亚麻纤维素合酶超基因家族的生物信息学及表达分析   总被引：3，自引：1，他引：2  

袁红梅  郭文栋  赵丽娟  于莹  吴建忠  张利国  程莉莉  赵东升  吴广文  关凤芝 《中国农业科学》2016,49(23):4656-4668

【目的】全基因组水平鉴定亚麻纤维素合酶超家族基因Ces A/Csls,并对基因的进化、基因结构及组织表达特性等进行分析,为亚麻纤维发育的机理研究奠定基础。【方法】利用Phytozome基因组数据库,通过生物信息学手段,鉴定亚麻纤维素合酶超基因家族成员,并进行蛋白理化特性分析;利用MEGA 5.0、GSDS、MEME等软件构建系统进化树,并进行基因结构、蛋白保守基序分析;根据RNA-Seq数据对Ces A/Csls进行表达分析。【结果】系统分析鉴定了45个亚麻Ces A/Csls超家族基因,该家族基因在scaffolds上是分散分布的,没有明显的成簇现象。Ces A/Csls蛋白主要分布于质膜上,氨基酸数目为409—1 167,分子量为47 401.1—130 578.3,等电点分布在5.43—9.08。Ces A/Csl蛋白均含有跨膜结构域,数目为2—8。根据系统进化分析将其分成Ces A与Csl两类,细分为Ces A、Csl A、Csl B、Csl C、Csl D、Csl E、Csl G共7组。基因结构分析显示,亚麻Ces A/Csls基因的长度在2.1—6.8 kb,外显子数量在2—14。保守基序分析表明,不同组间Motif组成有一定的差异,Motif 1、Motif 2、Motif 3、Motif 4、Motif 12在Ces A、Csl B、Csl D、Csl E、Csl G组蛋白中均有分布,Motif 18、Motif 20在Csl A、Csl C组蛋白中均有分布,而Motif 13、Motif 14、Motif 15、Motif 19的分布则表现出一定的组间特异性。表达谱分析结果表明,Ces A/Csls家族成员在不同发育阶段表达模式不同,部分Ces A/Csls可被Na Cl、BR和Brz诱导上调或下调表达,预示Ces A/Csls功能的多样性以及在植物发育过程中扮演着不同角色。【结论】鉴定出45个亚麻Ces A/Csls家族基因成员,分属于两类,7组,分布于scaffolds上,基因结构和蛋白基序具有组间多样性和组内保守性。不同的基因在不同发育阶段具有一定的时空特异性。Ces A/Csls中部分基因响应激素BR、Brz及Na Cl胁迫。  相似文献   

11个亚麻品种的产量特征分析     

吴建忠  赵茜  关凤芝 《黑龙江农业科学》2012,(10):18-20

为探讨亚麻纤维遗传相关性,对11个亚麻品种的原茎产量、种子产量、全麻率和纤维产量4个产量相关性状进行相关性分析、主成分分析和聚类分析.结果表明:引进品种DIANE纤维产量最高,纤维和原茎产量相关系数最高,达到0.64,原茎产量在纤维物质积累中占主要成分,因此在纤维育种中注意原茎产量的选育同时要注意适当兼顾到对种子产量的影响.  相似文献   

基因表达系列分析技术在植物基因表达中的研究进展     

杨学  刘丽艳  关凤芝  李柱刚  吴广文  王珣  路颖  陈浩 《中国麻业科学》2009,31(4):233-237

基因表达系列分析(Serial analysis ofgene expression,SAGE)是一种研究真核细胞表达基因信息的高通量检测技术,它能对细胞内所有表达基因进行定性与定量分析.SAGE技术在植物方面的应用相对较少,但在植物抗病性研究中的应用近几年发展很快.综述介绍了SAGE技术的原理与操作、实施的方法与步骤、SAGE技术的主要优点及在植物基因表达分析中的应用.明确SAGE的优势与它的缺陷,在实际应用中加以完善及采取必要的辅助方案,这样就可以构建较完美的设计思想.  相似文献   

亚麻灰霉病发生规律及综合防治技术研究     

姜卫东  YANG Xue  关凤芝  LI Zhu-gang  刘丽艳  WU Guang-wen  王珣  SONG Xian-you  路颖  KANG Qing-hua 《中国麻业科学》2008,30(4)

从亚麻灰霉病的发生、发展、危害及病原菌生长发育规律到病害综合防治,进行了系统研究,明确了该病的发生与品种、土壤类型及气象因素等诸方面的关系,为病害防治提供了理论依据;也明确了带菌土壤和种子是该病害主要侵染源和传播途径,用药剂防治效果可达75％以上;同时建立综合防病体系。  相似文献   

亚麻品系9801-1对白粉病的抗性遗传分析   总被引：3，自引：0，他引：3  

杨学  赵云  关凤芝  李柱刚  刘丽艳  吴广文  王珣  宋宪友  刘昭军  路颖  李铁  康庆华 《植物病理学报》2008,38(6):656-658

 The genetics of resistance against powdery mildew in flax was analyzed. The F₁ plants from reciprocal cross of resistant materials 9801-1 and three susceptible cultivars ILONA, VENUS and DIANE were resistant to powdery mildew. The ratio of resistant and susceptible plants in F₂ generation fitted the excepted 3 to 1. It was postulated that 9801-1 carded a single dominant and resistant gene.  相似文献   

温度对不同亚麻品种发芽的影响     

姚玉波  关凤芝  吴广文  黄文功  康庆华  姜卫东  赵东升 《黑龙江农业科学》2015,(1)

以11个亚麻品种为试验材料,比较温度对不同品种亚麻种子发芽势和发芽率的影响。结果表明:供试的11个亚麻品种的发芽势和发芽率均随着温度的升高呈单峰曲线变化,5℃处理种子的发芽势和发芽率最低,与其它处理差异达极显著水平,当温度为20和25℃时,亚麻种子发芽势和发芽率最高。通过对11个品种的比较发现,黑亚18在低于10℃的情况下,仍保持了较高的发芽势(85.67%)和发芽率(94%)。  相似文献   

麻类优异种质的创新与利用研究     

粟建光  揭雨成  龚友才  关凤芝  戴志刚  路颖  王玉富  黎宇  许英 《中国麻业科学》2004,26(2):56-59

作物种质资源是育种和生产重要的物质基础,种质创新是种质资源研究的核心.通过多年的系统研究,我国麻类种质资源研究已跃居世界先进水平,成为世界麻类资源大国.但是,麻类种质创新落后、育种材料遗传基础狭窄、可利用资源贫乏的矛盾还十分突出,种质资源研究与育种和生产还有较大的差距.本文报告了麻类种质创新的方法和技术,麻类优异基因源的发掘和利用,"十五"苎麻、红麻、亚麻、黄麻优异种质创新和利用的成果,对今后的麻类种质创新工作提出了一些设想和建设性建议.  相似文献   

亚麻枯萎病发生规律及其综合防治措施     

杨学  王玉富  关凤芝  路影  宋宪友  张福修  康庆华  刘燕  吴广文  曲瑞璞 《中国麻业科学》2002,24(1):23-26

本文从亚麻枯萎病的发生发展、危害、病原菌传播途径到病害综合防治,进行了系统研究,明确了该病的发生与品种、土壤类型及气象因素等诸方面的关系,为病害防治提供了理论依据 ; 也明确了带菌土壤和种子是该病害主要侵染源和传播途径,用药剂防治效果可达 80% 以上,同时建立综合防病体系.  相似文献   

亚麻种植业与WTO   总被引：9，自引：0，他引：9  

王玉富  关凤芝等 《中国麻作》2001,23(1):29-32

本文介绍了国内外亚麻产业情况。分析了我国加入世界贸易组织给我国亚麻种植业的发展带来的机遇与挑战，提出了振兴对加入WTO后亚麻行业的战略调整措施。从多方面可看出亚麻产业在我国加入WTO后，将有更广阔的发展前景。  相似文献   

亚麻雨露快速生物脱胶技术研究Ⅰ.脱胶菌株的筛选     

陈浩  关凤芝  王立群  宋宪友  吴广文 《中国麻业科学》2007,29(6):339-343

本实验为了解决雨露沤制过程中因温度和湿度的不足造成沤制不成功这一问题,采用生物快速脱胶,提高脱胶速度.本实验采用不同地区的12个样品,分离脱胶菌142株,其中以沤麻时间在15d左右的为多,获得率居首位(45.8%).在脱胶终点的判定上首次采用蜗旋混合震荡仪法,在酶活力的测定上采用DNS法,实验结果更加准确;得到亚麻脱胶程度在4级的有3株,占所分离脱胶菌的10%;YL79和YL113两株脱胶菌尤为突出,亚麻脱胶程度均在4级;果胶酶活性均在800个单位以上;故均为微生物脱胶的优选菌株,为雨露沤麻生物制剂的研究打下良好的基础.  相似文献