基于园林植物的SSR标记开发及应用研究进展     

王永路  孙正海  辛培尧  张睿 《现代园艺》2015,(7)

通过查阅文献,笔者对目前SSR引物开发方法以及SSR标记在园林植物上的应用做了综合分析,并对目前SSR标记在园林植物上的应用存在的问题及前景做了展望,研究结果为了解SSR标记在园林植物的研究现状及利用SSR标记研究园林植物提供了理论依据。  相似文献   

几种经济植物UFGT基因的生物信息学分析     

付海辉  辛培尧  许玉兰  刘岩  韦援教  董娇  曹有龙  周军 《广西农业生物科学》2011,30(1):92-102

本文根据在GenBank中已登录的葡萄、玉米、水稻、草莓、拟南芥和苹果等植物的类黄酮-3-O-葡萄糖基转移酶基因的核苷酸序列和氨基酸序列,应用生物信息学软件预测了其理化性质、疏水性/亲水性、导肽、跨膜结构、卷曲螺旋结构、二级结构、功能结构域及高级结构,并构建了类黄酮-3-O-葡萄糖基转移酶蛋白家族的系统进化树。结果表明这几种植物的UFGT基因核苷酸序列除葡萄存在2个外显子外,其它植物均存在1个外显子。含量最丰富的氨基酸是Leu、Ala、Gly、Val和Ser等,除葡萄、苹果UFGT属于不稳定类蛋白外,其余均属于稳定类蛋白。进一步研究分析表明,这几种植物UFGT蛋白存在明显的疏水区和亲水区、信号肽、跨膜结构以及卷曲螺旋。二级结构组成上比例相似,并且都由α-螺旋、延伸链和无规则卷曲所组成。它们都存在UDPGT、COG1819和MGT等保守域。除了拟南芥外,其它几种植物都能够通过同源建模建立UFGT蛋白的三维结构。进化分析表明,把它们的UFGT基因分成5个类群,其中3个大类群,另外陆地棉和野芭蕉的UFGT基因分别单独成一类。本工作将为深入研究该蛋白在植物花、果实和叶片等器官颜色变化中发挥的功能,开展生物大分子结构模拟以及药物设计提供抛砖引玉的作用。  相似文献   

楸树叶绿体基因组密码子偏性分析          下载免费PDF全文

李凤  辛静  辛雅萱  肖遥  屈亚亚  王军辉  麻文俊  辛培尧 《南方农业学报》2021,52(10):2735-2743

【目的】分析楸树叶绿体基因组密码子使用偏性,为楸树乃至梓属植物叶绿体基因组学、物种进化特征及遗传多样性分析等研究提供理论依据。【方法】利用Codon W 1.4.2及EMBOSS expiorer的cusp和chips软件对51个楸树叶绿体基因的编码区（CDS）序列进行密码子相关参数、中性绘图、ENC-plot和PR2-plot等分析,并通过构建高、低表达偏性基因库,以ENC值和RSCU值为参考标准,最终筛选最优密码子。【结果】51个基因密码子的平均GC_all含量为38.48%,密码子不同位置GC含量为:GC₁（47.03%）>GC₂（39.93%）>GC₃（28.09%）,说明第3位的GC并非均匀分布;ENC为34.93~56.50,平均为46.87。GC₂与GC₁呈极显著正相关（P<0.01）,而GC₃与GC₁和GC₂无显著正相关（P>0.05）;ENC与GC_all、GC₁、GC₃和N均呈显著正相关（P<0.05,下同）;密码子数（N）与GC3和ENC呈显著正相关。RSCU>1的密码子共有30个,其中,以A或U结尾的密码子有29个。中性绘图分析结果显示,GC₃与GC₁₂相关系数为0.0188,二者无显著相关性,回归系数为0.143。ENC-plot分析结果显示,大部分基因偏离了ENC预期标准曲线,少数分布在预期曲线附近;有7个密码子分布在GC₃含量-0.05~0.15区间,其余区间共有44个密码子,而这44个基因离ENC标准曲线较远。PR2-plot分析结果显示,落在中线上的基因较少,平面图右下方的基因分布较多,表明在各碱基使用频率方面存在偏性,即T>A,G>C。各碱基使用频率存在偏性（T>A,G>C）,说明基因组密码子的偏性更多受选择效应的影响。最终筛选出7个为最优密码子UUU、CUU、CCU、AAA、GAU、CGA和GGU。【结论】楸树叶绿体基因组密码子偏性较弱,偏好使用A或U结尾的密码子,主要受选择压力的影响,受突变等其他因素影响较小。  相似文献   

重金属结合蛋白基因hmbp在转基因拟南芥中的功能分析     

周惠  辛培尧  赵丽华  原晓龙  陈杰  周军 《安徽农业科学》2013,41(10):4255-4258,4267

[目的]分析重金属结合蛋白基因hmbp在转基因拟南芥中的功能。[方法]利用PCR方法从抗辐射奇异球菌(Deinococcus radiodurans)中克隆hmbp基因,并用沾花法转入拟南芥,用氯化镉处理得到的阳性植株后,检测转基因植株中的丙二醛、脯氨酸、可溶性糖、叶绿素含量、相对电导率及SOD、POD活性。[结果]与野生型相比,镉处理后的转基因拟南芥中脯氨酸、可溶性糖含量及SOD、POD活性增加较多,丙二醛含量增加较少,叶绿素含量减少较少。[结论]研究表明hmbp转基因拟南芥对镉具有很高的抗逆性。  相似文献   

浅析麻疯树的研究进展     

殷瑶  王耘  苟平  施顺李  辛培尧 《林业实用技术》2013,(9):34-36

麻疯树作为一种能源树种,受到国家及科技工作者的高度重视,其综合利用前景广阔。概述了麻疯树的植物学性状、生态习性及其国内外研究进展等方面的一些进展,并对其应用前景及发展趋势进行了展望。  相似文献   

大麻雄性相关RAPD和SCAR标记的研究   总被引：2，自引：0，他引：2  

李仕金  辛培尧  郭鸿彦  杨明 《广东农业科学》2012,39(24):151-154

以云麻1号为试验材料,从200条随机引物中筛选出能在大麻雌雄株间产生差异的RAPD引物.结果显示,引物S208扩增得到的一条与大麻雄性相关的大小为429 bp的DNA分子标记特异性条带最明显,且稳定性高.根据测序结果,合成了两条SCAR标记引物,该SCAR标记不仅可以对已知性别的花期的大麻雌雄植株进行准确鉴定,还可以对未知性别的幼苗期的大麻雌雄植株进行鉴定.  相似文献   

中药材浸提液对金鱼草切花瓶插寿命的影响     

孙正海  辛培尧  林开文  李奇 《江苏农业科学》2012,40(1):225-228

为研制廉价、无毒、绿色环保的生物切花保鲜剂,研究天麻、桂皮和甘草等3种中药材浸提液对金鱼草切花瓶插寿命的影响,分析瓶插液电导率、pH值、微生物数量和花瓣POD活性等与切花寿命相关的生理生化指标.结果显示:3种中药材中桂皮浸提液保鲜效果较好,瓶插寿命平均可延长3～4d,其中以7.5％(表示每500 mL瓶插液中含有37.5 mL中药材浸提原液)处理效果最佳;桂皮浸提液对提高花瓣POD活性和保护细胞膜完整性具有优势.  相似文献   

三七几种后熟处理方式和DNA提取方式比较     

孙正海  唐军荣  辛培尧  黎林梅 《江苏农业科学》2011,39(6)

为建立三七种子后熟处理和DNA提取技术体系,分别以种子活性、DNA纯度、浓度和提取时间为指标,比较了三七3种后熟处理方式(昆明冬季常温处理、4℃冰箱内低温处理和昆明冬季沙埋处理)和4种DNA提取方式(改良CTAB法Ⅰ、改良CTAB法Ⅱ、改良CTAB法Ⅲ和改良SDS法)的效果.结果发现,3种后熟处理方式中昆明冬季沙埋处理效果最好,处理后具有活力种子占90％；4种DNA提取方式都可以提取三七基因组DNA,其中,改良CTAB法Ⅰ提取三七DNA纯度较好,浓度较高,所需时间最短,在4种方式中综合效果最好.  相似文献   

4种滑叶铁线莲基因组DNA提取方法比较     

胡祎晨  孙正海  王锦  李世峰  辛培尧  范萱 《安徽农业科学》2011,39(36):22215-22216,22363

[目的]对4种滑叶铁线莲基因组DNA提取方法进行比较研究,建立滑叶铁线莲最适DNA提取方法。[方法]以滑叶铁线莲叶片为材料,比较改良CTAB法I、改良CTAB法Ⅱ、改良CTAB法Ⅲ、改良SDS法这4种基因组DNA提取法在提取DNA纯度、浓度和提取时间等方面的不同。[结果]4种方法都可提取滑叶铁线莲基因组DNA。改良CTAB法I提取DNA纯度最高,但浓度最低且提取时间最长;改良SDS法提取DNA浓度最高,所需时间较短,但纯度较低;改良CTAB法Ⅲ提取所需时间最短。[结论]建立了铁线莲最适DNA提取方法,为运用分子生物学手段对其研究提供支持。  相似文献   

大麻染色体制片技术   总被引：1，自引：0，他引：1  

辛培尧  萧凤回  罗思宝  杨明 《安徽农业科学》2008,36(1):26-26,95

[目的]探究大麻染色体的制片技术。[方法]对大麻染色体制片技术的预处理液、解离时间、染色时间等进行试验研究,并对其进行染色体数目观察。[结果]研究表明:用大麻根尖在常温下用0.003%的8-羟基喹啉溶液预处理2 h或用饱和对二氯苯处理1.5 h,经卡诺固定液固定30 min后,在1∶1的1 mol/L HCl和45%醋酸60℃下恒温水浴中解离30 s,地衣红染液染色8 h压片镜检,能取得良好的制片效果。大麻染色体数目观察表明,大麻染色体数目2n=2x=20。[结论]该研究为大麻细胞学方面的深入研究提供了资料。  相似文献