祁连山排露沟流域青海云杉天然更新空间关联性研究     

刘济萌  刘贤德  马瑞  赵维俊  敬文茂  拓锋  王艳霞 《干旱区资源与环境》2024,(1):161-170

青海云杉作为祁连山森林生态的建群种，其天然更新的空间关联性及集聚模式对种群更新具有重要意义。于2022年8月对祁连山排露沟流域海拔2800-3300m样地内的青海云杉林进行每木检尺，研究将胸径小于50mm的青海云杉植株划为更新苗，并选取更新苗胸径、株高两个生物指标，通过空间自相关分析探究其胸径、株高的空间关联性及集聚模式。结果表明：1)不同海拔更新苗胸径、株高均表现为空间正自相关，胸径空间关联性呈现为2800m>3100m>3000m>2900m>3300m,株高空间关联性呈现为2800m>2900m>3100m>3000m>3300m,仅3200m样地胸径和株高均表现为不显著的空间负自相关，表明更新苗胸径和株高的空间关联性随着海拔的升高而逐渐降低。2)不同样地更新苗胸径和株高个体间空间正自相关的数量远多于空间负自相关，表明青海云杉更新个体的生长有益于邻近径级个体的生长。3)更新苗胸径和株高整体呈现为低低集聚比高高集聚更为集中，且相互间分界明显，表明邻近径级的植株间关系较为协调，径级差异较大的植株间排斥效应较为明显。4)更新苗胸径和株高均...  相似文献   

高温胁迫下大黄鱼肝脏的蛋白组学          下载免费PDF全文

章孝颖  蔡晓芳  刘贤德  赵虹博  宋普庆  张静 《水产学报》2021,45(6):862-870

为探究大黄鱼在高温胁迫条件下的蛋白表达情况，实验应用串联质谱标签tandem mass tag (TMT)标记结合液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)技术对大黄鱼耐高温组和不耐高温组的肝脏组织进行蛋白组学分析。共鉴定到3 369个蛋白，其中有687个差异表达蛋白，包括281个上调蛋白和406个下调蛋白。用平行反应监测(parallel reaction monitoring, PRM)对随机挑选的13个蛋白进行验证，其结果与TMT标记的蛋白组学分析结果一致。随后，通过生物信息学分析发现，高温胁迫对大黄鱼的蛋白质折叠、能量代谢有显著影响，其中热休克蛋白70 (heat shock proteins 70, HSP70)、钙网蛋白(calreticulin, CRT)和葡萄糖调节蛋白(glucose-regulated protein, GRP)参与调节蛋白质的正确折叠，丙酮酸激酶(pyruvate kinase, PK)参与高温条件下的能量供给。由此推测HSP70、CRT、GRP和PK在大黄鱼应对高温胁迫时发挥着重要的作用。  相似文献   

织锦巴非蛤不同颜色斧足的转录组     

曾庆民  赵虹博  邓素贞  章孝颖  刘贤德 《水产学报》2022,46(9):1562-1571

为探索织锦巴非蛤斧足颜色差异的分子机制，以指导高品质织锦巴非蛤的选育工作，本研究对织锦巴非蛤橘黄色和浅白色的斧足进行二代和三代转录组测序及差异表达分析。二代测序结果显示：6个样品的clean data均达到6.90 Gb，GC含量为35.30 - 38.21 %，Q30碱基百分比在94.43 %及以上；三代测序结果显示，橘黄色斧足组和浅白色斧足组分别得到16 968、21 611条高质量转录本，将其与各数据库进行比对，共获得5 058条有注释信息的全长转录本。以三代全长转录本作为参考序列，将二代数据比对回参考序列，鉴定到57个差异表达转录本，其中，橘黄色斧足组相对于浅白色斧足组有34个差异转录本表达量上调，23个差异转录本表达量下调。使用实时荧光定量PCR对随机挑选的12个差异表达转录本进行验证，其结果与转录组分析结果一致。随后，通过生物信息学分析发现，脂肪酸的生物合成和代谢、肌肉成分、能量代谢等都影响织锦巴非蛤斧足颜色的调控，其中过氧化物酶体增值物激活受体（peroxisome proliferators-activated receptors, PPARs）调节着脂肪酸的生物合成和代谢，肌钙蛋白（Troponin）是肌肉的重要组成成分，精氨酸激酶（arginine kinase, AK）参与了色素富集过程中的能量供应。由此推测PPARs、肌钙蛋白和AK在织锦巴非蛤色素富集过程中发挥着重要作用。  相似文献