节瓜抗镰刀菌酸突变体内切几丁质酶基因的克隆与植物表达载体构建     

赵芹  谢大森  何晓明  彭庆务  罗少波  陈俊秋 《热带作物学报》2016,37(3):539-547

根据节瓜与枯萎病菌互作构建抑制消减文库获得的内切几丁质酶基因EST序列,以节瓜抗镰刀菌酸突变体"LT3"为试材,通过RT-PCR与RACE相结合的方法,获得了该基因全长c DNA序列,命名为Cq Chi I。序列测定和生物信息学分析结果表明,该基因c DNA序列全长1 139 bp,编码区在38~982 bp之间,编码314个氨基酸,蛋白质分子量为33.94 ku,等电点为8.43,具有chitinase_gluco_hydro_19及lysozome_like superfamily功能域,推测该蛋白可能兼具几丁质酶与溶菌酶活性。结构分析表明,该蛋白二级结构中α螺旋、延伸链、β转角与无规则卷曲分别占24.20%、18.15%、7.96%和49.68%,该蛋白为亲水性非跨膜蛋白,1~23氨基酸预测为信号肽。其三级结构高度保守,为class I碱性几丁质酶,属于几丁质酶第19家族,为分泌细胞外蛋白。序列比对与系统进化分析结果显示,Cq Chi I与黄瓜、甜瓜、葫芦、苦瓜等植物几丁质酶基因亲缘关系紧密,与黄瓜碱性内切几丁质酶(XP004134833)相似性最高为85%。进一步构建了植物表达载体p Cambia1300并转化农杆菌EHA105,通过蘸花法转化拟南芥,为后续开展基因功能研究奠定基础。  相似文献   

广东地区冬瓜感染的小西葫芦黄花叶病毒检测及其外壳蛋白基因多样性分析   总被引：1，自引：0，他引：1  

赵芹  谢大森  何晓明  李华平  尤毅  罗少波  彭庆务 《园艺学报》2016,43(1):151-155

小西葫芦黄花叶病毒(Zucchini yellow mosaic virus,ZYMV)是危害广东省冬瓜的常见病毒。摸索了冬瓜叶片总RNA最佳提取方法,通过基于ZYMV病毒外壳蛋白基因(coat protein gene,cp)序列的RT-PCR扩增,检测采集自广东省9个冬瓜产区的76份病毒侵染样品的病毒田间发病率;将扩增产物克隆测序,利用MegAlign软件构建系统发育进化树分析cp基因遗传变异与系统进化。结果表明,24份样品检测为阳性,田间发病率为31.59%;所有参试病毒分离物cp基因全长840 bp,编码279个氨基酸的多肽;测序的16个分离物cp基因的核苷酸序列与推导蛋白的氨基酸序列相似性分别为98.1%~100%与96.1%~100%;所有广东分离物的推导氨基酸序列基序保守,除GD121-9增加2个人类白细胞抗原外,其他均包含5个人类白细胞抗原及1个N糖基化位点,均包含保守potyv_CP功能域及与病毒蚜传相关的结构域DAG三联盒"Asp-Ala-Gly";系统进化分析表明,ZYMV病毒划分为7个基因型,广东分离物均属于同一基因型Ⅰ,包含3个株系;广东地区的16个分离物分为3组,无明显地域选择性。总体上广东ZYMV-cp比较保守,分子变异较小。明确了广东省冬瓜上ZYMV病毒的侵染情况及外壳蛋白基因的变异特点,为对其致病性和抗病毒基因工程等研究提供依据。  相似文献   

中早熟辣椒新品种‘汇丰3号’     

王恒明  罗少波  李颖  徐小万  郭汉权  黎庭耀  徐晓美 《园艺学报》2012,39(11):2329-2330

‘汇丰3号’辣椒是中早熟优质杂交一代新品种, 果实羊角形,青果深绿色,成熟果大红色。果长 17.0～18.1cm,果宽 2.83～2.94cm,肉厚0.32～0.37cm,单果质量42.3～44.7g,单株产量 0.42～0.59kg。商品性好,耐贮运,品质佳。田间表现中抗病毒病,耐热性、耐寒性、耐涝性和耐旱性均强。适合在华南地区露地栽培。  相似文献   

苦瓜新品种‘长绿’   总被引：2，自引：1，他引：1  

张长远  罗剑宁  何晓莉  罗少波  郑晓明 《园艺学报》2009,36(10):1551-1552

 ‘长绿’苦瓜是以自交系‘03-2-31’为母本, ‘03-2-84’为父本配制而成的杂交一代。果实长圆锥形, 果色绿, 果长约25 cm, 横径约516 cm, 单瓜质量330 g左右, 条瘤顺直, 果形端正, 光泽好,品质优。连续坐果力强, 抗白粉病, 丰产性好。  相似文献   

瓠瓜Ty1-copia型逆转座子RT基因的分离与序列分析     

赵芹  谢大森  何晓明  江彪  罗少波  彭庆务  李明珠 《热带作物学报》2014,35(8):1577-1585

以3个瓠瓜栽培种为供试材料,利用Ty1-copia逆转座子逆转录酶保守序列设计简并引物,PCR扩增获得260bp左右序列条带,回收产物克隆至T载体进行测序,利用生物信息学软件分析获得的25条逆转录酶序列。结果表明,这些序列长度变化范围为218~267bp,经DNAStar软件比对同源性在26.1%~99.6%之间,存在高度异质性,主要表现为缺失突变,核苷酸序列聚类分析分为6个家族,家族1与家族3分别占总序列数的24.0%与36.0%。翻译成氨基酸序列后,分别有2条与11条序列发生移码与终止密码子突变。与已发表物种的相应序列构建系统发育进化树,发现瓠瓜Ty1-copia型逆转座子RT序列具有一定保守性,同时也与杨树、草莓、马铃薯等有很近的亲缘关系。本研究为后续利用逆转座子开发分子标记研究瓠瓜遗传变异及进化途径奠定基础。  相似文献   

黄瓜新品种粤秀3号的选育     

林毓娥  罗少波  梁肇均  黄河勋  陈清华  何晓明 《中国种业》2007,(6):51-52

1选育经过 粤秀3号是以A-2为母本、C-8为父本配制的一代杂种。A一2是在100多份资源材料鉴定的基础上，从中选出从亚洲蔬菜中心引进的材料，用单株选育法经7代自交纯化的优异材料。主要特点是早熟，植株长势较强，分枝强，主侧蔓结果，瓜长棒形、瓜条顺直、瓜长40cm、瓜把3．8cm，品质中等。父本C-8是从长春密刺系统变异植株中选出单株，其表现植株生长势强，  相似文献   

耐热优势黄瓜新品种夏盛的选育   总被引：1，自引：0，他引：1  

罗少波  中岛武彦 《中国蔬菜》1996,(5):25-27

  相似文献   

黄瓜新品种‘早青4号’   总被引：1，自引：1，他引：0  

林毓娥  梁肇均  黄河勋  龚浩  王瑞  罗少波 《园艺学报》2011,38(10):2027-2029

‘早青4号’黄瓜是以抗病雌性系B-36为母本,吉-6为父本,杂交育成的华南型雌型一代杂种。生长势强,主蔓结瓜为主,全雌株率达70%以上,连续结果性强。瓜短圆筒形,瓜长25.0cm,单瓜质量约400g,皮色深绿有光泽,口感脆,商品性好,耐贮运。抗病抗逆性强。适合广东乃至华南地区及东南亚国家种植。  相似文献   

长身苦瓜品种资源聚类分析   总被引：4，自引：0，他引：4  

张长远  罗少波  胡开林  罗剑宁  郑晓明  何晓莉 《广东农业科学》2003,(4):20-21,26

采用数量分类学的方法，对24个长身型苦瓜品种资源的15个农艺性状进行了聚类分析，结果表明，24个资源材料可划分为5个品种类群，即早中熟品种群、中晚熟普通品种群、中晚熟大果型品种群和极晚熟品种群、极早熟强雌性类群。  相似文献   

基于NBS-LRR类R基因保守结构域克隆瓠瓜抗病基因同源序列     

赵芹  谢大森  何晓明  罗少波  彭庆务 《华南农业大学学报》2015,36(5):92-98

【目的】分离鉴定瓠瓜Lagenaria siceraria抗病种质的抗病基因同源序列(Resistance gene analogs,RGAs),为瓠瓜功能性抗病基因的克隆及分子标记辅助育种奠定基础.【方法】根据已知核苷酸结合位点和富亮氨酸重复(Nucleotide binding site and leucine rich repeat,NBS-LRR)类抗病基因保守区设计简并引物,从"大籽瓠"抗性材料基因组DNA中分离抗病基因同源序列,并利用生物信息学软件进行长度变异、保守结构域、同源比对与系统进化分析.【结果和结论】基于同源克隆策略,获得23条瓠瓜NBS抗病同源序列,命名为HNB1~HNB23,Gen Bank登录号为KJ908192~KJ908214.序列分析及同源比对结果表明,这些RGAs长度变异在242~261 nt之间,18条序列具有连续开放阅读框(Open reading frame,ORF),推导氨基酸序列具有P-loop、Kinase-2a典型NBS类R基因保守结构域;核苷酸序列相似性为41.5%~98.8%,氨基酸序列相似性为21.5%~100.0%;利用NCBI Blast同源搜索发现,与其他植物尤其是冬瓜、黄瓜、葫芦及丝瓜的已知R基因具有40%~100%相似性;氨基酸序列聚类分析将其分为5个组;同源进化分析表明,23条瓠瓜RGAs均为non-TIR-NBS-LRR类R基因,与推导氨基酸序列多重比较结果一致.  相似文献