6个猪品种CD53基因中结构变异SV184分布频率的研究     

徐倩  岑永秀  喻昌燕  刘畅  冉雪琴  王嘉福 《中国畜牧兽医》2017,44(4):1079-1086

基于香猪全基因组重测序数据,在白细胞表面抗原CD53基因中筛选到一个结构变异（structure variant,SV）184,为了探索不同猪品种间此结构变异是否存在多态性变化,本试验选择香猪、大白猪、糯谷猪、柯乐猪、江口萝卜猪和荣昌猪作为试验动物,采用PCR方法对猪群中SV184的分布频率进行比较研究,应用RT-PCR技术,分析CD53基因的原初转录本序列结构,研究SV184对CD53基因的转录是否有直接影响。结果显示,6个猪品种中SV184的分布频率存在明显差异,香猪以VN基因型为主,其他5个猪品种是NN基因型占优势;计算两种等位基因的频率,香猪以缺失的V等位基因为主,其他5个猪品种以正常的N等位基因为主。选择3种基因型个体的血液样本,逆转录后分析CD53基因的原初转录本的序列,从中检测到缺失型和不缺失的两种转录本形式,提示SV184对CD53基因的转录无直接影响。SV184可作为分子标记用于区分香猪和其他猪品种。  相似文献   

两个不同高羊茅品系叶片差异表达基因研究     

谢健  牛熙  许瑶  喻昌燕  冉雪琴  王嘉福 《农业生物技术学报》2018,(5)

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香猪CYP3A29基因3′-UTR结构变异及其与肌肉雄激素水平的关联分析     

梁小芬  冉雪琴  牛熙  李升  黄世会  王嘉福 《中国畜牧兽医》2023,(8):3199-3209

【目的】探究猪特有的细胞色素P450超家族3A亚族成员29(cytochrome P450 3A 29,CYP3A29)基因3′-UTR区核苷酸结构变异(structural variation, SV)对该基因表达的影响,解析该结构变异与香猪肉质性状形成的关系。【方法】以香猪、大白猪为研究对象,应用UCSC、miRBase、PITA、RBPsuite等软件预测CYP3A29基因3′-UTR区结构变异区间所包含的重复元件、miRNA和RBP结合位点;采用PCR方法对结构变异位点进行基因分型;计算群体基因型频率、基因频率及Hardy-Weinberg平衡状态;采用实时荧光定量PCR检测该变异对CYP3A29基因表达的影响;利用ELISA法检测香猪肌肉组织中CYP3A29蛋白含量和雄激素(T、DHT)水平,并使用SPSS 17.0软件对T、DHT含量与不同基因型进行Pearson相关性分析。【结果】生物信息学分析显示,CYP3A29基因3′-UTR的结构变异区全长303 bp,该变异区存在1个长为241 bp的短散在元件(short interspersed element, SINE),...  相似文献   

11种肉及肉制品动物源性成分PCR检测技术          下载免费PDF全文

陈勇勇  黄世会  牛熙  李升  冉雪琴  王嘉福 《中国动物检疫》2023,40(5):107-114

为建立准确的动物源肉制品检测技术，采用生物信息学方法，针对猪、牛、马、山羊、小鼠、大鼠、兔、犬、鸡、鸭、鹅等11种动物肉类的特异性基因，建立了特异性PCR检测技术。该技术可高特异性检测猪、牛、马、山羊、兔、犬、鸡、鸭、鹅源肉样，并可鉴别掺入的大鼠、小鼠等违禁肉类成份，最低检测限为1.00 ng/μL基因组DNA，以及低至1%的肉类添加量。运用该技术在市场中随机抽检3种初加工肉制品各10份进行验证，结果在每种肉制品中均检出掺假样品，不同种类肉品的掺假率为10%～20%。本研究建立了具有高灵敏、准确、低成本、适用范围广等优势的肉制品动物源性成份检测技术，为消费市场肉制品质量检测提供了技术支撑。  相似文献