鸟巢蕨转录组高通量测序及分析   总被引：3，自引：0，他引：3  

贾新平  孙晓波  邓衍明  梁丽建  叶晓青 《园艺学报》2014,41(11):2329-2341

采用新一代高通量测序技术Illumina HiSeq 2000对鸟巢蕨转录组（Asplenium nidus）进行测序,共获得29 254 595个序列读取片段（reads）,包含了5 908 586 517个碱基序列（bp）信息。对reads进行序列组装,共获得42 907个单基因簇（Unigene）,平均长度936 bp,序列信息达到了40.16 Mb。数据库中的序列同源性比较表明,24 993个Unigene与其他物种的已知基因具有不同程度的同源性。鸟巢蕨转录组中的Unigene根据GO功能大致可分为细胞组分、分子功能和生物学过程3大类51个分支,其中有大量的Unigene与代谢进程、结合活性、催化活性和细胞进程相关。将Unigene与COG数据库进行比对,根据其功能大致可分为24类。KEGG数据库作为参考,依据代谢途径可将Unigene定位到116个代谢途径分支。SSR位点查找发现,从42 907个Unigene中共找到6 067个SSR位点。SSR不同重复基序类型中,出现频率最高的为AG/CT,其次是AC/GT、A/T和AGG/CCT。针对这些序列,设计了20对引物进行了扩增效率和多态性检测,其中7对引物在不同蕨类材料中表现出多态性。  相似文献   

梨新品种‘徽源白’     

刘普  衡伟  贾兵  刘莉  叶振风  朱立武 《园艺学报》2014,41(12):2539-2540

‘徽源白’梨为中熟品种。果肉乳白色,质地细腻,水分足,口感脆爽,果心小,可食率高。果实含可溶性固形物11.0%,维生素C 109.8 mg ? kg-1,可溶性糖8.62%,可滴定酸0.103%,糖酸比为83.69,果形指数0.88,平均单果质量269.7 g。在安徽黄山地区8月上旬成熟,具有较强的抗病性。  相似文献   

大蕉枯萎病病原菌鉴定及TEF-1α序列分析     

吕顺  曾莉莎  刘文清  王芳  赵志慧  周建坤  李洪波  杜彩娴  陈石  韩秀香  向欣叶 《植物病理学报》2014,44(4):337-348

 近年来,大蕉枯萎病在广东省东莞市发生严重,为了有效控制病害发生蔓延,生产上急需明确大蕉枯萎病的病原。本研究收集了我国华南地区的12株大蕉枯萎病病原菌及19株包括1号及4号生理小种的单孢菌株,以来源于澳大利亚的1号、2号、3号和亚热带4号生理小种以及4株非病原尖孢镰孢菌作对照,通过病原菌形态鉴定、致病性测定、4号小种(Foc 4)及热带4号小种(TR4)的分子特异检测、以及基于翻译延伸因子(TEF-1α)序列的系统发育分析,对大蕉枯萎病病原菌进行鉴定。同时,对我国华南地区不同来源的香蕉枯萎病病原菌的遗传发育关系及致病性分化情况进行了研究。结果表明:(1)引起大蕉枯萎病的病原菌主要是1号生理小种或者是与1号生理小种亲缘关系较近的一个新的系统发育谱系,该谱系可能为 1 号生理小种变异演化而来;(2)大蕉枯萎病病原菌对大蕉和粉蕉都有较强的致病力,但不能侵染香蕉;我国的1号小种存在一定的分化,其中有一个类群只能感染粉蕉,另一个类群既能感染粉蕉也能感染大蕉;(3)大蕉与粉蕉枯萎病的病原菌在致病性及遗传发育关系上都存在一定的交叉和分化。  相似文献   

粗糙集理论在土壤肥力评价指标权重确定中的应用   总被引：5，自引：0，他引：5  

叶回春  张世文  黄元仿  周志明  沈重阳 《中国农业科学》2014,47(4):701-717

【目的】土壤肥力是土壤诸多基本特性的综合反映,科学、合理、实用地评价土地肥力将为指导农业生产、土地利用规划和管理提供理论依据。其评价过程是一个无决策属性的多属性决策过程,而解决多属性决策问题的重要前提是各属性权重分配问题。【方法】确定指标权重的方法主要有主观赋权法和客观赋权法,然而,主观赋权法往往需要大量的先验知识,评价结果有一定的主观随意性,而且较少考虑评价指标之间的依赖关系;客观赋权法没有充分考虑到各参评因素对评价的重要度不同,统计数据有相关性也并不意味着两个事件具有因果联系。综合考虑主、客观赋权法各自的优缺点,利用粗糙集理论中知识约简和相对正域理论在消除冗余信息和处理不确定性信息等方面的优势,探究土壤肥力评价过程中一种主观和客观相结合的权重确定方法,并利用作物产量对评价结果进行验证。【结果】粗糙集理论在土壤肥力评价中的具体赋权思路包括：数据的离散化、土壤肥力综合等级的初步确定、属性值约简、等价类划分、属性重要度的计算和指标权重计算等步骤。以北京大兴区农田土壤样点的肥力评价对上述赋权思路进行实例分析,对比传统特尔斐法和粗糙集理论赋权结果发现,特尔斐法确定的土壤有机质、全氮、有效磷和速效钾等指标的权重分别为0.300、0.250、0.250和0.200,利用其评价得到的土壤综合肥力指数（IFI）与产量显著线性相关,R2为0.77,均方根误差（RMSE）为1.25;而粗糙集理论确定的土壤有机质、全氮、有效磷和速效钾等指标的权重依次为0.455、0.111、0.111和0.333,利用其评价得到的IFI与产量也显著线性相关,R2达0.83,RMSE为1.09,精度均较特尔斐法有了提高,其中RMSE相对精度提高值达12.80%。【结论】粗糙集理论在土壤肥力评价中的具体赋权思路基本是可行的,且相对于特尔斐法其确定出各指标权重更为合理、准确,可为土壤肥力评价及相关领域的评价提供一个有益的思路。  相似文献   

基于近自然林理论的生态景观林带建设探讨——以广州市科韵路为例     

李许文  ;唐小清  ;叶自慧  ;张荣京  ;陈红锋 《中国城市林业》2014,12(2):10-13

文章以人工林近自然化改造理论为指导,通过实地调查科韵路绿化现状,分析其植物种类、群落结构与林相观赏特性,在此基础上提出了近自然模式的优化策略。研究结果可为广东省生态景观林带建设提供参考与借鉴。  相似文献   

运行趋稳别具特色 重视现实力推发展——上半年我国食用畜产品加工业监测分析     

蔡学斌  ;孙洁  ;冯伟  ;石汝娟  ;杨琴  ;叶维武  ;乔晓玲  ;李家鹏  ;张德权  ;高观  ;马美湖  ;邱宁  ;李海燕  ;刘朋飞  ;谭智心 《农产品加工．学刊》2014,(9):11-12

<正>今年上半年,我国食用畜产品加工业整体运行形势稳中趋缓。生猪供应充足,牛羊肉供不应求,禽肉价格小幅上涨,乳制品加工业投资吸引力上升,液体蛋市场份额明显增加。屠宰行业集中度低、禽肉销售依然不畅、乳制品过度包装等突出问题需重点关注。1.行业总体发展趋势  相似文献   

一例孔雀急性大肠杆菌病的诊治     

阎俊杰  叶亚东 《当代畜禽养殖业》2004,(3):46-46

2003年正定县西乡的孔雀庄园的孔雀发病,死亡两只。经检验为大肠埃希氏菌感染引起。主诉,2003年7月20日早晨,孔雀庄园的饲养员饲喂时发现多数孔雀精神萎顿,拱头缩颈,不食。拉黄白绿色稀粪,其中一只粪便带血。即来本站就诊．途中死亡一只。  相似文献   

茶叶功能及产品开发研究现状   总被引：4，自引：0，他引：4  

叶新民 《蚕桑茶叶通讯》2004,(2):27-29

茶叶中含有茶多酚、茶多糖、茶氨酸、咖啡碱等有益健康的功能成分,茶及茶制品也因其低热量、纯天然和保健特性受到越来越普遍的欢迎.本文简要介绍了茶叶中主要活性成分的提取工艺、功能及其应用.  相似文献   

野果奇葩--香蕉蜜瓜     

叶国盛 《北方果树》2004,(4):40-40

香蕉蜜瓜,又名三叶拿绳,是木通科木通属落叶或半常绿缠绕藤本野生植物.果实除鲜食外,亦可用作中草药,并有多种工业用途,是一个极具开发价值的野生水果新品种,也是一个药物资源.日本专家大村鸿一郎先生称为"紫宝".  相似文献   

放线菌发酵产物对烟蚜的毒力研究   总被引：1，自引：1，他引：0  

廖文程  叶兰钦  邓建华  高家合  徐汉虹 《安徽农业科学》2004,32(6):1191-1191,1202

3个放线菌菌株 (3 1-1、3 0 -2、45 -A1)的发酵产物对烟蚜的毒力测定结果表明 :所测菌株对烟蚜均有毒力 ,施药后 2 4h ,菌株 3 1-1对烟蚜的毒力最强 ,LC50 为 0 .0 44 7mg/ml;而菌株 45 -A1毒力最弱 ,LC50 为 0 .0 92 3mg/ml。生物测定结果显示 :施药后 4h ,3个菌株的发酵产物对烟蚜的致死效果差异不显著 ,但施药后 2 4h ,菌株 3 1-1的校正死亡率达 82 .9% ,而菌株 45 -A1的校正死亡率只有 48.7%。  相似文献