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旨在分析高、低繁殖力川中黑山羊卵巢组织中长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)的表达谱,探讨lncRNA与山羊生殖调控的关系,为解释lncRNA在山羊繁殖调控中的分子机制提供理论依据。本研究选择3胎以上的10头健康川中母羊(3.5~4.5岁),将其分为高繁组和低繁组。高繁组为每胎产羔数在2头以上的母羊(n=6),低繁组为每胎产羔数为1头的母羊(n=4)。同期发情后,采集高繁和低繁山羊的卵巢样品,并从中提取总RNA构建测序文库,通过HigSeq X ten平台进行测序,筛选出差异lncRNAs,通过对差异显著的lncRNAs与mRNAs位置关系以及结合能的判定预测顺式作用的靶基因,并对其进行GO和KEGG通路分析。最后,随机抽取6个差异lncRNAs进行实时荧光定量验证。结果表明,本研究共鉴定出168个差异表达lncRNAs,其中,163个lncRNAs在高繁组卵巢显著上调,5个lncRNAs在低繁组卵巢显著上调。筛选出的差异表达lncRNAs可能为调控山羊繁殖力的候选lncRNAs,包括ENSCHIG00000001479、ENSCHIG00000002617和ENSCHIG00000002622等。这些候选lncRNAs的靶基因(MYC、CDH2、FGF9、PPARGC1A等)主要富集于Jak-STAT、细胞黏附分子及AMPK等信号通路,ENSCHIG00000001479的靶基因MYC参与了Jak-STAT、TGF-β和MAPK通路;ENSCHIG00000002617和ENSCHIG00000002622的靶基因CDH2参与了细胞黏附分子通路。通过qRT-PCR验证发现,定量结果与测序结果基本一致。研究结果推断,ENSCHIG00000001479、ENSCHIG00000002617和ENSCHIG00000002622等lncRNAs可能对山羊生殖发育过程中的卵巢发育及排卵等进程具有重要的调控作用,认为鉴定出的差异表达lncRNAs与山羊产羔数有关。本研究利用RNA-Seq技术筛选高、低繁殖力山羊的差异表达lncRNAs,并对其进行GO和KEGG功能分析,为探讨山羊产羔数的繁殖机制提供更完善的转录组数据。 相似文献
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广式液体凉茶经过浸提工艺之后,产生数量巨大的凉茶原料残渣,处理费用成本高,易造成环境污染。目前,关于凉茶残渣作为动物非常规饲料的相关研究较少,文章以蔗糖、尿素和纤维素酶为添加剂,研究其对凉茶渣发酵品质的影响。结果表明,未发酵凉茶渣中粗蛋白(CP)、粗脂肪(EE)、中性洗涤纤维(NDF)、酸性洗涤纤维(ADF)和水溶性碳水化合物(WSC)含量分别为:11.94%、3.47%、74.95%、53.96%和0.52%。添加尿素、纤维素酶、蔗糖和尿素+蔗糖+纤维素酶组中NDF含量显著低于对照组(P<0.05),发酵后的凉茶渣ADF含量在49%~59%范围之间,单独添加尿素、纤维素酶和蔗糖的处理组能够显著降低半纤维素含量(P<0.05),添加0.6%尿素使发酵后凉茶渣水溶性碳水化合物(WSC)、乳酸(LA)和乙酸(AA)含量增加,并且丁酸(BA)含量最低,为0.17%。研究结果可为凉茶渣的有效利用提供参考。 相似文献
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利用甲基化限制性酶切试验(Combined bisulfite restriction analysis, COBRA)和亚硫酸盐转换PCR
(Bisulfite sequencing PCR , BSP)后测序的方法,筛选猪体细胞克隆优势供体细胞提供基因座位特异的DNA 甲基化
遗传标记。比较8 个发育重要基因的差异甲基化区域(Differentially methylated regions,DMRs)在不同克隆供体细胞系
中的DNA 甲基化多态性,并与猪克隆成绩进行关联分析。结果表明院除了XIST-DMR2 和H19-DMR3 DNA 甲基化变
异幅度较小(低于10%)外,其他基因的相关座位均存在一定的COBRA 多态性,其中,LINE1-DMR1、POU5F1-DMR1
和NANOG-DMR1 等3 个差异甲基化化区域在克隆效率最高细胞系中处均处于最低程度的DNA 甲基化状态,因此,
可作为筛选猪体细胞克隆优势供体细胞系的潜在的DNA 甲基化遗传标记。 相似文献
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将携带茁-甘露聚糖酶基因manA 的转基因FVB 原代小鼠与“生型FVB 小鼠进行繁殖得到F1代,通过
PCR 和Southern blot 鉴定出F1代转基因小鼠。提取转基因小鼠腮腺、舌下腺、下颌下腺、心脏、肝脏等组织的总RNA,
通过RT-PCR 检测出manA 在转基因小鼠的腮腺和舌下腺组织特异性表达。进行定量PCR 验证出manA 基因在302
号家系小鼠的舌下腺中表达量最高,证明茁-甘露聚糖酶基因manA 在转基因小鼠的腮腺和舌下腺特异性表达成功。
对转基因小鼠唾液进行收集测定茁-甘露聚糖酶活性,在302 号家系中检测到酶活性较高。通过代谢试验测定饲料
中粗蛋白、粗纤维和粗脂肪的消化率,结果显示,与非转基因小鼠相比,302 号家系转基因小鼠对饲料中粗蛋白、粗纤
维的表观消化率无明显差异,而粗脂肪的消化率得到显著提高;304 号家系转基因小鼠对饲料中粗蛋白、粗脂肪、粗
纤维消化率方面均无明显差异。 相似文献
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β-葡萄糖苷酶是纤维素酶系三大成员之一,被认为是纤维素糖化的限速酶。本研究克隆黑曲霉β-葡萄糖苷酶基因(bgl1),并在中国仓鼠卵巢(CHO)细胞中进行表达分析。以GenBank上黑曲霉β-葡萄糖苷酶基因(bgl1)序列为模板,设计特异性引物,从黑曲霉(Asperjillus niger)基因组DNA中扩增目的片段,通过SOE-PCR的方法将猪腮腺分泌蛋白信号肽序列sp和bgl1相连,成功构建分泌型真核表达载体pc6-sp-bgl1,利用脂质体介导法瞬时转染哺乳动物CHO细胞,通过RT-PCR和Western blot检测,最后通过DNS(dinitrosalicylic acid)法测定表达产物酶学活性。PCR扩增得到的目的序列与文献报道序列的相似性为91%,预测的蛋白氨基酸序列相似性为99%。RT-PCR和Western blot检测证明,外源基因bgl1在CHO细胞中得到表达;分泌到细胞培养上清中的重组蛋白对水杨素的水解活性为1.74U/mL,说明重组蛋白具有β-葡萄糖苷酶活性。本研究克隆得到黑曲霉bgl1基因并在哺乳动物CHO细胞中进行表达,为β-葡萄糖苷酶在单胃动物中的利用提供了基础研究资料。 相似文献
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本文收集广东省某一DHI参测规模化奶牛场2021年1-12月份的测定数据及牛群的基础资料,运用CNDHI和Excel软件对该场全年乳脂率、乳蛋白率、脂蛋比、乳尿素氮、体细胞数、胎次及泌乳天数指标进行综合分析。结果表明,该场2021年乳脂率、脂蛋比、乳尿素氮指标整体偏低;SCC>50万/mL的牛数有下降趋势;而头胎奶牛及泌乳天数在200d以上牛数占比偏高。由此可见,奶牛场正确解读DHI报告并将其应用于牧场生产有利于及早发现牧场生产中存在的问题,还可以及时改善该牧场日粮结构、环境卫生、牛群结构以及繁殖状况等方面存在的问题,提高牧场生产管理水平及经济效益。 相似文献
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对14个物种的全基因组序列进行比对,识别其基因组中的同源区域,进而鉴定牛和山羊基因组的共同加速进化区域(以下简称加速区域),并对加速区域进行注释及组蛋白修饰位点的富集分析;运用生物信息学方法,筛选编码区出现加速进化的基因,并对其进行GO和KEGG通路分析。结果表明:在牛和山羊基因组中共检测到44 794个加速区域;加速区域在基因区与非基因区均有分布,分别占总数的54.80%与45.20%;加速区域显著富集了25个不同的组蛋白标记;鉴定出2703个候选基因的编码区出现了加速区域;GO条目分析发现,候选基因主要富集的生物过程包括轴突形成、腺体发育、肌肉组织发育等,细胞组成包括突触膜、轴突部分、突触后致密等;KEGG通路分析发现,这些候选基因参与了cAMP信号通路、轴突导向、钙离子信号通路、Rap1信号通路、神经活性配体–受体互作等信号通路。这揭示在牛角形成过程中,突触和轴突的产生可能发生了独特的变化,影响信号传递与神经结构组成并导致转录调控和基因表达发生变化,从而导致牛科动物出现形态特异的洞角。 相似文献