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不同地理区间上家马母系结构的差异分析 总被引:2,自引:1,他引:1
为了分析家马在世界各地理区间上的遗传结构差异,对家马遗传资源评价提供有益帮助,并对其母性起源和驯化提供一些分子生物学依据。对4个家马品种(蒙古马、锡尼河马、三河马和纯血马)共36个个体的mtDNA Cytb基因全序列进行了扩增和测序,并结合目前GenBank上登录的世界各地所有家马Cytb全序列进行分析,共检测到86种单倍型80个多态位点,其单倍型多样度为0.946,核苷酸多样度为0.00454,表明家马的遗传多态性比较丰富。首次通过将各品种家马根据地理区域划分为北美、西欧、东欧、中东、中亚、东亚6个类群以Cytb全序列作为标记比较母系遗传结构差异。结果表明:北美类群和亚洲类群之间差异较显著,而其余类群间则差异不显著,一方面说明亚欧大陆各地区马种之间母系基因渗透现象比较严重;另一方面一定程度上支持北美马种来自欧洲的论断。构建的Median Joining网络聚类图显示,所有家马的母系起源于A-G 7个单倍型群,进一步支持家马多重母系起源的观点。并且,家马各单倍型群都是由多个地理区间上分布的家马混杂而成的,即未发现由单独一种地理区间的家马构成的单倍型群,即地理位置、母系构成以及母性起源之间没有明显的相互关系。 相似文献
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山羊生长激素基因部分序列的PCR-SSCP分析 总被引:5,自引:0,他引:5
以鲁北白山羊、波尔山羊和波尔山羊与鲁北白山羊的杂交一代、回交一代共计 2 74个个体为研究材料 ,对山羊生长激素基因 5′调控区 - 4 0 6~ - 1 93片段进行PCR扩增 ,扩增产物经SSCP分析发现存在多态性。结果表明发现波尔山羊及杂交后代以AA型占多数 ,而鲁北白山羊则BB型个体较多 ,基因型频率在品种间存在显著差异 (P <0 .0 5 )。对该片段的两种纯合型克隆测序发现 :AA型在第 6 0位发生了C→T的突变 ,第 2 1 1位发生碱基C的丢失 相似文献
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猪精子结合和内化外源基因的影响因素研究 总被引:1,自引:0,他引:1
精子介导基因转移(SMGT)是目前转基因动物研究中简单而高效的方法之一,其中精子结合和内化外源基因的效率是精子介导转基因成功的关键.本试验以DIG标记的线性化EGFP作为示踪基因来检测猪精子结合和内化外源基因的影响因素,结果表明:猪精子能够自发结合外源基因,结合部位主要在精子顶体后区.精子结合外源DNA的阳性率随共孵育时间延长而增加,在37℃或39℃时孵育60 min后,阳性率不再增加;在17℃时孵育90min后,阳性率不再增加.在检查的15只公猪样本中,精子与外源DNA的结合率为6.57%~35.81%,内化率为2.99%~24.66%,个体间差异显著(P<0.01).精浆能够强烈抑制外源基因的结合和内化,脂质体及DMSO能够显著提高转染效率.死精子能够结合外源基因,但不能将其内化;反复冻融导致质膜破裂的精子对外源基因有更高的结合率,且不受个体影响. 相似文献
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[目的]研究光照时间对崂山奶山羊泌乳量及乳成分的影响。[方法]选择体重、胎次、产奶量、产羔日期相近,健康泌乳高峰期崂山奶山羊母羊12只,随机分成3组,每组4只。采用人工光照的方式,使奶山羊每天的光照时间分别由自然光照的10 h增加到13 h和16 h。通过试验测定了崂山奶山羊的产奶量、乳脂率和乳蛋白率,并分析了经济效益。[结果]当光照时间为13 h时,试验羊的产奶量均显著高于10 h和16 h试验奶山羊(P0.05),而在乳脂率和总干物质等指标上各试验组间也没有显著差异(P0.05),且光照13 h组比16 h组有更高的经济效益。[结论]建议在奶山羊饲养管理中每天提供13 h光照较好。 相似文献
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本研究以3~4月龄兔为研究对象,收集卵母细胞,按直径将其划分为75~95μm、95~105μm、105~115μm3个组,通过亚硫酸盐测序法检测了印迹基因Igf2r的甲基化程度,并运用RT-PCR对Dnmt1、Dnmt3a、Dnmt3b、Dnmt3l、Lsh的表达量进行检测。结果表明,在3组卵母细胞内,Igf2r的甲基化比率依次为15.7%、60%、91.5%,甲基化程度随卵母细胞直径的增加而不断提高。 相似文献
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雌性生殖细胞印迹的获得发生于小鼠的卵子发生过程中,本研究以颗粒细胞分化前后的卵泡卵母细胞为研究对象,利用重亚硫酸盐测序法,对卵泡腔形成前后的卵母细胞中Igf2r和Peg3两个印迹基因的甲基化状况进行了分析。颗粒细胞分化前,卵母细胞Igf2r和Peg3两个印迹基因DMR区CpG位点的甲基化比率分别为80.67%和82.78%;颗粒细胞分化后的早期有腔卵泡卵母细胞中,卵母细胞Igf2r和Peg3两个印迹基因DMR区CpG位点的甲基化比率分别为82%和83.89%。可见,卵泡腔的形成对于直径相同的卵泡卵母细胞印迹基因甲基化的建立没有影响。 相似文献
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基于ND4基因部分片段探讨中国4个家驴品种的母系构成 总被引:1,自引:0,他引:1
为了分析中国家驴的遗传多样性,对保种和开发利用这一固有遗传资源提供有益帮助,并对其母性起源提供一些基础资料,作者对我国4个家驴品种(德州、凉州、云南、蒙古)209个个体的mtDNAND4基因编码区409bp片段进行了扩增、单链构象多态(SSCP)检测与测序分析,共检测到5种单倍型8个多态位点,其单倍型多样度为0.4699,核苷酸多样度为0.00308,表明我国家驴的遗传多态性比较丰富。通过对各单倍型序列按照脊椎动物线粒体编码规则翻译成氨基酸序列进行比对发现,部分核苷酸变异引起了氨基酸的变异。构建的简化加权中值网络聚类图显示,4个家驴品种的样品来自两个母系源头,并且,4个中国家驴品种都是由这两个母性世系混杂而成的,即未发现由同一种世系构成的品种。这与以前基于D-loop区序列对于中国家驴的研究结果相似,即地理位置、世系构成以及母性起源之间没有明显的相互关系。 相似文献
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为了筛选华西牛和雪龙黑牛背最长肌重量相关的遗传标记和候选基因,试验以1 478头华西牛和452头雪龙黑牛为研究对象,对其背最长肌重量性状进行全基因组关联分析(genome-wide association study, GWAS),即测定其屠宰后背最长肌重量表型数据,利用Illumina Bovine-HD(770K)芯片对其基因组进行基因分型,采用FarmCPU模型和GEMMA模型对质控后的芯片数据进行GWAS,挖掘与华西牛和雪龙黑牛背最长肌重量显著相关的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)位点和候选基因。结果表明:华西牛与雪龙黑牛群体背最长肌重量表型性状均符合正态分布,且二者芯片数据经过质控后分别得到607 198,511 320个SNP位点,这些SNP位点在二者各个染色体上的分布比较均匀;利用FarmCPU模型在华西牛与雪龙黑牛群体分别检测到12个和9个与其背最长肌重量显著相关的SNP位点,且华西牛群体的显著SNP位点分别位于1,5,7,11,12,13,15,16,22,23号染色体上,鉴定到KCNAB1、PFN2、RNF13... 相似文献
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德州驴心脏脂肪酸结合蛋白(H-FABP)基因的克隆及序列分析 总被引:2,自引:1,他引:1
本试验对德州驴心脏脂肪酸结合蛋白(H-FABP)基因进行了克隆测序,并与GenBank中11个物种相应基因编码区核苷酸序列、氨基酸序列进行了比对分析,同时通过最小进化法(ME法)、邻接法(NJ法)和非加权组平均法(UPGMA法)对H-FABP基因编码区核苷酸序列进行了物种间分子系统进化树分析。结果表明,德州驴H-FABP基因由4个外显子和3个内含子组成,外显子1、2、3、4大小分别为73、173、1025、7 bp,内含子1、2、3大小分别为3500、1980、1425 bp。CDS序列全长为405 bp,前体氨基酸数为134个;德州驴与马、野猪、人、牛、山羊、牦牛、大鼠、小鼠、红原鸡、绿头鸭、斑马鱼各物种在H-FABP基因编码区核苷酸序列上有较高的保守性,同源性大小分别为96.79%、91.36%、89.14%、88.89%、88.89%、88.64%、84.07%、83.46%、75.80%、74.81%、67.90%;3种方法构建的物种间分子系统进化树基本一致,并且3种分子进化树结果与动物学分类一致,表明H-FABP基因适合于构建不同物种间的系统进化树。 相似文献