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犬尿氨酸途径（Kynurenine pathway,KP）是色氨酸分解代谢的主要途径，其途径关键酶基因参与多种重要的生物过程。为明确玉米大斑病菌犬尿氨酸途径及其途径关键酶基因在病菌生长发育和致病过程中的功能，本研究利用生物信息学方法，对玉米大斑病菌犬尿氨酸途径中的关键酶基因进行鉴定；利用玉米大斑病菌的表达谱数据，对犬尿氨酸途径关键酶基因在病菌生长发育和侵染过程中的表达水平进行分析。结果发现，玉米大斑病菌中含有犬尿氨酸途径关键酶犬尿氨酸单加氧酶（KMO）、犬尿氨酸酶（KYN）、犬尿氨酸氨基转移酶（KAT）和吲哚-2, 3-双加氧酶（IDO）的编码基因，犬尿氨酸途径关键酶基因在病菌生长发育和侵染的不同时期呈现高表达水平，表明玉米大斑病菌中存在犬尿氨酸途径，犬尿氨酸途径关键酶基因可能在病菌生长发育和侵染过程中具有重要功能。研究结果为阐明玉米大斑病菌犬尿氨酸途径在生长发育和致病过程中的功能奠定了基础。 相似文献
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为了鉴定玉米基因组中组蛋白编码基因并分析其在不同条件下的表达规律，本研究利用生物信息学方法对玉米基因组中组蛋白编码基因进行了系统性鉴定和分析，利用同源性分析鉴定玉米组蛋白编码基因，利用保守结构域分析对组蛋白进行结构域鉴定，利用转录组测序数据对组蛋白编码基因进行表达规律分析。结果表明，玉米基因组中存在16个H2A,13个H2B,12个H3,9个H4和4个H1；对蛋白结构分析时发现玉米组蛋白保守结构域的数量和序列在同一亚族中高度保守，并且在不同物种中也非常保守；对玉米组蛋白基因的组织表达特异进行分析，发现玉米组蛋白编码基因在不同组织中表达水平有明显差异；对生物胁迫和非生物胁迫数据分析，发现组蛋白编码基因在不同胁迫下表达水平发生明显变化。本研究全基因组层面对玉米组蛋白编码基因进行了系统性鉴定和分析，明确了玉米中组蛋白的编码基因，揭示了组蛋白编码基因在玉米不同组织及生物和非生物胁迫中的表达规律，为进一步阐明其功能奠定了重要的理论基础。 相似文献