鸡miR-10b-5p生物信息学及组织表达分析     

黄正洋  赵振华  黄华云  李春苗  王钱保  穆春宇  黎寿丰 《中国畜牧兽医》2022,49(4):1262-1270

【目的】 通过对苏禽3号肉鸡的miR-10b-5p进行靶基因预测、生物信息学分析及其在鸡不同生长时期组织表达变化规律研究,探索其在鸡肌肉生长发育中作用。【方法】 通过文献和miRBase检索脊椎动物的miR-10b-5p序列,利用Ensembl数据库查询并确定miR-10b-5p在基因组中的位置,根据前体序列构建系统进化树;使用miRDB、microT和TargetScan网站预测miR-10b-5p靶基因,并对靶基因进行GO功能和KEGG通路分析,进而揭示miR-10b-5p的基因功能。采用实时荧光定量PCR技术检测不同生长时期鸡miR-10b-5p组织表达量,探索其在大脑、小脑、垂体、下丘脑、胸肌、腿肌、卵巢、心脏、肝脏、脾脏、肺脏和肾脏组织中表达变化。【结果】 miRBase检索共获得59种动物59条miR-10b-5p序列,即每一种动物都只有一种miR-10b-5p形式。基因定位分析发现,鸡miR-10b-5p位于2号染色体上的HOX基因家族中。常见物种miR-10b-5p成熟序列比对分析结果表明,miR-10b-5p的成熟序列相似性较高,物种间较为保守。系统进化树分析发现,miR-10b在哺乳类中的灵长目、啮齿目、鸟类、鱼类中各自先聚为一支,然后再共同聚为一类,这表明miR-10b在进化过程中是保守的。靶基因预测发现,miR-10b-5p共有300个靶基因。GO功能分析发现,靶基因主要富集到染色质组装和基因表达的转录后调控、组蛋白甲基转移酶复合物、转录因子复合物等功能。KEGG通路分析表明,靶基因主要富集到Wnt和p53信号通路上。组织表达分析显示,miR-10b-5p在检测的各个组织中均有表达;3日龄时大脑、小脑、垂体、胸肌和腿肌中miR-10b-5p表达量显著高于心脏、下丘脑、肾脏和肺脏等组织(P<0.05);90日龄时,垂体、胸肌、腿肌和大脑中miR-10b-5p表达量显著高于其他组织(P<0.05)。与3日龄雏鸡相比,90日龄时垂体、胸肌和腿肌中miR-10b-5p表达量均显著上升(P<0.05)。【结论】 鸡miR-10b-5p是组织广泛表达的miRNA,miR-10b在进化过程中是保守的,其可能通过Wnt及p53信号通路调控肌肉细胞增殖分化,进而调控鸡肌肉生长发育。  相似文献   

鸡舍环境参数控制与福利养殖研究进展     

赵东伟  王钱保  张子晓  黄华云  李春苗  黄正洋  赵振华 《中国家禽》2023,(3):99-105

鸡舍环境是影响家禽健康和产品质量的重要因素之一，改善其生活环境不仅关乎家禽福利，而且更能提升家禽养殖水平和生产性能。鸡舍环境作为复杂且多维度的范畴，涵盖了温度、湿度、空气流通等多种因素，这些交互叠加的参数指标对鸡群福利养殖的综合评价起着重要的影响。目前我国家禽福利的评估标准尚未统一，福利养殖与环境参数有机结合的评价体系有待进一步研究。文章通过对国内外相关文献的搜集，集中阐述了家禽舍内环境参数控制及其福利养殖的研究进展和现状，以期为鸡舍环境参数精准设定与现代化福利养殖的有效评价提供理论依据，从而深度优化、改善养殖环境，全面推动家禽养殖快速健康发展。  相似文献