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长期的自然和人为选择使家畜品种经济性状得到了显著改善,其相关的基因组区域也发生了特定遗传变异。随着时间的推移部分基因多态性已经下降或消失,而在群体中保留包含单一单倍型的多个基因。这种基因组上特定区域基因多态性频率的变异被称为选择信号。识别选择信号可以提供家畜驯化机制并进一步揭示表型相关的基因变异。目前,高密度SNP芯片及大规模重测序技术已成功应用于家畜选择信号鉴定研究。全基因组选择信号检测方法有等位基因频率检测法、连锁不平衡检测法和群体分化分析法。作者综述了全基因组范围内选择信号检测方法及其在家畜研究中的应用进展,为从事家畜育种及生物进化研究人员提供参考。 相似文献
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[目的]研究银杏叶提取物和茶多酚联用对HU-VEC的影响。[方法]用缺氧缺糖方法体外模拟血管供血不足,观察缺氧诱导下人脐内皮细胞(HU-VEC)中谷胱甘肽过氧化物酶(GSH-PX)活力及乳酸脱氢酶(LDH)泄漏量的变化,研究银杏叶提取物和茶多酚对HU-VEC的作用。[结果]缺氧诱导可使内皮细胞GSH-PX活力降低,LDH泄漏量增加;银杏叶提取物、茶多酚以及两者联用组与模型组相比细胞GSH-PX的活力升高,LDH泄漏量有所下降;银杏叶提取物和茶多酚联用效果优于银杏叶提取物组和茶多酚组。[结论]缺氧可损伤HU-VEC的形态和功能;银杏叶提取物和茶多酚对缺氧诱导下的HU-VEC有保护作用,且联用组效果优于单独作用组。 相似文献
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基于空间分析的桉树人工林土壤肥力评价 总被引:1,自引:0,他引:1
利用广西黄冕林场桉树人工林135个土壤样点数据,分析该区域土壤p H、有机质、碱解氮、速效钾、有效磷等养分含量及其空间分布情况,利用空间分析法,对研究区桉树人工林的土壤肥力进行综合评价。结果表明,黄冕林场桉树人工林的土壤肥力分为"低、中、高"3个等级,其土壤呈酸性,p H值为4.39-4.64,土壤有机质含量为21.97-39.46g/kg,土壤碱解氮含量为97.18-171.84mg/kg,土壤速效钾含量差异性较大,整体含量为26.29-184.98mg/kg,土壤有效磷含量为1.32-3.09mg/kg。根据区域养分等级划分标准,其土壤有机质、碱解氮、速效钾含量的范围均在中等以上水平,而土壤有效磷含量水平为极低。黄冕林场各分场土壤有效铜、有效锌、有效硼较为缺乏,在其施肥推荐方案中可适量添加铜、锌与硼等微量元素。研究结果为桉树人工林土壤改良提供参考。 相似文献
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光控增绒是一种高效、环保、低成本的绿色增绒技术,该技术的推广对于提高绒山羊的产绒量具有重要意义。但是,该技术调控绒山羊绒毛生长的机制尚不明确,本试验在此基础上,通过比较正常光照和缩短光照条件下,内蒙古阿尔巴斯型绒山羊血液中激素及产绒性状的差别,探讨缩短光照引发绒毛提前生长的原因。选取2-4岁的内蒙古阿尔巴斯型绒山羊母羊50只,通过进行光照时间限制的处理,对不同月份试验组和对照组血清中褪黑激素和催乳素的变化情况和绒毛性状等指标进行监测,结果表明:(1)光控后试验组褪黑激素水平有略微升高的趋势,而对照组急剧下降;短日照处理组催乳素水平在9月份光控组中显著下降。(2)褪黑激素、催乳素随次级毛囊生长呈现显著性周期变化。(3)试验组比对照组绒毛产量提高了54%,差异极显著(P0.01)。本试验揭示了光控增绒技术可能通过调节绒山羊血液中褪黑激素和催乳素水平,进而造成毛囊生长周期的改变,延长绒毛生长期,最终显著增加了绒山羊的年产绒量。该试验为光控增绒技术的推广提供了理论支撑。 相似文献
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【目的】ZBED6基因是一个调控肌肉生长发育的转录因子,为了探讨 ZBED6 在心肌生长发育中的调控机制,利用RNA Sequencing(RNA-Seq)技术比较ZBED6基因敲除巴马小型猪(ZBED6-KO)和同日龄正常巴马小型猪(ZBED6-WT)的心脏组织转录组,挖掘ZBED6基因的敲除对家猪心脏组织发育及基因表达的影响。【方法】利用t-test对ZBED6-KO猪和ZBED6-WT猪心脏组织大小的表型特征进行显著性分析,利用实时荧光定量PCR对ZBED6基因的靶基因IGF2的表达量进行定量。通过制作石蜡组织切片对心肌进行组织学分析,比较其组织结构的差异。提取ZBED6-KO猪和ZBED6-WT猪心脏组织的总RNA,以Illumina Hiseq 2000平台进行RNA-Seq分析。以猪Sus_scrofa10.2为参考序列,用转录组的标准流程筛选ZBED6-KO猪和ZBED6-WT猪心脏组织中的差异表达基因,对差异基因进行GO和IPA富集分析。随机选择9个差异表达基因,利用实时荧光定量PCR验证RNA-Seq结果的可靠性。【结果】ZBED6-KO猪心脏重以及IGF2表达量均显著高于ZBED6-WT猪(P<0.05),与ZBED6-WT猪相比,ZBED6-KO猪肌纤维的宽度较宽,结缔组织较少,ZBED6基因的敲除对家猪心脏的生长发育有一定的促进作用;测序结果显示,各样本获得至少10 G的数据量,每个样本clean ratio、Q30 data均达到90%以上,其中62.8%-80.1%的reads能比对到猪的基因组上,表明测序饱和度良好,测序数据真实可靠;对测序数据进行分析,筛选到 184个差异基因,其中上调的基因114个,下调的基因70个,注释的141个,未注释的43个;差异基因层次聚类分析显示,ZBED6-KO组(x1、x3、x6)的3个个体表达模式相似,ZBED6-WT组(x2、x4、x5)的3个个体表达模式相似;GO和IPA富集分析得到13个显著的GO条目,33条显著的pathway通路,差异基因主要富集在免疫反应、肌肉发育和RhoA信号等相关的通路;qRT-PCR 检测9个差异表达基因的表达模式与RNA-Seq分析结果一致,证实了RNA-Seq结果的可靠性。【结论】首次以ZBED6-KO巴马小型猪为模型,利用RNA-Seq技术探究了ZBED6敲除对心脏发育和功能的影响,丰富了ZBED6 对心脏发育和功能的研究。 相似文献
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