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采用PCR产物直接测序法对来自福建东山、广东湛江和广西北海的3个群体方斑东风螺(Babylonia areolata)的COI基因进行比较分析。结果表明:COI基因片段长度为680 bp,碱基组成显示A+T比例较高,约为62.42%;种群间多态位点数为32,单倍型多样性指数为0.707±0.092,核苷酸多态性指数为0.001 85±0.000 39,平均核苷酸差异数为1.252。以泥东风螺(Babylonia lutosa)和织纹螺(Nassarius)为外群,构建了NJ系统发育树,其拓扑结构显示,3个群体的方斑东风螺首先聚类到一起,然后与泥东风螺聚为一支,与织纹螺形成不同的分支。 相似文献
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本研究采用MISA软件分析泥东风螺(Babylonia lutosa)转录组中微卫星信息。结果显示,从转录组中共获得16324个SSR,共有181种重复基元;泥东风螺转录组中不同类型微卫星的重复基元具有不同的分布特征,其中,二核苷酸重复基元中AC/GT(70.58%)重复基元以重复6次出现频率占优;长度为12~20 bp的SSR占63.95%,长度为21~25 bp的SSR占9.14%,总体的平均长度为18.4 bp。随机选取其中50条序列设计引物,通过对福建野生泥东风螺群体(WP)DNA样本进行PCR扩增和分型,结果获得23个多态性位点,等位基因数目为2~7个不等,期望杂合度(Ne)为0.190~0.937,观察杂合度(No)为0.065~0.936,多态性信息含量(PIC)为0.061~0.777,有4个位点显著偏离哈迪温伯格平衡(Hardy-Weinberg equilibrium, HWE) (P<0.05)。对野生群体和养殖群体(BP)遗传多样性分析显示,野生群体和养殖群体的平均Ne分别为0.491和0.544,平均No分别为0.477和0.564,平均PIC分别为0.541和0.407。Fis结果显示,野生群体和养殖群体分别有13个和9个位点杂合子过剩。群体间遗传分化指数(Fst)为0.001~0.655,平均值为0.053 (0.05相似文献
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2020年4月至2021年1月按4个季节，在永州、衡阳、株洲、湘潭、长沙、岳阳共设6个采样站，35个采样点，对湘江浮游植物的种类组成、优势种群、密度分布与群落结构进行调查，分析浮游植物种类数、生物指数及其与环境因子的相关性。结果表明：调查期间，在湘江共鉴定出浮游植物8门133属259种，其中绿藻(92种)和硅藻(71种)种类较多，分别占总种类数的35.52%、27.41%，密度分别为1.00×104、6.20×103 ind/L，分别占总密度的47.39%和29.38%，呈绿藻–硅藻型水体；浮游植物种类整体呈现冬、春、夏、秋季逐渐增加的趋势，春、冬季主要为硅藻型水体，夏、秋季则变为绿藻型水体；湘江四季浮游植物密度为6.20×103~9.29×104 ind/L，四季平均密度为2.11×104 ind/L，其中以秋季密度最大，春季最小，除衡阳站夏季浮游植物密度最大外，其余各站位均以秋季的最大；四季共出现13种浮游植物优势种，全年浮游植物的优势种主要为绿藻门的普通小球藻；浮游植物α多样性指数(H)、丰富度指数(D)、均匀度指数(J)年平均值分别为3.20~4.80、1.13~4.79、0.73~0.81，冬、春、夏、秋季的H和D均依次升高，J的季节差异不明显，而D的季节变化较大，6个采样站中，株洲站的H、D、J年平均值均为最低，永州站的H值最高，衡阳的D值最高，永州站的D值次之，永州及湘潭站的J值最高，可见，湘江水质较好，属于轻污染或无污染，且上游水质优于下游；相关性分析发现，浮游植物群落分布与溶解氧、pH、营养盐等环境因子存在一定的相关性。 相似文献