牛CRP2基因SNPs筛查及生物信息学分析     

杨永强  龚俞  焦仁刚  惠嫣婷  刘若余 《西南农业学报》2012,25(5)

为遗传效应分析及CRP2基因对牛生长调控的功能研究奠定基础,选取生长发育性状差异明显的务川黑牛和贵州荷斯坦奶牛构建DNA池,设计1对引物分别扩增2个牛种CRP2基因第6外显子序列和部分3’-UTR(总长724 bp),切胶回收后对PCR产物进行双向测序,进行不同牛种CRP2基因SNPs筛查.结果表明:在CRP2基因有7个SNPs:T20G,C22G,T151C,T285A,T-157C,G-145A,G-85A,包括3个新的SNP位点(C22G,T-157C,G-85A).CRP2基因第6外显子编码区有2个SNPs,包含1个错义突变(C22G,Gly→Ala)和1个同义突变(T20G);CRP2基因3’-UTR有2个SNPs(T151C和T285A);CRP2基因内含子区有3个SNPs,分别为T-157C、G-145A和G-85A.T20G、C22G和T151C位点等位基因频率在不同牛种间有较大差异.突变前后CRP2的RNA二级结构和蛋白质二级结构有明显改变,蛋白质三级结构无明显差异.  相似文献   

黔北麻羊RERGL基因cDNA克隆与生物信息学分析     

蔡惠芬  陈志  罗卫星  刘若余  张依裕  石照应 《湖北农业科学》2012,51(15):3362-3365

选择与羊同源性较高的牛RERGL基因组序列设计特异性引物,提取黔北麻羊脾脏总RNA,通过RT-PCR技术对RERGL基因进行克隆测序及序列分析.结果表明,成功克隆了黔北麻羊RERGL基因,其cDNA序列646 bp,GenBank登录号JN 671919,编码205个氨基酸.生物信息学分析表明,黔北麻羊RERGL基因蛋白二级结构α-螺旋占40.68％,延伸链占16.18％,无规则卷曲占43.14％;没有跨膜螺旋结构域且没有糖基化位点.  相似文献   

六个肉兔杂交组合筛选试验     

肖超能  陈眷华  刘若余  陈学会  彭羽 《黑龙江畜牧兽医》2012,(7):159-160

为了提高商品肉兔的日增重和成活率,试验采用比利时兔分别与新西兰兔、加利福尼亚兔和齐卡兔组成6个正反交杂交组合,进行品种间杂交组合筛选试验。结果表明:试验组在日增重、料重比和成活率方面的杂交优势较明显,其中比利时兔(♂)×新西兰兔(♀)组与双亲对照组相比在日增重、料重比、28日龄成活率和90日龄成活率上的优势更为明显。  相似文献   

黔北山区舍饲养羊牧草均衡供应方案     

田雄  刘若余  史忠辉 《农村养殖技术》2012,(6):40-41

贵州务川仡佬族苗族自治县自2005实施草地生态畜牧业科技养羊项目以来,经历了全放牧、半放牧和全舍饲养的发展过程。为了保证舍饲营养的均衡供给,采用豆科牧草和禾本科牧草搭配饲喂;为了保证青草的四季均衡供应,采取冷季型牧草、暖季犁牧草相互搭配、交替种植。  相似文献   

黔北麻羊GHRH—R基因多态性与生长性状的关联分析     

肖礼华  史忠辉  曾琼  穆林  徐猛  罗卫星  刘若余  陈志 《中国草食动物》2012,(5):8-10

为研究黔北麻羊GHRH—R基因多态性及其与生长性状的关系,以相同条件下饲养的30只36～48月龄母羊为研究对象,利用克隆测序技术,对GHRH—R基因的第2、第3外显子及部分内含子进行SNPs位点的检测,并将发现的SNPs位点与黔北麻羊生长性状进行关联分析。结果表明：在第3内含子6bp处C→A碱基突变AA型基因型个体的体重显著高于AC型个体（P〈0．05）,该位点可作为黔北麻羊体重选择的分子标记。  相似文献   

香猪的种质特性     

刘培琼  刘若余  燕志宏  张依裕  谌宏光 《中国猪业》2013,(Z1):163-164

香猪是世界著名小型猪种,中心产区位于我国贵州省从江县加鸠、宰便,也广泛分布于该县加勉、光辉等8个乡镇及荔波、榕江、黎平、剑河、三都等县。香猪沉脂力强,早熟易肥,肉质优异,在我国地方猪种分类中属华南型猪种。中国农业大学王连纯教授将香猪种质特性归纳为"一小、二香、三纯、四净"。1"一小"徐文超教授于1977~1984年在原贵州农学院进行过从江香猪的种质测定,他认为香猪体短、矮、小、丰圆,肥腴。经刘培琼等1993~2002年考查,从北向南香猪体躯逐  相似文献   

江口萝卜猪UCP2基因启动子变异分析          下载免费PDF全文

吴雪  张继  邱淦远  刘鹏程  杨茂林  刘若余 《南方农业学报》2019,50(10):2314-2321

[目的]研究江口萝卜猪UCP2基因启动子变异,并对其进行生物信息学分析,为江口萝卜猪品种选育及开发利用提供理论依据.[方法]利用江口萝卜猪基因组DNA构建混合DNA池,PCR产物直接测序后采用DNASTAR等生物软件分析筛选出SNP位点,然后采用Neural Network Promoter Prediction、TFsitescan、WebGene等生物信息学分析软件预测单核苷酸突变前后的UCP2基因启动子核心区域、转录因子结合位点和CpG岛.[结果]在江口萝卜猪UCP2基因启动子上共筛选到3个SNPs位点,分别是G-84>A、G-161>C和T-366>A.利用生物信息学分析软件分析单核苷酸突变对UCP2基因启动子核心区域、转录因子结合位点及CpG岛的影响,结果发现,从江口萝卜猪UCP2基因启动子上筛选到的3个SNPs位点均不在预测到的启动子核心区域,但靠近转录起始点;3个SNPs位点也不在预测得到的CpG岛内,且不会影响UCP2基因启动子的甲基化水平;3个SNPs位点能在不同程度上导致转录因子结合位点消失或产生新的转录因子结合位点,其中G-161>C突变对转录因子结合位点的影响最大.[结论]从江口萝卜猪UCP2基因启动子上筛选到3个SNPs位点,分别为G-84>A、G-161>C和T-366>A,虽然这3个SNPs位点均不在启动子核心区域及CpG岛内,但不同程度造成转录因子结合位点消失或产生,其中G-161>C的影响最大,可能是调控UCP2基因表达的重要功能突变位点.  相似文献   

野猪资源的开发与利用     

李萍  刘世会  刘若余 《贵州畜牧兽医》2004,28(3):46-47

野猪在动物分类学上属偶蹄目,猪科,猪属,是家猪的祖先。世界上的野猪分为欧洲野猪和亚洲野猪,野猪的染色体数(2n)在36～38之间,彼此间没有繁殖障碍。我国主要有华南野猪、台湾野猪、华北野猪、东北白胸野猪和矮野猪等亚种分布,形成了极为丰富的遗传资源。鉴于野猪生态、生存空间日渐减少,现存数量不足以满足人们对野味的需求,加之野猪某些特殊性状和特征,促发了人们对野猪资源开发和利用的兴趣。  相似文献   

贵州剑河白香猪的生长发育测定   总被引：17，自引：0，他引：17  

张启林  刘培琼  刘若余 《中国畜牧杂志》1999,35(3):41-42

香猪是祖国猪种资源的无价之宝,是国家二级稀有动物,继１９７８年西南区猪种资源普查发现贵州从江香猪后,徐文超先生对贵州从江香猪的种质进行了系统测定,在《中国猪种地方猪种质特性研究》中,许振英先生向全世界宣布,贵州香猪是世界最小的侏儒猪。以后陆续报道了贵...  相似文献   

贵州半细毛羊促生长激素分泌素受体基因SNPs筛查与变异分析     

张琼娣  宋德荣  周大荣  彭华  刘若余  吴蕊汝  江兴美  吴萍 《中国畜牧兽医》2014,41(4):189-193

通过研究促生长激素分泌素受体（growth hormone secretagogue receptor,GHSR）基因多态性,为贵州半细毛羊选种选育提供进一步的分子生物学依据。试验选取36只贵州半细毛羊构建DNA池,设计1对引物扩增其GHSR基因第2外显子及第1、2内含子部分序列并进行双向测序,对SNPs位点等位基因频率进行估算,利用在线生物信息学软件分析SNPs位点对GHSR基因RNA二级结构的影响。结果发现,在贵州半细毛羊GHSR基因中筛选到2个SNPs：T70G和G229A,均为同义突变,SNPs位点导致GHSR基因mRNA二级结构发生变化。GHSR基因多态性可能影响贵州半细毛羊的生长。  相似文献