利用RNA-Seq技术筛选不同海拔地区山羊转录组SNP     

姚娜  张文广  张兵  赵倩君  左清清  董坤哲  冯爱琴  马月辉 《中国草食动物》2012,(Z1)

动物和人类的高海拔环境适应性机制和作用途径一直是生物学、医学和疾病学等领域研究者热衷探讨的课题之一,而从转录组水平对于西藏绒山羊的高海拔环境适应性研究仍未开展.以处于不同海拔地区的西藏班戈绒山羊和辽宁绒山羊为研究对象,利用RNA-Seq(RNA sequencing)技术,对其转录组进行测序,共筛选出153654个班戈绒山羊品种内SNP位点,154815个辽宁绒山羊品种内SNP位点,以及5391个两品种间SNP位点,为从转录组水平对西藏班戈绒山羊高海拔环境适应性研究提供基础数据.  相似文献   

绒山羊细菌人工染色体BAC文库构建条件的优化   总被引：1，自引：1，他引：0  

刘志红  李宁  任立明  胡晓湘  郭英  崔文涛  尹俊  张文广  李金泉 《中国畜牧兽医》2009,36(10):55-58

近年来,细菌人工染色体BAC文库成为应用最广泛的基因组文库之一,它以其容量大、遗传特性稳定、嵌合体少、插入片段易回收、操作简便等不可比拟的优点而被广泛应用于基因组较大的真核生物基因组研究之中。作者就细菌人工染色体BAC文库的构建条件进行了研究,用HindⅢ部分酶切绒山羊基因组,脉冲场凝胶电泳分离大片段DNA,以电洗脱法回收DNA后,与BAC载体连接,将连接产物点透析后,电转化DH10B感受态细胞,最后对转化的片段小提质粒进行NotⅠ酶切,脉冲电泳鉴定其大小。结果表明,本试验采用的方法既可获得较大的插入片段又可获得较高的转化效率,是较好的用于构建大基因组文库的方法。  相似文献   

第七届世界美利奴羊大会介绍     

马宁  张文广 《中国草食动物》2007,27(4):64-65

2006年7月12-14日在西澳大利亚首府柏斯举行了由世界美利奴羊育种者联盟组织的第七届世界美利奴羊大会(7th World Merino Conference),文章介绍了会议期间澳大利亚美利奴创新节展示和大会交流的基本信息。  相似文献   

开发文献资源 为农业科研和生产服务     

张文广  安国民 《农业图书情报学刊》1991,(6):34-36

藏书是图书馆开展活动的基础,也是图书馆存在和发展的物质保证。藏书质量的高低是衡量一个图书馆存在价值和工作成就的重要标志之一,而馆藏文献资源的开发利用,又是影响图书馆工作质量的主要因素。吉林省农科院图书馆自1957年建立以来,经过多年的系统收集,现已形成了一定的馆藏特色。70年代以来,较多地收藏了联合国粮农组织(FAO)、国际水稻中心(IRRI)出版的书刊和反映世界农业科学进展的国际会议录及国内外重要的农业著作。同时还非常重视国内  相似文献   

无尾鸡骨骼发育关键信号通路研究进展     

齐旺梅  徐斯日古楞  哈登楚日亚  刘斌  胡斯乐  孙燕勇  张文广 《中国畜牧兽医》2021,48(6):2011-2019

骨骼系统对机体的生命活动至关重要，它为生物体提供了造血微环境、机械支撑、保护脏器等功能，同时也是钙和其他矿物质等的储存库。家鸡尾骨的表型多样性是研究骨骼系统发育及形成机制的良好资源。Notch、Wnt信号通路的靶基因及其相互作用可以形成周期性表达的特点，是调节体节形成及尾部骨骼终止延伸的分子通路。为了解无尾鸡骨骼发育终止的分子机制，作者分别总结了骨骼发育、无尾鸡骨骼研究进展，并重点讨论影响无尾性状的关键信号通路Notch、Wnt及其在无尾鸡研究中的进展。但是，受体和配体之间相互作用的精确调节以及信号通路中的核心元素仍不清楚，需要通过更多的功能基因组和蛋白质组等方法进行深入研究。  相似文献   

如何提高棉花制种的质量与产量     

张文广 《种子科技》2005,23(3):164-165

提高棉花单产的首要条件是具有优良性状的棉花良种,棉花种子质量直接影响到了棉花生产.棉花是双子叶作物,顶土能力差,一播保全苗是棉花增产的关键.因此,棉花的播种质量与产量表现又有着密切的关系.现将如何提高棉花繁种质量与产量技术介绍如下.  相似文献   

基于鸽胸肌转录组挖掘其卓越飞行性能的分子标记     

刘娜娜  白雪  孙燕勇  特日格勒  付绍印  段仕  刘永斌  张文广 《畜牧与饲料科学》2020,41(4):28-31

目的对赛鸽和观赏鸽胸肌组织的转录组进行比较分析,探讨鸽胸肌中与飞行性能相关的关键基因。方法通过差异分析获取赛鸽和观赏鸽胸肌中显著上调和下调的差异基因并进行富集分析。结果数据经质量控制共获得18.3 G的有效数据,筛选出477个差异表达基因,包含194个上调基因和130个下调基因。KEGG pathway显著性富集分析共筛选出3个与鸽飞行性能相关的候选基因,分别为MUSTN1、PDK4和MSTN。结论通过比较赛鸽和观赏鸽胸肌转录组数据,筛选与鸽飞行性能相关的关键基因,丰富了鸽的基因组信息,为进一步揭示鸽胸肌分子机理奠定了基础。  相似文献   

肌肉生长发育可变剪接研究进展     

孙燕勇  付绍印  何小龙  王标  刘永斌  张文广 《中国农业大学学报》2021,26(3):96-104

为了解动物肌肉生长发育可变剪接调控过程最新研究,本文对近年来人、小鼠和其他多种动物肌肉生长发育的可变剪接调控的相关研究进行了整理与分析,总结了肌肉生长发育可变剪接的发生、调控蛋白多样性的分子机制、人和动物的肌肉发育过程中可变剪接的调控研究进展及可变剪接的数据量化方法。结果表明:肌肉是表现出最高水平的组织特异性和保守可变剪接的组织之一;可变剪接的发生与胎儿发育进程并不统一,而是集中于出生后的前两周;牛的肌肉内含子保留类型最多,其次为跳跃外显子类型;猪与鸡肌肉发育中可变3’剪接是最常见的剪接类型;可变剪接的分析方法随着测序技术的发展,由通量低(qRT-PCR和ESTs)、噪音高(ESTs和芯片)的分析方法逐渐发展为以太平洋生物科学(PacBio)和牛津纳米孔技术(Nanopore)为代表的第三代测序方法(IsoSeq),成功识别了许多具有良好特征的转录本和可变剪接。综上,随着测序方法和分析软件的开发与更新,对动物肌肉发育可变剪接研究的逐渐深入,将为揭示肌肉的发育机制奠定基础。  相似文献   

谈以销定产与以产促销     

张文广  刘哲 《种子科技》1994,(2)

谈以销定产与以产促销河北省高碑店市种子公司张文广，刘哲良种的供应坚持以销定产的原则，现在已被种子系统所公认，但实行以产促销，目前在认识上还不完全一致。现就这个问题谈点粗浅的看法。几年来，我们在安排种子生产时始终坚持以销定产的原则来规范自己的业务活动。...  相似文献   

绵羊睾丸差异基因及蛋白质互作网络关系研究     

刘在霞  段仕  孙燕勇  吕琦  付绍印  何小龙  张文广  刘永斌 《中国畜牧兽医》2022,49(1):1-11

[目的] 整合分析多个绵羊睾丸转录组数据集,揭示绵羊睾丸差异基因及蛋白质互作网络关系,以期探索影响绵羊精子生成的关键基因,为绵羊的繁殖提供理论参考。[方法] 对74个绵羊睾丸转录组进行生物信息学分析,通过limma软件包进行差异基因分析,使用WGCNA构建加权绵羊睾丸差异基因共表达网络,并通过MCODE计算网络中重要基因;利用Metascape进行功能富集分析,利用Cytoscape插件AutoAnnotate识别基因集簇。[结果] 最终筛选到11 884个基因,构建237 366对蛋白质互作关系;对2 058个差异基因构建蛋白质互作网络,产生46 169对蛋白质互作关系,确定了4个得分最高的基因集合。对2 058个差异基因构建加权共表达网络,共获得7个模块,其中Blue模块内有929个基因,功能富集分析发现显著富集于雄性配子产生、繁殖、精子发生、鞭毛运动和AMPK信号通路等,且富集结果高度连接并聚成一个完整的网络,最终确定了25个参与精子发生和精子细胞发育过程的关键基因。[结论] 本研究揭示了绵羊睾丸表达基因的蛋白质互作网络和多维差异基因的蛋白质互作网络,最终找到与睾丸精子发生相关且有互作关系的25个基因,为绵羊繁殖研究提供理论依据。  相似文献