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为探究let-7b在鸡不同生长时期和不同组织中的表达规律及生物信息学特点,以苏禽3号肉鸡为试验材料,检测鸡let-7b在不同时期和不同组织中的表达变化,通过生物信息学工具对常见脊椎动物的let-7b序列特点及基因组定位进行分析,构建系统进化树,并对靶基因进行预测。结果表明,在鸡大脑、心、胸肌和腿肌中,let-7b的相对表达量较高,且90日龄相对表达量显著高于3日龄。let-7b位于1号染色体基因间隔区,不同物种let-7b的成熟序列同源性较高,进化树分析结果表明,鸡let-7b与鸟类聚为一类。靶基因预测分析共获得263个靶基因,对获得的靶基因进行基因本体(GO)功能富集分析,发现靶基因主要富集到蛋白质泛素化、miRNA介导的翻译抑制和mRNA 3′-非翻译区(3′-UTR)结合等方面。KEGG通路分析发现,靶基因主要富集到丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)、转化生长因子β(TGF-β)通路和卵母细胞减数分裂等通路。总之,鸡let-7b在组织中广泛表达,物种间较为保守;结合靶基因富集分析结果,推测let-7b可能通过靶向MAPK和TGF-β等信号通路参与调控鸡肌肉生长及细胞增殖分化。 相似文献
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以优质鸡矮小型品系S4母系第3世代为素材,估测其12周龄体重和主要繁殖性状的遗传参数.结果表明:12周龄体重、开产日龄、开产体重、开产蛋重、43周龄体重、43周龄蛋重、43周龄产蛋数和种蛋合格率的遗传力分别为0.3324、0.3178、0.3412、0.2336、03609、0.4206、0.3005和0.1684.开产日龄与12周龄体重、开产体重和43周龄产蛋数呈表型极显著负相关(P0.01),表型相关系数分别为-0.423、-0.351和-0.428,而与开产蛋重和种蛋合格率呈表型极显著正相关(表型相关系数分别为0.265和0.395,P0.01),还与开产蛋重呈遗传正显著相关(表型相关系数为0.262,P0.05);开产体重与43周龄产蛋数呈表型极显著正相关(表型相关系数为0.357,P0.01),与开产蛋重和种蛋合格率同时呈遗传和表型极显著正相关(遗传和表型相关系数分别为0.346和0.422,P0.01);其他各指标间也存在不同程度的遗传和表型正负显著关联性(P0.01或P0.05).因此,今后在对开产日龄、产蛋数和种蛋蛋重为主的繁殖指标进行优质鸡矮小型品系的个体选择时,应多方面权衡考虑各因子之间的相互影响,制定最适宜的家系综合选择指数. 相似文献
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以矮小型优质肉鸡品系(S2系)为素材,采用RT-PCR技术分析dw基因在12周龄S2鸡肝脏、胸肌、腿肌和骨膜中等组织中的表达情况。结果表明,dw基因在肝脏、胸肌、腿肌和骨膜中均有表达,但在不同组织中的表达量不同。公母鸡在肝脏的mRNA水平(公鸡拷贝数为11.2±1.11,母鸡拷贝数为10.4±0.51)均显著高于胸肌、腿肌和骨膜(P<0.05);公母鸡在骨膜中的mRNA表达量(公鸡拷贝数1.8±0.37,母鸡拷贝数1.6±0.4)最低,且显著低于肝脏、胸肌和腿肌(P<0.05);母鸡在腿肌中的表达量(拷贝数为8.0±0.32)显著高于胸肌中的表达量(拷贝数为4.0±0.32)(P<0.05);公鸡在腿肌和胸肌中的表达量差异不显著。dw基因mRNA在肝脏和骨膜中的表达无性别效应,在胸肌和腿肌中的表达有明显的性别效应。 相似文献
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以矮小型优质肉鸡品系(S2系)为素材,采用RT-PCR技术分析dw基因在12周龄S2鸡肝脏、胸肌、腿肌和骨膜中等组织中的表达情况.结果表明,dw基因在肝脏、胸肌、腿肌和骨膜中均有表达,但在不同组织中的表达量不同.公母鸡在肝脏的mRNA水平(公鸡拷贝数为11.2±1.11,母鸡拷贝数为10.4±0.51)均显著高于胸肌、腿肌和骨膜(P<0.05);公母鸡在骨膜中的mRNA表达量(公鸡拷贝数1.8±0.37,母鸡拷贝数1.6±0.4)最低,且显著低于肝脏、胸肌和腿肌(P<0.05);母鸡在腿肌中的表达量(拷贝数为8.0±0.32)显著高于胸肌中的表达量(拷贝数为4.0±0.32)(P<0.05);公鸡在腿肌和胸肌中的表达量差异不显著.dw基因mRNA在肝脏和骨膜中的表达无性别效应,在胸肌和腿肌中的表达有明显的性别效应. 相似文献
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以清远麻鸡、白耳鸡、鹿苑鸡、藏鸡和S2系为试验素材,利用PCR-SSCP技术对核受体辅激活蛋白1(NCAO1)基因编码区进行SNP检测和基因型的判别,探讨NCAO1基因作为影响鸡产蛋性状候选基因的可能性。结果显示:在NCOA1基因的第3和第12外显子上分别发现一个SNP位点,其中第3外显子10155007处发生了T→A突变,检测到AA、AB、BB3种基因型;第12外显子108273423处发生了C→T突变,检测到CC、CD、DD3种基因型。χ2检验表明突变产生的基因型和基因频率在各品种(系)间差异极显著(P<0.01),A、C基因在蛋用型的地方品种白耳鸡中频率较高,B、D基因在肉用型的地方品种清远麻鸡、藏鸡和肉用型培育品系S2系鸡中频率较高。不同基因型与S2系鸡的开产日龄(AFE)、开产蛋重(WFE)、连产天数(CL)及300日龄产蛋数(EN)之间的最小二乘均数分析显示:AA基因型个体的连产天数比BB型个体多0.59 d,开产蛋重重0.6 g,300日龄产蛋量高7.76%,且差异显著(P<0.05);CC基因型个体比DD型个体的连产天数多0.51 d,开产蛋重重1.04 g,300日龄产蛋量高9.07%,且差异显著(P<0.05);组合基因型发现,基因型AACC个体的开产日龄、连产天数和300日龄产蛋量均高于BB、DD基因型组合。因而,初步推断NCOA1基因是影响鸡产蛋性状的主效基因或与主效基因连锁。 相似文献
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以邵伯鸡核心群母系母鸡为试验材料,利用PCR SSCP技术检测核受体辅激活蛋白1(NCOA1)基因的SNPs,并分析基因多态性与开产日龄(AFE)、开产蛋重(WFE)、连产天数(CL)及300日龄产蛋数(EN)之间的关联性。结果显示:在NCOA1基因的第3和第12外显子上分别发现1个SNPs位点,其中第3外显子10155007处发生了T→A突变,检测到 AA,AB,BB 3种基因型;第12外显子108273423处发生了C→T突变,检测到CC,CD,DD 3种基因型。不同基因型与各性状间有显著相关,其中AA基因型个体的连产天数比BB型个体多0.59d,开产蛋重重0.6g,300日龄产蛋量高7.76%,且差异显著(P<0.05);CC基因型个体比DD型个体的连产天数多0.51d,开产蛋重重1.04g,300日龄产蛋量高9.07%,且差异显著(P<0.05);组合基因型发现,基因型AACC个体的开产日龄、连产天数和300日龄产蛋量均高于BBDD基因型组合。因而,NCOA1基因可作为鸡产性状的标记基因用于分子标记辅助选择中。 相似文献
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为探讨钙蛋白酶抑制蛋白(Calpastatin,CAST)基因5'调控区的多态性与鸡肉质性状的关系,本研究以中国农业科学院家禽研究所选育的F、D、Y、B和S3等5个优质肉鸡(Gallus gallus)品系为试验素材,利用聚合酶链式反应限制性片段长度多态性(polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism,PCR-RFLP)技术检测CAST基因的SNPs,并分析其多态性与肌肉pH值、维生素B1、肉色、系水力、肌内脂肪和肌纤维密度之间的关系.结果显示,在距CDS-198位点发现1个突变位点(G→A),G-198A位点检测到3种基因型GG、GA和AA,相关分析显示,AA基因型个体的肌内脂肪和肌纤维密度显著高于GG型和GA型个体(P<0.05),而其他肉质性状无显著差异(P>0.05).由此可见,对于肉质性状而言,AA是最有利基因型,本研究结果初步表明CAST基因G-198A多态位点的A等位基因是提高鸡肉质性状的一个潜在的DNA标记. 相似文献
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研究探索了优质肉鸡不同生长时期的最佳光照模式,以期优化生殖系统发育及全面提升生产性能。选用0日龄的优质肉鸡S3系母鸡540只,每组180只,分别针对育雏期、育成期和产蛋期设计三种不同类型的光照模式饲养于三间封闭式鸡舍内,试验期66周。结果表明:(1)14周龄时,第Ⅱ组卵巢表面开始密布着小黄卵泡和大白卵泡,至开产周龄时第Ⅱ组较第Ⅰ组和第Ⅲ组明显密集(P0.05),卵泡表面相对更为光滑;23周龄时,第Ⅱ组输卵管长度更长、管壁更厚(P0.05)。(2)整个产蛋期第Ⅱ组的产蛋率、蛋重和日产蛋量显著高于Ⅰ组和Ⅲ组(P0.05),产蛋后期Ⅰ组产蛋率开始显著低于Ⅲ组(P0.05)。整个产蛋期Ⅱ组料蛋比显著低于Ⅰ组和Ⅲ组(P0.05),死淘率高于Ⅰ组(P0.05),低于Ⅲ组(P0.05)。(3)整个产蛋期内,蛋壳强度、蛋黄重表现为Ⅰ和Ⅲ组显著小于Ⅱ组,产蛋后期蛋壳强度表现为Ⅲ组显著高于Ⅰ组(P0.05),蛋黄重表现为Ⅲ组显著低于Ⅰ组(P0.05)。(4)相关性分析表明了输卵管长与输卵管管壁厚度、最大卵泡直径和产蛋率呈极显著正相关(P0.01),与大、小黄卵泡数、蛋重等呈显著正相关(P0.05)。综合比较三组光照模式,第Ⅱ组在生殖系统发育、产蛋性能及蛋品质方面最优。 相似文献