基于不同密度SNP面板的凡纳滨对虾AHPND抗性基因组预测准确性分析          下载免费PDF全文

刘杨  栾生  刘绵宇  李旭鹏  孟宪红  罗坤  隋娟  谭建  代平  曹家旺  陈宝龙  孔杰 《水产学报》2023,47(1):019612-019612

为评估不同SNP标记密度对凡纳滨对虾AHPND抗性基因组预测准确性的影响，本实验对26个全同胞家系进行Vp AHPND侵染，收集686尾个体的存活时间数据，对其中242尾个体利用液相芯片“黄海芯1号”(55.0 K SNP)进行基因分型，基于A、G和H亲缘关系矩阵估计Vp AHPND侵染后存活时间的遗传参数；采用随机和等距抽取方式，基于55.0K SNP构建了8个低密度SNP面板(40.0、30.0、20.0、10.0、5.0、1.0、0.5和0.1 K)，利用GBLUP和ssGBLUP等方法预测Vp AHPND侵染后存活时间的基因组育种值，利用交叉验证方法计算其预测准确性，并与BLUP方法进行对比分析。遗传参数估计结果显示，Vp AHPND侵染后存活时间表现为高遗传力水平，估计值为0.68～0.79。在55.0 K SNP密度下，针对242尾基因分型个体数据集(G242)，利用BLUP、GBLUP和ssGBLUP方法获得的预测准确性分别为0.424、0.450和0.452,GBLUP和ssGBLUP比BLUP分别提升了6.13%和6.60%；针对686尾表型测定个体数据集(P686)...  相似文献   

凡纳滨对虾在低氧环境下存活性状的遗传参数评估          下载免费PDF全文

段毓佳  谭建  栾生  罗坤  王宏杰  隋娟  孟宪红  孔杰 《渔业科学进展》2024,(1):138-147

在水产养殖中，尤其是高密度养殖情况下，缺氧会短期内造成个体的大量死亡，从而影响生产效益。本研究以凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)高抗和快大2个品系作为研究对象，利用高致死溶解氧(DO)胁迫的方式，对2个品系各41个家系共计6 560尾幼虾进行低氧耐受性测试，统计高致死溶解氧水平下幼虾的存活性状，分析不同品系间及同一品系不同家系间耐低氧性状的差异，评估其遗传参数；对耐受性有显著差异的家系个体的鳃、肌肉、肝胰腺组织进行组织学观察，并比较其细胞水平上的差异。结果显示，在0.3mg/L低氧条件下，高抗品系和快大品系的家系半致死存活率SS50均表现出显著差异(P<0.05)，高抗品系SS50为49.30%，快大品系SS50为42.52%；家系间存活时间的变异系数分别为60%和45%。利用阈值性状动物模型，以半致死时的个体存活状态作为观测值(存活为1，死亡为0)估算的遗传参数为(0.345±0.031)～(0.378±0.029)，经过转换后在连续变化的观测值尺度上的遗传力为(0.219±0.031)～(0.237±0.029)，表现为中等遗传力水平。高抗品系中低氧耐受...  相似文献   

EM菌与鱼腥草镶嵌模式对池塘养殖水体的净化效果     

王金乐赵凤  曾诗雨孔杰闵文武  杜强李小义  张美彦李建光 关梅周洲  才让卓玛陈晖  杨芳华 《贵州农业科学》2022,50(7):84

【目的】探明EM复合菌与鱼腥草镶嵌模式对池塘养殖水体的净化效果，以期为鱼腥草浮床＋EM菌修复系统在池塘养殖水体修复上的应用提供科学依据。【方法】选择鱼腥草为浮床植物，研究7.5%浮床、15.0%浮床、7.5%浮床＋EM菌、15.0%浮床＋EM菌、EM菌无浮床和无EM菌无浮床(CK)对池塘养殖水体的净化效果。【结果】不同处理池塘pH及水温均在正常范围，处理间变化不明显；但对池塘养殖水体的净化效果存在差异，不同处理水质的pH、DO、TN、NH3-N、TP、CODMn和BOD5平均分别为7.92～8.48、4.44～7.19 mg/L、1.15～1.83 mg/L、0.40～0.61 mg/L、0.09～0.18 mg/L、1.20～2.40 mg/L和1.90～3.23 mg/L，综合污染指数为0.97～1.84，15.0%浮床＋EM菌镶嵌处理对池塘水质修复效果最好，对TN、NH3-N、TP、CODMn和BOD5水质因子浓度的削减效果分别为9.66%、5.86%、－25.93%、40.98%和31.33%，其水质污染程度和污染水平分别为尚清洁和标准限量内(达2级标准)，其余处理水质均为污染和超出警戒水平。【结论】15%鱼腥草浮床＋EM复合菌镶嵌处理对池塘水质修复效果最好，但因“水呼吸”现象影响水体溶解氧浓度，选择15%鱼腥草浮床＋EM菌修复模式时需要配备增氧设备辅助增氧，以进一步提升池塘水体修复效果。  相似文献