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利用微卫星标记技术对形态差异较大的2个德国镜鲤(Cyprinus carpio L. mirror)群体的189尾个体进行研究.利用一般线性模型(general linear model,GLM)对15个微卫星位点与德国镜鲤的体重、体长、体高、尾柄长、尾柄高、头长和头高的关系进行方差分析和多重比较,结果表明微卫星引物MFW1与体重和体长显著相关,与体高极显著相关;引物MFW9与头长显著相关;引物MFW11与尾柄长和头高显著相关;引物MFW29与体长、体高和头高极显著相关,与尾柄高显著相关.利用引物MFW1检出10尾含有座位208/208的个体;利用引物MFW9检出25尾含有座位90/90的个体;利用引物MFW11检出3尾含有座位202/188的个体;利用引物MFW29检出10尾含有座位172/162的个体.将上述个体利用SPSS13.0对其进行差异性分析,选育出33尾优良个体,利用PopGene3.2对其遗传距离进行分析,最终选出13尾性状优良且遗传距离较大的亲鱼,其中5尾为保种群体,8尾为北林群体,对其培育并建立选育系. 相似文献
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散鳞镜鲤两个保种群体的遗传多样性 总被引:1,自引:0,他引:1
利用20个微卫星标记分析国内仅存的两个散鳞镜鲤(Cyprinus carpio)保种群体(SP、CJ)的遗传多样性。结果表明:共检测到147个等位基因,平均值为7.35,有效等位基因数(Ae)、期望杂合度(He)以及多态信息含量(PIC)的平均值分别为2.7828、0.6041和0.5386。SP群体的Ae、He以及PIC值分别为3.1126、0.6479和0.5948,大于CJ群体(2.4529、0.5602和0.4823)。在两个群体中,群体特有等位基因共53个,其中9个为低频等位基因。对20个引物在两个群体中等位基因的显著性分析表明:其中有16个引物可以作为区分两个群体的特异性分子标记。瓶颈效应分析结果显示:2个群体均经历了瓶颈效应。同胞率检测结果(SP 97.5%;CJ 96.7%)偏高说明群体内近交压力较大。哈迪-温伯格平衡检测表明:两个群体大部分位点偏离平衡并处于杂合子过剩状态。两个群体间的遗传距离(D)为0.5625,SP和CJ群体的个体均各聚为一支。群体间的遗传分化指数(Fst)为0.1138,Nm值为1.9462。该研究表明:散鳞镜鲤群体遗传多样性水平较高,其中SP群体的遗传多样性水平高于CJ群体,两群体处于中度遗传分化。 相似文献
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松浦红镜鲤保种群体的遗传结构 总被引:1,自引:1,他引:0
应用35对多态性较高的微卫星标记对鲤新品种——松浦红镜鲤(Cyprinus carpio var. songpu red mirror carp)的保种群体进行了遗传结构研究。结果显示, 在91尾松浦红镜鲤个体中, 共检测到140个等位基因, 每个位点等位基因数3~6个, 平均有效等位基因数为3.042 6; 期望杂合度范围为0.375 0~0.827 4, 均值为0.649 3; 多态信息含量范围为0.396~0.912, 均值为0.586 9; 哈迪−温伯格平衡检验结果表明群体处于不平衡状态; 平均固定系数为-0.026, 说明该群体存在杂合子过剩现象; 瓶颈效应分析表明, 群体已经历了瓶颈效应; 根据连锁不平衡方法计算有效群体大小为31.2。该研究表明松浦红镜鲤遗传多样性较为丰富, 为了在下一步保种工作中避免或降低瓶颈效应, 应加强保护工作, 从而保持其丰富遗传多样性和优良的经济性状。
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鲤易捕性状选育群体不同世代微卫星分析 总被引:6,自引:2,他引:4
用30对微卫星引物对易捕性状人工选育鲤(Cyprinus carpio)的4个连续世代共计154个个体进行了遗传分析。4个世代(F1-F4)的平均等位基因数分别为7.7619、6.9189、5.0889、4.6667;平均多态信息含量分别为0.6215、0.7512、0.7314、0.7431;平均观测杂合度分别为0.7730、0.7135、0.7593、0.7196,人工定向选育已对群体的多样性造成了影响。Hardy-Weinberg平衡的卡方检验及F-检验数据显示人工累代选育已经使群体的遗传结构发生了变化,并开始趋于稳定,表现为偏离平衡的位点逐代增加,相邻世代之间遗传分化系数逐代减小。FST平均值0.0995提示出选育群体已处在中等分化水平,有90%的遗传变异来自于群体内个体间。遗传距离及遗传相似性结果显示随着选育世代的增加,世代之间遗传距离越来越小,遗传相似性越来越大,但与理论值仍有差距,说明还有育种潜力,应继续保持遗传效应,确保育种成功。 相似文献
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德国镜鲤养殖群体中抗病与死亡个体遗传结构比较研究 总被引:1,自引:1,他引:0
利用AFLP技术对2007年、2008年所采集的我国北方网箱养殖中出现爆发性死亡的德国镜鲤的死亡个体和存活个体分子样品进行遗传结构分析,以期对德国镜鲤群体内二者遗传变异进行快速而准确的评价。研究结果表明,(1)8对引物组合共扩增出289个条带,其中多态位点比例为47.40%,每对引物多态位点比例为18.8%~56.3%。(2)死亡和存活个体在两年采集样品中的遗传相似性系数分别为0.981 8和0.986 2,遗传分化系数分别为0.037 4和0.037 9,表明死亡个体和成活个体遗传分化程度较低。(3)在两年采集样品中死亡个体平均多态位点比例均低于存活个体,平均杂合度在2007年采集的样品中死亡个体比存活个体低,在2008年采集的样品中二者相等,表明成活个体遗传变异相对较大,遗传多样性较高,而死亡个体遗传变异相对较小,遗传多样性较低。(4)个体聚类分析表明死亡个体和成活个体分别在不同程度上进行了聚类。本实验结果表明出现大规模死亡现象德国镜鲤的死亡和存活个体在遗传物质上存在一定的差异,而这种差异可能导致了二者抗病性能的不同。研究结果将对德国镜鲤抗病品种的选育提供重要参考。 相似文献
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利用AFLP技术对2007年、2008年所采集的我国北方网箱养殖中出现爆发性死亡的德国镜鲤的死亡个体和存活个体分子样品进行遗传结构分析,以期对德国镜鲤群体内二者遗传变异进行快速而准确的评价。研究结果表明,(1)8对引物组合共扩增出289个条带,其中多态位点比例为47.40%,每对引物多态位点比例为18.8%~56.3%。(2)死亡和存活个体在两年采集样品中的遗传相似性系数分别为0.981 8和0.986 2,遗传分化系数分别为0.037 4和0.037 9,表明死亡个体和成活个体遗传分化程度较低。(3)在两年采集样品中死亡个体平均多态位点比例均低于存活个体,平均杂合度在2007年采集的样品中死亡个体比存活个体低,在2008年采集的样品中二者相等,表明成活个体遗传变异相对较大,遗传多样性较高,而死亡个体遗传变异相对较小,遗传多样性较低。(4)个体聚类分析表明死亡个体和成活个体分别在不同程度上进行了聚类。本实验结果表明出现大规模死亡现象德国镜鲤的死亡和存活个体在遗传物质上存在一定的差异,而这种差异可能导致了二者抗病性能的不同。研究结果将对德国镜鲤抗病品种的选育提供重要参考。 相似文献
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用30对微卫星引物对易捕性状人工选育鲤(Cyprinus carpio)的4个连续世代共计154个个体进行了遗传分析。4个世代(F1-F4)的平均等位基因数分别为7.7619、6.9189、5.0889、4.6667;平均多态信息含量分别为0.6215、0.7512、0.7314、0.7431;平均观测杂合度分别为0.7730、0.7135、0.7593、0.7196,人工定向选育已对群体的多样性造成了影响。Hardy-Weinberg平衡的卡方检验及F-检验数据显示人工累代选育已经使群体的遗传结构发生了变化,并开始趋于稳定,表现为偏离平衡的位点逐代增加,相邻世代之间遗传分化系数逐代减小。FST平均值0.0995提示出选育群体已处在中等分化水平,有90%的遗传变异来自于群体内个体间。遗传距离及遗传相似性结果显示随着选育世代的增加,世代之间遗传距离越来越小,遗传相似性越来越大,但与理论值仍有差距,说明还有育种潜力,应继续保持遗传效应,确保育种成功。 相似文献
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本试验在一个镜鲤家系中,随机选取68尾作为实验鱼,在测量体重、体长、全长等数量性状的同时,利用15个微卫星分子标记对其进行遗传检测,共检测到40个等位基因,每个基因座的等位基因数为1~4个不等,平均等位基因2.66个,片段长度在132-551之间,有效等位基因数(Ne)为1.3721~3.8278,平均观察杂合度(Ho)为0.3235~1.0000,平均期望杂合度(He)为0.3464~0.7442,平均多态信息含量(PIC)为0.4754。结果表明:该镜鲤家系的遗传多样性处于中等水平,但在较大的选择压力下已严重偏离Hardy-Wenberg平衡。利用SPSS程序下的GLM过程对15个微卫星位点与主要经济性状的相关性进行分析,结果发现:HLJ021、HLJ354、HLJ551共3个微卫星位点对镜鲤体重显著影响(p〈0.05),其中,位点HLJ021、HLJ044、HLJ551、HLJ1330还对体高存在显著影响(p〈0.05),HLJ354对体长、体厚、全长存在显著影响(p〈0.05)。本研究所鉴定的与生长性状相关的标记可为德国镜鲤分子标记辅助育种提供重要信息。 相似文献
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微卫星标记的发展和利用极大地扩展了DNA分子标记应用的深度和广度,使探索生物性状遗传本质的研究发生了革命性变化。本文简要介绍了微卫星标记技术的发展及其在水产遗传与育种研究中的应用。首先回顾了微卫星克隆技术的发展,尤其是水产生物微卫星标记及技术的发展过程,以及水产生物微卫星序列的主要来源,并对微卫星标记与其他DNA分子标记在使用范围、难易程度等方面做了比较;其次探讨了微卫星标记在遗传连锁图谱的制备、性状分析及QTL定位、群体遗传学、进化遗传、种质鉴定与亲权分析、品种培育等6个研究领域的应用;本文还对几种DNA分子标记在操作上的难易程度、多态性程度、重复性与可比性等方面进行了比较,同时还分别阐述了微卫星和其他DNA分子标记应用于水产生物研究中的适用性,并对微卫星标记的应用前景做了展望。本文旨在为微卫星标记技术在水产生物中的有效应用提供理论依据。 相似文献