产蛋前期和产蛋高峰期鸡全基因组甲基化差异及其对肝脏转录组影响的研究     

郭玉龙  职毅豪  李欣妍  董佳佳  李转见  田亚东  李红  刘小军 《畜牧兽医学报》2022,53(9):2888-2899

旨在通过对产蛋前期和产蛋高峰期鸡肝全基因组甲基化差异进行分析,解析基因组甲基化对不同发育阶段肝中基因表达差异的影响。本研究采用全基因组重亚硫酸盐测序（WGBS）技术对产蛋前期（20周龄）和产蛋高峰期（30周龄,各3只DNA混池）卢氏绿壳蛋鸡肝全基因组的甲基化水平进行检测,并与已有的肝mRNA转录组数据进行整合分析,探讨基因组甲基化对不同生理阶段基因表达差异的影响。结果表明,全基因组范围约有4%的胞嘧啶（C）发生了甲基化（mC）;两个生理阶段的总体甲基化水平基本一致。共检测到670个差异甲基化区域（DMRs）和356个差异甲基化基因（DMGs）。基因本体（GO）和相关信号通路（KEGG）分析发现,超甲基化DMGs显著富集在发育的正向调控、细胞形态改变的调控、VEGF信号通路、肌动蛋白细胞骨架的调控、粘着斑及间隙连接等相关过程,低甲基化DMGs显著富集在胚胎消化道形态的发生、间充质细胞增殖的正向调控、淀粉和蔗糖代谢及Wnt信号通路等相关过程。基因不同功能区域甲基化水平与基因表达水平有关,启动子（promoter）及基因体（gene body）区域甲基化水平与基因表达水平呈显著负相关,其他区域（内含子、3'UTR）的甲基化水平与基因的表达水平无明显关系。其中,与肝脂质代谢相关的候选基因RASD1、HAO1、UBE2O、MSRB3受甲基化调控。本研究绘制了不同生理时期卢氏绿壳蛋鸡全基因组甲基化图谱,结合mRNA转录组数据阐述了DNA甲基化在基因表达方面的调控作用,并鉴定出了不同生理时期受甲基化调控的基因,为深入研究表观遗传调控在不同生理时期蛋鸡肝代谢中的作用机制提供参考。  相似文献   

基于植被指数时序动态的冬小麦氮素营养诊断方法     

李鑫格  项方林  吴思雨  刘小军  田永超  朱艳  曹卫星  曹强 《麦类作物学报》2022,(1):109-119

为构建冬小麦冠层临界植被指数时序模型,探究实时、无损诊断冬小麦全生育期氮素营养状况的可能性,基于冬小麦不同生育时期氮营养指数(nitrogen nutrition index,NNI)与相对产量的关系确定NNI临界值,并利用归一化红边植被指数(normalized difference red edge,NDRE)与NNI的定量关系确定临界NDRE值,进而以累积生长度日为时间驱动因子,利用双Logistic函数构建临界NDRE时序模型并用于诊断,且对诊断结果进行了验证。结果表明,NNI与冬小麦相对产量在不同生育时期均呈现明显的线性加平台关系(R²在0.76以上),在开花—灌浆期表现最好;NNI与NDRE呈显著的幂函数关系(R2在0.76以上),在孕穗—开花期表现最好;临界NDRE时序诊断模型在拔节后期、孕穗期、开花期的诊断精度较高;适期播种时冬小麦在180 kg·hm^-2施氮水平下整个生育期均处于轻微氮亏缺或氮适宜状态,为较优施氮量。适期播种时冬小麦氮素营养状况主要受施氮水平的制约;过晚播时受播期的影响,不同施氮水平下冬小麦全生育期均处于氮亏缺状态。综上,依据氮营养指数与相对产量所构建的临界NDRE时序模型能够较准确地实时诊断冬小麦不同生育时期的氮素营养状况,并为作物氮肥精确管理提供技术方法。  相似文献   

奶牛线性外貌Fuuzy综合评判方法的研究     

刘小军  黄应祥  白金枝 《山西农业大学学报(自然科学版)》1996,(1)

本研究拟合了将线性评分转换为百分隶属度功能分的最优回归方程，采用Ｆｕｕｚｙ广义综合评判决策模型，确定了综合评判奶牛体型的模糊数学模型和计算机程序，其中各性状的权重分配用灰色关联度分析法研制。用此法对部分实测奶牛做的计算结果表明，该数学模型本身具有较高的灵敏度，评判结果与实际情况相符。  相似文献   

山西瘦肉型猪新品系(SD-Ⅰ系)6月龄体重遗传趋势分析     

刘小军  周忠孝 《中国畜牧杂志》1998,(1)

用混合模型ＢＬＵＰ法对山西瘦肉型猪新品系（ＳＤ Ⅰ系）选育过程中０～４世代４０头公猪的４４７头后裔６月龄体重进行了遗传趋势评估。结果表明：群体平均育种值随世代的增加而增加，说明ＳＤ Ⅰ系猪选育过程中所采取的育种措施是有效的。各世代间环境条件基本一致，且除０世代外，对表型值都有正的效应。继续进行选育，６月龄体重尚有提高的可能。  相似文献   

基于消费级无人机搭载数码相机监测小麦长势状况研究     

江杰  张泽宇  曹强  田永超  朱艳  曹卫星  刘小军 《南京农业大学学报》2019,(4)

[目的]本文旨在探究消费级无人机搭载数码相机更好地用于小麦长势快速监测。[方法]于2015—2017年开展涉及2个小麦品种和4个施氮水平处理的田间小区试验,在小麦关键生育期采用大疆精灵3专业版无人机自带的数码相机获取试验区数码影像,并提取6种颜色指数,同步取样并测定叶面积指数、叶片干物质量及叶片氮积累量等小麦长势信息,在小麦抽穗前、后及全生育期分别运用指数函数和随机森林算法定量分析长势信息与颜色指数的关系。[结果]在小麦各生长阶段,指数函数模型表现较好,可见光大气阻抗指数(visible atmospherically resistant index,VARI)、超红指数(excess red index,ExR)和归一化绿减红差值指数(normalized green minus red difference index,NGRDI)与叶面积指数、叶片干物质量和叶片氮积累量的相关性均表现较好,继而分别建立了基于VARI、ExR和NGRDI的叶面积指数(R~2=0.71～0.82)、叶片干物质量(R~2=0.42～0.71)和叶片氮积累量(R~2=0.52～0.76)的指数函数监测模型。独立试验数据的检验结果表明:在抽穗前及全生育期,ExR(R~2=0.45～0.70和0.42～0.62)监测模型估测的叶面积指数、叶片干物质量和叶片氮积累量与实测值拟合性更好,在抽穗后期,VARI(R~2=0.68～0.72)监测模型估测效果更好。[结论]结合小麦各生长阶段指数函数监测模型,利用无人机搭载数码相机可以快速无损监测小麦长势状况。  相似文献   

烟株砍收遮光水养对东北烤烟低温减灾的成效     

吴飞跃  高荣  游连尉  孙武  何健  李树利  赖成连  刘小军  刘奕平 《湖南农业大学学报(自然科学版)》2023,49(3)

为破解东北烟区烤烟生长后期低温影响烟叶采收的障碍,提高烟叶质量,尝试将低温灾害风险预警等级划分成正常、低风险、中风险、高风险,在中风险和高风险临近时(前2 d),采取对烟株砍收遮光水养采烤的措施,分析其对烤后烟叶的经济性状、外观质量、化学成分含量及感官质量的影响。结果表明：当预警等级为中风险以下时,烟株砍收遮光水养采烤处理,烤坏烟损失率较常规采烤降低8.5%,总损失率降低12.6%,烟叶外观质量评价总分可提高0.06分,但外观和感官质量改善不明显;当预警等级为高风险时,烟株砍收遮光水养采烤处理,烤坏烟损失率降低55.1%,总损失率降低70.2%,上等烟和中等烟比例显著提高78.7%、57.2%,外观质量评价总分显著提高了0.58分,两糖比、糖碱比较高,改善了化学成分的协调性及感官质量。建议当低温灾害风险预警等级为中风险及以下时,对田间未达成熟标准的烟叶,采用常规采烤方法;当高风险临近时,则采用烟株砍收遮光水养采烤方法,以达到减灾保收的目的。  相似文献   

鸡肝脏中PNPLA3基因表达及调控研究     

杨丽玉  李艳敏  郑航  田卫华  王彦彬  田亚东  康相涛  刘小军  李红 《农业生物技术学报》2018,(8)

PNPLA3(patatin like phospholipase domain-containing 3)也称为脂肪细胞营养素(adiponutrin)或不依赖于钙的磷脂酶A2ε(calcium-independent phospholipase A2ε,i PLA2ε),是PNPLAs家族中的一员,具有水解磷脂和中性脂质的活性以及酯酰基转移酶活性,能够参与脂肪的积累和脂肪动员。本研究旨在探讨鸡(Gallus gallus)肝脏中PNPLA3基因表达调控规律,为进一步阐明PNPLA3基因在鸡肝脏脂质代谢中的生物学功能奠定基础。首先运用生物信息学方法对鸡和其他12种动物的PNPLA3氨基酸序列进行分子进化分析;然后利用q RT-PCR技术,分析PNPLA3基因在不同发育时期卢氏绿壳蛋鸡各组织的时空表达规律,并分别从个体与细胞水平分析雌激素及其受体拮抗剂对PNPLA3表达的调控机制。结果表明,鸡与两栖类、爬行类和鱼类等物种的PNPLA3氨基酸序列相似性较高,在哺乳动物人(Homo sapiens)和小鼠(Mus musculus)等物种中的序列相似性较低;鸡PNPLA3基因在各组织中表现出广泛表达的特性,其中在10周龄的鸡胸肌、腹脂、胰腺中表达水平较高,在30周龄鸡的肝脏、胸肌、腹脂中表达水平较高,且在肝脏中的表达水平随着性成熟而显著升高(P0.01);雌激素处理可显著提高鸡肝脏组织和体外培养的鸡胚胎肝原代细胞中PNPLA3的表达水平(P0.05),雌激素受体(estrogen receptor,ER)-α特异性拮抗剂MPP(methyl-piperidino-pyrazole)可完全抑制雌激素的作用(P0.05)。综上所述,鸡与两栖类和鱼类等物种的PNPLA3氨基酸序列相似性较高,与哺乳动物序列相似性较低;PNPLA3在肝脏组织表达丰度较高,且在性成熟后显著升高;雌激素通过雌激素受体ER-α调控PNPLA3表达。上述发现为深入研究鸡PNPLA3与肝脏脂肪代谢调控机制提供了基础资料。  相似文献   

桥山林区不同坡向麻栎林种群生态位特征分析     

徐凤玲  刘小军  马建全  张文辉 《西北林学院学报》2018,(5)

为研究天然麻栎林种群生态位特征,应用Levins(LB)、Hurlbert(HB)和Pianka公式,对桥山林区24个400m~2天然麻栎林群落内10种乔木、25种灌木和5种草本的生态位宽度和生态位重叠进行计算、分析。结果表明:1)麻栎和茶条槭为乔木层的优势种群,狼牙刺、胡枝子和南蛇藤为灌木层的优势种群,苔草为草本层的优势种群,它们的生态位宽度较大,对环境资源的利用较充分,坡向对其生态位宽度影响较小;2)乔木层的杜梨、灌木层的卫矛、南蛇藤、胡枝子、鼠李,对光照与水分的要求较苛刻,其生态位宽度受到坡向的影响,而草本层的物种生态位宽度并未受坡向影响;3)阳坡麻栎林乔灌草的生态位重叠值较阴坡偏大,阳坡存在种间竞争使得物种丰富度降低,阴坡应对辽东栎、茶条槭等伴生树种和狼牙刺、胡枝子等生态位宽度较大的灌木进行适当间伐,增大林窗面积,提高植物对环境资源的利用率。  相似文献   

基于GIS和模型的种植系统设计   总被引：5，自引：2，他引：3  

单英杰  刘小军  姜海燕  朱艳  曹卫星 《农业工程学报》2009,25(2):145-151

本研究在总结、提炼相关农业种植设计理论与技术研究成果的基础上,运用系统分析原理和数学建模技术,构建了生态区划、种植制度设计、精确管理和生产力分析的定量化农业管理知识模型。并运用软构件技术,基于GIS空间信息管理平台,建立了数字化的基于GIS和模型的种植设计系统。系统实现了区域性种植信息的规范化管理及不同层次下的农业种植制度设计与管理,具有文件管理、地图操作、信息查询、生态区划、种植制度设计、精确管理、生产力分析、专家咨询、系统维护以及系统帮助等主要功能。以江苏省为案例区,对系统进行了初步的实例分析,结果表明,系统有效地实现了种植设计功能,从而为农作物种植设计的定量化和数字化奠定了基础。  相似文献   

水稻冠层光分布模拟与应用   总被引：1，自引：0，他引：1  

汤亮  李艳大  张玉屏  朱相成  刘小军  曹卫星  朱艳 《中国水稻科学》2011,25(4):427-434

 综合已有作物模型的优点,构建了水稻冠层光分布模型,并进一步与原有光合作用和干物质生产模型相耦合,构建了水稻光合生产模型。新模型将水稻冠层按叶面积指数划分为5层,各层次水平面上的太阳辐射强度按Monsi和Saeki的指数模型进行分布;模型利用日照百分率资料推算直接辐射与散射辐射,并考虑了光合有效辐射的日变化、冠层结构和太阳位置对直接辐射消光系数的影响。利用独立的水稻田间试验资料,对主要生育期冠层内的光分布进行了初步验证,结果表明模拟值与观测值之间具有较好的一致性。最后,将基于冠层光分布模型与原有光合生产模型进行了比较,预测水稻干物质积累量的根均方差分别为0.74 t/hm2和1.26 t/hm2,建立的基于冠层光分布模型的预测性较好。研究结果将为水稻生长模型的改进完善以及生产管理调控与品种数字化设计奠定基础。  相似文献