大尾寒羊和小尾寒羊尾部脂肪lncRNA差异表达分析     

章焕  张成  邸腾刚  王冠  高丰衣  李明  杨广礼 《河南农业大学学报》2023,(2):298-306

【目的】通过识别影响绵羊尾部脂肪沉积的长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA),深入研究lncRNA参与绵羊尾部脂肪沉积的规律。【方法】采集大尾寒羊和小尾寒羊2个品种各3只公羊的尾部脂肪组织样本，通过Illumina NextSeq500高通量测序技术对样本RNA进行转录组测序，对所获得的reads进行lncRNA分析，筛选出差异表达lncRNA,通过GO和KEGG富集分析挖掘lncRNA靶基因参与的生物学过程和代谢途径。【结果】研究共筛选获得22个差异表达的lncRNA,对其进行靶基因预测，获得20个顺式靶基因。通过对靶基因功能分析，检测到包括调控血管生成、细胞迁移、胰岛素反应和MAPK级联反应正调控的4条生物学过程，以及胞外区、细胞外间隙的2条细胞组分。KEGG富集分析筛选到20个靶基因参与脂肪细胞因子信号通路、进入脂质代谢、代谢途径、AMPK信号通路和磷脂酶D信号通路等19条信号通路。【结论】本研究鉴定了影响绵羊尾部脂肪沉积的差异表达lncRNA及其靶基因，为进一步研究绵羊尾部脂肪沉积过程的作用机理奠定基础。  相似文献   

侧柏叶颗粒剂对产气荚膜梭菌Ⅳ型菌毛系统功能的抑制作用及其机制     

吴玉臣  朱先鹏  李有志  侯云峰  聂婧  尚小雷  邓旭明  高丰  吕强华 《中国兽医学报》2023,(10):2056-2061

为研究侧柏叶颗粒剂(Platycladi cacumen granules, PCG)对产气荚膜梭菌(Clostridium perfringens,C.perfringens)Ⅳ型菌毛系统(typeⅣpili, TFP)功能的抑制作用及其机制，首先，在体外进行滑动运动和生物被膜测定2种表型试验，验证PCG对TFP功能的抑制作用；随后，通过细胞黏附试验测定PCG对产气荚膜梭菌黏附至人克隆结肠腺癌细胞(Caco-2)的影响；最后，通过qRT-PCR测定PCG对TFP基因转录的影响，并结合透射电镜(TEM)观察PCG对TFP形态的影响。结果显示，PCG在质量浓度为1.3 g/L时，显著抑制产气荚膜梭菌的滑动运动和生物被膜形成；显著抑制产气荚膜梭菌黏附至Caco-2细胞，在有效浓度范围内对Caco-2细胞无明显检测毒性；qRT-PCR和TEM结果表明，PCG通过降低产气荚膜梭菌的TFP相关基因virR、virS、pilA、pilD、pilT、pilC和pilM的转录水平，破坏TFP菌毛形态，抑制TFP介导的功能。  相似文献