基于分子对接技术的拟南芥植酸酶的水解特性     

袁凡  周敏  丁君辉  彭晓赟  徐文忠  萧浪涛  王若仲 《湖南农业大学学报(自然科学版)》2019,45(5)

采用生物信息学、同源建模、分子对接等方法,对拟南芥植酸酶(ATMINPP)的功能结构及其与植酸的分子对接模式进行了预测。结果表明:ATMINPP由487个氨基酸组成,其二级结构由18个α螺旋、6个β折叠、伸展片段和无规则卷曲等4个主要部分构成;保守半胱氨酸在螺旋结构之间形成4个二硫键;ATMINPP蛋白有2个结构域(α/β–结构域和α–结构域),活性位点位于2个结构域的中间;对接时,带负电的植酸结合在ATMINPP带正电的亲水性口袋内;保守序列RHGARYP中的His 66对植酸氢键所结合的磷酸基团进行亲核攻击,形成中间复合物,中间复合物水解得到磷酸和磷酸肌醇衍生物,His 343为解离基团氧原子提供质子,使得磷酸基团解离。  相似文献   

不同杂种优势群玉米籽粒百粒质量差异性分析     

刘强  袁凡  王雪飞  刘伊凡  李婷婷  宋伟彬  郭晋杰 《江苏农业科学》2022,(21):54-61

鉴评和筛选不同杂种优势群玉米百粒质量性状优异的玉米自交系,为育成高产玉米品种提供借鉴。研究材料为313份玉米自交系,利用包含玉米全部基因组的40个SSR核心标记对杂种优势群体进行划分,通过测定籽粒百粒质量性状,对来自各个杂种优势群的玉米籽粒百粒质量进行多重比较分析,筛选不同杂种优势群中百粒质量高的自交系。结果表明,P群、旅大红骨、塘四平头、瑞德互相的百粒质量之间在0.05水平上差异均不显著;P群、旅大红骨群、塘四平头群、瑞德群等4个杂种优势群与兰卡斯特的玉米籽粒百粒质量在0.05水平上差异显著。P群的高百粒质量自交系包括遵90110、E200、R31、78599、8701等;旅大红骨群的高百粒质量自交系包括中741、关17-1、L473、天77、吉846等;兰卡斯特群的高百粒质量自交系包括CT52C、Ay3566、Va26、Mo24W和Mo17;塘四平头群的高百粒质量自交系包括昌D、武126、D619、中黄64、20837等;瑞德群的高百粒质量自交系包括邢230、Maxa、d140、SS99、苏75等。  相似文献   

玉米自交系成熟期籽粒含水相关性状综合评价     

郑云霄  高小宽  袁凡  刘强  黄亚群  赵永锋  贾晓艳  祝丽英  陈景堂  郭晋杰 《种子》2021,(3):29-34

玉米成熟期籽粒含水量是推广玉米机械化粒收的前提条件.本研究以100份玉米自交系为试验材料,对14个与含水量紧密相关的性状进行测定,采用多元分析方法综合评价玉米种质资源的含水量.结果表明,14个性状间具有一定的相关性.主成分分析的结果表明,14个性状转换成6个主成分因子,反映了原始数据信息量的72.899％.聚类分析的结...  相似文献