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大黄鱼高温适应的转录组学分析 总被引:3,自引:3,他引:0
为了探究大黄鱼高温胁迫条件下基因表达水平的变化,实验利用Illumina Hiseq 2500的125 pair-ended测序模式分别对大黄鱼高温处理组和常温对照组进行了转录组测序。对照组(3个生物学重复)和高温处理组(3个生物学重复)分别获得15.28和13.92 Gb测序数据,GC含量平均值约为51%。过滤后的高质量测序reads使用Bowtie2软件比对到大黄鱼参考转录组序列上估计基因表达量,进而进行基因表达差异统计学检验。以常温对照组为参比,高温处理组中阈值设为|log2(FC)|2和FDR0.05,共检测到1 259条显著差异表达基因。其中,821条基因为高表达,438条基因为低表达。随机选取12条差异表达基因,运用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)进行了验证,结果证实转录组分析可靠。进一步将所有差异表达的基因进行GO功能注释和KEGG通路富集分析,结果发现大量差异表达基因的功能与氧化还原反应、蛋白质折叠和去折叠、糖和脂代谢以及某些疾病的发生相关。该研究结果为下一步深入研究大黄鱼高温适应的调控机制提供了重要的参考材料。 相似文献
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针对‘浙梨6号’因部分萼片宿存或残存、果顶尖凸等而影响果实品相问题,选择PBO、氟硅唑、丙环唑3种脱萼剂,以清水为对照进行试验。结果表明:与对照相比,3种脱萼剂处理果实的脱萼率提高23.27~26.01个百分点,果顶尖凸率降低24.55~26.44个百分点,扁圆果占比、单果重、可溶性固形物含量分别增加33.19~37.66个百分点、37.9g~57.1g和0.68~0.94个百分点,但果实偏斜度、全锈果率偏高0.54~0.74和18.36~19.23个百分点,端正果率、花朵坐果率下降15.89~21.07和5.43~6.62个百分点,差异达显著或极显著水平。三者分别选择4000mg·L-1、333.3mg·L-1、444.4mg·L-1使用浓度和花序分离期进行喷施,在保证脱萼防凸效果的同时,可有效降低对花朵坐果率及果形端正度等不利影响。 相似文献
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