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肖海霞 阿布来提·苏来曼 托乎提·阿及德 努尔尼萨·莫拉尼亚孜 张国庭 帕热哈提江·吾甫尔 王琼 苏玲玲 谢立荣 刘应进 买买提·克玉木 田可川 刘武军 《安徽农学通报》2023,(1):15-18+32
畜禽资源是中国种业创新、打赢种业翻身仗的根基。疆岳驴是陕西关中驴(大型驴)和新疆驴(小型驴)经过半个多世纪杂交改良、横交固定、选育提高、培育而成的良种驴,旨在基因组水平上揭示疆岳驴的遗传进化,解析疆岳驴的遗传结构及遗传多样性。该研究利用SLAF-seq简化基因组测序鉴定疆岳驴SNP标记,构建125头样品群体进化树并进行分析。共鉴定SNP标记4 887 196个;通过MEGA 5软件neighbor-joining算法,构建的群体进化树显示,125头疆岳驴聚集为2个大的分支:一个分支46头聚集在一起,亲缘关系较近;另一分支79头聚集在一起,亲缘关系较近。这2个分支间亲缘关系较远。通过admixture软件、EIGENSOFT软件、SPAGeDi软件进一步佐证了125头疆岳驴可分为2个群体,利用SLAF-seq简化基因组测序能全面准确地揭示疆岳驴的遗传多样性和遗传结构,为疆岳驴的关联遗传学研究和重要性状QTL定位提供依据,为争取在第3次全国畜禽遗传资源普查申报新培育品种(配套系)和疆岳驴重要性状QTL定位奠定基础。 相似文献
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为探索苏博美利奴羊毛囊发育相关ncRNA分子调控网络,本研究通过挖掘苏博美利奴羊皮肤组织样本不同时期转录组数据,利用生物信息学方法构建lncRNA-miRNA-mRNA分子调控网络。结果表明:不同时期mRNA与lncRNA及miRNA具有复杂的网络连接。通过GO富集分析发现靶基因主要参与细胞增殖调控、凋亡过程及毛囊形态发生等生物学过程;参与细胞外空间、细胞外泌体、转录因子复合体、质膜的整体成分等细胞组分;参与转录因子活性、结构分子活性、细胞外基质结构组成等分子功能。通过KEGG通路分析发现差异的靶基因主要参与TGF-beta信号通路、癌症途径、MAPK信号通路、PI3K-Akt信号通路、细胞因子与细胞因子受体的相互作用等多种途径。筛选寻找调控网络中的关键基因,发现G2 vs.G1组中miR-133、miR-433-5p的靶基因TGFβ2和NOTCH1参与毛囊形态发生(GO:0031069)的生物学过程,因此TGFβ2和NOTCH1为毛囊发育的关键基因。通过构建苏博美利奴羊毛囊发育相关ncRNA分子调控网络,解析毛囊发生发育的分子调控机制,从转录组学层面对毛囊生长发育进行探讨,能够对苏博... 相似文献
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本研究旨在估计中国美利奴羊(新疆型)繁殖性状的遗传参数,为优化中国美利奴羊(新疆型)选育方案提供理论支撑。本研究收集了新疆巩乃斯种羊场2003—2017年的中国美利奴羊(新疆型)系谱信息及配种产羔记录8 033条。利用SAS 9.2的GLM过程分析群别、出生年份对4个繁殖性状(头胎妊娠天数、平均妊娠天数、头胎羔羊平均初生重、羔羊平均初生重)的影响,结果表明群别和出生年份对4个繁殖性状均有极显著影响;通过DMU软件对4个繁殖性状进行遗传参数估计,结果表明本研究中头胎妊娠天数(0.05±0.05)与平均妊娠天数(0.04±0.02)均属于低遗传力,羔羊平均初生重(0.11±0.02)属于中等遗传力,头胎羔羊平均初生重(0.38±0.05)属于高遗传力;平均妊娠天数和头胎妊娠天数之间的遗传相关为0.89,羔羊平均初生重与头胎羔羊平均初生重之间的遗传相关为0.53。研究结果发现,在中国美利奴羊(新疆型)育种、选育过程中不应忽视出生年份和群别的影响,在培育繁殖性能优良的细毛羊过程中应提高牧场管理水平及牧工操作技术。 相似文献