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高通量测序技术的不断发展和应用,为挖掘重要功能基因提供了转录组分析方法,但如何利用海量测序数据准确、高效地挖掘功能基因,仍是转录组学分析方法研究的重要瓶颈。本文综述了RNA-seq数据质量控制与读段定位、基因组注释、转录本拼接、表达水平评估、差异表达分析等环节分析方法,比较了数据分析常用软件、算法和数据库等的性能和适用范围;同时,又综述了蛋白调控互作网络和加权基因共表达网络等差异表达基因的功能分析方法。转录组分析正在从只利用物种内信息挖掘差异基因,向引入其他物种参考系进行目标物种功能基因挖掘分析方向发展。结合同源基因预测候选基因法、选择信号法、极端数据法、GO注释和KEGG富集分析法及BSR-Seq(bulked segregant RNA-Seq)法等鉴定方法,使分析结果更加科学可靠。随着测序技术和数据分析方法不断进步、数据库资源不断完善,测序数据中隐含的基因表达调控和生命规律将会逐渐得到准确、深入揭示。 相似文献
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鲜肉苁蓉气体射流冲击干燥工艺 总被引：3，自引：0，他引：3
以鲜肉苁蓉为材料,采用气体射流冲击干燥法对鲜肉苁蓉切片进行干燥,通过研究风温、风速、和切片厚度这3个工艺条件在干燥过程中对肉苁蓉饮片色泽和有效成分含量的影响,优选肉苁蓉饮片的最佳干燥工艺,采用图像分析法鉴别肉苁蓉干燥后的颜色;采用高效液相色谱法（HPLC法）测定肉苁蓉中松果菊苷、毛蕊花糖苷和半乳糖醇的含量。结果表明：鲜肉苁蓉饮片的最佳干燥工艺为风温70℃,风速12 m/s,肉苁蓉切片厚度2 mm。该工艺干燥的肉苁蓉饮片半乳糖醇含量较高,色泽呈淡黄色,有效提高了商品的价值,并对肉苁蓉饮片的精细化加工具有一定的参考意义。 相似文献
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在全人工光型植物工厂中进行试验,运用供光模式可调的红蓝LED光源,以不同频率的红蓝光交替照射生菜,并以同比例的红蓝光同时照射生菜作为对照组,通过测定生菜生长动态、光合色素、可溶性糖、粗蛋白、维生素C以及硝酸盐含量,研究红蓝光供光模式及交替频率对生菜生长与品质的影响。结果表明:在等能耗基础上,16 h光期里,红蓝光交替1次有利于生菜地上部分生物量、可溶性糖以及粗蛋白的积累;红蓝光交替4次有利于生菜中维生素C的积累以及硝酸盐的代谢;所有处理中,叶绿素及类胡萝卜素含量均以4次和8次红蓝光交替为最大,且二者之间无显著性差异。 相似文献
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在全人工光型植物工厂中进行试验，运用供光模式可调的红蓝LED光源，以不同频率的红蓝光交替照射生菜，并以同比例的红蓝光同时照射生菜作为对照组，通过测定生菜生长动态、光合色素、可溶性糖、粗蛋白、维生素C以及硝酸盐含量，研究红蓝光供光模式及交替频率对生菜生长与品质的影响。结果表明：在等能耗基础上，16h光期里，红蓝光交替1次有利于生菜地上部分生物量、可溶性糖以及粗蛋白的积累；红蓝光交替4次有利于生菜中维生素C的积累以及硝酸盐的代谢；所有处理中，叶绿素及类胡萝卜素含量均以4次和8次红蓝光交替为最大，且二者之间无显著性差异。 相似文献
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以番茄为试验材料,测定其在温室内基质栽培负水头供液条件下的日耗液量、空气相对湿度、气温和太阳辐射强度等气象因子数据,采用通径分析方法,建立多元回归模型,计算各气象因子对番茄日耗液量的直接通径系数、间接通径系数、决定系数和对回归方程估测可靠程度R~2的总贡献值。结果表明:作物系数和日平均太阳辐射强度的直接通径系数达到极显著水平(P0.01),2个因子的决定系数和对R~2总贡献值最大,是影响番茄日耗液量的重要因子;气象因子减少对番茄日耗液量影响的通径分析发现,敏感性最强的气象因子是日平均太阳辐射强度,其次分别是作物系数和日最高太阳辐射强度。 相似文献