基于GBS技术的新杨绿壳纯系蛋鸡SNPs检测   总被引：1，自引：0，他引：1  

张彩云  王晓亮  涂盈盈  叶绍辉  姚俊峰  杨长锁 《中国家禽》2018,(13)

研究选取291只新杨绿壳纯系蛋鸡,利用Hi Seq2500测序仪对试验鸡群进行GBS测序,检测群体SNPs。结果获得267.402 Gb有效数据,平均每个样本918.910 Mb,平均测序深度为10.15,平均覆盖度为15.46%,Q30≥85%。经过严格过滤后,最终鉴定421 142个高质量SNPs(MAF≥5%),其中4 682个(1.11%)SNPs位于外显子上,8 727个(2.07%)位于基因上下游1 kb区域内,183 821个(43.65%)SNPs在内含子区域,位于基因间的SNPs有220 779个(52.42%)。将这些高质量SNPs与db SNP库进行比对,发现45 034个新的SNPs,约占总SNPs的10.4%。研究表明,GBS技术适用于新杨绿壳纯系蛋鸡基因组的SNPs开发,成本低,可为后续经济性状的全基因组关联分析和全基因组选择提供更丰富的遗传标记。  相似文献   

家禽育种中的基因组学-已进入巩固阶段     

姚俊峰 《国外畜牧学(猪与禽)》2013,(11):49-51

基因组学随着肉鸡、蛋鸡和火鸡的高密度单核苷酸多态性（Single Nucleotide Polymorphism,SNP）芯片开发和应用的重大进步,在家禽育种中已经取得了显著的进展.此外,在常规遗传评估中用于整合基因组学的大量统计工具对家禽育种者来说也变得越来越多.  相似文献   

我国主要蛋鸭饲养品种及饲养模式     

肖长峰  吕文纬  朱丽慧  杨长锁  姚俊峰  徐海军 《上海畜牧兽医通讯》2020,(3)

我国蛋鸭品种(系)相对较多,以地方特色品种为主,饲养模式参差不齐。本文介绍我国主要蛋鸭品种特性及饲养模式。  相似文献   

禽沙门氏菌病、疫苗和免疫保护机制:现状和前景     

姚俊峰 《国外畜牧学(猪与禽)》2013,33(1):34-38

1 引言 研究者长期以来都在寻找预防肠炎沙门氏菌感染鸡群从而导致禽产品污染的方法.因为在一体化养禽企业中沙门氏菌感染和禽产品污染的来源众多,很难有效地使用一些控制措施.养禽场的沙门氏菌感染防控需从良好的养殖规范和严格的卫生措施等科学管理开始.预防和治疗策略已被广泛应用,以降低鸡场沙门氏菌在鸡体上定植的发生率.多种预防措施应用于预防和控制沙门氏菌在养禽生产中的感染,免疫接种就是其中的一种措施.  相似文献   

引进高产商品蛋鸡FM02敏感基因及其基因型频率分布研究     

马旭东  姚俊峰  涂盈盈  叶绍辉  杨长锁 《中国家禽》2012,(24):18-20,24

FMO3基因俗称鱼腥味基因,该基因突变可能导致鱼腥味综合征。本试验选择7个国外引进的高产商品蛋鸡品种:海兰褐、海兰白、罗曼褐、罗曼粉、海赛克斯、伊莎褐和尼克珊瑚粉,采用PCR-RFLP方法对FMO3基因以及基因型频率进行检测,旨在研究FMO3基因A694T突变在7个国外引进高产商品蛋鸡品种中的分布。试验结果表明,海兰白、罗曼粉和尼克珊瑚粉3个品种个体基因型全部为AA型,不表现鱼腥味综合征;其他4个品种中都存在不利等位基因T,其中海赛克斯、伊莎褐2个品种中TT型频率较高,分别为8.3%和10.5%。根据本试验结果,建议FMO3易感基因型频率高的品种,对其纯系需加大剔除力度。  相似文献   

上海地区蛋鸡养殖场夏秋季全价饲料黄曲霉毒素和呕吐毒素污染情况调查     

姚俊峰  王晓亮  吕文纬  蔡霞  杨长锁 《上海畜牧兽医通讯》2015,(1)

本研究旨在调查夏秋炎热潮湿季节后,上海郊区蛋鸡养殖场饲料中黄曲霉毒素和呕吐毒素污染情况,为鸡场的毒素污染预防和治理提供相关数据。选择上海郊区及周边蛋鸡场鸡舍内可能受污染的区域采集具有代表性的10批饲料样品,使用美国Affinitech公司酶联免疫试剂盒对样品毒素含量进行检测。结果表明,被检的全价饲料中黄曲霉毒素和呕吐毒素的检出率都为100%,其中黄曲霉毒素检出率虽然很高,但是都没有超标,检测样品的黄曲霉毒素平均值为4.03!g/kg,属于轻度污染;呕吐毒素的超标率为80%,其中呕吐毒素含量在1.0~5.0mg/kg,属于中度污染的样品数为8个,是污染上限的2~4倍。2种毒素都没有检出重度污染。结果提示,酶联免疫法(ELISA)操作简单和便捷,有利于在广大饲料生产企业和蛋鸡养殖企业中推广使用。广大饲料生产企业和蛋鸡养殖企业也要做好原料质量控制并在饲料中使用有效的霉菌毒素吸附剂,同时建立相应常规采样检测制度,以预防和防治霉菌毒素的污染。  相似文献   

红外断喙对蛋鸡产蛋期生产与蛋品质性状的影响     

王晓亮  王敏  涂盈盈  朱根生  吕文纬  黄红梅  姚俊峰  杨长锁 《上海农业学报》2018,(1)

选择国内饲养量最大的海兰褐壳商品蛋鸡为试验材料,采用Nova-Tech红外断喙器不同断喙模块和强度对鸡只进行1日龄断喙处理,同时以不断喙和传统7日龄热刀断喙为对照组,定期收集产蛋期蛋鸡不同组别鸡只生长和生产性状数据进行统计分析。本研究再次验证了正确恰当的断喙尤其是红外断喙方式对鸡只产蛋期性能有提高作用,尤其是红外浅断喙组(IB2)的鸡群在产蛋率、死淘率以及淘汰前的羽毛覆盖程度上表现更为优秀。在密闭式鸡舍中,红外浅断喙模式是海兰褐蛋鸡更加适用的断喙模式。  相似文献   

纯系肉鸽28日龄体重遗传力和近交系数分析     

王晓亮  侯浩宾  包敖敦格日乐  吕文纬  姚俊峰  赵维民  杨长锁 《上海农业学报》2022,(1):82-84

为评估'天山雪'肉鸽纯系经过多世代选育后的群体近交情况,并分析28日龄肉鸽体重遗传力,收集了连续4个世代942只肉鸽个体的系谱资料,以及第4世代231个个体的28日龄体重数据,采用ASReml软件动物模型估计了肉鸽28日龄体重的遗传力,并计算了各世代的群体平均近交系数.结果表明:'天山雪'肉鸽纯系28日龄平均体重为(6...  相似文献   

中国11个地方鸡种中鱼腥味敏感基因FM03基因型频率分布研究     

王晓亮  徐桂云  郑江霞  姚俊峰  曲鲁江  杨宁 《畜牧兽医学报》2010,41(11)

本试验旨在研究影响鸡蛋鱼腥味的FMO3基因 T329S突变在11个中国地方鸡种中的分布.所选的11个地方鸡种包括:北京油鸡、河北柴鸩、固始鸡、溧阳鸡、如皋鸡,太湖鸡、淮南麻黄鸡、丝羽乌骨鸡、东乡绿壳蛋鸡、文昌鸡、藏鸡,采用PRC-RFLP方法对FM03基因及基因型频率进行检测.试验结果表明东乡绿壳蛋鸡全部表现为TT基因型,不表现鱼腥味综合症,具有较好的蛋品质;而其他10个地方鸡种中均有SS基因型的鱼腥味综合症易感个体,其中北京油鸡SS基因型频率最高,为8.8%,藏鸡的SS基因型频率最低,为0.7%.地方鸡种中鱼腥味综合症易感基因型频率都不高,可以通过PCR-RFLP的方法予以剔除.  相似文献   

让肉鸡的遗传潜力满足市场的需求     

姚俊峰  何闪  Yves Jego  Paulvan Boekholt 《国外畜牧学(猪与禽)》2014,(8):4-5

世界人口正在迅速增长,因此哈伯德育种公司的目标就是通过培育具有最高生产效率的肉鸡种来满足全球人类消费的需求,同时以可持续发展的方式进行生产。  相似文献