黔北黑猪BF基因遗传多态性分析     

吴芸  陈玉珍  刘若余 《广东农业科学》2011,38(4):125-127

运用PCR及测序技术对黔北黑猪的BF基因进行了检测,并对该基因核苷酸序列进行分析.结果表明:第16外显子45 bp处发生A→C碱基突变,命名为:BF-exon 16-A45C,产生3种基因型:CC型、AA型、AC型.3种基因型中,AA基因型频率为0.6875,CC基因型频率为0.125,AC基因型频率为0.1875.基...  相似文献   

猪DAZ基因的DNA池测序分析     

李敬瑞  丁远华  向程举  刘若余 《中国畜牧兽医》2011,38(8):60-62

选取大约克猪、白香猪、可乐猪3个猪种的公猪构建品种DNA池。对DAZ基因的部分CDS区和3'UTR进行PCR扩增,并对PCR产物进行测序。结果表明,3个猪种中,DAZ基因的该序列未发现任何突变。同源性分析结果表明,猪与人、猩猩、猴、鼠、牛的DAZ基因该序列核苷酸同源性分别为97.0%、95.2%、96.1%、92.9%、97.0%。说明在哺乳动物中,其DAZ基因CDS部分序列和3'UTR是高度保守的。系统进化分析结果表明,猪和牛在一个进化支上。蛋白疏水性分析表明,在17－20位有个强疏水区。  相似文献   

山羊前列腺素内过氧化物合酶2基因的多态性检测及生物信息学分析     

宋桃伟  罗卫星  蔡惠芬  刘若余  陈志  惠嫣婷 《中国畜牧兽医》2013,40(2):121-125

本试验以贵州省3大地方山羊品种贵州白山羊、贵州黑山羊、黔北麻羊和2个省外地方品种关中奶山羊和内蒙古绒山羊为研究对象,采用DNA池结合PCR直接测序法对山羊前列腺素内过氧化物合酶2(prostaglandin-endoperoxide synthase 2,PTGS2)基因进行单核苷酸多态性检测。结果表明,在5个山羊品种中共检测到6个SNPs位点:A96G、C20T、A239G、T192C、T164A和G91C,其中,A96G和T164A分别位于外显子7和外显子8中,且均为同义突变,其余4个变异位点位于内含子中。生物信息学分析显示,外显子7和8中的2个SNPs位点均导致了mRNA二级结构的改变。  相似文献   

威宁鸡体尺与屠宰性状间的相关性研究     

蒋会梅  张义玲  刘章忠  杨远青  舒畅  李万贵  张依裕  刘若余 《中国畜牧兽医》2015,42(12):3300-3307

试验旨在揭示威宁鸡体尺和屠宰性状的性别差异情况及体尺与屠宰指标间的相关性,参照中国家禽体尺和屠宰性状测定标准对65只(♀:33;♂:32)180日龄公、母威宁鸡的体尺和屠宰性状进行测定和分析。结果发现,威宁鸡体斜长在公、母鸡之间呈现显著差异,公鸡显著高于母鸡(P< 0.05);冠高和胫长公鸡极显著高于母鸡(P< 0.01),体尺和屠宰性状均呈性别差异,较国内其他地方鸡种,威宁鸡表现出了优异的体形外貌特征,体质健壮,肉用性能好,抗逆性强,其中,公鸡较母鸡表现为体形结构大,肉用性能更佳;另外,威宁鸡各体尺性状、多数屠宰性状及多数体尺与屠宰性状间均呈正相关关系,且多数指标间达到了显著或极显著水平(P< 0.05;P< 0.01),这对今后威宁鸡的选育尤其是早期选育具有重要参考意义。  相似文献   

两个贵州山羊品种GHSR和GHRL基因遗传变异及其与生长性状的关联性   总被引：2，自引：1，他引：1  

宋桃伟  蔡惠芬  罗卫星  刘若余  张依裕  孙岩岩  刘彬 《中国农业科学》2015,48(1):140-153

【目的】探讨GHSR和GHRL基因作为山羊体重体尺性状候选基因的可能性,寻找与山羊生长性状相关的分子遗传标记。【方法】以贵州白山羊和贵州黑山羊为研究素材,采用DNA混合池结合PCR产物直接测序及PCR-SSCP技术检测GHSR和GHRL基因的单核苷酸多态性,利用SPSS (18.0)软件GLM统计模型分析基因SNPs不同基因型及合并基因型与贵州山羊生长性状的关联性,同时采用在线软件对GHSR基因进行生物信息学分析。【结果】在GHSR基因外显子2和3′UTR分别检测到G200A同义突变和T628C位点,而在5′UTR区和外显子1则未发现多态性。设计一对特异性引物对G200A位点进行PCR-SSCP分析,表现为3种基因型,依次命名为GG、GA和AA。GG基因型为优势基因型,在贵州白山羊和贵州黑山羊母羊群体中等位基因G为优势等位基因,其等位基因频率分别为0.6731和0.5243。而在贵州黑山羊公羊群体中A则为优势等位基因,其频率为0.5122。多态信息含量均表现为中度多态(0.25＜PIC＜0.50)。在GHRL基因内含子2处发现1个G141A突变,外显子2和外显子4处分别检测到2个同义突变(T78C和C14T),设计一对特异性引物对C14T位点进行SSCP分析,显示为2种基因型CT和CC。在所有试验群体中,CC基因型为优势基因型,其频率分别为0.7692、0.9417和0.9390,等位基因C为优势等位基因,其频率依次为0.8846、0.9709和0.9695,多态信息含量均显示为低度多态(PIC＜0.25)。χ²检验显示所有试验群体G200A和C14T位点基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡(P＞0.05)。关联分析表明,GHSR基因G200A位点与山羊体重、体高、体斜长和管围显著相关 (P＜0.05),纯合子GG基因型优势较为明显,贵州白山羊GG基因型个体的体高显著高于GA基因型个体和管围显著高于AA基因型个体(P＜0.05)。C14T位点贵州黑山羊 (公羊) CC基因型个体的体重、体高和胸围显著高于CT基因型 (P＜0.05)。组合基因型对体高和胸围指标的影响显著(P＜0.05),表现为CCGG合并基因型个体的体高显著高于CCAA合并基因型个体 (P＜0.05)。生物信息学分析揭露,GHSR基因5’UTR处未检测到核心启动子区和CpG岛,仅发现1个CAAT-box和部分潜在的转录因子结合位点,G200A导致mRNA二级结构发生明显变化。GHSR蛋白二级结构以α-螺旋为主 (48.90%),三级结构及跨膜螺旋结构预测表明该蛋白是膜蛋白。【结论】研究初步推测GHSR基因和GHRL基因多态性及合并基因型对山羊生长性状具有较显著的影响,G200A和C14T位点可作为山羊生长性状的有效遗传标记用于指导山羊的分子育种。  相似文献   

威宁绵羊和贵州半细毛羊FecB 基因SNP 分析     

王振  申小云  盘道兴  谢海强  刘若余 《广东农业科学》2016,43(1):130-135

利用威宁绵羊和贵州半细毛羊构建DNA池,设计11对引物扩增其Fec B基因外显子和部分内含子的序列,对纯化后的PCR产物双向测序,分析确定多态性位点。然后利用生物信息学软件分析SNPs位点对Fec B基因RNA二级结构、Fec B蛋白结构的影响。结果显示,在扩增的Fec B基因中筛选到10个SNPs,其中exon5-A39G、exon9-C37A、exon11-C87A、intron2-A62G、intron4-A1023G、intron10-G24A突变为威宁绵羊和贵州半细毛羊中所共有,而exon9-A8G和intron1-G243A突变为威宁绵羊所特有,intron3-G177A和exon8-T86C突变为贵州半细毛羊所特有。上述的SNPs中,exon5-A39G和exon9-A8G为错义突变,exon5-A39G突变导致编码的异亮氨酸(Ile)变为缬氨酸(Val),exon9-A8G突变导致编码的天冬酰胺(Asn)变为天冬氨酸(Asp);exon9-C37A和exon11-C87A多态位点均未改变氨基酸的编码,为同义突变。  相似文献   

贵州白香猪的育种原理与方法     

刘培琼  刘若余  张依裕 《猪业科学》2012,29(7):124-125

贵州白香猪是从贵州剑白香猪(两头乌毛猪)中纯系选育出的新品系,育种原理是:在猪群中根据其毛色分布,用"同质选配的方法"让其后代中白毛基因重组,使白毛、白皮逐渐增多,黑毛、黑皮逐渐减少,至全白毛个体形成。  相似文献   

贵州威宁黄牛线粒体DNA D-loop区全序列分析     

刘若余  杨公社  夏先林  刘培琼  张明忠  雷初朝 《黑龙江畜牧兽医》2005,(10):11-12

为了解贵州威宁黄牛的遗传多样性及遗传背景，测定了19个个体的线粒体DNAD-loop区全序列。威宁黄牛D-loop区全序列中，A＋T平均含量为61．4％，G＋C含量为38．6％。经比对，共检测到威宁黄牛D-loop区8种单倍型，核苷酸多态位点45个，其中7种为普通牛血统的单倍型，1种为瘤牛血统的单倍型，表明威宁黄牛同时受到普通牛和瘤牛的影响。在威宁黄牛19个个体中，其单倍型多样度为0．715，核苷酸歧异度（π值）为2．415％，表明威宁黄牛品种的遗传多样性丰富。  相似文献   

贵州剑河白、黑香猪生长发育测定   总被引：7，自引：1，他引：6  

刘世会  张启林  刘若余 《山地农业生物学报》2004,23(2):104-108

对剑河白香猪、黑香猪零世代、一世代、白香猪与大约克夏猪杂交F1代2～6月龄的生长发育数据进行了测定,在同条件下与从江香猪的生长发育及饲料报酬进行比较.结果表明,白香猪与黑香猪零世代、一世代在体重、体高、体长、胸围等指标上差异不显著(P＞0.05),与从江香猪差异也不显著(P＞0.05).剑河白香猪与大约克夏猪正、反交试验显示,除体重外,体长、体高、胸围指标F1代间无显著差异(P＞0.05),且正、反交F1比纯繁的剑河白香猪的体重、体尺指标均高,差异极显著(P＜0.01).  相似文献   

贵州剑白黑香猪的亲缘的关系     

刘若余  刘部琼 《山地农业生物学报》1998,17(6):337-340

用聚丙烯酰胺凝胶电泳技术,测定贵州剑河白,黑香猪血清转铁蛋白、前白蛋白、后白蛋白的遗传多态性,计算其基因频率。同时,利用其他学者的研究结果与对贵州剑河白,黑香狸与湖南,江西等省的部分地方猪种的遗传距离进行估算,利用类平均聚类法对它们之间的亲缘关系进行研究;并绘制了类平稳聚类图。结果表明,贵州剑白香与黑香猪的遗传距离最近,可以认为是同一品种而两个不同毛色的品系或亚群;贵州省剑河白香与黑香狸与湖南的汀  相似文献