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试验通过对苏姜猪背最长肌和腿肌进行转录组分析,旨在挖掘影响苏姜猪肌肉肉质性状的候选基因。选取90和180日龄苏姜猪各3头,利用RNA-seq技术对90日龄苏姜猪背最长肌、180日龄苏姜猪背最长肌和腿肌进行测序,对差异表达基因进行GO功能和KEGG Pathway显著性富集分析。结果显示,180日龄苏姜猪背最长肌和90日龄苏姜猪背最长肌中有1 655个基因差异表达,其中474个基因表达上调,1 181个基因表达下调,GO功能和KEGG Pathway显著性富集分析发现,474个表达上调基因主要参与肌肉纤维、转录调节、钙信号通路、MAPK信号通路、胰岛素信号通路、FOXO信号通路等生物学功能,1 181个表达下调基因主要参与免疫、造血、溶酶体、绑定、酶活性等生物学功能;180日龄苏姜猪背最长肌和腿肌中有383个基因差异表达,其中70个基因表达上调,313个基因表达下调,GO功能和KEGG Pathway显著性富集分析发现,70个表达上调基因未能显著富集,313个表达下调基因主要参与细胞分化增殖、肌肉发育、细胞外基质、cGMP-PKG信号通路等生物学功能。本试验获得了苏姜猪背最长肌和腿肌组织的转录组信息,筛选出6个与苏姜猪肉质性状相关的候选基因:FOXO1、FOXO3、FOXO4、MYF6、A-FABP和H-FABP,为深入研究苏姜猪肉质性状的分子机理奠定基础。 相似文献
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本实验采用PCR-RFLP技术,检测苏姜猪PRLR和RBP4基因的多态性,并分析了RBP4与PRLR对苏姜猪6月龄体尺和背膘厚的影响。结果表明:RBP4基因中A基因频率为0.850,高于B基因频率(0.150)。PRLR基因中A基因频率为0.510,B基因频率0.490。与体尺和背膘厚的相关性分析结果表明同一性别的不同基因型间的体尺性状差异不显著。母猪RBP4基因的AA型背膘厚显著大于(P<0.05)BB基因型。PRLR基因与性别对体高、体长及胸围之间存在互作效应。应进一步扩大群体分析PRLR和RBP4基因与体尺与背膘厚的相关性,并研究与繁殖性状的相关性,以确定是否可以作为候选基因辅助选择产仔数,并对其他性状有无负效应。 相似文献
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