复合酶制剂体外预消化仔猪饲粮最佳条件的筛选以及对其品质的影响     

杨阳  王悦  武一帆  刘思均  赵燕  李步高  曹果清  郭晓红 《动物营养学报》2022,34(5):3329-3338

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lncRNA-6617调控猪肌内前体脂肪细胞分化的筛选与功能研究     

孟珊  杨阳  李睿霄  姬梦婷  张娜  路畅  蔡春波  高鹏飞  郭晓红  曹果清  李步高 《畜牧兽医学报》2022,53(6):1712-1722

旨在探究lncRNA-6617的生物学特性及其对猪肌内前体脂肪细胞分化的影响，以及初步探究其上游调节机制，为后续深入研究猪肌内脂肪沉积调控机制提供参考依据。本研究以饲养在相同条件下的1、90、180日龄健康马身公猪(n=3)和大白公猪(n=3)为研究对象，利用RNA-seq技术筛选脂肪型猪(马身猪)和瘦肉型猪(大白猪)肌肉特异表达的lncRNAs，并通过生物信息学分析、RT-PCR及Sanger测序鉴定lncRNA-6617生物学特性及其猪组织中的表达特征。在猪肌内前体脂肪细胞中干扰lncRNA-6617，检测lncRNA-6617对肌内脂肪细胞分化能力的影响。随后，检测m⁶A修饰相关酶在不同品种猪中的表达差异，研究lncRNA-6617的上游调控机制。结果显示，lncRNA-6617位于猪18号染色体，RAMP3基因反义链的第3内含子区域，无蛋白编码能力，主要分布于细胞核; lncRNA-6617在猪所检测各组织中均有表达，背部皮下脂肪中表达量最高，且在马身猪肌肉组织中的表达极显著高于大白猪(P < 0.01);在猪肌内前体脂肪细胞分化过程中，lncRNA-6617表达量呈上升趋势，且在分化第5天表达量达到最高; 干扰lncRNA-6617诱导分化7 d后，分化的成熟脂肪细胞明显减少，成脂关键基因CEBPα、PPARγ和aP2的表达均极显著下调(P < 0.01)。m⁶A修饰的去甲基化酶FTO在马身猪背最长肌和股二头肌中的表达极显著高于大白猪(P < 0.01)，在腰大肌中的表达显著高于大白猪(P < 0.05)，上游调节因子ZNF217在马身猪肌肉组织中的表达极显著高于大白猪(P < 0.01)，与lncRNA-6617表达模式一致。干扰FTO后，lncRNA-6617的表达极显著下调(P < 0.01)。本研究筛选了在马身猪肌肉组织中显著高表达的lncRNA-6617，并深入研究了lncRNA-6617促进猪肌内前体脂肪细胞分化的功能及其上游调节机制，丰富了脂肪细胞生成的表观调控网络。  相似文献   

猪DDX家族成员基因结构与表达特性分析     

席梦瑶  王舒  马艺珈  郭晓红  曹果清  李步高  高鹏飞 《黑龙江畜牧兽医》2023,(3):52-57+133-135

为了系统研究DDX解旋酶家族成员在猪生长发育中的作用，试验采用生物信息学方法和实时荧光定量PCR检验技术，对猪DDX家族的42个成员的基因结构、理化性质、功能结构域、聚类进化树、GO功能，以及在大白猪和马身猪盲肠组织中的表达情况进行了研究。结果表明：猪DDX家族除DDX28和DDX53基因没有内含子外，其他成员均含有外显子和内含子，且外显子平均数量为16个，内含子平均数量为15个。除8号染色体外，其他染色体上均有猪DDX家族成员分布。该家族成员均为疏水蛋白并且大多数不稳定，具有多个亚细胞定位，整体来看主要分布于细胞核中。猪DDX家族成员共预测到了15个保守基序，其中DDX1、DDX11、DDX19B、DDX26、DDX36、DDX39A、DDX58和DDX60基因缺失D-E-A-D保守基序，有10个保守基序出现在超过30个成员的序列中，同时不同成员有相同的基序类型和特定的基序排列顺序。聚类分析将猪DDX家族42个成员分为6大簇，其中DDX2和DDX48、DDX21和DDX50、DDX43和DDX53、DDX5和DDX17具有高度同源性，支持率为100%。该家族大多数成员具有ATP依赖性...  相似文献