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21.
基于SNP标记的桃矮化基因精细定位 总被引:1,自引:1,他引:0
【目的】矮化型桃树体矮小、节间短,是盆栽观赏和砧木育种的重要遗传资源。明确矮化性状形成的遗传机制并对桃矮化基因进行精细定位,是建立目标性状分子辅助选种体系和遗传改良的前提,可为有目标的选育矮化观赏桃和砧木品种奠定基础。【方法】以‘05-2-144’(‘97矮’ב鸳鸯垂枝’桃)套袋自交获得的395个后代单株构建的分离群体为材料。参考桃基因组信息并基于Sanger技术开发的SNP标记对亲本和后代单株进行分析,在扩大群体单株中进行连锁关系分析,确定连锁的SNP标记,初步定位目标基因。在定位区域内基于二代测序技术开发更多的基因型和表型一致的SNP标记,对后代单株进行基因分型,完成目标性状的精细定位。然后在精细定位区域内开发SNP标记,即杂交群体双亲均为Aa杂合基因型,对‘10-7’ב96-5-1’杂交后代89个单株进行分子鉴定,以验证基因定位结果的准确性。【结果】通过对桃单株‘05-2-144’自交后代实生苗表型鉴定表明,普通型和矮化型单株数分别为300株和95株,性状分离比例接近3﹕1(P值为0.67;χ2为0.19),符合孟德尔遗传规律,桃矮化性状受隐性单基因控制。用于分子鉴定的单株来源于‘10-7’(普通型)ב96-5-1’(普通型)杂交组合,共获得89个后代单株,其中普通型66株;矮化型23株(P值为0.854;χ2为0.034)。基于Sanger测序技术开发了SNP标记,在桃基因组数据库Pp06上25 230 425 bp和27 191 090 bp处获得了连锁的SNP标记,且目标基因位于这两个标记的右侧,初步获得了连锁的SNP分子标记。在此基础上,对亲本进行66.89X深度测序,继续开发符合Aa杂合基因型的SNP标记位点。根据参考基因组和物理距离区间共设计了15对SNP引物,其中12对引物与重测序结果中SNP的类型一致,3对引物与重测序结果中SNP的类型不一致,连锁标记的基因分型成功率为80.0%。通过基于SNP基因分型分析,最终完成了目标性状的精细定位,位点位于Pp06的28 712165 bp(引物为JXSNP-5)和28 899 661 bp(引物为JXHRM-SNP-3)之间,遗传距离分别为0.38 c M和0.13 c M,物理距离约为277 kb,精细定位区域内有54个已知转录本。在定位区域内桃基因组Pp06的28 108 436 bp处和29 247 763 bp处开发SNP标记用于杂交后代表型的鉴定,结果表明所有后代单株基因型和表型鉴定结果完全一致,鉴定准确率为100%。【结论】本研究精细定位了桃矮化基因,物理距离约为277 kb,为基因克隆、亲本早期筛选以选育矮化观赏桃和砧木品种等奠定了基础。 相似文献
22.
2009年10月份气温偏高,加上11月上中旬的强寒潮天气造成了河南省中部地区桃苗木的严重冻害。2010年1月9日对冻害发生地区的随机抽样调查表明,桃苗木未发生明显冻害的占23.9%,轻度冻害和中等冻害的占18.1%和15.3%,发生严重冻害和致死冻害的分别为24.3%和18.4%,平均冻害指数48.82。苗木高度与冻害指数呈显著正相关(r=0.893*),苗木粗度与冻害指数无显著正相关(r=0.613),不同品种冻害发生情况存在一定差异,冻害发生的边际效应非常明显。对桃苗木冻害发生的综合原因进行了分析,并就相关对策进行了探讨。 相似文献
23.
为了进一步研究调控节间长度相关基因的表达模式及为克隆该半矮生性状的基因提供依据,
采用cDNA-AFLP 分析方法对半矮生型桃节间“生长跃变期”差异表达的基因进行筛选,并对差异的转录
衍生片段(TDFs)进行回收、克隆、测序、功能注释及qRT-PCR 验证。采用256 对引物,共产生9 021
个TDFs,有明显差异的TDFs 共899 个,成功回收到497 个TDFs,254 条序列与已知基因高度相似。差
异表达的基因主要涉及到信号转导、生长发育、转录调控、蛋白质代谢、防御和物质与能量代谢等。选
取其中26 个基因进行实时荧光定量PCR 验证,结果表明26 个基因的qRT-PCR 表达丰度分析与
cDNA-AFLP 结果一致。分离到植物生长素、细胞分裂素、油菜素内酯、脱落酸、细胞周期等调控途径中
生长调控相关的候选基因,可为阐明节间生长调控机制奠定基础。 相似文献
24.
对6种不同生长型桃树的营养生长特征和叶片形态、解剖结构进行了研究,并对营养生长与叶片解剖结构的关系进行了分析.结果表明:不同生长型间在树体高度、枝条节间长度等方面存在显著差异.从树体高度看,矮化型<紧凑型<半矮化型<垂枝型<普通型;紧凑型的萌芽率(86.1%)和成枝率(78.1%)在所有类型中均是最高的,平均每个母枝可形成近10个中长枝,远高于其它类型;在叶片结构特征方面,普通型的叶片干物质含量最高,其后依次为半矮化型,垂枝型,紧凑型和矮化型,相关分析表明,干物质含量与成枝率之外的其它生长参数均呈正相关,而单位叶面积鲜重与成枝率之外的其它生长参数呈负相关;在解剖结构上,普通型叶片最厚,为194.5 μm,紧凑型叶片最薄,叶片组织较疏松;普通型的栅海比(栅栏组织厚度/海绵组织厚度)最小,而矮化型最高,栅海比与树体高度成负相关,与一次枝长呈显著负相关(r=-0.986**).叶背气孔密度分布范围为1 mm2 234.1~393.5个,垂枝型最高,半矮化型最低,气孔密度与一次枝粗的相关系数达到极显著水平(r=-0.944**),而与枝条长度和节间长度的相关系数则较低. 相似文献
25.
26.
本研究以普通型油桃品种‘晴朗’为母本、半矮生型油桃‘SD9238’后代——‘中油桃14号’为父本杂交的141个F1代单株为试材,对半矮生性状进行了SSR分子标记研究。通过集群分离分析法(bulked segregant analysis,BSA)用位于桃基因组上的56对SSR引物进行了筛选,获得一个与桃半矮生性状相关的SSR标记CPDCT23,该标记在普通型上表现为显性,在半矮型上表现为隐性。进一步分析表明,该标记对F1代单株性状预测的正确率为92.2%,为进一步开展有关控制该半矮生性状的分子机制研究提供参考。 相似文献
27.
油桃作为普通桃的单基因突变体,因其果实表面光滑无毛,艳丽美观,食用方便而受到世人的青睐,并已成为世界鲜食桃品种改良和生产发展的方向。虽然油桃起源于我国,但有计划的品种改良研究起步较晚,培育熟期配套、栽培适应性强、综合性状优异的油桃品种以促进我国油桃生产的发展,是当前和今后一个时期我国桃育种工作者的主要任务之一。1选育经过1992年选用综合性状优良、但风味较酸的美国特早熟油桃品种五月火为父本,北京市农林科学院育出的早熟油桃品种瑞光3号(该品种果形较大,风味甜,但着色不良,且有裂果现象)为母本,配置杂交组合。1992年春杂… 相似文献
28.
29.
30.
在过去的35年,匈牙利的大樱桃密植栽培获得了可喜的进步,新建大樱桃园的栽培密度达到了1200~2000株/公顷,这意味着果园密度增加了6~7成,以及更早投产、更高的产量、更好的果实品质、更方便的采收等。 相似文献