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亚麻纤维素合酶超基因家族的生物信息学及表达分析 总被引:3,自引:1,他引:2
【目的】全基因组水平鉴定亚麻纤维素合酶超家族基因Ces A/Csls,并对基因的进化、基因结构及组织表达特性等进行分析,为亚麻纤维发育的机理研究奠定基础。【方法】利用Phytozome基因组数据库,通过生物信息学手段,鉴定亚麻纤维素合酶超基因家族成员,并进行蛋白理化特性分析;利用MEGA 5.0、GSDS、MEME等软件构建系统进化树,并进行基因结构、蛋白保守基序分析;根据RNA-Seq数据对Ces A/Csls进行表达分析。【结果】系统分析鉴定了45个亚麻Ces A/Csls超家族基因,该家族基因在scaffolds上是分散分布的,没有明显的成簇现象。Ces A/Csls蛋白主要分布于质膜上,氨基酸数目为409—1 167,分子量为47 401.1—130 578.3,等电点分布在5.43—9.08。Ces A/Csl蛋白均含有跨膜结构域,数目为2—8。根据系统进化分析将其分成Ces A与Csl两类,细分为Ces A、Csl A、Csl B、Csl C、Csl D、Csl E、Csl G共7组。基因结构分析显示,亚麻Ces A/Csls基因的长度在2.1—6.8 kb,外显子数量在2—14。保守基序分析表明,不同组间Motif组成有一定的差异,Motif 1、Motif 2、Motif 3、Motif 4、Motif 12在Ces A、Csl B、Csl D、Csl E、Csl G组蛋白中均有分布,Motif 18、Motif 20在Csl A、Csl C组蛋白中均有分布,而Motif 13、Motif 14、Motif 15、Motif 19的分布则表现出一定的组间特异性。表达谱分析结果表明,Ces A/Csls家族成员在不同发育阶段表达模式不同,部分Ces A/Csls可被Na Cl、BR和Brz诱导上调或下调表达,预示Ces A/Csls功能的多样性以及在植物发育过程中扮演着不同角色。【结论】鉴定出45个亚麻Ces A/Csls家族基因成员,分属于两类,7组,分布于scaffolds上,基因结构和蛋白基序具有组间多样性和组内保守性。不同的基因在不同发育阶段具有一定的时空特异性。Ces A/Csls中部分基因响应激素BR、Brz及Na Cl胁迫。 相似文献
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温度和水分是制约大棚蔬菜生长发育,影响蔬菜产量和品质的重要因素。微灌技术就是根据蔬菜生长发育的需要,由水泵通过压力管道有计划地将水输送并分配到蔬菜根部,满足蔬菜生长发育的需要,有效改善土壤中水分、养分、通气、温度等状况,保证蔬菜的正常生长发育,是一种投资少、见效快,经久耐用,灌水均匀,节约用水,不破坏土壤结构,不降低地温,不造成棚膜揭露的灌溉方法。微灌技术的主要特点是以低压小流量出流将灌溉水供应到作物根区土壤,以实现局部灌溉。主要有2种方式,以断续滴出的形式供水时称为滴灌,以喷洒的方式出流时称为微喷灌。 相似文献
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猕猴的繁殖及仔猴的哺育 总被引:2,自引:0,他引:2
猕猴乃灵长类动物,它在形态解剖、习性行为和生理生化机制等方面与人有许多相似之处,因此在生命科学各个领域的实验中用以代替人类,主要用于疫苗生产和疫病模型,是重要的实验动物。随着人类对医学技术水平要求的日益提高,对猕猴需求量的不断增加,同时猕猴野外资源的不断减少,因此我们很有必要加强猕猴的人工养殖。本文就猕猴的繁殖及仔猴的哺育方面展开阐述。1 猕猴的繁殖1.1 种猴的选择选种工作直接关系到生育率的高低和后代生命力的强弱,不论雄猴、雌猴,都要选择体形正常、毛色润泽而且在生育年龄的健壮个体。1.1.1 … 相似文献
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