一致,而活体模型预测值与实测值的散点分布则较分散;胴体模型预测值与实测值的相关系数为0.497,活体模型为0.672,均为极显著正相关;经t检验,胴体模型预测值与实测值差异不显著,活体模型则差异极显著。本研究结果表明,用眼肌深度预测猪活体眼肌面积是可行的,但预测值的准确性仍需进一步研究。  相似文献   

蓝塘猪和长白猪骨骼肌差异表达cis-NATs基因鉴定     

许月园  齐晓龙  侯晔  赵云霞  栾宇  周焕焕  赵书红  李新云 《中国农业科学》2018,51(9):1795-1805

  相似文献   

现场裂解猪全血提取DNA   总被引：6，自引：0，他引：6  

李雪梅  龚炎长  赵书红  李奎  彭中镇  师守坤 《河北农业大学学报》1997,(4)

为了解决常规现场裂解猪全血时出现的血液凝结问题，提高了裂解液中抗凝剂EDTA的浓度，并对血液消化的蛋白酶K的用量作了梯度处理。结果经方差分析表明：不同裂解液间DNA产量有极显著差异（P＜0．001）。用我们改进的抗凝剂配方，DNA产量高于常规裂解波，且所提DNA质量没有下降；不同蛋白酶K用量间无显著差异（P＞0．05）。  相似文献   

基于选择信号分析揭示猪终端父本群体间性状趋同的关键基因     

李望娇  彭夏  宋徽  董文君  李新云  赵书红  马云龙 《中国畜牧兽医》2022,49(8):2982-2991

【目的】试验旨在揭示终端父本皮特兰猪与杜洛克猪在人工选择作用下重要经济性状呈现出表型趋同的基因组变化特征。【方法】利用376头皮特兰猪、451头杜洛克猪品系Ⅰ、841头杜洛克猪品系Ⅱ和497头杜洛克猪品系Ⅲ群体的50K SNP芯片数据,以100 kb窗口、50 kb步长计算综合单倍型评分(iHS)和等位基因频率差(△AF),分别取前5%作为猪群体内、群体间的基因组选择信号候选区域;利用bedtools分别对iHS、△AF按照左右200 kb进行合并,每2个群体间合并后的iHS、△AF统计量的重叠区域定义为性状趋同区域,并挖掘该区域与猪重要经济性状相关的平行选择信号。【结果】iHS结果显示,在皮特兰猪和杜洛克猪4个群体内共检测到5 112个选择信号候选区域,总长约487.51 Mb。基于△AF方法,于皮特兰猪和杜洛克猪每2个群体间共检测到9 579个选择信号显著区域,总长约913.50 Mb。基于合并后的iHS和△AF,共检测到52个性状趋同区域,总长约4.67 Mb,注释到88个与猪的繁殖、胴体和肉质等性状相关的平行选择候选基因。【结论】皮特兰猪和杜洛克猪群体间存在性状趋同的基因组选择区域有52个,平行选择信号主要涉及猪的繁殖、胴体及肉质等重要经济性状,这与瘦肉型猪种相同的育种方向相关,这些关键基因的发现可为后续商业猪品种遗传改良提供参考。  相似文献   

猪miR-206前体的克隆、表达及生物信息学分析     

陈俭海  魏文娟  肖骁  赵书红 《畜牧兽医学报》2007,38(5):425-431

研究骨骼肌中表达的miRNAs对深入探明骨骼肌生长发育的调控机制具有十分重要的意义。采用比较基因组学与生物信息学相结合的方法,从猪骨骼肌中克隆了猪miR-206的前体（Precursor）,对该miRNA前体的二级结构及与其它物种序列的同源性进行了分析。RT-PCR结果显示,该前体miRNA在猪大多数组织中均有表达,在骨骼肌中表达量最高。生物信息学分析表明miR-206前体序列在不同物种间具有较高的保守性。  相似文献   

链球菌2型对恩施黑猪和美系纯种长白猪的致病性研究     

刘国平  刘健  杨小林  胡利群  谭仕旦  赵书红 《中国动物传染病学报》2018,(1)

猪链球菌(Streptococcus suis,S.suis)病是一种能够引起人和多种动物发病的重要人畜共患病,其中以2型(SS2)流行最广,致病力最强,不仅可引起猪脑膜炎、关节炎、心内膜炎、败血症、肺炎和突然死亡,还可以感染人并致其死亡,严重地威胁着人类的公共卫生安全。本研究对恩施黑猪和美系长白猪进行猪链球菌2型的攻毒试验,观察其病理损害,进而探讨其致病机制。20头猪分A、B、C、D四个组,A组为5头恩施黑猪,B组为5头美系长白猪,C、D两组作为空白对照组。A、B组感染猪链球菌2型菌株,攻毒后都出现出现体温升高、跛行和神经症状,但A组恩施黑猪更加明显,出现3头死亡,解剖后各组织器官病变也比美系长白猪明显。通过对病理器官组织切片、细菌学检验、细菌计数等结果,恩施黑猪对链球菌2型的易感性比美系长白猪更强,从而证实了猪链球菌2型对鄂西黑猪的致病性比美系长白猪更强。  相似文献   

猪血液免疫性状的复合基因组选择研究     

张巧霞  刘飞  张玲妮  刘向东  赵书红  朱猛进 《猪业科学》2016,(8):104-106

该研究在提出“复合基因组选择（composite genomic selection）”概念的基础上,利用华中农业大学农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室构建的免疫资源群体数据,通过交叉验证（cross-validation）策略,与标准GBLUP法对照,利用白细胞（WBC）、噬中性粒细胞（NE）等13项血液免疫性状对复合基因组选择的预测效果开展验证。研究结果表明,除血小板（PLT）等3个性状外,所有性状复合基因组选择的准确性均高于标准GBLUP法,分析结果支持复合基因组选择优于基于单一加性遗传组分的GBLUP的结论。同时,还探讨了不同交叉验证参数组合对复合基因组选择准确性的影响,发现最宜交叉验证倍数是性状特异性的,跟性状特性有关。总之,该研究提出了基于全部遗传组分的复合基因组选择法,并得到猪血液免疫性状数据分析结果的初步支持,特别是针对较小规模群体,复合基因组选择可能是提高基因组预测准确性的有效方法。  相似文献   

猪多经济性状的重建研究   总被引：2，自引：2，他引：0  

朱猛进  李长春  樊斌  余梅  刘榜  赵书红 《中国畜牧兽医》2008,35(2):28-31

本研究的目标是对猪多个经济性状进行性状重建,并对重建性状的遗传参数进行估计。本研究涉及性状重建的原始经济性状包括了生长、胴体和肉质3类共24个性状。性状重建利用主成分分析法,经统计分析后得到4个主成分作为新的重建性状。在对重建性状进行描述性统计处理基础上,进一步利用动物模型和DFREML算法估计了各性状的遗传力,得到第1、2、3和4主成分的遗传力分别为0.87、0.58、0.49和0.56。研究结果表明,通过性状重建不但可以实现多性状的降维处理,而且重建性状的遗传力有提高趋势,性状重建策略有望促进多性状育种的进程。  相似文献   

用于遗传作图的动物参考家系   总被引：1，自引：0，他引：1  

赵书红 《湖北农业科学》1998,(6):68-71

综述了动物遗传作图中参考这系建立时应考虑的因素，应用参考家系进行遗传作图的原理与方法及参考家系资源的管理，并对几种主要畜禽遗传作图的参考家系做了简要介绍。  相似文献