藜草花叶病毒外壳蛋白基因的克隆与RT-PCR检测     

陈青  李桂芬  董菁  陈红运  廖富荣  陈洪俊  朱水芳 《植物病理学报》2010,40(4):438-441

 The nucleotide sequence of coat protein (cp)gene of Sowbane mosaic virus (SoMV)was determined. The cp gene of SoMV consists of 726 nucleotides and encodes a putative protein of 241 amino acid re-sidues. Sequence comparison showed that SoMV was most closely related to Rubus chlorotic mottle virus compared to other sobemoviruses. A primer pair was designed for the detection of SoMV based upon the determined cp nucleotide sequence. An expected fragment with 510 bp could be obtained from SoMV, while no specific band was observed from the healthy control. The result showed that the RT-PCR assay with the primer pair was suitable for the specific detection of SoMV.  相似文献   

玉米褪绿斑驳病毒入侵损失指标体系及直接经济损失评估   总被引：3，自引：0，他引：3  

饶玉燕  尤扬  朱水芳  严进  黄冠胜  魏国荣 《植物检疫》2010,24(2)

玉米褪绿斑驳病毒(Maize chlorotic mottle virus)是我国进境检疫性病毒,严重危害玉米的生长,给玉米生产带来巨大经济损失。文中根据科学性、系统优化、通用可比及实用性原则,结合玉米褪绿斑驳病毒特点,系统构建了玉米褪绿斑驳病毒损失评判指标体系,共1个一级指标、3个二级指标、11个三级指标。并对其在我国可能造成的直接经济损失作出初步评估,经估算,玉米褪绿斑驳病毒对我国造成的潜在直接经济损失达140.95亿人民币。  相似文献   

利用多重PCR技术快速检测4种水稻病原细菌     

莫瑾  王哲  周慧平  朱宏建  朱水芳  廖晓兰 《植物保护》2021,47(3):160-164

对水稻中多种病原细菌的检测,使用常规方法往往耗时耗力,而多重PCR可以更加高效地进行多种细菌的检测。根据水稻细菌性谷枯病菌gyrB基因,水稻细菌性叶鞘褐腐病菌PfsI/R quorum sensing 位点以及水稻细菌性条斑病菌和水稻白叶枯病菌含铁细胞接受因子基因设计引物,建立4种水稻病菌的多重PCR检测方法,对方法进行特异性和灵敏度测试,并对采自不同地区的水稻样本进行检测。结果显示,多重PCR方法能同步地快速检测出水稻细菌性谷枯病菌、水稻细菌性叶鞘褐腐病菌、水稻细菌性条斑病菌或水稻白叶枯病菌,检测灵敏度达到103 cfu/mL的菌液浓度,利用该方法对我国不同地区的58份水稻种子进行检测,其中17个样本检测出水稻细菌性条斑病菌或水稻白叶枯病菌,未检测到水稻细菌性谷枯病菌和水稻细菌性叶鞘褐腐病菌。  相似文献   

应用分子生物学方法检测红火蚁   总被引：1，自引：0，他引：1  

陈岩  黄英  朱水芳 《植物检疫》2009,23(6)

根据Simon(1994)发表的Cyt b基因的通用引物,扩增了红火蚁、黑火蚁及其杂交种不同地理种群的Cyt b基因片段.所测样品在Cyt b基因上存在两个不同单倍型.经序列比对后,根据核苷酸位点多态性,设计了检测红火蚁的特异引物.PCR实验结果表明:引物成功检测出所有红火蚁样品,而黑火蚁样品未被检出,该方法对不同虫态的红火蚁分子检测均有效.  相似文献   

蚕豆染色病毒CPS基因的序列测定及RT-PCR检测方法的建立     

陈红运  陈青  黄峰  赵文军  廖富荣  陈洪俊  朱水芳 《植物病理学报》2009,39(6):646-649

 The nucleotide sequence of small coat protein (CPS) gene of Broad bean stain virus (BBSV) was determined and compared with other comoviruses. The CPS gene of BBSV consisted of 687 nucleotides and encodes a putative protein of 228 amino acid residues. The CPS sequence of BBSV and those of other comoviruses shared identities of 36.5%-58.9% and 35.2%-70.3% at the nucleotide and amino acid levels, respectively. The RT-PCR method specific for BBSV detection was developed based on the determined CPS sequence. The RT-PCR assay presented here allows, for the first time, rapid and specific detection of BBSV.  相似文献   

我国几种植物植原体的快速分子鉴别与鉴定的研究   总被引：6，自引：3，他引：3  

李永  田国忠  朴春根  朱水芳 《植物病理学报》2005,35(4):293-299

 选用桑萎缩病(Mulberry dwarf,MD)、枣疯病(Jujube witches'-broom,JWB)、酸枣丛枝病(Wild jujube witches'-broom,WJWB)、泡桐丛枝病(Paulownia witches'-broom,PaWB)和苦楝丛枝病(Chinaberry tree witches'-broom,CWB)5种不同植物植原体和来源于3个不同地区PaWB和JWB材料进行16S rDNA和23S rDNA PCR扩增、异源双链迁移率分析(HMA)、PCR产物的RFLP分析和16S rDNA的克隆和测序等比较研究,建立了一种快速确定未知植原体种类和分类地位的分子鉴别与鉴定优化程序;并可对田间采集的各种植物植原体样品进行快速鉴定和鉴别。16S rDNA PCR产物HMA分析结果显示,JWB与CWB、MD和PaWB皆可形成明显的异源杂交双链;而CWB、MD和PaWB植原体之间未能形成异源双链。JWB和PaWB不同地区样品之间、JWB和WJWB之间也未发现异源杂交双链的形成。而23S rDNA PCR产物HMA分析则可以将MD与PaWB区分开。进一步对未知分类地位的CWB序列测定及与其它植原体16S rDNA的RFLP和同源性比较结果显示,CWB与PaWB同源性为99.5%,其中与MD的同源性高达99.7%,因而应将CWB归为翠菊黄花组16Sr I-B,16Sr I-B (rp-B)。  相似文献   

葡萄卷叶伴随病毒Ⅲ基因的克隆及序列分析   总被引：1，自引：0，他引：1  

张满良  朱水芳 《西北农业大学学报》2000,28(5):70-75

根据葡萄卷叶伴随病毒Ⅲ美国分离物的ＧＬＲａＶ－３ＣＰ基因序列,设计并合成了１对该病毒的ＰＣＲ引物,利用ＩＣ－ＲＴ－ＰＣＲ成功地检查到合适大小的ＰＣＲ产物;同时将ＰＣＲ产物克隆到中间载体ＰＧＥＭ－３Ｚｆ,转化大肠杆菌ＤＨ５α菌株,筛选阳性克隆。通过双酶切以及序列分析表明,扩增样品与美国分离物的同源性为９４．１％。  相似文献   

苹果锈果类病毒RT-LAMP检测方法的建立简     

辛言言  李曼  张永江  马荣群  朱水芳  李志红 《植物检疫》2014,(1):33-37

  相似文献   

烟草环斑病毒、马铃薯X病毒碱性磷酸酶酶联诊断试剂盒的研制简报   总被引：1，自引：0，他引：1  

李明福  魏梅生  朱水芳  李桂芬  陈燕芳  黄文胜  相宁  李尉民  施宗伟 《植物检疫》2001,15(2):89

利用血清学技术开发的酶联诊断试剂盒 ,由于快速灵敏 ,操作简便 ,可进行大量样品的检测 ,比较好地满足了生产上需要 ,具有广阔的应用前景。由于国内尚没有成熟的植物病毒诊断试剂盒供应者 ,缺乏可靠的产品 ,因而限制了植物病毒诊断在国内的应用和发展。一旦需要时 ,主要是依赖国外进口 ,由于价格昂贵 ,采购不便 ,不能及时供应 ,在国内推广尚有一定的困难。另外 ,国外有些试剂盒在技术上有一定的缺陷 ,造成一些假阳性反应的出现 ,其中在阳性对照和阴性对照处理上不很成熟 ,对于危险性病毒的阳性对照处理不当 ,还易造成危险性病毒的扩散 ,而阴…  相似文献   

三系杂交水稻真伪及纯度实时PCR技术鉴定的研究     

程毅  朱水芳 《农业生物技术学报》2007,15(2)

杂交水稻的研究和推广为国民经济的发展起到了重要的作用，并已经在东南亚地区推广。如何建立一套快速、准确的杂交水稻真伪及纯度检测体系一直是困扰着口岸检疫人员的技术难题。实时荧光PCR技术是近年来新兴的检验技术。我们通过对已报道的雄性不育特异片段R2-630WA进行PCR验证，发现其可以作为鉴定杂交稻不育胞质的分子标记。依据此片段设计并合成一对引物和一条TaqMan荧光探针，对17个水稻品种进行实时荧光PCR检测。结果表明：此探针可以特异扩增三系杂交稻F1及不育系，并可初步用于三系杂交稻的纯度检测，由此建立了一套准确、快速的三系杂交稻鉴定体系。  相似文献