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【目的】密码子使用的偏好性普遍存在于几乎所有物种基因组中。试验旨在探究野骆驼(Camelus ferus)基因组密码子的使用偏好性和影响因素,为骆驼基因组研究和密码子优化提供依据。【方法】以野骆驼全基因组数据为材料,通过生物信息学、ENC-plot绘图、Neutrality-plot绘图和PR2-plot绘图等多种分析方法,对野骆驼蛋白质编码基因密码子的使用特性和影响因素进行分析,并与其他动物基因组的密码子偏好性进行比较研究。【结果】野骆驼基因组编码区的GC含量高于AT含量,密码子末位碱基较偏好以G/C结尾。相对同义密码子使用度(RSCU)>1的有29个密码子,其中14个以C结尾,9个以G结尾。ENC-plot、Neutrality-plot和PR2-plot绘图分析结果表明,野骆驼基因组密码子的使用情况受自然选择和突变的双重影响,主要因素是自然选择。确定了15个主要以C或G结尾的最优密码子,分别为AUC、GGC、CUG、GUG、GCC、UCC、CCC、AGA、ACC、UAC、CAC、AGC、UUG、CAG和CGG。野骆驼与单峰驼、小鼠的密码子使用偏好性较为接近。【结论】野骆驼基因组密码子的使用情况受自然选择和突变的双重影响,导致密码子偏好性的主要因素为自然选择。研究结果可为野骆驼遗传种质资源保护和利用、基因工程、异源基因高效表达提供参考。 相似文献
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沙培条件下磷、 钾、 钙亏缺对枳(Poncirus trifoliata)幼苗根系形态及营养吸收的影响 总被引:6,自引:2,他引:4
【目的】根系是吸收水分和养分的主要器官,对于多年生木本果树的生长发育尤为重要。由于果树根系庞大、 分布错综复杂,对根系构型和空间分布等的研究相对较少。本文利用计算机扫描系统及其图像分析软件观测根系二维形态参数,并用原子吸收法测定植株养分含量,以探索养分亏缺对枳根系形态的影响,以及根系形态变化与植株养分吸收的关系。【方法】本试验在沙培条件下,以柑橘砧木枳(Poncirus trifoliata)实生苗为试材,研究了缺磷、 钾和钙对其根系形态以及植株体内营养元素含量的影响。利用爱普生数码扫描仪(Expression 10000XL 1.0, Epson Inc. Japan)扫描根系,并用WinRhizo Pro (S) v. 2004b软件(Regent Instruments Inc., Canada)分析获取根系总长、 总体积和总表面积等二维形态参数。利用原子吸收光谱仪(SPECTR AA220)测定样品K、 Ca、 Mg、 Fe、 Cu、 Zn等元素含量。【结果】从扫描数据可知,3 种缺素处理对枳幼苗根系形态结构有较大的影响,即在缺素时根系总长、 表面积和体积均显著降低,缺P处理使枳实生苗粗根的根系长度、 表面积、 体积显著降低,但是增加了中等粗根的表面积和体积; 缺K和缺Ca处理的中等粗根根系长度、 表面积和体积均显著低于对照; 3种缺素处理均显著降低了细根和粗根的根系长度、 表面积和体积。不同缺素处理对植株根系和地上部生长的影响也存在差异,缺P对地上部的抑制作用显著强于根系,缺K处理对根系生长的抑制作用较强,缺Ca对根系和地上部生长的抑制作用均较小。缺Ca处理植株体内Zn和Fe浓度均显著增加但Ca浓度降低,缺P时植株体内Ca和地上部Zn浓度增加,而缺K时植株体内Ca、 Zn浓度增加但Fe和K浓度均显著降低。【结论】不同缺素条件下枳实生苗根系形态各异,导致根系对不同养分的吸收能力不同,从而使植株体内K、 Ca、 Zn、 Fe等养分含量发生改变,最终影响整个植株根系和地上部的生长,表现出各缺素环境所特有的树体特征。 相似文献
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为探究品种、年龄及采精频率对犬精液品质和精子形态的影响,本实验选取沈阳某警犬基地1~9岁健康德国牧羊犬和马里努阿犬各30头,按照品种(德国牧羊犬和马里努阿犬)、年龄(1~3岁、4~6岁和7~9岁)、采精频率(2、4、6、8 d和10 d)设置不同组别。用计算机辅助精子分析法(CASA)测定精液体积、精子密度、精子活力、精子活率等精液品质指标,采用伊红Y染色结合CASA测定精子头部长度、头部宽度、顶体比例、尾部中段长度等精子形态指标。结果显示:年龄对精液品质的影响较品种、采精频率对精液品质的影响更大,7~9岁年龄段各项精液品质指标出现下降(P<0.05);4~6岁年龄段的精液体积、精子密度、精子活力均优于1~3岁及7~9岁;采精频率为每间隔2、4d和10d时,精液体积、精子密度、精子活力和精子活率下降,采精频率为6 d或8 d对精液品质无影响;两犬种之间精液品质差异不显著。德国牧羊犬与马里努阿犬精子中段长度分别为11.35、8.74μm左右,存在显著差异;两犬种精子头部长度、宽度和顶体比例无显著差异;同一品种不同年龄段犬的精子形态差异不显著。在制定犬繁殖育种计划时,应将公犬年龄作为... 相似文献
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以焉耆盆地主栽的5个加工番茄品种为试验材料,在焉耆盆地富硒土壤分布较广的焉耆县域内选取5块不同地源硒水平(Se0.309、Se0.349、Se0.400、Se0.408、Se0.495)的耕地为试验地点,采取随机区组试验,探究不同地源硒水平对加工番茄品质的影响,为焉耆盆地天然富硒土壤上生产富硒番茄产品、提高加工番茄品质提供数据支撑。结果表明,随着地源硒水平的增高,不同加工番茄品种硒含量、番茄红素含量、还原糖含量、总酸含量和糖酸比变化趋势不同。‘屯河1015’、‘屯河5501’硒含量呈增加趋势,‘屯河3501’、‘屯河17’番茄红素含量增加明显,‘屯河1943’、‘屯河17’还原糖含量增加明显,‘屯河1943’总酸含量增加明显,‘屯河1943’、‘屯河5501’糖酸比呈下降趋势,‘屯河17’糖酸比呈上升趋势。本研究中的地源硒水平梯度较小,需进一步扩大地源硒水平梯度,验证不同加工番茄硒含量、番茄红素含量、还原糖含量、总酸含量等品质的变化趋势。 相似文献
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为了研究不同品种母犬繁殖指标的差异,笔者基于辽宁省某养犬场2003—2019年德国牧羊犬、荷兰牧羊犬和马里努阿犬的繁殖记录数据,采用单因素方差分析和卡方检验分析三个品种母犬的发情指标、窝产指标、受胎情况及其他繁殖指标的差异。结果表明:德国牧羊犬发情时间极显著长于荷兰牧羊犬(P<0.01),显著长于马里努阿犬(P<0.05);马里努阿犬显著长于荷兰牧羊犬(P<0.05)。马里努阿犬发情间隔极显著长于荷兰牧羊犬和德国牧羊犬(P<0.01),荷兰牧羊犬发情间隔极显著长于德国牧羊犬(P<0.01)。德国牧羊犬窝产总数、窝产公犬数和窝产母犬数均极显著低于荷兰牧羊犬和马里努阿犬(P<0.01),荷兰牧羊犬与马里努阿犬差异不显著(P>0.05)。德国牧羊犬仔犬2月龄成活总数、成活公犬数和成活母犬数极显著低于荷兰牧羊犬和马里努阿犬(P<0.01),马里努阿犬与荷兰牧羊犬差异不显著(P>0.05)。荷兰牧羊犬受胎率显著高于德国牧羊犬(P<0.05),与马里努阿犬差异不显著(P>0.05);德国牧羊犬与马里努阿犬差异不显著(P>0.0... 相似文献