参薯ADP-ribosylation factor（ARF）基因的生物信息学分析     

高洪昌  黄小龙  陈银华  许云  吴文嫱  谢俊  黄东益 《广西农业科学》2013,(7):1069-1075

【目的】对参薯等11种植物的ARF基因进行生物信息学分析,为深入研究植物ARF基因的结构与功能分析奠定基础。【方法】对参薯ARF同源序列进行克隆和序列测定,利用生物信息学相关软件对参薯等11种植物的ARF的核苷酸序列、氨基酸序列、组成成分、疏水性/亲水性、蛋白质二级和三级结构、信号肽、跨膜结构、导肽进行分析。【结果】参薯ARF基因同源片段大小为1200bp。系统进化分析结果表明,参薯等11种植物的ARF氨基酸序列可分为Ⅰ和Ⅱ两大类,细分A、B、C、D、E5个亚族,其中参薯ARF1和蒺藜苜蓿组成一个亚族,参薯ARF2和风信子组成一个亚族。参薯ARF的氨基酸序列中存在GTP/Mg2＋结合位点和G2、G3保守区域,具有两个相同的效应结构域Switch1和Switch2。参薯ARF蛋白结构以无规则卷曲为主,三级空间结构不稳定。ARF蛋白为疏水性、脂溶性蛋白,无信号肽,存在明显跨膜结构域;ARF导肽无明确定位,预测等级为3级。【结论】参薯ARF蛋白结构的特殊性为其执行物质转运和参与信号转导功能奠定基础。  相似文献   

草莓的管道化栽培技术   总被引：2，自引：0，他引：2  

赵根  陈银华 《农业新技术》2005,(4):14-15

草莓的管道化栽培就是利用管道为草莓栽培的载体,利用微控制计算机来实现营养液及温、光、气、热等环境因子的智能化调控,让草莓在管道上正常快速地生长、开花、结果.  相似文献   

木薯MeNOSIP与MeRbohD蛋白的互作验证及其对外源激素的响应          下载免费PDF全文

赵锐  樊若晨  丁凯旋  唐枝娟  王红刚  黄思源  蒋凌雁  陈银华  耿梦婷 《热带生物学报》2020,11(2):170-176

为了解木薯（Manihot esculenta）MeRbohD在抗病途径中的功能，笔者在获得MeRbohD候选互作蛋白MeNOSIP（nitric oxide synthase-interacting protein，一氧化氮合酶互作蛋白）的基础上，通过RT-PCR克隆获得MeNOSIP基因编码区序列，并进行生物信息学分析。结果表明，MeNOSIP的CDs序列全长918 bp，编码含305个氨基酸的多肽，属于不稳定的亲水类蛋白质，亚细胞定位预测MeNOSIP在细胞膜上表达。采用酵母杂交验证发现，MeRbohD与MeNOSI真实互作。MeRbohD和MeNOSIP在JA，SA，ABA诱导下基因均上调表达；ABA处理下，MeRbohD和MeNOSIP基因表达变化趋势一致，推测它们可能共同参与了由ABA介导的抗逆通路。  相似文献   

转录调节因子VrhR负调控野油菜黄单胞菌的致病力          下载免费PDF全文

张钰  林茂娟  李婷  李春霞  陈银华  陶均 《热带生物学报》2020,11(2):217

以野油菜黄单胞菌（Xanthomonas campestris pv. campestris, Xcc）转录调节因子VrhR，VrhA和VrhB为研究对象，通过基因敲除和致病性分析确定它们在Xcc与宿主互作过程中的作用。结果表明:VrhR只含有HTH（helix-turn-helix）结构域；在基因组上vrhR位于其他2个lysR类转录调节因子（vrhA和vrhB）之间，但转录方向相反。vrhR突变会提高Xcc的致病能力，但vrhA和vrhB突变对病原菌的致病能力没有影响。同时, vrhR，vrhA和vrhB突变均不影响细菌的运动性及胞外酶（蛋白酶、纤维素酶和淀粉酶）的活性。  相似文献   

转基因大豆插入位点分析及特异性PCR检测方法的建立     

郭娜娜  吴辉  于晓惠  黄惜  陈银华  彭明 《热带作物学报》2011,32(8):1527-1531

采用TAIL-PCR方法研究转基因大豆外源基因LEC1插入位点序列特征,并根据此特征建立了LEC1转化事件特异性检测方法。依据正义表达载体上T-DNA区段侧翼序列设计特异性引物和简并引物,获得4个同源序列。对获得的序列进行Blastn分析发现,p69、p148、p225均为载体T-DNA区段一部分,未见大豆基因组序列;P217插入片段的序列分析表明,该序列长863 bp,其中T-DNA左边界序列长143 bp,720 bp为大豆基因组片段,与大豆光系统II类囊体膜蛋白(Thylakoid membrane proteins)的206-926区段同源性为99%,这表明,外源DNA插入了大豆基因组中类囊体膜蛋白编码区的206位。根据分离的序列建立事件特异性定性检测方法,扩增片段大小为277 bp。该事件特异性检测方法具有高度的特异性和良好的灵敏性,为转基因大豆品种LEC1的身份识别提供了有效的方法。  相似文献   

辣椒ACC氧化酶基因部分序列的分离与鉴定     

陈银华  张广平  王海  蔡铭  袁平该  陈宪成 《农业科学与技术》2006,7(1):2-7

乙烯作为一种植物激素，在植物生长发育过程中发挥着重要的作用。1-氨基环丙烷-1-羧酸（ACC）氧化酶（ACO）是乙烯生物合成途径中的一种关键酶。本研究以辣椒为研究材料，根据报道的辣椒ACC氧化酶基因序列（AJ011109）设计引物，利用PCR的方法从中国种湘研4号基因组获得长度为354bp的gDNA序列和213bp的cDNA序列。利用生物信息学软件对所获得的gDNA和eDNA序列进行了分析。  相似文献   

番茄耐盐性及耐盐育种研究进展     

陈火英  李怀志  刘杨  陈银华 《上海交通大学学报(农业科学版)》2007,25(5):507-512

综述了国内外番茄耐盐的生理机制,耐盐性状的筛选技术,以及耐盐育种的方法。针对番茄耐盐育种的现状,提出了常规育种与细胞工程育种、分子标记辅助选择育种相结合选育番茄耐盐品种的新途径。  相似文献   

番茄王栽培技术     

陈银华  赵根  冯黎灵 《农业新技术》2005,(5):28-29

1株番茄可以结1万多个果实,植株的覆盖面积可达到60m2,这就是番茄王.番茄王的栽培是设施环境高度智能化与无土栽培技术高水平相结合的一种综合性技术,是我国经济实力与科技水平的集中体现.  相似文献   

湖南省地方标准《杂交棉亲本保纯与繁育技术规程》     

贺云新  梅正鼎  张志刚  陈银华 《中国棉花》2013,40(1):39-41

棉花亲本种子的纯度是保持杂种F1一致性和杂种优势获得重演的关键.因此,国家对种子的质量非常重视,几次颁布与修订了相关法规:《中华人民共和国种子管理条例》于1989年5月1日由国务院农业、林业主管部门颁布;《中华人民共和国种子法》(2004年修正),于2004年8月28日由全国人民代表大会常务委员会颁布;《农作物种子质量检验机构考核管理办法》由农业部发布,自2008年7月1日起施行.  相似文献   

大豆GmPic基因的分离及表达分析     

吴辉  符秀梅  张巧玲  郭倩丽  陈银华  沙爱华 《热带作物学报》2012,33(3):446-452

对光敏感型大豆品种“中豆24”进行长日、短日和自然光3种光周期处理,采用cDNA-AFLP的方法筛选差异片段,并进一步通过RACE技术分离了该基因。该基因全长983 bp,包含一个完整的开放阅读框,编码248个氨基酸,在遗传关系上与线粒体磷酸盐转运蛋白高度同源。通过半定量RT-PCR对该基因在不同光周期中的表达模式进行分析,结果表明,该基因在大豆生长发育的早期阶段表达,短日照抑制其表达,而长日照则增强其表达。因此,大豆线粒体磷酸盐转运蛋白基因可能是作为一种负调控因子参与大豆光周期反应。对大豆线粒体磷酸盐转运蛋白基因的研究能为进一步阐明大豆光周期反应分子机理打下基础。  相似文献