利用GoldenGate分析的高通量SNP芯片对鲤基因进行分型     

张晓峰  郑先虎  匡友谊  李超  鲁翠云  孙效文 《水产学杂志》2016,(6):19-25

单核苷酸多态性(SNPs)标记在大多数物种基因组中数量巨大且分布均匀,是许多水产物种遗传研究的理想标记,因此快速发展了几种高通量、快速的SNP标记分型平台。本研究利用Golden Gate分析技术对鲤Cyprinus carpio转录组测序的1 536个SNP标记合成了一张中等密度SNP芯片,对5个鲤群体的480份样本进行基因分型。结果表明:1 235个SNP标记成功分型,约占80%;915个标记至少在一个家系中呈现多态性,占74.1%;标记最小等位基因频率(MAF)介于0.05~0.5之间,平均为0.334,其中48.9%的标记最小等位基因频率(MAF)大于平均值;5个群体中SNP标记平均多态性信息含量(PIC)在0.3左右,为中度多态,杂合度为0.010~0.990,平均为0.5左右,暗示群体具有丰富的遗传多态性,育种价值及性状改良潜力很大。本研究分型的多态性SNP标记可广泛应用于遗传多样性研究、标记-性状关联分析以及分子标记辅助育种。  相似文献   

中国对虾不同凝集素基因应答WSSV侵染的表达差异          下载免费PDF全文

高焕  赖晓芳  王伟继  孟宪红  孔杰 《渔业科学进展》2012,33(5):53-58

本研究探讨了7种细胞凝集素基因在中国对虾中应答白斑综合征病毒(WSSV)感染上的生物学功能差异.结果显示,LT1 (DQ167572.1)、LT2(EU834289.1)、LT3 (EU834292.1)和LT5(EU834290.1)是肝胰腺组织特异、受WSSV感染诱导表达的基因,其他3种基因主要在肌肉、肠和腮中表达,与WSSV感染诱导无明显相关;在应答WSSV感染不同时间段的表达特征上,7种凝集素基因各不相同;在各组织中的表达量上,方差分析表明7种凝集素基因除在肝胰腺中的表达上存在显著差异外,其他组织中不存在显著差异.这些结果显示这7个凝集素基因在应答WSSV侵染的表达特征上存在较大差异,推测其在中国对虾体内免疫防御功能上的作用也各不相同.  相似文献   

饲料维生素C对急性降温后花鲈免疫、抗氧化及抗应激的影响          下载免费PDF全文

孙敬诚  李潇  鲁康乐  王玲  宋凯  张春晓 《渔业科学进展》2021,42(4):126-133

为研究饲料维生素C(Vc)对急性降温后花鲈(Lateolabrax maculatus)免疫、抗氧化及抗应激的影响,以含有不同水平Vc (6.85、46.90、88.24、167.43、329.21和658.69 mg/kg)的饲料饲养花鲈56 d后,进行急性降温(从33℃水体转入27℃水体)处理24 h和48 h。结果显示,降温24 h和48 h时,各组血清补体3(C3)水平高于0 h,而补体4(C4)水平低于0 h。饲料Vc在6.85~167.43 mg/kg时,血清免疫球蛋白M(IgM)水平随降温时间的增加,在24 h和48 h显著高于0 h (P<0.05);当饲料Vc含量高于167.43 mg/kg时,各时间点IgM差异不显著。血清溶菌酶(LZM)活性在降温48 h后显著低于降温前(P<0.05),而各Vc添加组显著高于对照组(P<0.05)。肝脏丙二醛(MDA)含量在降温后显著高于降温前,但在降温后随着饲料Vc水平的升高而显著降低(P<0.05)。肝脏总超氧化物歧化酶(T-SOD)含量随降温时间的增加,先增加后降低。在各时间点,花鲈肝脏谷胱甘肽(GSH)含量都随着饲料Vc水平的升高而升高。当饲料Vc为6.85 mg/kg时,肝脏血红素氧合酶(HO-1)活性在降温后显著高于降温前(P<0.05);当饲料Vc为88.24~167.43 mg/kg时,肝脏HO-1活性在降温后显著低于降温前(P<0.05)。花鲈血清热休克蛋白(HSP70)水平在降温后显著高于降温前(P<0.05),而当降温时间达到48 h时,各Vc添加组HSP70含量显著低于对照组。研究表明,饲料中适量的Vc (46.90~167.43 mg/kg)能提高花鲈肝脏的抗氧化能力,减轻脂质过氧化水平,缓解花鲈急性降温引起的应激反应。  相似文献   

裙带菜褐藻酸钠的分离纯化及降血脂作用的研究     

赖晓芳  沈善瑞  范琦锋 《水产科技情报》2013,40(4):222-224

为探讨裙带菜褐藻酸钠对饮食性高血脂的影响,从裙带菜中提取褐藻酸钠,经DEAE-Sepharose FF、Sepharose 4B纯化;以高脂乳剂对小鼠灌胃,建立高脂血症模型,再给小鼠灌胃褐藻酸钠溶液,研究裙带菜褐藻酸钠对小鼠血脂水平的影响。结果表明,与正常对照组相比,模型对照组小鼠血清总胆固醇(TC)、甘油三酯(TG)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)和动脉硬化指数(LDL-C/HDL-C)水平显著升高,高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)和抗动脉粥样硬化因子(HDL-C/TC)水平显著降低,成功建立起高血脂模型;与模型对照组相比,试验组小鼠血清的TC、TG、LDL-C和LDL-C/HDL-C水平显著降低,HDL-C和HDL-C/TC水平显著升高。结果表明,裙带菜褐藻酸钠具有较强的降血脂作用。  相似文献   

镜鲤两个繁殖群体的遗传结构和几种性状的基因型分析   总被引：9，自引：2，他引：9  

孙效文  鲁翠云  匡友谊 《水产学报》2007,31(3):273-279

利用扩增效果好、在群体中具有多态性的28个微卫星标记，检测国家换新良种场的镜鲤繁殖群体和黑龙江水产研究所松浦实验场的镜鲤繁殖群体的遗传组成，计算了两个群体的有效等位基因数，期望杂合度和多态信息含量等遗传参数，换新与松浦两个群体的有效等位基因数分别为2.874和3.102, 期望杂合度分别是0.565和0.603,多态信息含量分别是0.534和0.568；遗传结构分析研究结果表明这两个群体的多样性较高,信息含量丰富,具有进一步筛选出优良品种的遗传基础。但连锁不平衡分析表明这两个群体在较大的选择压力下，已严重偏离Hardy-Weniberg平衡，要保持群体的优良性状相关的遗传基础，应该在进一步的选种中注意增加群体的遗传多样性。也用28个基因座的不同基因型与换新208个亲本的体重值进行了连锁分析，得到12个与镜鲤体重相关的基因型，其中紧密相关的基因型3个；分析了一些严重偏离平衡的基因型，并分析了出现这种现象的可能原因，同时探讨了一些基因型与胚胎期致死或易感病基因连锁的可能性。为描述基因型偏离程度，创造了基因型偏离指数，并用其对群体中一些基因型出现的偏离现象进行了探讨。图1表2参19  相似文献   

基于26个微卫星标记的三江水系草鱼遗传多样性分析   总被引：2，自引：2，他引：2  

周盼  张研  徐鹏  鲁翠云  孙效文 《中国水产科学》2011,18(5):1011-1020

选取26个微卫星标记对来自长江(监利、邗江)、黑龙江、珠江3个水系的4个野生草鱼(Ctenopharyngodon idellus)群体的遗传多样性进行了检测。结果表明,26个微卫星位点均为高度多态位点,草鱼4个地理群体的多态信息含量(PIC)平均值为0.581 3~0.638 6;共检测出141个等位基因,其中有102个为共有等位基因;每个位点有等位基因2~11个,平均等位基因5.46,平均有效等位基因3.455 6。4个地理群体野生草鱼的平均杂合度在0.711 4~0.804 5之间。群体间遗传固定指数(FST)及AMOVA分析表明,群体间遗传分化并不显著(FST=0.031 73)。基于DA遗传距离构建的UPGMA聚类树表明,监利群体与邗江群体这两个长江水系野生地理群体聚为一支,然后与珠江群体聚为一支,黑龙江群体单独聚为一支。长江群体是原始群体。综上所述,三江水系野生草鱼具有较高的遗传多样性,4个群体之间遗传分化并不明显。  相似文献   

TDZ诱导中间锦鸡儿植株再生   总被引：2，自引：1，他引：1  

胡钠梅  韩素英  梁国鲁  齐力旺 《北方园艺》2009,(8)

以中间锦鸡儿种子无菌萌发得茎段为外植体,不同激素组合诱导丛生芽,得出最佳丛生芽诱导培养基为MS+TDZ 0.1 mg/L+NAA 0.02 mg/L+糖30.0 g/L+琼脂9 g/L,芽诱导率达220%。诱导得到的丛生芽直接生根困难,需过渡培养。在培养基MS+BA 0.2 mg/L+NAA 0.4 mg/L+糖30.0 g/L+琼脂9 g/L上过渡培养三代以上后转入生根培养基1/2MS+IAA 0.5 mg/L+糖30.0 g/L+琼脂9 g/L生根,长出的根粗壮,且须根数多,生根率在85%以上。生根培养后在草炭土∶珍珠岩=4∶1的基质上移栽成活率达到80%。  相似文献   

小麦抗麦红吸浆虫品种遗传多样性的表型和SSR标记分析   总被引：2，自引：0，他引：2  

仇松英  史晓芳  史忠良  张松令  谢福来  高炜  逯腊虎 《麦类作物学报》2011,31(6):1050-1056

为更深入地揭示小麦抗麦红吸浆虫品种（系）的遗传多样性,从而为进一步选育抗虫品种提供依据,在对田间虫圃1 562份小麦品种（系）损失率鉴定的基础上,取47份年度间鉴定抗性结果较为一致的材料,利用表型和SSR标记,进行遗传多样性分析。这些抗麦红吸浆虫品种农艺性状表现出较大的差异,表型聚类在遗传距离为0.68处将供试材料分为6个类群。19对SSR标记在47份不同抗性品种中检测到104个等位基因,能够将所有品种区分开来,每对引物可以检测到3～8个等位基因,平均5.47个。47个小麦品种间遗传距离为0.40～0.95,平均为0.71。SSR标记聚类分析在遗传距离为0.74处将供试材料分为6大类群。Mental测验结果表明,表型同基因型距离矩阵间存在显著正相关（r=0.76,P〈0.05）。抗虫品种晋麦65号单独聚为一类,同其余品种具有较远的亲缘关系,可作为新的抗源用于抗虫育种,并在吸浆虫发生地块推广种植。  相似文献   

大学文化结构层面对城市文化的影响     

李蕴慧  何晓芳 《高等农业教育》2014,(11)

现代大学已经走出了中世纪所说的“象牙塔”,逐渐拓展的职能要求其承担更多的社会责任,大学的文化传承职能使大学文化成为提升城市文化软实力的助推器.秉持辩证自然观结构决定功能这一普遍规律,先明晰大学文化与城市文化的涵义,之后从大学文化结构层面入手探讨大学文化结构与其功能之间的关系,进而从这一视角阐述大学文化结构层面对城市文化的影响,提出大学精神文化引领城市精神文明建设、大学制度文化推动城市文化创新发展、大学行为文化为城市文化可持续发展注入新鲜血液、大学环境文化有助于传承与镌刻城市文化等可行性建议.  相似文献   

日光温室土墙传热特性及轻简化路径的理论分析   总被引：2，自引：6，他引：2  

李明  周长吉  周涛  尹义蕾  富建鲁  王志强  齐长红 《农业工程学报》2016,32(3):175-181

为减小日光温室土墙厚度,该研究在分析土墙温度变化的基础上提出了土墙轻简化路径并进行了理论分析。根据测试分析,土墙可划分为用于储蓄热量的蓄热层和防止热量从蓄热层向室外方向流失的保温层。土墙86.9%的部分为保温层。模拟结果表明使用由47 cm厚夯土和7 cm厚聚苯板(热阻等于3.13 m厚夯土保温层)构成的复合墙在夜间的放热量与3.6 m厚土墙相近。使用保温材料替代夯土保温层来减薄土墙在理论上可行。另外,根据模拟,当土壤20 cm深处温度提高至23℃后,土壤供热量可超过测试条件下土壤和土墙放热量总和。为此,土墙在理论上可通过以下2条途径实现轻简化:1)使用保温材料建造墙体保温层;2)使用土壤蓄热替代墙体蓄热。  相似文献