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为了解甘蓝型油菜材料乙酰辅酶A 羧化酶(ACCase)基因单核甘酸多态性及其与含油量的关系,该文采用
高、低含油量的自交纯合系材料各6份,克隆了其同质型ACCase基因,经双向测序后用DNASTAR 软件进行
CLUSTAL分析,并用DNASP软件进行SNP多态性计算.结果表明:在供试材料共88824bp的基因组核苷酸序
列中共检测到317个SNPs,出现频率为1/279;其中发生在编码区的SNP有179个,非编码区138个;ACCase基
因编码区的变异小于非编码区;非同义突变平均数(Ka)与同义突变平均数(Ks)比值小于1,表明该基因比较保守.
在高含油量材料组中发现了一个明显高于低含油量材料的突变热点区,位于5000~6500bp(即全基因序列的第
10088到11588bp)之间,该突变热点区包含了4个外显子和3个内含子,编码同质型ACCase的第1279到1648
位共368个氨基酸的序列,这段序列位于生物素羧基载体蛋白(BCCP)与羧基转移酶(CT)功能域之间.此变异区域
与ACCase活性及含油量的关系值得进一步研究. 相似文献
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全世界危害柑橘的疫霉有14种,其中冬生疫霉Phytophthora hibernalis和丁香疫霉Phytophthora syringae为我国规定禁止进境的两种检疫性柑橘真菌病害,目前尚未见有此两种病原菌的同步分子检测报道.该研究根据14种柑橘疫霉的18SrRNA,ITS,heat shock protein 90(HSP 90)等基因分别设计了疫霉属的通用引物和此两种检疫性疫霉的特异引物,通过进行反应体系优化,建立了同时检测柑橘上两种检疫性疫霉的特异三重PCR检测方法,并进行了灵敏度试验.用15个柑橘疫霉菌株与甜橙的混合DNA做模板进行模拟带菌试验,结果表明该三重PCR分子检测能实现两种检疫性疫霉菌的同步特异检测,这两种检疫性柑橘疫霉提供了特异、可靠、便捷、适于口岸应用的检测方法,可有效促进柑橘类水果的快速通关. 相似文献