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通过PCR-SSCP法对中国荷斯坦牛BoLA-DRB3基因的外显子2进行多态性分析.在223个个体中共获得10种等位基因,其中D等位基因频率最高为0.228 7,A等位基因频率最低为0.013 5;等位基因型18种,其中FG基因型频率最高,为0.125 6,其次为HH,基因型频率为0.112 1;ML基因型频率最低,为0.004 5.另外分析发现,在不同家系中,DRB3基因外显子2等位基因具有特异性,等位基因的类型和频率存在比较明显的差异.差异显著性分析表明,D等位基因对305 d产奶量和305 d乳蛋白量有明显的负效应,ME基因型个体305 d乳脂量显著低于其他个体.结果表明中国荷斯坦牛的BoLA-DRB3外显子2具有丰富的多态性,并具有家系分布的特异性. 相似文献
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奶业发展水平是衡量一个囝家畜牧业乃至整个农业发展水平的重要标志。奶、№持续健康发展,对于改善城乡居民膳食结构、提高全民身体素质、促进农村产业结构调整、增加农民收入、带动国民经济相关产业发展,都具有十分重要的意义。遗传育种技术是影响奶牛业牛产效率的主要因素,其贡献率达到40%。因此,不断提高奶牛群体的遗传水平,才能从根本上提高经济性状的生产性能。 相似文献
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中国荷斯坦牛OPN基因对产奶性状的遗传效应分析 总被引:2,自引:0,他引:2
该试验以北京地区7个公牛家系共计1196头中国荷斯坦母牛为研究对象,利用荧光标记引物和AB13730测序仪对OPN基因启动子上游1240bp处的T碱基插入,缺失突变(OPN3907)进行了基因型检测,共发现T9T9、T9T10和T10T10三种基因型,频率分别为0.0535、0.1957和0.7508:通过SAS软件(8.02)对3个产奶性状与OPN基因的关联程度进行了统计分析.结果表明,OPN基因不同基因型间的305d产奶量和乳蛋白量差异显著(P<0.05),乳脂量差异不显著(P>0.05);多重比较结果显示:T9T9和T9T10基因型的305d产奶量和乳蛋白量显著高于T10T10(P<0.05). 相似文献
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天山马鹿清原品系血液蛋白多态性及其与产茸量关系的研究 总被引:7,自引:3,他引:4
本试验对天山马鹿清原品系 1 0种血液蛋白位点分布进行了遗传检测 ,结果表明 :Hb、Tf、Alb、AKP、Ptf1 、Pa1 、α -gl、β1 -gl、β2 -gl和γ - gl分别受 1个基因位点上的 3,2 ,1 ,3,5 ,2 ,2 ,4,3和 1个等位基因控制 ;群体的遗传变异性结果表明 ,该品系群体的均质度较高 ,选育已达到比较纯化的程度 ;多重比较结果表明 :Tf和Hb型与产茸量之间存在着一定的关系 ,可作为产茸量的遗传标记 ,TfAA、TfCC和HbAB型的产茸量显著或极显著地高于其它基因型(P <0 0 1 ,P <0 0 5 ,P <0 0 1 ) ,为优势基因型 相似文献
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前期研究通过荷斯坦公牛全基因组重测序鉴定到17个奶牛产奶性状候选功能基因,其中,肽基脯氨酸顺反异构酶基因(PIN1)参与甘油三酯代谢、甘油磷脂代谢以及mTOR信号通路,且位于产奶量和乳蛋白量性状QTL区间。为进一步系统分析PIN1基因是否对奶牛产奶性状具有遗传效应,本实验基于40头公牛的基因组DNA混池,采用PCR产物直接测序法对PIN1基因的全部编码区以及上下游调控区2000 bp进行扫描,在内含子2检测到1个SNP位点7:g.14432394G>A,A、G等位基因频率分别为0.4797和0.5203。采用靶向测序基因型技术对北京地区987头中国荷斯坦母牛进行个体基因型检测,对SNP位点7:g.14432394G>A与5个产奶性状进行关联分析。结果表明:在第1泌乳期,SNP 7:g.14432394G>A与产奶量、乳脂量、乳蛋白量和乳蛋白率呈显著或极显著关联(P=0.0001~0.0493);在第2泌乳期,SNP与产奶量、乳脂量、乳脂率和乳蛋白量呈显著或极显著关联(P=0.0001~0.0104);SNP位点7:g.14432394G>A对产奶量、乳脂量、乳蛋白量和乳蛋白率的加性效应或等位基因替代效应均达到显著或极显著。综上,PIN1基因对中国荷斯坦牛的产奶量和乳蛋白、乳脂性状具有显著遗传效应,可作为遗传标记用于基因组选择,以加快遗传进展。 相似文献
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采用不连续垂直板聚丙烯酰胺凝胶电泳检测了58个地方猪种和5个外来猪种的10个血液蛋白座位,并计算了遗传杂台度(h)、F-统计量.用probabilitytest进行Hardy Weinberg平衡符合度的检验,以及用Nei氏标准遗传距离Ds、Nei氏遗传距离Da、UPGMA和NJ分析了猪群间的遗传关系。结果表明.Alb为单态,Pa-2、Pa-1、Po-1、Po-2、Cp,Am、Akp和Hpx9个血液蛋白座位分别受2,2.2、5、5、5、4和7个等位基因所调控;41个猪种的平均遗传杂合疫范围为0.250~0.447;一些座位在某些种群中处于不平衡状态(P〈0.05)或极不平衡状态(P〈0.01);中国地方猪种间的遗传距离差异较大(0.011≤DS≤0.616;0.014≤DA≤0.545);聚类结果将58个地方猪种分为5类。 相似文献
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基于全基因组信息鉴定中国荷斯坦牛产奶性状基因及功能注释 总被引:1,自引:1,他引:0
前期研究基于中国荷斯坦牛女儿设计资源群体,采用Illumina公司Bovine50K微珠芯片对产奶性状进行了全基因组关联分析(GWAS),利用传递不平衡(L1-TDT)和回归分析(MMRA)2种统计分析方法共同检测到35个显著SNPs位点。本研究旨在基于该GWAS结果进一步对产奶性状基因进行鉴定及功能注释。基于牛基因组序列草图(Btau4.2),采用生物信息学和比较基因组学方法进行显著SNPs位置候选基因筛查和功能预测。分析发现,12个SNPs位点位于基因内部,23个位于基因侧翼,最终鉴定到28个位置候选基因,并确定了其物理位置、基因类型及潜在功能。基因功能可归纳为6种类型:调节机体营养成分代谢和平衡、细胞骨架或基质成分、调节细胞增殖和周期及凋亡、参与细胞信号转导和盐离子通道构成、具有激酶活性、参与mRNA转录调控或翻译调控。该研究为进一步鉴定中国荷斯坦牛产奶性状主效基因及功能验证打下了基础。 相似文献
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荷斯坦奶牛STAT5A基因的SNPs检测及其与产奶性状的关联分析 总被引:4,自引:0,他引:4
根据GenBank公布的牛STAT5A基因的2个SNPs(AJ237937和AF079568)的引物序列,采用PCR-SS-CP方法对758头中国荷斯坦奶牛进行了STAT5A基因多态性检测,并将其与5个产奶性状进行了关联分析。在SNP1的9501碱基处发现A→G突变;SNP2中发现2个连锁点突变,即12 440位T→C和12 550位的CCT插入/缺失;方差分析结果表明:SNP1对乳蛋白率有显著影响(P〈0.05);SNP2对产奶量有极显著影响(P〈0.01),对乳脂量、乳蛋白量有显著影响(P〈0.05);单倍型组合对产奶量和乳蛋白量有极显著影响(P〈0.01),对乳脂量有显著影响(P〈0.05)。多重比较分析表明SNP2的AB基因型的产奶量、乳脂量和乳蛋白量的最小二乘均数极显著(P〈0.01)或显著(P〈0.05)高于基因型AA;而单倍型组合H1H2的产奶量、乳脂量和乳蛋白量的最小二乘均数显著(P〈0.05)或极显著(P〈0.01)高于其它4种单倍型组合;H3H4对产奶量和乳蛋白量的效应极显著高于其它4种单倍型组合(P〈0.01)。结果提示:STAT5A基因可以作为奶牛产奶性状的候选分子遗传标记。 相似文献