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【目的】比较苏姜猪背膘组织生长发育过程中基因表达谱的差异,挖掘影响背膘组织生长发育的关键基因。【方法】选择1、3、6和8月龄(M1、M3、M6、M8)4个生长时期苏姜猪背膘组织进行高通量转录组测序,组成3个比对组(M1 vs M3、M3 vs M6、M6 vs M8)进行差异表达基因(differentially expressed genes, DEGs)的筛选,并进行功能富集和表达趋势分析。【结果】转录组测序显示,M1 vs M3、M3 vs M6、M6 vs M8组分别筛选到1 869、296、1 257个DEGs。功能富集显示,Wnt信号通路、细胞外基质-受体相互作用等信号通路在M1 vs M3组表现活跃,PI3K-Akt信号通路、AMPK信号通路、丁酸代谢、柠檬酸循环等信号通路在M6 vs M8组表现活跃。基因表达趋势分析显示,富含半胱氨酸的酸性分泌蛋白(secreted protein, acid and rich in cysteine, SPARC)、组织蛋白酶S(recombinant cathepsin S,CTSS)、Kruppel样因子7(Kruppel-lik... 相似文献
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中国荷斯坦牛泌乳曲线拟合研究 总被引:5,自引:1,他引:4
为了解南方大型奶牛场中国荷斯坦牛泌乳曲线及其影响因素,利用5种泌乳曲线模型(Wood模型、Nelder 逆多项式模型、WIL模型、混合对数模型和Ali-Schaeffer模型)和4种时间间隔方式(天、周、旬和泌乳月),对海丰奶牛场2009-2010年度980头第1~5胎具有完整泌乳期的中国荷斯坦牛296 895次日产奶量记录进行泌乳曲线拟合,并进一步分析不同模型、时间间隔和胎次3个因素对泌乳曲线拟合度及其参数的影响.结果表明,5种模型泌乳曲线拟合度变化范围为0.839 7~0.954 1,不同模型和胎次极显著影响泌乳曲线拟合度(P<0.01),时间间隔对泌乳曲线拟合度无显著影响(P>0.05).Ali-Schaeffer模型拟合度最高,Nelder逆多项式模型拟合度最低;不论哪种泌乳曲线模型,第一胎拟合度均显著高于第三胎.不同模型、时间间隔和胎次均极显著影响参数a值(P<0.01),模型极显著影响参数b值(P<0.01),时间间隔显著影响参数b值(P<0.05).模型和胎次均极显著影响高峰产奶量和产奶高峰日(P<0.01).综合各方面情况,确定Ali-Schaeffer模型为适合于海丰奶牛场奶牛的最佳泌乳曲线模型. 相似文献
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基于川麦冬活性成分高和重金属含量低的有机无机肥最佳配施方案 总被引:1,自引:1,他引:0
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利用微卫星标记分析滩羊群体的遗传多样性及遗传分化 总被引:1,自引:0,他引:1
利用10对微卫星标记对小尾寒羊、宁夏牧区园区白滩羊、保种场滩羊和黑滩羊的遗传多样性和遗传分化进行分析,根据DC和DA遗传距离构建系统树。结果表明:10个微卫星座位中共检测到167个等位基因,每个座位在每个群体均检测到5个以上的等位基因。座位和群体期望杂合度均在0.8左右;座位平均多态信息含量为0.722 3~0.838 5;园区白滩羊平均多态信息含量为0.794 6,保种场白滩羊平均多态信息含量为0.778 4,黑滩羊平均多态信息含量为0.772 3,群体平均多态信息含量为0.772 3~0.794 6。群体间表型分化系数为0.089 3,总群体近交系数为0.674 0,群体内近交系数为0.642 0。运用DC和DA遗传距离,分别采用UPGMA和NJ法构建的系统聚类图基本一致。综合遗传分化系数、遗传距离及聚类图,结果提示,滩羊与小尾寒羊群体间遗传分化程度最大,黑滩羊与白滩羊群体间存在一定的遗传分化,2个白滩羊群体间遗传分化程度相对最小。 相似文献
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利用多因子降维法研究CXCR1和IL-8基因交互作用与中国荷斯坦牛乳房炎的关系 总被引:1,自引:0,他引:1
[目的]运用多因子降维法(MDR)分析中国荷斯坦牛CXCR1和IL-8两个基因多态性与乳房炎易感性的交互作用,并评价MDR模型的具体应用.[方法]以上海光明乳业集团金山种奶牛场634头(其中有228头患乳房炎)中国荷斯坦牛为试验材料,采用PCR-SSCP和直接测序法分析CXCRl基因-5'端和编码区及IL-8基因编码区共7个SNP位点的遗传多态性,并用MDR法和Logistic回归分析CXCR1和IL-8基因各位点突变及其基因型组合对奶牛乳房炎易感性的影响.[结果]CXCR1基因5'端-1 830、-1 768、-344和编码区783共4处发生突变,IL-8基因的2 789(A/G)位点与2 862(T/C)位点发生连锁突变,并导致两位点分别发生Ser→Gly和Cys→Arg的突变.单因素Logistic回归分析结果表明,CXCR1基因和IL-8基因5个SNP位点变异对该牛场奶牛乳房炎易感性均没有达到显著水平,但MDR分析发现CXCR1-(-1 768)-IL-8两位点、CXCR1-(-1 768)-(783)-IL-8三位点及CXCR1-(-1 768)-(-344)-(783)-IL-8四位点交互作用均达到显著水平,且交叉验证一致性均为最大(10/10).CXCR1-(-1 768)-(78 3)-IL-8三位点互作模型和CXCR1-(-1 768)-IL-8两位点互作模型检验样本准确度较高(分别为0.5457和0.5485),但4个位点联合效应分级图表明CXCR1-(-1 768)-IL-8两易感基因型为强正交互作用,同时将CXCR1-(-1 768)-(78 3)-IL-8三位点互作效应和CXCR1-(-1 768)-IL-8两位点互作效应引入Logistic回归分析表明,CXCR1-(-1 768)-IL-8两位点互作效应对该牛场奶牛乳房炎易感性达到显著水平.[结论]CXCR1-(-1 768)-IL-8两位点交互模型作为奶牛乳房炎易感性相关的基因联合选择模型最佳,MDR和Logistic回归均可用于奶牛乳房炎易感性多基因分析模型,MDR发现交互作用的能力比Logistic回归强,但两者有着各自的适用条件和优点.遇到有交互作用分析要求时,二者的联合应用效果更佳. 相似文献
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[目的]植物-土壤碳(C)、氮(N)、磷(P)含量及生态化学计量关系反映其土壤养分利用效率及林下光环境对植物的养分限制状况.针对17年生马尾松Pinus massoniana人工林林下4种灌木叶片与土壤全碳(TC)、全氮(TN)、全磷(TP)养分含量及生态化学计量特征进行研究,探索马尾松林下灌木养分状况,为马尾松林下复... 相似文献
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锌硼钼配施对川白芷药材农艺性状与产量的影响 总被引:1,自引:0,他引:1
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生猪养殖属于畜牧产业核心,与民生基础生活保障密切相关。随着市场需求的变革与发展,生猪规模化养殖已经成为常态,因此需要重点研究生猪养殖技术,以此提升规模化猪场安全性和经济性。据此,本文对规模化生猪养殖技术要点进行探讨。 相似文献